定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标记多肽的氨基基团,然后进行串联质谱分析,可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。iTRAQ/TMT试剂由三部分组成:报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-10种等质量同位素标签。iTRAQ/TMT试剂标记酶解后的肽段,可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中,来自于不同样本的同一肽段,标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中,报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂,带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子,根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息,再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。其基本原......阅读全文

蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压

  慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面系统性的分析。   Proteomic and p

蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压

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杭师大沈波组:水稻叶片衰老相关定量蛋白质组学分析

  水稻是重要的粮食作物之一,随着人口的增长,人类对大米的需求不断增加。为确保粮食安全,提高水稻生产成为人类的首要任务之一。但是,水稻籽粒的产量往往受到叶片衰老的严重影响。例如,梁优培9号(LYP9)超级杂交稻具有较高的抗病性优势,但对衰老较敏感,常导致水稻产量下降。因此,了解水稻叶片的衰老机制将有

精彩不断,ASMS-2020-11大主题探讨质谱应用最新进展

  分析测试百科网讯 2020年6月2日,万众瞩目的美国质谱年会如期举行。在今天的大会上,颁发了AI Yergey质谱科学家奖和JOHN B. FENN杰出贡献奖,以奖章对质谱科学研究有重大贡献的学者。今年的AI Yergey质谱科学家奖是加州大学洛杉矶分校的Rachel O. Loo教授。JOHN

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术

2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享

探寻肿瘤标志物

肿瘤标志物是能够反映肿瘤存在的化学物质,其存在或量变可提示肿瘤的性质,借此了解肿瘤的组织发生、细胞分化、细胞功能,帮助肿瘤的诊断、分类、预后判断以及治疗指导。本文介绍了应用iTRAQ试剂和MALDI-TOF/TOF找寻退行性神经间质瘤生物标志物的方法。 本实验旨在应用iTRAQ试剂和MAL

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(三)

人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的,将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识,同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设,以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具,使得人类能够横跨癌症基因组

10标串联质谱标签(TMT)能更快速定量肿瘤蛋白

  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通路的鉴定。图片来源于网络  然而,实体瘤组织在组成上比细胞系要复

Orbitrap在植物蛋白质组领域的应用

蛋白质组学技术已经成为植物科学研究中重要的工具,以Orbitrap为代表的高分辨质谱技术已在植物蛋白质研究领域产生重要的科研成果,发表在Nature Plant,Plant Cell 等核心期刊上。 利用Orbitrap质谱可针对植物样本描绘细胞和亚细胞蛋白定位,以及追踪蛋白之间的相互作用,鉴定不同

基于质谱分析技术的蛋白质组学检测法能更有效识别肝癌

随着丙型肝炎病毒感染的不断发生,肝癌病例不断增加,这就急需一种针对肝癌的早期诊断方法。 一项发表在1月15日《临床癌症研究》(Clinical Cancer Research)杂志上的研究性文章称,一种基于质谱分析技术的蛋白质组检测比传统的生物标志物检测更为准确,可以更好地区分肝癌患者和丙型肝炎肝硬

定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密

巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤,包括动脉疾病。最近,布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析,强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同

蛋白质组学的临床科研解决方案心血管篇

  根据世界卫生组织发布的数据,心血管疾病一直是人类健康的“第一杀手”,但是相比于各种恶性肿瘤,这个“杀手”在科研领域却低调很多。究其原因,没有细胞模型,动物模型并不能完美的模拟心血管疾病发生发展的过程等等,都导致了心血管疾病的基础科研相对薄弱。但是对于临床医生,除去关心机制,我们更应该通过科研去解

蛋白质组学的临床科研解决方案心血管篇

根据世界卫生组织发布的数据,心血管疾病一直是人类健康的“第一杀手”,但是相比于各种恶性肿瘤,这个“杀手”在科研领域却低调很多。究其原因,没有细胞模型,动物模型并不能完美的模拟心血管疾病发生发展的过程等等,都导致了心血管疾病的基础科研相对薄弱。但是对于临床医生,除去关心机制,我们更应该通过科研去解决临

蛋白质组学的临床科研解决方案心血管篇

  根据世界卫生组织发布的数据,心血管疾病一直是人类健康的“第一杀手”,但是相比于各种恶性肿瘤,这个“杀手”在科研领域却低调很多。究其原因,没有细胞模型,动物模型并不能完美的模拟心血管疾病发生发展的过程等等,都导致了心血管疾病的基础科研相对薄弱。但是对于临床医生,除去关心机制,我们更应该通过科研去解

Nature-Protocols-快速重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量

  Broad研究所蛋白质组学平台的研究人员近日在《Nature Protocols》杂志上报道了一个经过优化的新流程,能够快速且重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量。  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析

Q-Exactive中TMT定量工作流程的参数优化和Proteome-Di...(四)

 图 10. 运用本研究中每个研究因素筛选蛋白质组(上图)和肽段组(下图)鉴定结果的滤筛。 图 11. 筛滤后肽段组的定量分析结果总览。 图 12. 结果中的 Abundance Ratios 栏。比值分别按 Isolation Windows 和 Quan Channel 排序。比例上调或下调的蛋

蛋白质组学实验技术大全

每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与

蛋白质组学鉴定技术流程

蛋白质组(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学(Proteomics)以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象,通过高通量的色谱质谱联用技术

普林斯顿大学引进MALDI-LTQ-Orbitrap质谱仪

普林斯顿大学引进Thermo Scientific MALDI LTQ Orbitrap质谱仪应对病毒基因组和蛋白质组研究 加州圣何塞 (August 15, 2008)—--服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技宣布,普林斯顿大学引进其新推出的MALDI LTQ Orbitrap XL™质谱仪,对病

2015CNHUPO生物质谱高级研讨会成功举办

  2015年1月22日,“2015CNHUPO生物质谱高级研讨会”在北京文津国际酒店隆重召开。此次活动以“蛋白定量”为主题,旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作。特邀Dr. Mike MacCo

蛋白质芯片技术应用与基因表达的筛选

基因表达的筛选AngelikaL.等人从人胎儿脑的cDNA文库中选出92个克隆的粗提物制成蛋白质芯片,用特异性的抗体对其也进行检测,结果的准确率在87%以上,而用传统的原位滤膜技术准确率只达到63%。与原位滤膜相比,用蛋白质芯片技术在同样面积上可容纳更多的克隆,灵敏度可达到pg级。

蛋白质定量

Quantitative Determination of Peptides by Sulfhydryl (-SH) Groups New (Contributed by David Van Horn, Dept. of Chemistry, UC Berkeley Greg Bulaj, Dept

2025蛋白质组学大会之非变性质谱分析与蛋白质结构

分会报告水雯箐 教授上海科技大学Conformational Dynamics of GPCR Signaling Complexes Revealed by Structural MS  上海科技大学水雯箐教授围绕G蛋白偶联受体(GPCR)复合物的结构动态性,展示其课题组发展、联用多种结构质谱方法

【Sci-Rep-IF5.228】iTRAQ技术研究植物胁迫

  associated near-isogenic line and its recurrent parent.   文献来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27468931   研究背景:ZmCCT,是影响植物光周期反应非常重要的一个基因。对于玉米而

张玉奎院士:蛋白质组相对定量新方法

  第5届亚洲与大洋洲质谱会议暨第33届中国质谱学会学术年会于2014年7月17日上午在北京大学盛大召开。在大会报告中,来自中国科学院大连化学物理研究所的张玉奎院士带了题为《蛋白质组相对定量新方法》的报告。中国科学院大连化学物理研究所 张玉奎院士  蛋白质组相对定量新方

应用Orbitrap-Fusion对TMT标记样本进行MS2定量方法...(二)

3.数据分析3.1 MS2 定量方法原始文件(raw file)使用Proteome Discoverer 1.4 软件搜索Uniprot_mouse.fasta 数据库( 数据库编号10090),检索结果通过严格标准进行筛选(1% FDR)。 3.1.1 鉴定结果汇总  Distribution

应用Orbitrap-Fusion对TMT标记样本进行MS2定量方法...(三)

Peptide and Unique Peptide Identified Using SPS MS3 Quantitation Method among 16 Samples  Distribution of Protein Group Identified and Quantified Usin

应用Target-MS2-方法对大鼠血浆中人重组干扰素进...(一)

应用Target MS2 方法对大鼠血浆中人重组干扰素进行绝对定量的测试 1. 前言随着蛋白质组学的不断发展,蛋白质组学已广泛深入到生物学研究的各个领域,目前,蛋白质组学研究已经由传统的大规模鉴定逐步转向了靶向蛋白质组学,研究内容已经由蛋白质鉴定扩展到了蛋白质相对和绝对定量,对复杂样本中蛋白质的相对

单细胞蛋白质组学:让细胞个体研究更加精细

    细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。    在组织、器官或个体中,细胞具有非常大的异质性,而传统的研究手段针对大量细胞进行分析,得到的是大量细胞的平均结果,无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值,从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异,不

注重实践经验!Urimarker-2020线上会前培训率先登场

  分析测试百科网讯 2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学