lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究...
lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究非酒精性脂肪肝发生机制利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝对于很多小伙伴们,特别是医院的工作人员,除了每天繁忙的门诊工作之外,还需要挤出时间来做科研,发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单,又快速地发表还可以的影响因子(3分以上)的文章呢?小编告诉您,是可以的。那么,需要满足哪几个条件呢?通过《International Journal of Molecular Sciences》上一个案例,我们来一一破解。研究主题每一个科研领域的小伙伴们,所在的科室,实验室都会有一个研究的方向。那么,我们的目的就是从分子角度去选择一个点,来解释这个问题。问题很简单,相对正常,脂肪肝模型中有哪些特异性表达的分子,他们怎么就影响了脂肪肝的形成。研究材料做实验总要有实验材料,凭空想象是想不出数据的。在这里,研究人员以高脂肪喂育的小鼠模型(NAFLD)和正常小鼠的肝脏为......阅读全文
挑选基因芯片的小技巧
上一期给大家聊了聊芯片vs RNA-seq哪个好(点我点我),但很多同学可能会发现,市场上的基因芯片有好多种啊,不知从何入手?今天就来818挑选基因芯片的小技巧。一句话—— 看研究目的。先给大家科普两个词:基因表达量:检测基因表达量的芯片一般针对某个基因的的所有转录本设计探针,经过对每个探针信号的算
应用Arraystar-ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期,其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明,Tug1能够直接结
首次揭示Y染色体上LncRNA-TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖...
首次揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移文章导读前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,
Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27
新洞察!科学家发现一个有希望的预后和治疗靶点
肝细胞癌(Hcc)是肝癌的主要类型,占总诊断率和死亡率的很大比例,其发病率在高发病率地区呈上升趋势,在许多低发病率地区呈下降趋势,这是由于受潜在危险因素影响,如:地理差异、乙型肝炎/丙型肝炎病毒的流行、饮酒水平、代谢综合征和非酒精性脂肪性肝病的发病率等。 目前,尽管肝癌的诊断和治疗策略正在不断
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
lncRNA在农业领域的研究成果(三)
【结论】①通过lncRNA测序,在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达,其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异,在V级花蕾中特异
科研人员揭示结核抵抗者外泌体lncRNA调控训练免疫新机制
训练免疫是指固有免疫细胞通过表观遗传修饰与代谢重编程,对再次刺激产生的长效、非特异性增强反应。结核病是由结核分枝杆菌(Mtb)引起的慢性传染病,结核病抵抗者是一类与患者持续密切接触却未出现感染症状的特殊人群,这类人群缺乏典型的Mtb抗原特异性T细胞免疫应答,这提示或可在感染早期,通过固有免疫高效清除
科研团队发现防治非酒精性脂肪肝新策略
中国工程院院士、哈尔滨医科大学药理学教授杨宝峰团队首次发现类泛素化分离蛋白1(CAND1)能够抑制非酒精性脂肪肝的发生发展,增强CAND1的功能有望成为非酒精性脂肪肝治疗的新策略。相关研究成果近日在线发表于《自然·通讯》。 据介绍,非酒精性脂肪肝是指不是由酒精滥用和病毒性肝炎、自身免疫性肝炎等
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
猪等位基因特异性表达的时空特异性首获系统研究
近日,我国学者首次系统研究了猪等位基因特异性表达(ASE)的时空特异性,揭示了在不同发育时期、不同组织中的亲本决定型和等位基因型决定型两种ASE类型。相关成果在线发表于《自然-通讯》杂志。现代养猪产业普遍采用专门化品系选育和配套系杂交,其目的是充分利用杂种优势。基因表达调控是将基因型转化为表型的关键
Scientific-Reports:miRNA调控脂肪肝中的肝细胞激活和增殖
非酒精性纤维化脂肪肝是贯穿非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的一个统一过程。MicroRNAs(miRNAs)已被证明在肝脏疾病中调节细胞过程。然而,miRNA在非酒精性纤维化脂肪肝中的作用在很大程度上还是未知的。 在这项研究中,河北医科大学南月敏教授领衔的课题组以蛋氨酸胆碱缺乏(MCD)饮食诱
应用Arraystar-ChIRP测序和RNA测序于糖尿病性肾病研究
美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心Farhad R. Danesh教授主要从事肾脏病理的基础与临床研究。近期,其实验室通过Arraystar RNA-seq发现lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠体内低表达。表达谱芯片及Arraystar CHIRP-seq等证明,Tug1能够直接结合PGC
药物筛选中分子生物学技术的应用研究
【引言】药物筛选是药物研发过程中的重要环节,它是针对有可能药用的各类物质,包括各类蛋白多肽、化合物、天然及海洋产物等,运用一定的筛选方法和技术,对其内部可能存在的具有药理作用的活性物质进行检测,并利用相应的方法,进行药用成分的提取与合成。药物筛选在药物的实验室研究到临床应用之间发挥了核心的桥梁作用。
microRNA-芯片与表达谱芯片的联合应用
microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前, 国际上许多科研
我国研究团队发现肝癌新型ceRNA调控靶点
肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌的主要类型,在我国肝癌患者中占75%~85%。深入阐明HCC发病和进展的肿瘤特异性机制,对于寻找HCC新的治疗靶点、制定治疗策略至关重要。 近日,中国中医科学院研究团队使用微阵列(GSE166163)分析了HCC患者的肝癌组织及癌旁正常组织中lncRNA、miRN
如何研究lncRNA?三位科学家现身说法
人生如戏,相信长链非编码RNA(lncRNA)也体会到了。之前一直遭冷遇,如今却是万人迷。其实,人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据,人类基因组中包含16,000条lncRNA,产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据,目前已知
牡蛎多糖应用于非酒精性脂肪肝防治研究获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500045.shtm
上皮调节蛋白促进唾液腺腺样囊性癌的肺转移
研究背景: 唾液腺腺样囊性癌(Salivary adenoid cystic carcinoma, SACC)是常见的唾液腺恶性肿瘤之一,其特点是肿瘤生长缓慢,侵袭性强,肺转移率高,预后差。上皮调节蛋白是表皮生长因子家族的成员,有多种生物功能,如抑制某些肿瘤细胞生长、促进纤维细胞等多种细胞
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究
安捷伦科技推出最新版基因表达微阵列程序
加利福尼亚州圣克拉拉,2015年6月8日-安捷伦科技公司今日宣布更新其用于分析人类、小鼠和大鼠模型信使RNA的SurePrint基因表达微阵列应用程序。更新后的应用程序增加了编码和非编码的内容,将成为研究人员调查表达模式的一个非常方便的平台。 安捷伦科技公司开发出的最新版旗舰SurePrint
顶级科学家张毅Cell子刊聚焦lncRNA
来自哈佛医学院、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,一种叫做DEANR1的lncRNA通过激活FOXA2表达促进了人类内胚层分化。这一重要的研究发现发表在4月2日的《Cell Reports》杂志上。 著名华人科学家张毅(Yi Zhang)教授及Wei Jiang博士是这篇论文的共同通讯作者。几
lncRNA功能机制研究(一)
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
lncRNA功能机制研究(二)
实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
南京医科大学最新文章:癌细胞中的RNA表达模式
系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA,来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索,旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR
JCAD通过抑制LATS2激酶活性促进非酒精性脂肪肝向肝癌发展
非酒精性脂肪肝(NAFLD)是一种由于代谢紊乱引起的肝炎,也是肝癌(NASH-HCC)发生的重要来源之一。但是,对于NAFFLD如何向NASH-HCC发展的分子机制还不了解。来自复旦大学医学院的研究人员,通过石蜡包埋样本的检测与后续功能验证,找到了一个肥胖相关基因,KIAA1462(JCAD),
发现lncRNA-CAAlnc1在癌性恶病质脂肪丢失中的重要作用
2月26日,国际学术期刊International Journal of Cancer 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所冯英研究组和复旦大学附属中山医院吴国豪研究组的最新合作研究成果“Cachexia-related long noncoding RNA, CAAlnc1, suppre
科学家发现长链非编码RNA作用新模式
中国工程院院士、中国医学科学院院长曹雪涛带领课题组发现,长链非编码RNA(lncRNA)可通过直接结合细胞浆中的信号转导蛋白分子并影响其磷酸化的新方式而调控免疫细胞的分化发育与功能。该成果为研究lncRNA发挥生物学效应的作用机制提出了新观点,并为免疫细胞分化发育与功能调控研究提出了新方向。相关
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制
外泌体是细胞间传递信号的媒介,直径在30-200nm,表面具有磷脂双分子层,内部具有丰富内含物的小囊泡,其内含物包括miRNA,环状RNA,LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology(影响因子:19)的文章为例,看一看外泌体中LncRNA的功能机制是如何研究的。