长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展
6月13日，Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队，关于长链非编码RNA（lncRNA）编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides Encoded by Long Noncoding RNAs。 lncRNAs被认为是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的非编码RNAs转录本。然而，研究表明，较多lncRNAs转录本中的小开放阅读框（small open reading frame，smORFs）可以编码多肽（smORF encoded polypeptides，SEPs），后者可广泛参与肌肉形成、粘膜免疫、RNA脱帽及肿瘤增殖等生物学过程。考虑到lncRNAs转录本及其smORFs的庞大数量，SEPs或代表着一个被忽视且待开发的富含蛋白质活性调节因子的宝库......阅读全文
长链非编码－RNA－测序案例分析
背景：人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加，因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的：利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析，探讨其对 mRNA 选择性剪接的
长链非编码－RNA（lncRNA）研究策略
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子，它们不编码蛋白，位于细胞核或胞质内，具有保守的二级结构。研究显示，lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能，它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA)，但是至今为止，人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明，两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录，而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA（lncRNA）是一类异质性的非编码RNA，根据lncRNA的功能，可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
长链非编码RNA:－从科研到临床
长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构
长链非编码RNA:－从科研到临床（一）
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色，近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76％，但转录产物中只有不到2％是编码蛋白质的mRNA，其他均为非编码RNA，其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA（circRNA）等调控
长链非编码RNA:－从科研到临床（二）
脂类代谢和脂肪生成最新的研究表明，lncRNA控制肝脏中的脂类代谢，调控脂肪生成，从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接，它还介
长链非编码RNA:－从科研到临床（三）
肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGF β1、PAI 1等因子的高表达。相反，敲除P
调节免疫应答的新途径——长链非编码RNA
“我们需要知道细菌感染引发的炎症反应是由什么来调节该过程的。”该研究的领导者，UTA大学化学副教授Subhrangsu Mandal说。 “如果我们能做到这一点，我们就可以控制中枢神经系统炎症性疾病，迄今为止这些疾病一直难以治疗，如败血症和脑膜炎，以及癌症和肌肉营养不良，它们也可以看作一种炎症
科学家发现长链非编码RNA作用新模式
中国工程院院士、中国医学科学院院长曹雪涛带领课题组发现，长链非编码RNA(lncRNA)可通过直接结合细胞浆中的信号转导蛋白分子并影响其磷酸化的新方式而调控免疫细胞的分化发育与功能。该成果为研究lncRNA发挥生物学效应的作用机制提出了新观点，并为免疫细胞分化发育与功能调控研究提出了新方向。相关
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日，华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列，不仅可以对已知lncRNA进行定量分析，还可对 novel lnc
长链非编码RNA对脑生长起重要作用
“长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里，我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制，”Puthanveettil说。 RNA是细胞的主要调节因子，是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链，虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究，发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解，肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症，其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而，空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
中国科大在动物长链非编码RNA研究中取得进展
中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》（Genome Biology）发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章，报道了
长非编码RNA与肺癌转移
我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白，不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了，近年来人们又发现了一类长非编码RNA，这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。 长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细
长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展
6月13日，Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队，关于长链非编码RNA（lncRNA）编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides En
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有1
同济大学教授最新文章：癌症与长链非编码RNA
同济大学生命科学与技术学院的研究人员发表了题为“HULC cooperates with MALAT1 to aggravate liver cancer stem cells growth through telomere repeat-binding factor 2”的文章，长链非编码RNA－
中国科大在长链非编码RNA调控肿瘤形成研究中取得进展
7月1日，中国科学技术大学生命科学学院教授梅一德研究组在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上在线发表题为Long noncoding RNA EMS connects c-Myc to cell cycle control and tumorigenesis的研究论文。 c-Myc作为促癌蛋白
CRISPR新成果：－针对长链非编码RNA的完全敲除高通量筛选
之前的方法在效率、质量（假阳性、假阴性）上各有欠缺：比如CRISPRi的方法只能实现基因表达抑制而不是完全敲除，CRISPRa的方法只能上调基因表达，无法对基因不可或缺的作用实施筛选评估。大片段删除的策略由于步骤的繁琐，也限制了其在更大规模上得到应用。 作为强大的基因编辑工具，CRISPR/C
如何揭开长非编码RNA的神秘面纱
长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本，但并不编码任何蛋白质。尽管如此，长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，
陈润生院士、赵春华教授Cell子刊解析长链非编码RNA
来自中科院生物物理研究所、中国医学科学院的研究人员证实，长链非编码RNA ADINR通过在转录水平上激活C/EBPα调控了脂肪生成。这项研究发布在10月15日的《Stem Cell Reports》杂志上。 中科院生物物理研究所的陈润生（Runsheng Chen）院士和中国医学科学院的赵春华
上海巴斯德所等揭示长链非编码RNA调控HIV复制新机制
2月21日，国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所王建华课题组的研究论文“Long noncoding RNA MALAT1 releases epigenetic silencing of HIV-1 replication
我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式
国际学术期刊Cell Stem Cell（《细胞·干细胞》）于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel
Cell－Death－and－Disease－长链非编码RNAMEG3抑制肝癌发生新机制
母源性印记基因MEG3是一种长链非编码RNA，在大多数肿瘤中呈低表达，且有抑制肿瘤生长的功能，但其作用的分子机制不详。 最近同济大学生命科学技术学院的陆东东教授课题组和东方医院肝病科合作研究发现，MEG3在人类肝癌组织中表达极低, 且能抑制肝癌细胞的体内外生长。 研究结果显示，MEG3促进
长链非编码RNA在沙棘果实花青素合成中的调控作用研究
沙棘（拉丁学名：Hippophae rhamnoides Linn.）是一种落叶性灌木，其特性是耐旱、抗风沙，可以在盐碱化土地上生存，因此被广泛用于水土保持。中国西北部大量种植沙棘，用于沙漠绿化。沙棘果实中维生素C含量高，素有维生素C之王的美称。沙棘是植物和其果实的统称。植物沙棘为胡颓子科沙棘属
长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础
近日，中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作，揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati
孙树汉：长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究
10月31日，2014（第二届）非编码RNA学术研讨会继续在上海好望角大饭店（中科院上海学术活动中心）如火如荼地进行。 来自第二军医大学遗传学教研室的孙树汉教授介绍了长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究。在研究非编码RNA肝炎病毒致癌过程的作用中，该课题组发现在HCV中，miR-155表