实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料:ESI-MS MALDI - MS 试剂、试剂盒:提取缓冲液仪器、耗材:SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳 实验步骤:众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。......阅读全文
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品
实质等同性(蛋白质组学)实验
实验材料:ESI-MS MALDI - MS 试剂、试剂盒:提取缓冲液仪器、耗材:SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳 实验步骤:众所周知,在实验室内和实验室间难
实质等同性(蛋白质组学)实验(二)
3.2 等电聚焦(IEF)各种长度(如 7 cm、13 cm、18 cm、24 cm ) 和不同 pH 范围的固定化 pH 梯度 ( IPG ) 胶条可供使用。IPG 胶条常在 20℃ 下(温度低于 20℃ 可导致尿素结晶)于适量水化液中水化过夜(16 h ) 。这可在溶胀托盘 ( re-s
实质等同性(蛋白质组学)实验(一)
实验材料 ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒 提取缓冲液仪器、耗材 SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小
实质等同性(蛋白质组学)实验(三)
3.4 凝胶染色为了用蛋白质组学研究 2D 胶上蛋白点,染色必须与质谱分析兼容,且灵敏度越高越 好。符合这些标准的染色法有好几种可供使用,包括胶体考染、某些银染和各种荧光染剂,如 Sypro Ruby、Orange、Deep Purple 和 Flamingo。胶体考染灵敏性不如银染和荧
实质等同性(代谢组学)实验
实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试
实质等同性(转录组学)实验
实验材料小麦试剂、试剂盒β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index. htm
实质等同性(代谢组学)实验
实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试验或温室
实质等同性(转录组学)实验
实验材料:小麦 试剂、试剂盒:β-巯基乙醇 氯仿
实质等同性(代谢组学)实验
实验材料:SIMCA - P 多变量统计软件 试剂、试剂盒:[ 1H ] - NMR 抽提剂 仪器、耗材:Eppendorf 聚丙稀管 NMR 管
实质等同性(转录组学)实验2
3.9 芯片数据介绍对简单的实质等同性实验来说,一个比较转基因系与对照之间基因表达的散点图就已足够了。文献 [ 5 ] 中参与两个实验的样品都标注在图15. 2中。结果用 GeneSpring 软件包显示,绘制了每组比较小麦系之间每个基因成对的平均强度,并突出显示少数感兴趣的基因(统计上显著差异表达
实质等同性(转录组学)实验(四)
3.9 芯片数据介绍对简单的实质等同性实验来说,一个比较转基因系与对照之间基因表达的散点图就已足够了。文献 [ 5 ] 中参与两个实验的样品都标注在图15. 2中。结果用 GeneSpring 软件包显示,绘制了每组比较小麦系之间每个基因成对的平均强度,并突出显示少数感兴趣的基因(统计上显著
实质等同性(转录组学)实验(五)
3.13 实时 RT- PCR 验证转录组数据有两种常用的基因(扩增子)定量检测方法:基因特异荧光探针(如 TaqMan chemistry) 或者特异双链 DNA 结合试剂(SYBR green chemistry ) [22]。我们通过实时 RT-PCR,选择 SYBR green che
实质等同性(转录组学)实验(一)
实验材料 小麦试剂、试剂盒 β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤 3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index.
实质等同性(转录组学)实验(三)
3.5 cDNA 合成( 1 ) 加 100 μg DNA 酶处理过的总 RNA ( 不超过 20 μl) 、8 μl oligo (dT)23 锚定引物和无核酸酶水至终体积 28 μl。( 2 ) 将启动反应混合物在 70℃ 孵育 10 min,置于冰上 5 min。( 3 ) 向启动反应混合物
实质等同性(转录组学)实验(二)
3.4 RNA 提取3.4.1 小麦胚乳总 RNA 提取提取方法根据 Chang 等 [ 11 ] 改编而来。( 1 ) 用预冷的研钵和杵(-70°C ) 在液氮里将 2~3 g 组织磨成粉末(见注 8 ) 。( 2 ) 室温下迅速将磨碎组织转移到有 15 ml 提取缓冲液(加入 300 μl β-
实质等同性的概念
中文名称实质等同性英文名称substantial equivalence定 义系联合国经济和合作组织(OECD)于1993年提出的对新食物进行安全性评估的原则。根据该原则,若一种生物工程食物或食物成分与其相应的传统食物或食物成分基本相同,则可以认为具有相同的安全性。这一种基于比较的指导原则已被许多
关于实质等同性的基本信息介绍
生物安全的危险度评估和安全性评价表明,安全是生物技术中的核心问题,是发展生物技术的底线,但是安全问题本身也是抽象的,是动态的,其安全性标准不是绝对的和等同划一的。风险预防的目的在于在保障安全的基础上实现生物技术的良性健康发展,其含义有二,一是生物安全立法的目的不在于遏制生物技术的发展,而是推动生
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
什么是蛋白质组学
(Marc Wilkins(1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
蛋白质组学研究技术
可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,
蛋白质组学+AI技术
人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
蛋白质组学的研究内容
主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面: ①针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。 ②以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学