多重序列比对及系统发生树的构建实验（一）
实验方法原理在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤：1. 以FASTA格式准备8个DNA序列test.seq（或txt）文件。2. 双击进入CLUSTALX程序，点FILE进入LOAD SEQUENCE，打开test.seq（或txt）文件。3. 点ALIGNMENT，在默认alignment parameters下，点击Do complete Alignment 。在新出现的窗口中点击ALIGN进行比对，这时输出两个文件（默认输出文件格式为Clustal格式）：比对文件test.aln和向导树文件test.dnd。4. 点FILE进入Save seque......阅读全文
NCBI－BLAST比对结果详细分析
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NCBI－BLAST软件比对结果详细分析
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多重－PCR－扩增实验
多重PCR扩增实验可以用于：（1）在同一PCR反应管内同时检出多种病原微生物，或对有多个型别的目的基因进行分型，特别是用一滴血就可检测多种病原体；（2）多重PCR很适宜于成组病原体的检测，如肝炎病毒，肠道致病性细菌，性病，无芽胞厌氧菌，战伤感染细菌及细菌战剂的同时侦检；（3）多种病原体在同一反应管内
多重－PCR－扩增实验
试剂、试剂盒 Taq 聚合酶溶于水的 DNA引物仪器、耗材 热循环仪实验步骤 一、材料1. 酶和酶缓冲液Taq 聚合酶许多 Taq 聚合酶都可以用；作者发现 Roche 公司的 Taq 聚合酶可以满足大多数需要. 如果需要提高PCR 产物的特异性，应该使用热启动聚合酶。使用 Tag 聚合酶本身附带的
多重－PCR－扩增实验
实验方法原理 多重PCR（multiplex PCR），其反应原理，反应试剂和操作过程与一般PCR相同。一般PCR仅应用一对引物，通过PCR扩增产生一个核酸片段，主要用于单一致病因子等的鉴定。重PCR的特点有：①高效性在同一PCR反应管内同时
2012年兽医系统实验室检测能力比对工作开展
农业部办公厅关于开展2012年兽医系统实验室检测能力比对工作的通知 为进一步加强兽医系统实验室管理，提高兽医系统实验室检测能力和水平，按照《农业部2012年兽医工作要点》(农办医[2012]2号)和《兽医系统实验室考核工作实施方案》(农办医[2010]13号)有关要求，我部决定组织开展2
最新研究重写鸟类家谱，构建鸟类生命之树
鸟类是恐龙的后裔。所有其他类群的恐龙在白垩纪末期的大灭绝事件中走向了终结，但绝大多数现生鸟类的祖先却在不到1000万年时间里快速繁衍，分化出非常多的新类群，堪称演化奇迹。在过去一个多世纪里，现生鸟类家谱的内部关系问题一直悬而未决，这成为构建生命之树的代表性难题。4月2日，以我国科学家为发起方和主要参
超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用
水稻泛NLRs家族基因的共线性位点（左）；基于全基因组SNPs的水稻系统发生树（右）。中国农科院供图 近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作，组装了251份高质量的水稻基因组，构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱
蚜虫核基因EF1－alpha基因序列测定及系统发育分析
实验概要核基因含有更加丰富的遗传信息，生物的性状基本上是由核基因决定的，用适当的核基因研究昆虫的系统发育，结果更有可能真实地反映昆虫的进化历史。本研究采用DNA序列分析法，对三种蚜虫的核基因EF-1 alpha进行比较，通过系统发育树分析了它们的系统进化。这一结果结合三种蚜虫的mtDNA的C
单一蛋白就可引发帕金森疾病及多系统萎缩症的发生
许多神经变性障碍都是由名为α-突触核蛋白的单一蛋白的集聚而引发，近日刊登在国际杂志Nature上的一篇研究论文中，来自安特卫普大学（University of Antwerp）等处的研究人员通过揭示了这些聚集物的结构及形状，同时研究者还发现这些聚集物可以决定个体是否患帕金森疾病或多系统萎缩症。
实验室间比对实验工作程序
1．1前言 能力验证的主要作用是评估实验室胜任检验工作的能力，识别与实验室相关的问题，如人员的技术素质，设备的状态，所用耗材质量，环境的控制等诸多影响测试结果的因素。 通过实验室之间的比对可以鉴别实验室间的差异及水平，作为实验室本身而言，可以示其为一次外部审核，可以促进、完善和提高自身的内部质量控制
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
兽医系统实验室检测能力比对工作顺利完成
为进一步加强兽医系统实验室管理，提高兽医系统实验室检测能力，按照《农业部2012年兽医工作要点》和《兽医系统实验室考核工作实施方案》有关要求，2012年农业部继续在全国范围内组织对兽医系统省、市、县三级实验室分级实施检测能力比对工作。日前，由中国动物疫病预防控制中心具体承担的兽医系统
多重PCR反应中关键因素和实验步骤（一）
O. Henegariu, N.A. Heerema, S.R. Dlouhy, G.H. Vance and P.H. VogtIndiana University, Indianapoils, IN, USA and Heidelberg University, Heidelberg, Germ
微流控芯片技术构建多重诱导神经芯片模型
神经系统发育是一个高度动态和极其复杂的过程。建立体外仿生的组织细胞外微环境，探索和理解这些错综复杂的神经发育过程对神经科学、发育生物学及临床医学都具有极大的科学研究与应用价值。然而，目前国内外学者研究主要集中于单因素诱导的神经发育，对于多诱导因素参与的神经系统发育微环境体外构建及其技术与方法，还有待
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核酸序列分析实验
实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中，确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言，在重复片段频繁出现的区域里，基因编码区和调控区不太可能出现；如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋
从全基因组水平构建鸟类物种生命树
近日，“第一届万种鸟类基因组（B10K）项目国际研讨会——鸟类复杂性状的进化解析与调控”在北京召开。会议由中国科学院昆明动物研究所主办，中国科学院动物研究所协办。会议组织委员会主席由昆明动物所特聘讲座研究员张国捷和动物所研究员雷富民担任。 据悉，由中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所
象甲总科系统演化研究取得进展
象甲总科是一类非常繁盛的昆虫，已描述超过6万个物种，是当今自然界物种多样性最高的类群之一。近日，中国科学院南京地质古生物研究所研究员蔡晨阳等通过对前人发表的象甲总科数据集进行重新系统发育分析，构建了可靠的象甲总科各科间的系统发生骨架树，解决了现生象甲总科各个科之间的演化关系。9月20日，相关研究
为什么deSALT技术能够突破长RNAseq读序列比对瓶颈
由于高测序错误和复杂的基因结构，长读RNA测序读段的比对就显得非常重要。2019年12月16号，哈尔滨工业大学臧天仪、王亚东团队在Genome Biology上在线发表了题为deSALT: fast and accurate long transcriptomic read alignment
蚜虫mtDNA12S/16SrRNA基因序列测定及系统发育分析
实验概要线粒体DNA在分子进化中具有许多独特的优越性，mtDNA己成为研究生物(主要是动物)进化的重要材料。本研究所利用的mtDNA基因序列包括12SrRNA，16SrRNA以及12SrRNA和16SrRNA之间的序列，通过分析三种蚜虫mtDNA 12S/16SrRNA基因序列的进化，不仅揭示了
农业部组织开展兽医系统实验室检测能力比对工作
为了加强兽医系统实验室能力建设，近期农业部组织完成了省级兽医实验室检测能力比对工作。本次比对共设置了H5亚型禽流感抗体检测、O型口蹄疫抗体检测和高致病性猪蓝耳病病毒检测等3个比对项目。全国32个省级兽医实验室全部参加了比对，均在规定时间内完成了检测并提交了检测结果。 在此次兽医系统实
实验室比对和能力验证
实验室比对和能力验证是检测机构内部质量控制程序的有力补充。 实验室比对是按照预先规定的要求，由两个及以上实验室对同类或类似的被检测样品进行检测的组织、实施和评价的活动。 能力验证是利用实验室间比对确定实验室的检测能力的活动，它是为了确定某个实验室进行某项特定检测的能力以及监控其持续能力而进行的一种实
实验室比对结果评价方法
比对试验：即按照预先规定的条件，由两个或多个实验室或实验室内部对相同或类似的被测物品进行检测的组织、实施和评价。对于结果评价一般大家熟悉的Z比分直，En值外，我们下面介绍三种另外的评价方法，即格鲁布斯(Grubbs)检验、F检验、t检验。我们分别来介绍： 格鲁布斯(Grubbs)检验格鲁布斯检验是离
随机序列库的纯化实验
实验方法原理实验材料DNA 库试剂、试剂盒氢氧化铵正丁醇TE 缓冲液尿素上样缓冲液NaCl乙醇仪器、耗材荧光薄层层析板（VWR）紫外灯剃刀刀片小孔注射器能耐受极端温度的 13 ml 离心管（Sarstedt）90℃水浴旋转混合器实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 寡核苷酸
随机序列库的纯化实验
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实验方法原理 实验材料 DNA 库 试剂、试剂盒 氢氧化铵
一种无载体的多重基因编辑系统，可用于抗癌免疫疗法
在一项新的研究中，韩国科学技术研究院（KIST）的Mihue Jang博士及其团队和韩国世宗大学的Seokmann Hong教授及其团队开发出一种新的基因编辑系统，而且这种系统可同时抑制淋巴瘤细胞表面上表达的干扰免疫系统的蛋白和激活细胞毒性T淋巴细胞，因而可以用于抗癌免疫治疗中。相关研究结果近期
首次多重动态键构建电解质固态锂电池
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508015.shtm全固态锂电池具有高比能、高安全性、高可靠性、长寿命、可柔性化等优点，在柔性电子器件、电动汽车、航空航天等领域具有巨大的储能应用价值。然而，全固态锂电池有限的固态电解质-电极界面接触导致