PCRArray简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)
重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理想的曲线,斜率为1.0,相关系数均不小于0.99。结果显示,PCR芯片实验体系的重复性高,不同批次的芯片,不同时间进行实验,不同的重复设计,在原始值水平都能获得很高的重复性。 图5 PCR芯片的重复性 PCR芯片具有高重复性 RNA样品为XpressRefTM人总RNA(GA-004,5.0ug),PCR芯片为人药物代谢PCR 芯片(APH-022A),采用RT2 Real-TimeTM SYBR Green / 荧光素PCR反应体系(PA-011)。两位不同的研究者分......阅读全文
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(二)
1.2 植物材料 1.2.1 水稻秧苗。将1.6-mL 96方孔板底部用6 mm电钻头打穿,或将旧96孔PCR板的底部剪去约4 mm。使用时将方孔板压入少量泥巴。每孔放入1粒萌动的水稻种子,在自然日光下(或人工气候箱)生长至3~4片叶。其他植物小苗也可用类似方法种植。 1.2.2 水稻大植株的鲜
Atlas#8482;cDNA表达距阵(Expression-Array)
AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析检测关键基因在细胞关键功能中的角色只需简单的杂交步骤就在数年前,核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开
PCR实用大全
PCR引物设计的11条黄金法则一、引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。二、引物长度一般在15~30碱基之间。引
简单实用的PROM电路测试器
本设计实例分享一种电路测试器,可以夹在每颗PROM上进行测试,不用将PROM从电路板上拔下。 处理老旧技术会带来有趣的挑战;虽然现代的可程式化元件透过JTAG或SPI介面很容易实现电路测试(tested in circuit,或称“线上测试”),但测试较老的元件就没这么方便了。 我从
超高通量PCR-一次上万个qPCR
大家好,Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit, IFC),将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上,形成纳升(nL)量级的反应仓,不需特别移液器,就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单,
无创产前基因检测实用问答无创产前基因检测实用问答
Q:我一定要做无创产前基因检测吗?A:没有人强迫你做任何事情,也没有人能够预测谁的孩子会患有唐氏综合征。无创产前基因检测可能是目前针对正常孕妇预防唐氏综合征最有效的手段。如果你没有羊水染色体检测的指征,建议你在怀孕期间接受无创产前基因检测。Q:无创产前基因检测能预防什么病?A:无创产前基因检测针对的
数字PCR在基因表达差异研究的应用
数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。
基因表达之RTPCR之我见
在论坛上看到不停地有人在问RT-PCR的问题,实际上在以前的帖子中各位香主和eeflying(我为什么总是提他们?因为还是很佩服的哦,生怕自己说错了,被他们指出来哦)都谈到了很多,鄙人也充大头答了一些问题,但是还是有各种问题,由于的基因表达还有点实战经验(但也技止此而),所以想些点东西给大家参考,计
检测肝癌细胞基因表达的实验方法
材料与方法⒈材料人肝癌细胞系HepG2由中国医科大学科学实验中心保存。DMEM培养基和胎牛血清购自BioInd公司。细胞转染试剂Lipofectamine 3000和Trizol购自Invitrogen公司。BDNF AS质粒、BDNF AS与BDNF基因完全互补序列缺失突变质粒以及空载体质
检测肝癌细胞基因表达的实验方法!
检测肝癌细胞基因表达的实验方法! 材料与方法 ⒈材料 人肝癌细胞系HepG2由中国医科大学科学实验中心保存。DMEM培养基和胎牛血清购自BioInd公司。细胞转染试剂Lipofectamine 3000和Trizol购自Invitrogen公司。BDNF AS质粒、BDN
通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析,大家马上会想到芯片。然而,并不是每个实验室都具备这个条件。现在,利用每个实验室都有的定量PCR仪,也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术,它利用实时定量PC
PCR的几个实用小技巧
增加PCR的特异性:1. primers design这是zui重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60
简单地讨论光端机的实用性
1、外观大方,结构合理 电话光端机技术含量高,其外观应小巧精致,美观大方,整体结构必须尽量的符合工程安装要求。一般室内型数字视频光端机除采用19 寸机柜外,还应能兼顾工程中将光端机置于桌面或壁挂的需要。数字光端机 另外,电话光端机还必须具有良好的散热性能和电气接触性能。 2、接口丰富,布局合
PCR实用大全2
几种常用特殊PCR技术几种常用特殊pcr技术一、逆转录PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)RNA经逆转录后可作为PCR的模板。逆转录PCR(RT-PCR)常用于基因表达研究(定量pcr)和逆病毒检测。设计RT-PCR引物时,应使引物分别位于不同的外显子中,以便区
PCR实用小技巧
增加PCR的特异性:1. primers design这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60%3
PCR实用大全3
PCR经验总结(先声明,此文不如分子克隆第三版权威与分子克隆相背处,请信分子克隆)一、增加PCR的特异性1、primers design这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火的引物要符合下面的一些条件1)足够长,18-24bp,以保证特异性。当然不是说越长越好,太长的引
PCR实用技巧
增加PCR的特异性: 1. primers design 这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件 a. 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量 b. GC% 40%~
PCR实用技巧
PCR实用技巧增加PCR的特异性: 1. primers design 这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件 a. 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量 b. G
pcr实用技巧
增加PCR的特异性:1. primers design这是最重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火的引物要符合下面的 一些条件a. 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的引物同样会降低特异性,并且降低产量b. GC% 40%~~~~60% c. 5&
PCR技术服务PCR的实用技巧
增加PCR的特异性:1. primers design这是zui重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60
PCR-Array产品介绍趋化因子及其受体的功能
趋化因子及其受体的功能免疫细胞的定向迁移是机体免疫应答发生和完成的必须条件。趋化因子是一类控制细胞定向迁移的细胞因子。其功能行使由趋化因子受体介导。趋化因子与其受体的相互作用控制着各种免疫细胞在循环系统和组织器官间定向迁移, 使之到达感染、创伤和异常增殖部位, 执行清除感染源、促进创伤愈合和消灭异
表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法
人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中绝大部
Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用
华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法,可从粪便样本中检测与EE(热带肠病)关联的人mRNA,灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA,可作为反应病人消化道病
多药抗药基因的表达实验——PCR扩增法
多药抗药基因的表达实验主要用于肿瘤治疗研究。实验方法原理大多MDR细胞膜上出现MDR-1基因及其基因产物P-糖蛋白过度表达。 多药抗药基因的表达实验是通过反转录和PCR的方法来检测这些特定基因的过度表达。实验材料RNA试剂、试剂盒PBS氯仿异丙醇萘酸异硫氰酸肽十二烷基肌酸钠构橼酸钠乙酸钠二疏基乙醇乙
PCR-Array-常见问题解答
PCR Array FAQ:任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format):plate formatInstrument providerQPCR instr
荧光定量PCR:基因相对表达量计算方法
荧光定量PCR之后计算目的基因的相对表达量一般采用2-△△ct的方法。我们还是假设对照组和处理组各有三个生物学重复(即对照组3个cDNA样品cDNA1, cDNA2, cDNA3,处理组3个cDNA样品cDNA4, cDNA5, cDNA6),三个技术重复(即每个cDNA的每个基因点三个孔)。
PCR基因芯片上荧光PCR反应的研究(五)
3.讨论 随着近年基因芯片技术的发展,研究者逐渐认识到基于核酸杂交原理的传统基因芯片缺陷与应用的局限性。随着PCR技术的进展,特别是荧光定量PCR技术的出现PCR技术已成为生物医学领域中应用最广泛的技术。如果一种基因芯片能直接进行PCR反应,而且能够同时扩增大批可能发生变异的基因显然会有广泛
bcl2凋亡基因表达的检测原理和方法
(一)原理:细胞凋亡是一个受基因调控的主动过程,bcl-2是抑制细胞凋亡的原癌基因,正常细胞的激活和发育过程中都有表达,但在发育成熟的细胞中,其表达降低,在低分化或癌变的细胞中,bcl-2高表达与肿瘤的发生、发展相关,bcl-2过量表达常导致对化疗药物的耐药性而阻止细胞凋亡,影响治疗效果,一旦细胞发
癌基因编码蛋白表达的检测
实验步骤展开
快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化
在甲基化分析中,亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单,但要想获得漂亮的结果,却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。 最近,QIAGEN