通过杂交筛选未扩增的黏粒文库(滤膜影印)

实验方法原理 经黏粒转化的稠密细菌菌落可通过杂交的方法筛选,该方法源于质粒转化菌落的大规模筛选(Hanahan and Meselon 1980)。实验步骤 一、材料1. 培养基含 25 μg/ml 卡那霉素的 TB 琼脂平板(150 mm )TB 培养基2. 专用设备厚玻璃板皮下注射针头(17号)灭菌的硝酸纤维素膜或尼龙膜(137 mm)灭菌的 Whatman 1 号滤纸3. 载体与菌株λ 噬菌体包装反应适合平板接种的大肠杆菌菌株(例如:XL1-BLUE, ED8767, NM554, DH5αMCR)。二、方法已包装到 λ 噬菌体颗粒中的黏粒 DNA 转化至大肠杆菌1. 计算能产生 3 万~ 5 万个转化菌落的包装反应体积。2. 准备数支灭菌的试管,试管中加有上述体积的包装反应产物和 0.2 ml 的接种细菌。3. 37℃ 温育试管 20 min。4. 在每支试管中加入 0.5 ml TB, 继续温育 45 mi......阅读全文

基因组文库的扩增实验

通过平板培养可对重组噬菌体文库进行扩增,平板培养的原种可直接来源于本方案所述的包装混合物。但只要可能,该扩增过程可被省略,而感兴趣的 DNA 序列可从原始文库直接筛选。扩增将不可避免地降低文库的复杂性,部分原因在于在连续几轮的噬菌体生长中,对生长缓慢的重组噬菌体来说是十分不利的。本实验来源「分子克隆

随机RNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形

随机RNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形成发夹、假结、凸环、G-四聚体等多种空间结 构,它

随机RNA文库的SELEX筛选实验

随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的

cDNA的筛选1

(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,

关于黏粒的基本信息介绍

  黏粒英文cosmid,指带有黏端位点(cos)的质粒。黏粒是由人工构建的含有λ噬菌体DNA的cos序列和质粒复制子的载体。黏粒的组成包括质粒复制起点(ColE1)、氨苄青霉素抗性标记、cos位点。黏粒有4个特点:  ①具有λ噬菌体的特性。黏粒在克隆了外源DNA在体外包装成噬菌体颗粒后,可以感染宿

大量细菌克隆的杂交方法筛选实验

这一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)报道,主要用来处理由质粒 cDNA 文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的 cDNA 文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上,复制膜用膜-膜接触的方法制备。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方

关于cDNA文库的筛选鉴定的介绍

  1.核酸杂交  是最常用,最可靠的方法之一,可大规模地分析文库的克隆子。  1.同源探针:至少含有所需cDNA克隆的一部分确切序列,常用于以一个部分克隆分离cDNA文库中的全长克隆。  2.部分同源探针:探针的序列与所要筛选的cDNA克隆的序列相关但不相同,常用于克隆家族基因。  3.总cDNA

RACE技术扩增构建全长cDNA文库

实验概要利用RACE(利用PCR技术快速扩增全长mRNA)技术构建全长cDNA文库是传统C库构建技术的改进。本实验即是利用寡核苷酸帽法,进行全长C库的构建,从而掌握RACE技术的原理与基本操作方法。实验原理其原理是利用真核mRNA的3’poly(A)和5’帽子结构作为标签,用通用引物识别并配对标签序

单链DNA文库的SELEX筛选实验

单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3

单链DNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪

单链DNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上,以标记的 RNA 探针进行筛选,最终获取能与靶

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上,以标记的 RNA 探针进行筛选,最终获取能与靶 RNA 分子特异性结合

Northwestern筛选蛋白表达文库实验

            实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库(融合蛋白的 N 端由载体序列编码,C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码),进而诱导融合蛋白表达,并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤

酵母双杂交系统的实验步骤

酵母双杂交系统的实验步骤 1. 将报告基因p8op-LacZ转化酵母EGY48菌株,用培养基SD/-Ura筛选。2. 同时构建DNA文库,并纯化足够的质粒以转化酵母细胞。3. 构建DNA-BD/靶蛋白质粒pLexA-X,作为钓饵(bait)。4. 将上述钓饵质粒pLexA-X转化EGY48(p8op

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

            试剂、试剂盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸 PCR 正对照 PCR 主要混合物 蒸馏水

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVent 溶

基于-PCR-的-DNA-文库筛选实验方法

试剂、试剂盒 PCR 混合物PCR 引物寡核苷酸 杂交寡核苷酸PCR 正对照PCR 主要混合物蒸馏水仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水2. 酶和酶缓冲液PCR 混合物(可以放在一起冰冻),对于 lml 反应,包括:200nmol 的各种 dNTP;1XVe

杂交瘤细胞的筛选

杂交瘤细胞的筛选  在细胞融合后,要从上述五种细胞中筛选出杂交瘤细胞,一般使用HAT培养进行筛选,HAT培养基中含有次黄嘌呤(H)、氨基喋呤(A)和胸腺嘧啶(T)三种成分。细胞的DNA合成有内源性途径(主要途径)和外源性途径(旁路途径)两种方式。内源性途径就是利用谷氨酰胺或单磷酸尿苷酸在二氢叶酸还原

基因分离克隆的方法

1 基因芯片技术分离目的基因生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子的微列阵。列阵中每个分子的序列及位置都是已知的,并按预先设定好的顺序点阵。基因芯片是生物芯片的一种,其上固定的是核算类物质,主要用于DNA、RNA分析。分为DNA芯片和微点阵两种。分离目的基因是是指从基因组中发现或找出某个

大量细菌克隆的杂交方法筛选实验

            实验方法原理 这一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)报道,主要用来处理由质粒 cDNA 文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的 cDNA 文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上,复制

大量细菌克隆的杂交方法筛选实验

实验方法原理 这一方法由 Hanahan 和 Meselson (1980, 1983)报道,主要用来处理由质粒 cDNA 文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的 cDNA 文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上,复制膜用膜-膜接触的方法制备。采用这一方法,每块 150

筛选pⅧ噬菌粒库

实验概要大量的方法已经被设计用于筛选大规模的噬菌体肽库。其中最简单的形式就是使用直接吸附的方式将靶分子固定于一个固体支持物上,然后使其接触到噬菌体库。那些不能与之结合的噬菌体在一系列洗涤的过程中将会被除去,而可以结合的噬菌体克隆将在酸性洗脱后被重新获得。主要试剂1. 磷酸盐缓冲液2. PBS/0.1

筛选质粒载体构建表达文库实验

            试剂、试剂盒 封闭缓冲液 氯仿 裂解缓冲液 检测抗原-抗体复合物所用试剂 SM TNT 缓冲液 洗涤缓冲液

筛选质粒载体构建表达文库实验

试剂、试剂盒 封闭缓冲液氯仿裂解缓冲液检测抗原-抗体复合物所用试剂SMTNT 缓冲液洗涤缓冲液 125I 标记的蛋白质 A 或 125I 标记的免疫球蛋白放射性碘化第二抗体第一抗体LB 或 SOB 琼脂平板仪器、耗材 空气培养箱平头镊子 装有防水黑墨水(印度墨水)并带有 18 号针头的注射器硝酸纤维

筛选质粒载体构建表达文库实验

检测结合抗体的方法有以下 3 种:放射化学筛选,生色反应筛选及化学发光反应筛选。3 种方法的优缺点在本章导言中有所论述。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒封闭缓冲液氯仿裂解缓冲液检测抗原-抗体复合物所用试剂SMTNT 缓冲液洗涤缓

概述分子杂交技术常见的杂交分类

  分子杂交是通过各种方法将核酸分子固定在固相支持物上,然后用放射性标记的探针与被固定的分子杂交,经显影后显示出目的DNA或RNA分子所处的位置。根据被测定的对象,分子杂交基本可分为以下几大类:  (1) Southern杂交:DNA片段经电泳分离后,从凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,然后与探

根据杂交所用的方法对分子杂交进行分类

根据杂交所用的方法,另外还有斑点(dot)杂交、狭槽(slot)杂交和菌落原位杂交等。有3种固相支持体可用于杂交:硝酸纤维素滤膜、尼龙膜和Whatman 541滤纸。不同商标的尼龙膜需要进行不同的处理,在DNA固定和杂交的过程中要严格按生产厂家的说明书来进行。Whatman 541滤纸有很高的湿强度

在滤膜上进行细菌DNA的杂交实验

本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进行杂交,以及从琼脂板中将与探针特异性杂交的克隆回收培养的方法,这些方法适用于平均长度大于 100 核苷酸的探针。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案介绍如何用放射性标记探针与固定在滤膜上的转化菌 DNA 进