重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位
连锁分析寻找QTL位点，是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前，构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记，过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序，区别在于标记数量的多少。随着测序价格的不断降低，重测序高密度标记的优势将更加明显。本文介绍了伯豪客户近期的一篇使用重测序（该研究中重测序服务由伯豪生物提供）构建图谱进行QTL定位的文章。研究背景芝麻是重要的油籽作物，具有无限花序的特征，俗称“芝麻开花节节高”。但是，这样的性状使种子不同时间成熟，极不利于作物收集，影响农产品质量。图1. 无限花序（Dt）和有限花序（dt）的形态区别。其中dt型仅在茎顶端形成花簇。技术路线研究结果在此前的QTL定位研究中，使用构建的芝麻遗传图谱远未达到饱和。这项研究使用了全基因组重测序策略，对两种生长特征的亲本和其F2群体构......阅读全文
榕树气生根发育、性别决定和榕蜂协同多样化的分子机制
榕属植物是热带雨林的关键类群，具有极高的物种多样性、生活型多样性。榕属植物和与传粉榕小蜂有的高度专性共生关系，在探讨物种形成、动植物协同进化等方面均具有重要的研究价值，然而榕树和榕小蜂高质量参考基因组信息的缺乏，严重制约了以上榕树相关问题的深入研究。 10月8日，中国科学院西双版纳热带植物园陈
构建单细胞图谱，将心脏细胞重编程为健康的心肌细胞
每年有79万名美国人遭受心脏病发作，这会让受损的瘢痕组织存在于心脏中，并限制心脏的高效跳动能力。但是，如果科学家们能够将称为成纤维细胞的瘢痕组织细胞重编程为健康的心肌细胞会怎样呢？人们通过实验室实验和小鼠研究在这方面取得了很大进展，但人类心脏重编程仍然是一项巨大的挑战。 如今，在一项新的研究中
烟草所填补烤烟烘烤特性遗传分析研究空白
近日，中国农业科学院烟草研究所和山东省烟草公司共同承担的中国烟草总公司科技重点项目“烤烟烘烤特性遗传分析及QTL定位研究”通过了由国家烟草专卖局科技司组织的项目鉴定。 鉴定委员会认为，该项目在烤烟烘烤特性遗传效应、高密度分子遗传连锁图谱构建、QTL定位及分子标记的挖掘与验证等方面取得了创新性成
PacBio助力感染菌株基因组重测序
Andrew Kasarskis博士是Icahn基因中心遗传与基因组中心的副主任。他目前领导着一些专攻治疗和诊断的合作项目，而他自己的研究也主要在病原体检测，药物基因组学，睡眠与遗传的关系几个方面展开。在加入西奈山之前，他曾经就职于PacBio，Sage Bionetworks和Merck。他有
973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展
在973计划的支持下，中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱，为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路，并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。 黄瓜是最重要
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源：英国《新科学家》网站 20年前，科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸（DNA），其实，他们漏掉了少许。现在，由于读取DNA方法的改进，科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了！据生物预印本网站（biorxiv）近日报道，美国科学家对全部
科学家构建高质量金粟兰基因组图谱
11月26日，《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究，这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息，为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树，对了解被子植物的
荧光原位杂交用于基因染色体定位和基因图谱绘制
目前应用的基因定位的主要方法是FISH。分离到的DNA序列直接通过FISH,同时采用多种颜色荧光素的标记探针，结合中期染色体和间期细胞方面的信息，可快速确定一-系列DNA序列之间的相互次序和距离，完成基因制图。用不同颜色炎光索标记2个不同的DNA链，而且他们在染色体上的距离大于1Mbp时，可以依
烟草基因组计划
生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因，全面揭示种质资源的遗传背景，确立我国在烟草基因组研究上的核心优势，对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作
植物分子育种主要包括哪些内容
名词概述分子育种，就是将基因工程应用于育种工作中，通过基因导入，从而培育出一定要求的新品种的育种方法。动物分子育种方法主要是以分子标记为基础进行标记辅助选择，然后以转基因技术为基础进行转基因育种。是按照人们的愿望，进行严密的设计，通过体外 DNA重组技术 和 DNA转移技术，有目的地改造生物种性，使
全基因组重测序的生物信息分析内容
1．数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计，测序深度分析。2．一致性序列组装与参考基因组序列（Reference genome sequence）的比对分析，利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型，并组装出该个体
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
我科学家搭建超级杂交稻产量基因解析平台
美国《国家科学院院刊》(PNAS)杂志日前在线发表了一篇关于解析超级杂交稻产量相关基因遗传位点的最新研究论文，这项由中国水稻研究所、深圳华大基因研究院和中国科学院遗传与发育研究所等合作的科研成果，为解析与超级杂交稻产量有关的基因位点提供了宝贵的材料和有效的平台。 中国的杂交稻为世界粮食生产
PNAS：科学家搭建超级杂交稻产量基因解析平台
记者从中国农科院获悉，美国《国家科学院院刊》(PNAS)杂志日前在线发表了一篇关于解析超级杂交稻产量相关基因遗传位点的最新研究论文，这项由中国水稻研究所、深圳华大基因研究院和中国科学院遗传与发育研究所等合作的科研成果，为解析与超级杂交稻产量有关的基因位点提供了宝贵的材料和有效的平台。 中国
小麦基因组测序－为第三代育种绘制“高清地图”
不久前，中国科学院遗传与发育生物学研究所发表于国际著名期刊《自然》的论文称，该所研究团队已完成小麦A基因组测序和染色体精细图谱绘制。这是继2013年，该团队成功绘制出小麦A基因组祖先种乌拉尔图小麦基因组草图并发表于《自然》之后，在此领域的又一项重大成果。图片来源于网络 中国科学院遗传与发育生
基因定位的概念
基因定位是指基因所属连锁群或染色体以及基因在染色体上的位置的测定。基因定位是遗传学研究中的重要环节，是遗传学研究中的一项基本工作。
基因定位的定义
基因定位是指基因所属连锁群或染色体以及基因在染色体上的位置的测定。基因定位是遗传学研究中的重要环节，是遗传学研究中的一项基本工作。
基因定位的应用
基因定位和基因图对遗传学、医学和人类及生物进化的研究都有十分重要的意义。它可提供遗传病和其他疾病的诊断的遗传信息，可以指导对这些疾病的致病基因的克隆和对病症病因的分析与认识，这些又取决于遗传图和物理图的相互依赖关系。通过多态位点标记进行连锁分析获得物理图的位置有助于遗传作图，同时通过连锁分析（部
中科院学者Nature－Protocols：空间转录组测序新技术
在真核细胞中，转录组的空间组织已经成为调节RNA转录后命运的一种有力手段，但是一般研究采用的是原位杂交或者原位的荧光染色，这项技术操作困难且通量低。近期来自中科院生物化学与细胞生物学研究所细胞生物学国家重点实验室等处的研究人员作建立了一种可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱的技术方法：G
橡胶密度计用途以及密度测量目的
橡胶密度计用途 测量固体状产品的密度、DIN体积磨耗量、ARI磨耗量指数、阿克隆磨耗量、膨胀率、体积等数据。应用行业包括：如橡胶制品、轮胎、高分子、复合材料、鞋材、弹性材料、输送带、传动皮带、鞋底、软质合成皮、皮革等材质、新材料研究实验室…等领域。亦一样可以应用于其它固体状产品密度的测量。
Cell：构建人类免疫细胞图谱，确定遗传变异对基因影响
比较任何两个人的DNA，你会发现他们的遗传密码中的数百万个位点存在着不同。如今，在一项新的研究中，来自美国拉霍亚免疫学研究所（LJI）的研究人员分享了大量数据，这些数据对于破译这种自然遗传变异如何影响免疫系统保护我们健康的能力至关重要。相关研究结果于2018年11月15日在线发表在Cell期刊上
首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的？其背后的基因“开关”在哪里？近日，华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位，成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》（Advanced Science）。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’，将
华人学者构建新的大脑图谱
最近，南加州大学（USC）的科学家们，绘制了小鼠大脑的一个未知部分，可解释亨廷顿氏中和自闭症这类疾病中可能发生了哪些电路中断。 本文通讯作者、南加州大学Mark and Mary Stevens神经影像和信息学研究所的神经学副教授董宏伟（音译，Hong-Wei Dong）和他的同事们，在过去的
基因定位概述
基因组是生物的生殖细胞中所含全部基因的总和。人类基因组具有极其复杂的结构，其编码蛋白质的结构基因大约有100 000个，每个单倍体DNA含有3.2×109 bp，分布在24条常染色体和X，Y性染色体上。此外，还含有大量的非编码的重复DNA序列。基因定位（gene location)是
2019年中国基因测序产业全景图谱
近年来，基因测序行业得到迅速发展，吸引了大量资本和企业的进入。目前，在行业上游仪器设备环节，国外企业竞争优势显著，而在国内的基因测序与应用终端领域华大基因竞争力强劲。但是，基因测序技术在终端应用领域还未实现完全推广，未来发展仍具有巨大的想象空间。全景图：下游应用领域广泛，但尚未完全推广 从基因
测序与芯片定位葡萄膜黑色素瘤关键基因
英法两国的研究人员通过测序和芯片分析，发现了与葡萄膜黑色素瘤中选择性剪接相关的SF3B1突变。这一突变与预后良好相关，有望指导疾病的临床管理。这项研究成果于近日发表在《Cancer Discovery》(2012年影响因子：10.143)上。 葡萄膜黑色素瘤(uveal melan
abb定位器的组成以及安装事项
abb定位器由执行机构、阀瓣、先导阀、弹簧、反馈杆和电机等组成。随着执行机构气室内部压力增加，执行机构推杆下降，通过反馈杆把执行机构推杆位移的变化传达到滑板，位移变化又传达到量程反馈杆，拉动量程弹簧。线轴回到原位，阀瓣重新堵住底座，停止气压输入到执行机构。当执行机构的运动停止时，定位器保持稳定状
夏庆友：家蚕基因研究致力改善民生
“以前的研究只是单纯的几个方面，如今的成果不仅是全方位的，而且将被更好地运用到改善民生上。”在近日举行的第二届家蚕功能基因组学与现代丝绸之路国际研讨会上，西南大学教授、我国家蚕重要经济性状功能基因组和遗传改良研究首席科学家夏庆友接受《科学时报》采访时，这样评价我国家蚕基因的研究成果。 该
新的DNA测序技术有助绘制大量的疾病基因图谱
瑞典科学家再次研发出新的DNA测序技术，有助绘制大量的疾病基因图谱 瑞典医科大学卡罗林斯卡研究院的科学家发展出一种新的DNA测序技术，这种新的技术比现阶段实验室运用的测序技术更廉价。他们希望这种新的技术可用于绘制大量的疾病基因图谱，这意味着将在很多疾病的治疗上取得更快的突破。 通过绘制基因图谱，
用缺失定位法进行基因定位
缺失定位法一个细胞中的两个同源染色体中的一个上有一个突变基因，另一染色体上有一小段已知范围的缺失，如果这一突变基因的位置在缺失范围内，便不可能通过重组而得到野生型重组体；如果突变基因不在缺失范围内，那么就可以得到野生型重组体。利用一系列已知缺失位置和范围的缺失突变型，便能测定突变型基因的位置。