Lightscanner和Lightscanner32非标记探针法基因分型
Lightscanner 和Lightscanner32 非标记探针法基因分型载脂蛋白（ApoE）多重实验密码子112（T>C）密码子158（C>T）实验背景 载脂蛋白（ApoE）是一种糖蛋白，包括299个氨基酸，在身体调节胆固醇水平上起主要作用。胆固醇水平过高是冠心病的主要因素，在美国，冠心病是引起死亡的主要因素。ApoE与老年痴呆症也有关系，这种病是因为大脑额叶萎缩，造成神经衰弱。老年痴呆症的普遍表现是痴呆，而且是不能治愈、退化、终端的。ApoE基因有两个SNPs，位于密码子112（c.388 T>C）和158（c.526 C>T）。密码子112和158组合的基因型翻译3种不同类型的蛋白质，通常称为：ε3（正常），ε2（异常），和ε4（异常）。 &nbs......阅读全文
Lightscanner－和Lightscanner32－非标记探针法基因分型
Lightscanner 和Lightscanner32 非标记探针法基因分型载脂蛋白（ApoE）多重实验密码子112（T>C）密码子158（C>T）实验背景 载脂蛋白（ApoE）是一种糖蛋白，包括299个氨基酸，在身体调节胆固醇水平上起主要作用。胆固醇水平过高是冠心病的主要因素，在美国，
采用快速循环荧光定量PCR仪和LightScanner32上的非标记探...
采用快速循环荧光定量PCR仪和LightScanner32上的非标记探针进行MAAB简介高分辨率熔解曲线可以通过扫描PCR的扩增片断来检测杂合体中基因序列的变化。配合使用高分辨的饱和荧光染料，在检测小于400bp的PCR片断的SNP、插入或缺失时的灵敏度可达98%以上。该方法自开发以来，被不断的应用
应用非标记探针法进行基因分型（一）
RET原癌基因单个碱基的突变可以引发多发性内分泌腺瘤2型。RET突变传统的基因分型方法是外显子测序。一种闭管操作的基因分型方法已经成熟，此方法用的是一种饱和DNA染料，非标记探针及高分辨率熔解扩增子分析。此方法需要两个连续的聚合酶链式反应阶段，主要的和第二次实验。主要的实验共用7个反应和8个非标记探
应用非标记探针法进行基因分型（五）
用相似的方法分析外显子11（表3；补充图2；补充表3；http://jmd.amjpathol.org），且所有外显子11的RET序列变化用扩增子高分辨率熔解分析进行检测（没有显示数据）。外显子11的主要实验用一个在致病密码子630和634上的野生型探针。检测的外显子11的8个序列变化均有一个等位基
应用非标记探针法进行基因分型（二）
材料和方法样品 此报道中用到的野生型RET基因的DNA基因组样品或有RET序列变化的样品在以前描述过。RET基因序列变化改变RET蛋白的功能引发MEN2综合症的是突变，然而RET序列改变不会引发MEN2综合症是多态。不能确定意义的稀有的或不会引起MEN2综合症的RET基因序列变化成为“序列
应用非标记探针法进行基因分型（六）
外显子14：多重探针分析 主要实验的外显子14， 两个野生型的探针同时用于一个反应，用来检测所有已报道的外显子14的突变，同时消除密码子836（p.S836S）多态性（图4；a和b；表3；补充表5；http://jmd.amjpathol.org）。WT14A探针在65℃-76℃
应用非标记探针法进行基因分型（七）
一般来说，用特定突变探针产生1/3结果。首先，当突变序列与特定突变探针互补时，突变等位基因的熔解Tm要高于野生型（△Tm为-2℃至-5℃）。第二，当突变在相同位置但是与特定突变探针序列不互补时，突变等位基因被野生型等位基因相似的Tm值及稳定性所遮蔽（野生型等位基因Tm±0.5℃）。在这种情况下，没有
应用非标记探针法进行基因分型（三）
高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1（爱荷华科技，盐湖城，犹他州）上进行分析，将LightCycle毛细管加入HR-1中，0.3℃/s加热。主要的实验中，RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据，除了外显子14。因为所有报道的外显子1
应用非标记探针法进行基因分型（四）
外显子10和11：多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10（密码子609、611、618和620）和11（密码子630和634），且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40（表1）。RET10外显子的主要实验包括两个单独的实验和
HLA基因分型方法：PCR－SSO（ASO）探针法
PCR－SSO（ASO）探针法1）常规提取DNA参见RFLP法 2）PCR扩增参见PCR-RFLP法 3）斑点杂交1．将5～20μl扩增产物，加变性液100～200μl室温处理5～15min。2．在尼龙滤膜（预先用2×SSC浸湿2min）上真空点样，每孔以10×SSPE 200μl冲洗，抽干，80℃
非放射性地高辛标记DNA探针法
实验概要掌握非放射性地高辛标记DNA探针法。 实验原理以往人们是用放射性同位素来标记探针DNA。近年来，非同位素标记方法发展很快，已有取代同位素标记法的趋势。地高辛配基随机标记DNA探针法，是较为成功的一种非同位素标记方法（Saiki等，1985）。其原理是：用化学方法把类固醇类半抗原地高辛分子连
数字PCR，LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01％的...
数字PCR，LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01%的等位基因的突变数字PCR，LunaProbesTM和MAAB相结合可以检测到低于0.01%的等位基因的突变Matt Poulson, Jason McKinneyIdaho Technology, Inc. Salt La
通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测...（一）
通过温度内标提高高分辨熔解曲线中纯合子检测的灵敏度摘要应用高分辨率熔解曲线技术进行基因分型不仅简单而且有效。基于熔解曲线的分析方法中，探针法是进行基因分型的金标准，能够全面的检测匹配的目的等位基因。小片段扩增法是一种不需要设计探针进行基因分型的方法。由于异源双链的存在，杂合子很容易检测，而这很大程度
基于－PCR－的基因分型实验——用末端标记的引物－PCR－扩增－SSLP
试剂、试剂盒正向和反向引物10 X T4 多聚核苷酸激酶缓冲液ATPT4 多聚核苷酸激酶模板DNA10 X PCR 扩增缓冲液4dNTP 混合液Taq DNA 聚合酶轻矿物油2 X 甲酰胺载样液仪器、耗材96孔微量板热循环仪用旧的X光胶片或者 Whatman 3MM 的过滤纸实验步骤展
用PCR进行基因分型
与许多一次做数百块Southern blots的研究人员一样，我第一次用PCR做基因分型（genotyping）时觉得见效很快，不再需要等几天才能看到结果，不再需要DNA显微图像或者操作紫外线了。随着技术的不断进步，RCR使基因组学和转录组学发生了翻天覆地的变化，甚至随着免疫PCR的普及开始进军蛋白
PCR荧光标记选择探针法还是染料法？
特异性荧光标记——探针法： 是目前临床最常用的方法，在加入一对引物的同时再加入一对探针，特异性好，这里列举的是TaqMan水解探针：一段与靶基因特异性结合的序列，分别在5’端加入荧光报告基团，3’端加入荧光淬灭基团。其核心是利用taq酶的5’-3’外切酶活性切断探针，使得使荧光报告基团和荧
农业领域中的应用高分辨熔解曲线分析技术
高分辨熔解曲线分析技术（High Resolution Melting Curves Analysis）是近年来发展起来的一种检测基因突变和刷选SNP的新方法。这种方法也可以与标记和非标记探针结合对已知位点的突变和SNP进行检测以及用于SSR（STR）等短串联重复分子标记分析。该技术已经被大
标记基因和目的基因的区别
目的基因是需要表达的基因,标记基因是有一定特点的基因当人们想利用某些细菌产生某些物质时,会先提取目的基因,然后让目的基因与运载体结合,再将目的基因导入受体细胞,最后培养细胞进行表达.标记基因就是在导入受体细胞时导入进取的人类的已知作用的基因,目的是为检测目的基因是否成功导入.由于一般都是有"鸟枪法"
SNP分子标记的原理及其分型方法的比较
美国学者Eric S. Lander于1996年正式提出单核苷酸多态性（SNP）为第三代分子标记以后，SNP已经广泛应用于经济性状关联分析、生物遗传连锁图谱构建、人类致病基因筛选、致病风险诊断及预测、个体化药物筛选等生物、医学研究领域。在经济作物育种领域，检测SNP可实现对所需性状的早期选择。这
HLA基因分型方法：RFLP法
RFLP法1）常规制备DNA盐析法1．用淋巴细胞分离液从抗凝血中分离出白细胞。2．每3ml细胞悬液加10ml红细胞裂解液溶解红细胞两次，再加2ml白细胞裂解液溶解白细胞。3．加50μl 10％ SDS和70μl蛋白酶K消化蛋白质，37℃过夜或55℃ 3h。4．加0.25体积饱和醋酸钠溶液，剧烈摇动1
乙肝HBV基因分型检测原理
1、全面型别分析 采用Sanger测序法对乙肝病毒进行分型基因检测。通过提取慢性乙型肝炎患者血液中的病毒DNA，利用特异性引物对HBVDNA中的基因进行PCR扩增。通过对扩增后的目的基因进行测序，将测序信息与NCBI中标准株的序列信息进行比对，可一次性检出慢性乙型肝炎病毒A、B、C、D
用PCR进行基因分型1
与许多一次做数百块Southern blots的研究人员一样，我第一次用PCR做基因分型（genotyping）时觉得见效很快，不再需要等几天才能看到结果，不再需要DNA显微图像或者操作紫外线了。随着技术的不断进步，RCR使基因组学和转录组学发生了翻天覆地的变化，甚至随着免疫PCR的普及开始进军蛋白
HPV分型基因检测的简介
HPV分型基因检测指的是检测多种基因型HPV的同时可以对HPV阳性结果进行基因分型的检测技术。其利用包括PCR-荧光探针法或其他分子生物学方法在内的核酸检测技术，以特定高危型HPV核酸（包括DNA和RNA）序列为检测目的，对人宫颈样本(如人宫颈脱落上皮细胞或分泌物等)进行体外定性检测的试剂，以确
用PCR进行基因分型2
质谱法原则上，添加到引物末端的核苷能够直接依据质量，利用通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectroscopy，MALDI-TOFMS）直接检测出来，这是一种不需标
丙型肝炎病毒的基因分型
HCV基因分型还无统一标准，因用于基因分型的部位和采用的技术方法不同，出现了各种基因分型结果，但各种基因型分类方法之间有一定的对应关系，兹举几种基因型分类法供参考。 HCV基因型各种分型之间的对应关系 现知欧美国家多数HCV-Ⅰ型感染，而亚洲国家以Ⅱ型为主，Ⅲ型次之。Okomoto报告日本慢
HPV分型基因检测的意义
近年来，人类乳头状瘤病毒（HPV）的发现及分型为宫颈癌筛查提供了一个全新途径。1976 年，Zur Hausen H 首次提出人类乳头状瘤病毒（HPV）与宫颈癌的发病密切相关。随后大量流行病学资料及研究已明确显示 HPV 持续感染是宫颈癌发病的首要条件。绝大多数宫颈癌样本都可检出HPV，HPV阴
标记基因的特点和作用
标记基因，原本是基因工程的专属名词，但是它已经成为一种基本的实验工具，广泛应用于分子生物学、细胞生物学、发育生物学等方面的研究。标记基因是一种已知功能或已知序列的基因，能够起着特异性标记的作用。在基因工程意义上来说，它是重组DNA载体的重要标记，通常用来检验转化成功与否；在基因定位意义上来说，它是对
辨析标记基因和报告基因教程
一、标记基因和报告基因的概念 标记基因(marker gene)，是一种已知功能或已知序列的基因，能够起着特异性标记的作用。标记基因是选择标记基因的简称，是指其编码产物能够使转化的细胞、组织具有对抗生素等的抗性，或者使转化细胞、组织具有代谢的优越性。在培养基中加入抗生素等选择试剂的条件下，非转化的细
皮肌炎分型和治疗分析
【一般资料】女性，67岁，无业【主诉】女性,67岁,无业眶周、颈、躯干、四肢起水肿性紫红斑伴痒2月余，肌痛20天。【现病史】2月前无明显诱因，患者眶周、颈、躯干、四肢起水肿性紫红斑伴痒，于家附近医院诊为“过敏性皮炎”，予肌注调节免疫力药物（名称不详），未见好转，皮疹逐渐增多，20天前出现肌肉疼痛，来
小片段法进行基因分型（一）
摘要： 背景：用于基因分型的高分辨率熔解曲线技术既简单又有效。在以熔解为基础的方法中，探针法是基因分型的黄金标准，可以将等位基因与目标的匹配完全区分开。小片段基因分型法是代替探针的基因分型法。异源双链核酸分子的存在使得检测纯合子变得容易，其熔解峰的形状有明显的改变。纯合子G/C或A/T的基