共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能
lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点，但是，目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计，目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此，怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢？针对lncRNA和mRNA的共表达研究，为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提供了一种简单有效的方法。研究背景烟雾病（MMD）是一种原因不明、慢性进行性的脑血管闭塞性疾病，主要表现为单侧或双侧颈内动脉远端大脑中动脉和大脑前动脉近端狭窄或闭塞伴脑底部和软脑膜烟雾状、细小血管形成。临床表现主要有脑缺血、脑出血及癫痫等。目前对于MMD的发病机理还不清楚，因此，挖掘与MMD发病相关的功能基因有助于MMD的诊断与治疗。本研究从lncRNA和mRNA出发，运用共表达分析方法，挖掘了与MMD相关的lncRNA，为理解lncRNA在MMD中的作用提供了基础。研究结果1 MMD特异性差异基因筛选为寻找和MMD发病相关的lncRNA，......阅读全文
首次揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖...
首次揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移文章导读前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，
Cell子刊：重编程过程中的lncRNA动态
利用体细胞重编程生成诱导多能干细胞的技术称为iPS，该技术生成的诱导多能干细胞（iPSC）理论上可以生成任何类型的细胞。现在这一技术已经渗透到了生命科学的各个领域，帮助研究者们寻找致病基因、进行药物研发和开发细胞疗法。 全面挖掘iPS技术的临床潜力，需要详细了解重编程各个阶段发生的细胞事件。为
挖掘法对水稻根系分析的研究
对农作物根系的研究，从古至今一直就在研究中，特别是最近二三十年发展起来的影像技术更是使得在田间定点观测根系的生长和形态成为可能，在国内的很多地方都在使用根系分析仪或者根系分析系统等精密仪器进行分析测定。今天主要是简单介绍一种对水稻根系研究的方法供大家参考阅读。水稻根系由于纤细并长期生长在淹水环境中，
为lncRNA跨物种鉴定以及功能分析提供重要方法和工具
近日，中国科学院北京基因组研究所在国际生物多样性与健康大数据（Global Biodiversity & Health Big Data，简称BHBD）联盟框架下，与沙特阿卜杜拉国王科技大学、巴基斯坦真纳大学以及美国梅奥医学院开展科研合作，联合开发了可跨物种使用的长非编码RNA（long non
Nature－子刊：研究lncRNA功能的新方法
长非编码RNA（lncRNA）是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质，但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，有的位于基因间或者内含子中。
Cell子刊：超保守lncRNA的重要功能
谈到遗传物质，我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA（脱氧核糖核酸）。这些DNA会转录成为RNA，进而指导各种蛋白质的合成，例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外，细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。 MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA，这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭
我国学者成功挖掘和识别哺乳动物环形RNA功能
2019年3月19日，国际学术期刊Cell Reports 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为“Expanded expression landscape and prioritization of circular RNAs in mammals”的最新研究
孕妇要多补充蛋白质，不然baby肾里的lncRNA会异常
大鼠是常用的疾病研究模型，通过该模型，我们能理解很多在人体内无法直接去研究的疾病。低体重儿，一种常见的由于孕妇缺乏足够蛋白摄入而引起的常见疾病。来自苏州大学儿童医院的研究发现低体重儿的肾脏lncRNA表达模式会发生变化。 研究背景 低体重儿是一种常见的疾病，由于宫内生长受限（IUGR
揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移
前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前，已有报道指出许多明星Ln
长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展
6月13日，Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队，关于长链非编码RNA（lncRNA）编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides En
刘春宇陈超课题组在Science揭示精神疾病发病机理
国际顶级学术期刊Science（IF = 41.06）和Science Translational Medicine（IF = 16.71）同期发表了中南大学生命科学学院、医学遗传学研究中心刘春宇教授和陈超副教授团队的3项重要研究成果。这些研究发现加深了我们对精神分裂症、双向情感障碍和自闭症发病
科研人员发现鸡脂肪肝综合征表观遗传标记
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所鸡遗传育种创新团队在鸡脂肪肝相关研究方面取得重要进展，该团队通过DNA甲基化测序与LncRNA测序等手段发现了与鸡脂肪肝相关的重要表观标记。相关研究成果发表于《分子生物学国际期刊》。 鸡脂肪肝综合征（FLS）是一种以肝脏肿大、肝细胞发生严重脂肪变性为特征
葛根营养及功能挖掘研究获新进展
近日，国家中药材产业技术体系岗位科学家、华南农业大学食品学院教授杜冰团队从葛根蛋白中分离出新型抗氧化多肽YLWVGA，并揭示了其通过调控Keap1/Nrf2信号通路缓解HepG2细胞氧化损伤的分子机制。相关成果发表于《食品化学》（Food Chemistry）。氧化应激是由活性氧过剩和抗氧化防御减弱
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
有哪些工具或方法可以用于分析－Immune－Cell－Atlas－数据集？
以下是一些可用于分析 Immune Cell Atlas 数据集的工具和方法： 1. **Seurat**：这是一个常用的 R 包，用于单细胞 RNA 测序数据的分析，包括数据预处理、降维、聚类、差异表达分析等。 2. **Scanpy**：Python 中的单细胞分析库，提供了一系列数据分析和可
调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来的药物设计。相关论文 发布在12月16日的《自然》（Natur
SCI文章解析lncRNA－UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移
中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究，在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期，该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课
华人学者Cancer－Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
ncRNA－UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移
中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究，在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期，该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课题组筛
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有1
中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能
来自中科大的消息，中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT，并发现在灵长类中，5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的
T细胞的生物学功能
T细胞是淋巴细胞的主要组分，它具有多种生物学功能，如直接杀伤靶细胞，辅助或抑制B细胞产生抗体，对特异性抗原和促有丝分裂原的应答反应以及产生细胞因子等，是身体中为抵御疾病感染、肿瘤而形成的英勇斗士。T细胞产生的免疫应答是细胞免疫，细胞免疫的效应形式主要有两种：与靶细胞特异性结合，破坏靶细胞膜，直接杀伤
冈崎片段的生物学功能
新合成的DNA，即冈崎片段，由DNA连接酶结合，形成新的DNA链。当DNA合成时，会产生两条链。前导链是连续合成的，并在此过程中被延长，以便用于后滞链（冈崎片段）复制的模板能够暴露出来。在DNA复制过程中，后滞链中的DNA和RNA引物会被去除，方便与冈崎片段的结合。由于这个过程很常见，冈崎片段在完成
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日，华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列，不仅可以对已知lncRNA进行定量分析，还可对 novel lnc
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究...
lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究非酒精性脂肪肝发生机制利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝对于很多小伙伴们，特别是医院的工作人员，除了每天繁忙的门诊工作之外，还需要挤出时间来做科研，发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单，又快速地发表还可以的影响因子（3
lncRNA芯片脂肪肝中分子特异性非酒精性脂肪肝发生机制
伯豪客户利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝 对于很多小伙伴们，特别是医院的工作人员，除了每天繁忙的门诊工作之外，还需要挤出时间来做科研，发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单，又快速地发表还可以的影响因子（3分以上）的文章呢？小编告诉您，是可以的。那么，需要满足哪几
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析
近日，南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果，以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析
Nature子刊|联合南京医科大发表重要研究成果：揭示lncRNA促进胃癌进展的新机制 近日，南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果，以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge
lncRNA在农业领域的研究成果（一）
miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错！不是标题党。说到miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar，想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题，大阅哥呕心沥