PCRArray简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)
重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理想的曲线,斜率为1.0,相关系数均不小于0.99。结果显示,PCR芯片实验体系的重复性高,不同批次的芯片,不同时间进行实验,不同的重复设计,在原始值水平都能获得很高的重复性。 图5 PCR芯片的重复性 PCR芯片具有高重复性 RNA样品为XpressRefTM人总RNA(GA-004,5.0ug),PCR芯片为人药物代谢PCR 芯片(APH-022A),采用RT2 Real-TimeTM SYBR Green / 荧光素PCR反应体系(PA-011)。两位不同的研究者分......阅读全文
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(五)
重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性,2位研究者采用了同样的总RNA样品,分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片,但批号不同,并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法
简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法
简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(三)
PCR 芯片实验体系 完整的PCR芯片实验体系包括RT2ProfilerTM PCR芯片,RT2 Real-TimeTM SYBR Green PCR反应体系和cDNA合成试剂盒。所有这些组分均为基于SYBR Green的实时定量PCR反应优化。精心设计的引物和优化的PCR反应体系一起,为
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(一)
简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(二)
PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来
PCR-Array-简单实用的检测基因表达的高通量方法(四)
RT2ProfilerTM PCR芯片特点灵敏度 研究者总是希望能检测到表达量相当低的基因,有时候,研究者得到的起始总RNA量也很少,但仍希望能进行实时定量PCR检测。为了满足研究者的这些需要,Superarray严格检测了PCR芯片系统的灵敏度。例如,Superarray使用PCR芯片检测了一系列
PCR-Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(三)
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域,包括:癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证截止目前,QIAGEN 拥有ZL申请的PCR Array可以分析超过150条通路和特异的疾病类型。具
PCR-Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(一)
以前只要提到基因表达分析,人们就会想到荧光定量PCR;只要提到高通量基因表达分析,人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有,但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。那么只有一台荧光定量PCR仪是否也能进行高通量的基因表达谱分析呢?QIAGEN 推出的RT2 Profile
PCR-Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(二)
RT2 Profiler PCR Array操作流程 首先将RNA样本反转录成cDNA第一链,作为PCR模板;接着将cDNA模板与合适的即用型PCR预混液混合,等体积加入到已经固定好基因特异性引物的同一个孔板的每个孔中,然后即可运行real-time PCR循环程序。RT2 Profiler PCR
简单实用的细菌快速检测方法
目前有哪种微生物测试方法能够在6~8个小时内显示食品和食品生产环境清洁度的微生物水平? 食品和饮料生产公司的答案是令人失望的:没有! 细菌总数、大肠菌群以及大肠杆菌平板计数通常可以对食品样品以及表面处理环境的微生物水平进行评估,然而检测结果需要在24~72小时之后获得。而采用显色
BioMark™基因分析系统介绍
美国Fluidigm公司www.fluidigm.com创立于1999年,总部设在美国加州。其创始人是Steve Quake和Gajus Worthington(公司CEO)。Steve Quake是美国斯坦福大学教授,是微液流领域(Microfluidic Technology)的权威专家http
PCR-Array-技术原理
PCR Arrays是分析一组特定基因表达的可靠工具,引物经过优化。每个96孔板、384孔板PCR Array都包含SYBR® Green优化的引物分析,可对相关的通路或疾病相关的基因进行细致的研究,并含有相应的RNA、DNA质量控制。PCR Arrays也可针对您特定的研究兴趣对一些基因作定制化
什么是pcr-array?
pcr array 中文名称就是PCR阵列,或者PCR芯片。运用高通量荧光定量PCR array 方法,在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的多个基因的表达量变化进行检测,芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因;目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因
PCR-Array-性能优势
灵敏度: 每个芯片使用至少1 ng或至多5 µg总RNA可获得高于80%的阳性信号率,即使细胞中细胞因子的表达量很低,25 ng总RNA的阳性率也>80%。 重复性: 图为对比不同研究人员在间隔3个月的时间下使用不同批次的Human Drug Metabolism PC
Atlas™cDNA表达距阵(Expression-Array)
AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析检测关键基因在细胞关键功能中的角色只需简单的杂交步骤就在数年前,核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开
Atlas™cDNA表达距阵(Expression-Array)2
区分关系相近肿瘤的诊断工具分析在肿瘤发生中起关键作用的基因的表达588种与癌症相关的cDNA点阵于一带正电的尼龙膜上,另外还包括9个管家基因的质粒、噬菌体等阴性对照。cDNA按分子途径和家族分类置于不同板块,包括癌基因、抑癌基因、细胞周期相关基因和凋亡等。Atlas? Mouse cDNA Expr
高通量植物(转)基因检测的利器植物材料直接PCR技术
高通量植物(转)基因检测的利器---植物材料直接PCR技术 摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要
高通量植物(转)基因检测的利器——植物材料直接PCR技术
摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要液氮和研磨杵研磨,也不需要钢珠破碎,更不借助任何特殊的仪器设备,方法及其
高通量植物(转)基因检测的利器植物材料直接PCR技术
摘要: 北京百泰克生物技术有限公司暨推出通用植物总RNA提取试剂盒(RP3301)成功解决了各种难提植物RNA的问题后,新近又针对高通量植物DNA的提取扩增推出了最新产品——植物直接PCR试剂盒(PR7501),该试剂盒不需要液氮和研磨杵研磨,也不需要钢珠破碎,更不借助任何特殊的仪器设备,方法及
RTPCR在基因表达(gene-expression)检测中的应用
基因表达的检测有几种方法。经典的方法(仍然重要)是根据在细胞或生物体中 所观察到的生物化学或表型的变化来决定某一特定基因是否表达。随着大分子分离技 术的进步使得特异的基因产物或蛋白分子的识别和分离成为可能。随着重组DNA技术 的运用,现在有可能检测.分析任何基因的转录产物。目前有好几种方
BioTNT-PCR-Array实验操作介绍
一.用户需要自备的材料和仪器 Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ; Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112; RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (
BioTNT-PCR-Array实验操作(二)
三、数据导出后进行分析; 3.1 数据分析基本设置1. 确定基线基线是qPCR扩增前期的荧光本底信号,一般都由仪器自动设置。不同仪器类型,基线的设置也略有不同,往往在荧光信号指数扩增阶段的前几个循环处,一般将定量PCR的前15个循环信号作为荧光本底信号,如果实验数据中最低CT还小于基线的设置上
BioTNT-PCR-Array实验操作介绍
一.用户需要自备的材料和仪器 Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ; Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112; RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (
BioTNT-PCR-Array实验操作介绍
一.用户需要自备的材料和仪器 Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ; Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112; RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (
BioTNT-PCR-Array实验操作(一)
一.用户需要自备的材料和仪器 Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ;Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112;RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104,RNas
基因表达-RTPCR之我见
本文讨论的范围包括RNA酶保护分析,northernblot,原位杂交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不谈具体protocol,是因为各种书籍和kit说明书上都有,主要说一些原则,而且大部分是失败和成功的经验,还有小组讨论结果以及各种书里七零八落看的内容,希望对大家有用。基因表达的定义
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(四)
2.3 高通量的分子标记检测 本方法制备的DNA浓度虽然低,用96针复制器加入0.5~1 µL模板进行33~35个PCR循环就可获得足够浓度的产物,并不需要加入特别多的Taq酶(甚至使用量为每45~50 µL PCR反应液1 U也能扩增分子标记)。该方法已对数万份水稻样品进行了分子标记(S
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(一)
摘 要:制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费人工的工作。本文介绍一种高通量的植物基因组DNA(gDNA)快速制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(长度约30 mm或40 mm,与96方孔板的孔深大致相同) 或一小块(约2~4 mg)双子叶植物叶片放入9
高通量的PCR模板植物基因组DNA制备方法(三)
将纯化定量的水稻品种(93-11)基因组DNA标准样品(0.5~8 ng)与1.0 µL本方法制备的水稻品种(02428)基因组DNA混合作为模板,用InDel 标记引物(表1)进行PCR扩增和PAGE检测。箭头指某反应(或2个反应之间)其02428与93-11条带的信号值大致相等(即DNA