miRNA与表达谱芯片联合应用,揭秘IFNa抗病毒作用新机制

复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生部医学分子病毒学重点实验室主任袁正宏课题组,联合应用Exiqon miRNA芯片和Agilent表达谱芯片,发现干扰素-a诱导细胞分泌外胞体传递具有抗病毒作用的miRNA和mRNA等活性分子,从而发挥抗病毒活性的新机制。该成果2013年7月7日正式发表于国际权威期刊Nature Immunology,引起世界同行关注。研究背景:干扰素-a(IFN-a)通过细胞间通讯,诱导病毒抵抗力从不易受感染的细胞传递到允许病毒复制的细胞,放大细胞抗病毒效率;外胞体(exosome)是细胞间通讯的中介,可在临近的细胞间水平传递有活性的分子。外胞体介导的细胞间功能分子的转移,很有可能是干扰素介导的抗病毒反应的机制。研究思路:INF-a介导的抗病毒活性可以通过外胞体在细胞-细胞之间传递In vitro外胞体将INF-a的抗病毒活性从LNPCs细胞转移到病毒感染肝细胞In vivo外胞体促进INF-a的抗病毒活......阅读全文

PLoSONE:IGF1调控乳腺癌miRNA表达

  乳腺癌是由于恶性肿瘤侵略并破坏乳房正常组织而形成的癌变肿瘤,也可能扩散到其他地方,是全世界女性最常见的癌病,世界一年约有50万人死于乳腺癌。美国研究者对IGF-1调控乳腺癌miRNA表达的机制进行了系统研究*,研究结果发表在11月30日的PLoS ONE上。   MiRNA在肿瘤的发展和转

Exp-Cell-Res-:miRNA表达调节与HIV相关性肾病的改善有关

  艾滋病病毒相关性肾病(HIVAN),是指患者在感染HIV的基础上,出现水、电解质、酸碱平衡失调和急性肾衰竭,以及与HIV直接相关的肾小球疾病。最近的研究表明,miRNAs参与艾滋病毒相关性肾病(HIVAN)的疾病发展过程。雷帕霉素,一种广泛使用的免疫抑制剂,已被证明能减缓HIVAN的疾病发展过程

蛋白芯片制作与应用(1)-液态芯片原理

液态芯片原理编码微球:分别用不同配比的两种荧光染料将直径5.6μm的聚苯乙烯微球(Beads)染成不同的荧光色,从而获得多达100种经荧光编码的微球。 交联探针、抗体或抗原:把针对不同检测物的核酸探针、抗体或抗原以共价方式结合到特定荧光编码的微球上。 检测反应:先把针对不同检测物的、用不同荧光色编码

胚胎发育与肿瘤发生之间新关联

MicroRNAs(miRNAs)是长度约22个核苷酸的非编码小分子RNA,调节多种重要的生理和病理过程,包括胚胎发育和肿瘤发生。许多研究阐述了miRNAs在肿瘤发生与胚胎发育过程中具有重要作用,而目前,对于胚胎发育与肿瘤发生之间的关联研究非常有限。近期,武汉大学郭明雄副教授,领衔其团队,对胚胎发育

带你认识强大的基因表达专家——GeneSpring

GeneSpring是一款广受好评的基因组学工作人员必知软件 ,使用者可在短时间内分析运算出目的基因的序列,称得上系统生物学分析软件中的佼佼者,受到相关科研工作者的欢迎和肯定。本文对GeneSpring GX的优势做详细分析。GeneSpring生物数据分析软件GeneSpring GX是一套特别针

Cell子刊最新发表应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒

  中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基因转

中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制

  小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼

二军医大:miRNA200家族调控结膜MALT淋巴瘤的发生

  结膜黏膜相关淋巴组织(Mucosa-associated Lymphoid Tissue, MALT)淋巴瘤是一种较为常见的发生于眼眶软组织中的肿瘤,是非霍奇金淋巴瘤中边缘带淋巴瘤的一种。该类肿瘤除了胃肠道多发外,眼眶软组织也是它的好发部位,绝大多数患者起病隐匿,临床经过较缓慢,病程长,预后

小分子药物与miRNA关联图首次构建

  哈尔滨医科大学科研人员基于基因芯片数据、利用生物信息学方法,首次构建了人类癌症中小分子化合物与miRNA(微小核糖核酸)的关联图。近日,相关成果《基于转录反应识别人类癌症中小分子和miRNA关联》由Nature子刊《科学报道》在线发表。   miRNA是一种单链的非编码RNA,参与多种与人类癌

circRNA研究新成果

研究背景放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作

测序解析miRNA调控害虫发育机制

小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA

使用lncRNAi方法通过靶向多个OncomiRs来实现HCC的肿...(三)

AdSVPE1a-lncR感染后mRNA发生变化,miRNA是否也有变化呢?通过全基因组miRNA表达谱芯片检测,研究人员发现HCC细胞中有大量的miRNA表达发生改变。qRT-PCR显示,只有miR21在所有的HCC细胞中都表达下调。5、lncRNAi作用效果体内实验验证细胞实验表明lncRNAi

厦大生科院联合发文解析miRNA在免疫系统的新作用

  来自厦门大学生命科学学院的刘文贤、肖昌春和付国教授课题组在Journal of Experimental Medicine联合发表了题为“A miR-155-Peli1-c-Rel pathway controls the generation and function of T follicu

武汉大学:发现胚胎发育与肿瘤发生之间新关联

  MicroRNAs(miRNAs)是长度约22个核苷酸的非编码小分子RNA,调节多种重要的生理和病理过程,包括胚胎发育和肿瘤发生。许多研究阐述了miRNAs在肿瘤发生与胚胎发育过程中具有重要作用,而目前,对于胚胎发育与肿瘤发生之间的关联研究非常有限。近期,武汉大学郭明雄副教授,领衔其团队,对胚胎

miRNA测序应用于阿尔茨海默氏症新机制的研究

阿尔茨海默氏症(Alzheimer's disease,AD)是一种神经性疾病。有研究表明,miRNA-Seq和全基因组测序鉴定到了一些非编码RNA可能参与了其中的疾病形成。竞争性内源RNA(ceRNA)是非编码RNA执行生物学功能的一种重要方式。然而,相对于其重要的生物学功能,只有部分

江苏疾控:循环miRNA可作为噪声性聋的标志物

  循环microRNAs(miRNAs)作为生理和病理条件下的无创标志物受到广泛关注,其可能可作为噪声性聋(Noise-Induced Hearing Loss, NIHL)的标志物。然而,目前还没有流行病学研究调查过NIHL或是噪声暴露对miRNA表达谱的潜在影响。  为此,江苏省疾病预防控制中

中国医大:miRNA参与麻醉剂介导的细胞神经毒性

  虽然异丙酚对发育中的中枢神经系统(CNS)会施加毒性作用,它仍然是儿童群体首选的麻醉剂。星形胶质细胞是一类主要的神经胶质细胞,它在中枢神经系统发育中发挥广泛作用,最近的研究证明它在很大程度上受microRNAs(miRNAs)调控。相比之下,很少有报道发育中的星形胶质细胞在异丙酚处理过程中miR

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

西北农林:发现miRNA调控乳脂合成新机制

  乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊(Capra hircus)奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在

西北农林:发现miRNA调控乳脂合成新机制

   乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在调控山羊奶成分中的作用知之甚少

miRNA芯片及定量PCR数据超急性期脑梗死标志物循环血miR16

  研究背景   全世界范围内,卒中严重降低其患病者的生存质量。而缺血性卒中占整个卒中的70-85%。快速诊断对超急性期脑梗死的临床决策非常重要。人们逐渐把寻找生物标志物的方向投向循环血的miRNA。但脑梗死病因复杂,分类繁多,使寻找特异性和敏感性高的循环血miRNA标志物困难重重。本研究使用mi

分析和比较各种基因组数据的多面手

  Partek®是一家致力于开发与整合用于生命科学研究数据分析软件的公司。该公司的系列软件包括――Partek® Flow™, Partek® Genomics Suite™, and Partek® Pathway™――可以提供基因组数据分析的整体解决方案,也是唯一一家可以提供

基因芯片的应用与展望

一、基因芯片产生背景人类基因组计划(HGP)是人类为了认识自己而进行的一项最伟大和最具影响的研究计划。 人类基因组测序的“工作草图”即将向全球公布,预计在2003年完成全序列分析。此外,还测定了80万个cDNA片断(ESTs),相当于4-5万个基因,占7-10万个人类总基因的50%左右。目前

DNA芯片技术的原理与应用

DNA芯片技术就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接将大量的DNA探针以显微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后与标记的样品杂交,通过对杂交信号的检测分析,即可获得样品的遗传信息。是伴随“人类基因组计划”的研究进展而快速发展起来的一门高新技术。通俗地说,基因芯片是通过微加工技术,将数以万计、

线性泛素化在调控IFN抗病毒信号的新机制的应用

近年来,蛋白质泛素化成为基因表达调控研究的热点,泛素化在各类细胞信号通路中发挥重要的调节作用。泛素分子通常含有7种内部赖氨酸残基,通过这些残基可与其他泛素分子的甘氨酸C端相连产生分支,形成多聚泛素化修饰。 近年来又鉴定了一种新的多聚泛素链——线性泛素链,由两个泛素N、C端首尾相接而成。已有研究鉴定线

南医大:miRNA调控肺癌侧群细胞的分化与沉默

  肺癌又称原发性支气管癌,系指原发于支气管粘膜和肺泡的肿瘤。近年来,随着世界各国肺癌的发病率和病死率持续上升,肺癌成为最常见的恶性肿瘤之一。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其通过与靶mRNA特异性结合,降解mRNA或抑制蛋白翻译,从而

帕博利珠单抗用于MSIH/dMMR各类瘤种疗效

  创伤性股骨头坏死(TIONFH)是髋部创伤后引起的严重并发症,股骨颈骨折是最常见的原因,因此股骨颈骨折后早期筛查和诊断TONFH尤为重要。有研究发现,骨细胞、血管内皮祖细胞和血液流变学等异常改变与TIONFH相关,TIONFH患者体内微小核糖核酸(miRNA)表达谱也呈现出显著特异性改变。表明m

Scientific-Reports:miRNA调控脂肪肝中的肝细胞激活和增殖

  非酒精性纤维化脂肪肝是贯穿非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的一个统一过程。MicroRNAs(miRNAs)已被证明在肝脏疾病中调节细胞过程。然而,miRNA在非酒精性纤维化脂肪肝中的作用在很大程度上还是未知的。  在这项研究中,河北医科大学南月敏教授领衔的课题组以蛋氨酸胆碱缺乏(MCD)饮食诱

血清外泌体中的miRNA作为KD诊断biomarker

  皮肤粘膜淋巴结综合症(muco-cuta-meous lymph node syndrome,MCLS)又称川崎病(Kawasaki disease),是一种以全身血管炎变为主要病理的急性发热性出疹性小儿疾病。虽然已有的研究已经发现一些血来源的蛋白分子或者miRNA有潜在的诊断能力,但是,其有效

2016年外泌体研究进展

  外泌体是一种存在于细胞外的多囊泡体,可通过细胞内吞泡膜向内凹陷形成多泡内涵体,内涵体与细胞膜融合后释放其中的小囊泡。外泌体的直径在40-110 nm之间,其中包含RNA、蛋白质、microRNA、DNA片段等多种物质,存在于血液、唾液、尿液、脑脊液和母乳等多种体液中。外泌体从发现至今已有30多年