定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标记多肽的氨基基团,然后进行串联质谱分析,可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。iTRAQ/TMT试剂由三部分组成:报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-10种等质量同位素标签。iTRAQ/TMT试剂标记酶解后的肽段,可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中,来自于不同样本的同一肽段,标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中,报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂,带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子,根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息,再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。其基本原......阅读全文
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成细胞和生
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。 植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成
安捷伦科技资助定量蛋白质组学研究
安捷伦科技通过都柏林国立大学 Newman 奖学金计划 资助定量蛋白质组学研究 2010 年 5 月 12 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和爱尔兰都柏林市 — 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和都柏林国立大学(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben
定量蛋白质组学的优势有哪些?
质谱方法比抗体方法更先进的一个原因,就是已经开发出了一种新的定向分析技术,比生产一个新的抗体要快得多,并大大减少了检测特异性方面的问题(抗体方法存在交叉反应的问题)。 虽然抗体方法在低丰度蛋白的检测方面更加灵敏,但是质谱技术的一个明显优势就是能在单个实验中检测多种蛋白,比如说,系统生物学研究人
李兰娟院士新成果:唾液乳杆菌LI01的胆汁应激反应
最近发现几种唾液乳杆菌菌株,表现出良好的益生菌性质,如抗菌活性,炎症调节,甚至是肿瘤性病变减少等。从健康人体内分离的唾液乳杆菌LI01已经在预防和治疗肝衰竭中表现出了益生菌性质。对胆汁的耐受对于乳杆菌在胃肠道中的存活和发挥其益处至关重要。 在这项研究中,浙江大学附属第一医院的李兰娟院士所在课题
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组学研究选材四大原则
中国饮食文化博大精深,《舌尖上的中国》向世界展示了我们这个完美的吃货民族。一道成功佳肴,食材挑选有着非常严格的标准。在医学基础研究领域,实验与做菜亦有共通之处,做饭时如果偷懒,用煮过面条的汤煮馄饨,馄饨的卖相口感观感都大为降低。实验也如此,一是一,二是二,必要精确审慎,更不可以偷懒,变通条件。偷工减
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...(一)
蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并发高血压的病理机制慢性肾病病人一般会出现很多的并发症,其中大多数肾损伤晚期病人都患有严重的高血压。盐是慢性肾病和高血压发病的主要致病因素之一,但其中的病理机制仍然不清楚。本文利用蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析的技术,对慢性肾病并发高血压的病理机制进行了全面
定量蛋白数>1000个!血液样本DIA技术“质”的提升
传统的蛋白质组技术,如iTRAQ、TMT或者label-free等,采用的是DDA(data-dependent acquisition,数据依赖采集)数据采集方式,其策略是对响应最高的部分母离子进行二级采集。而新一代的蛋白质组学技术DIA(Data Independent Acquisitio
AB-Sciex视频讲座“AB-Sciex-电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”
4月12日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”的网络视频讲座。AB Sciex 亚太应用支持中心的靳文海博士首先为大家简单介绍了蛋白质组学和质谱技术发展方向,接下来重
大连化物所定量蛋白质组学新技术新方法研究取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)邹汉法、叶明亮研究员等人在定量蛋白质组学新技术新方法研究方面取得新进展。相关研究成果发表在最新一期的Angew. Chem. Int. Ed.上(2013年52卷,9205-9209页)。 该项研究工作利用胰蛋
马来酸酐二次衍生技术的定量蛋白质组学方法研究
基于马来酸酐二次衍生技术的定量蛋白质组学方法研究田姗姗1,柏雪1,翟贵金1,张锴*,1,张玉奎2(1天津医学表观遗传学协同创新中心,天津医科大学基础医学院,天津 3000702中国科学院大连化学物理研究所,国家色谱研究分析中心,辽宁省大连市 116023)摘要:定量蛋白质组学在当前生物医学研究中发挥
大样本量SNP鉴定神器MassARRAY之技术特点、实验流程
老美大当家的奥大叔似乎并不愿悄悄离去,在其任期最后一年又搞了个大动作。年初,奥叔在对国会发表的国情咨文中宣布将发起一项寻找癌症治愈疗法的“登月计划”,并任命二当家的拜登为该项目负责人。此外还有两项分别由个人(陈颂雄)和医院(美国MD安德森癌症中心)发起的癌症“登月计划”,可见老美此次是倾全国之力
首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布
近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐
定量定性蛋白质组学新工具亮相ASMS
赛默飞世尔科技在ASMS 2010展示定量定性蛋白质组学工具 美国犹他州盐湖城(2010年5月25日)– 全球服务科学领域的领导者赛默飞世尔科技,今日公布了其在蛋白质组学工具方面的重大进步,并表示这些进步将推动定量和定性蛋白质组学研究取得突破性的进展。这些新产品与赛默飞世尔科技其它的试剂和耗材
蛋白质组学几种定量方法的案例解读(二)
经典案例题目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一种基于多胺Hypusine轴(Polyamine-hypusine axis)的新型肿瘤抑制网络)期刊:Nature主要技术:iTRAQ定量文章摘要:
陈大雄最新研究:唐人街为什么不叫华人街
我是陈大雄,生物狗一枚,实验之余最大的乐趣是看电影。最近我有个疑问: 国外很多城市有专门的华人聚集点,称之为唐人街。 那么,为什么要叫"唐"人街,而不叫华人街、秦人街? 有一种常见的说法是: 唐朝当时实在是太牛X了,发展太猛了。 老外们一个个都懵逼了,甚至到了明朝, 国外还把和中国有
“Q-Exactive-蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座
9月27日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了“Q Exactive 蛋白质组学研究的综合平台”网络讲座。赛默飞世尔科技李静工程师为大家介绍了Q Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成及特点,着重讲解了Q Exactive 在蛋白质组学应用的优势。 赛默飞世尔科技
蛋白质组技术(Proteomic-Techniques)
一、研究材料1995年,Wasinger等在第一篇蛋白质组研究文章中研究的对象为目前已知最小但能自主复制的原核微生物——支原体Mycoplasma genitalium。1996年,研究对象即扩展到单细胞真核生物——酵母以及人体正常组织及病理标本[28],进而突破了早期人们普遍认为的“蛋白质组研
蛋白质组学+AI技术
人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,
蛋白质组的技术原理
双向凝胶电泳技术(2-DE)双向凝胶电泳技术与质谱技术是目前应用最为广泛的研究蛋白质组学的方法。双向凝胶电泳技术利用蛋白质的等电点和分子量差别将各种蛋白质区分开来。虽然二维凝胶电泳难以辨别低丰度蛋白,对操作要求也较高,但其通量高、分辨率和重复性好以及可与质谱联用的特点,使其成为目前最流行、可靠的蛋白
蛋白质组鉴定技术简述
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定。在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达。并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不
蛋白质组学研究技术
可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,
赛默飞在ASMS-2017上公布TMT研究奖获奖者名单
分析测试百科网讯 在第65届美国质谱年会(ASMS)上,赛默飞公布2016年赛默飞TMT(Tandem Mass Tag)研究奖的获奖者名单。这已经是第三年,这一奖项根据申请者应用串联质谱标记试剂的创新性和影响力,在全球众多蛋白质组学研究者当中评选出获奖者。专有的TMT试剂由Proteome S
最新高分文章套路-|-强强联合(脂质组+DIA),IF>10
脂质组学技术 相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
最新高分文章套路-|-强强联合(脂质组+DIA),IF>10
脂质组学技术 相比其他组学技术,脂质组学技术发展较晚,新颖性高,仅仅只是纯数据分析也可以发表在不错的期刊上。如果希望研究得更高深入,可以往下游脂质功能或者往上游的蛋白或基因出发研究脂代谢调控机制。 【纯组学数据分析发文】 PNAS | 脂质组学揭示病毒感染引起的脂代谢异常及
Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法
瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组,已制定了一个质谱工作流,用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。 据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说,对于多种形态,该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量,提供用于
赛默飞在ASMS-2016上公布TMT研究奖获奖者
分析测试百科网讯 在第64届美国质谱年会(ASMS 2016)上,赛默飞宣布2016 赛默飞TMT(Tandem Mass Tag)研究奖获奖者名单。今年,这一奖项根据申请者应用串联质谱标记试剂的创新性和影响力,在全球众多蛋白质组学研究者当中,评选出了三位获奖者。 三位获奖者会获得价