循环测序:利用PCR和引物末端标记进行双脱氧测序实验

试剂、试剂盒 ddNTP 延伸 终止混合物酶及其缓冲液AmpliTaq CS 或其他无外切酶活性的 DNA 聚合酶循环测序缓冲液热稳定的 DNA 聚合酶核酸和寡核苷酸模板 DNA仪器、耗材 小离心管 或者微孔板热循环仪实验步骤 材料溶液和缓冲液贮存液、缓冲液和试剂的配方请参照附录 1。将贮存液稀释到适当的浓度。ddNTP 延伸/终止混合物ddNTP 溶液:四种 ddNTPs, 各 5.0 mmol/LdNTP 溶液:四种 dNTPs, 各 1.0 mmol/LEDTA(0.05mol/L,pH8.0)甲酰胺上样缓冲液Tris-Cl(1mol/L,pH8.0)酶及其缓冲液AmpliTaq CS 或其他无外切酶活性的 DNA 聚合酶(5units/ul)。5X 循环测序缓冲液200 mmol/LTris-Cl(pH8.8)25 mmol/LMgCl2热稳定的 DNA 聚合酶选择酶时,请参照本章介绍中及方法 5 中......阅读全文

循环测序:利用-PCR-和引物末端标记进行双脱氧测序实验

本方法成功的关键是模板 DNA 的纯度。琼脂糖、盐和蛋白质的污染都会导致 DNA 聚合酶的提前终止或暂停,而 DNA 和 RNA 降解所产生的寡核苷酸将造成引物错配。这些污染会严重导致假阳性条带或空白出现。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试

循环测序:利用-PCR-和引物末端标记进行双脱氧测序实验

试剂、试剂盒 ddNTP 延伸 终止混合物酶及其缓冲液AmpliTaq CS 或其他无外切酶活性的 DNA 聚合酶循环测序缓冲液热稳定的 DNA 聚合酶核酸和寡核苷酸模板 DNA仪器、耗材 小离心管 或者微孔板热循环仪实验步骤 材料溶液和缓冲液贮存液、缓冲液和试剂的配方请参照附录 1。将贮存液稀释到

循环测序:利用-PCR-和引物末端标记进行双脱

            试剂、试剂盒 ddNTP 延伸 终止混合物 酶及其缓冲液 AmpliTaq CS 或其他无外切酶活性的 DNA 聚合酶 循环测序缓冲液 热稳定的 DNA 聚合酶

双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应

在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器

双脱氧法DNA测序实验——α标记核苷酸进行热循环测序反应

实验材料DNA试剂、试剂盒DNA测序缓冲液dATPDNA聚合酶仪器、耗材热心换反应装置离心机实验步骤1.  对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。2.  分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。 3.  对于单链模板:在0.5 ml 微量

双脱氧法DNA测序实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材 离心机离心管微量滴定板实验步骤 1.  对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4

双脱氧法DNA测序实验

测序酶进行标记测序反应 α-标记核苷酸进行热循环测序反应             实验材料 DNA

PCR引物和测序引物有什么区别

一、定义不同:PCR是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火(复性)及适温延伸等反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。测序引物分自带引物和通用引物,自带引物为客户自行设计的PCR扩增引物或者载体及目的片段上设计的引物进

用-Taq-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验

试剂、试剂盒 去离子蒸馏水ddNTPdNTP甲酰胺加样缓冲液。酶和缓冲液。Taq 酶或类似的热稳定 DNA 聚合酶Taq 酶稀释缓冲液核酸和寡核苷酸寡核苷酸引物模板 DNA(100ug ul) 溶于 TE 中放射性化合物5'32P 标记的寡核苷酸引物仪器、耗材 微量离心管(0.5 ml) 或

用-Taq-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验

热稳定 DNA 聚合酶除了在 PCR 反应中应用外,还可用来替代测序酶或 Klenow 片段进行双脱氧链终止法测序。它在高温下(70°C) 进行等温链终止反应的能力可减少测序反应中由于模板 DNA 上引物假结合位点与引物退火错配产生的问题,它还可用于富含二级结构模板的测序。本实验源于分子克隆实验指南

用-Taq-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验

            试剂、试剂盒 去离子蒸馏水 ddNTP dNTP 甲酰胺加样缓冲液。酶和缓冲液。Taq 酶或类似的热稳定 DNA 聚合酶 Taq 酶稀释缓冲液

化学发光双脱氧DNA测序实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPdTTP仪器、耗材 热循环仪尼龙膜滤纸离心机实验步骤 1.  在微量离心管中混匀下列试剂,配制DNA摸板混合物(1)1 μg 单链DNA模板或1~3 μg 变性双链DNA模板(2)0.5 pmol 生物素

化学发光双脱氧DNA测序实验

利用生物素标记引物             实验材料 DNA 试剂、试剂盒

化学发光双脱氧DNA测序实验

标准的双脱氧DNA测序可以很容易和很有效地使用非同位索标记的化学发光法进行检测。在测序反应中,使用生物素标记的引物。用非同位素标记如生物素衍生化的引物,可用于为5’-末端标记引物而设的入测序反应的工作方案。实验材料DNA试剂、试剂盒生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPd

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

重组表达载体pET32aHisAPC10的序列测定

通过上述实验所构建的表达质粒pET-32a-His-APC10经限制性内切酶分析正确后,必须进行DNA序列测定,以获得序列完全正确的克隆。1. 基本原理目前应用的DNA序列测定方法有双脱氧法(Sanger法)和化学测序法(Maxam-Gilbert法),在变性聚丙稀酰胺凝胶(测序胶)上进行高分离度的

制备DNA测序模板实验——双脱氧测序的双链质粒DNA的碱变性

实验材料DNA试剂、试剂盒NaOHEDTA乙酸钠乙醇仪器、耗材离心管离心机摇床实验步骤1.  加入约0.5 pmol 重组质粒DNA于0.5 ml 微量离心管中,如果体积大于20 μl 应以乙醇沉淀,重溶于20 μl 水。2.  如果体积小于20 μl,用水补足20 μl。3.  加入2 μl 2

PCR技术应用社会学DNA的检测

目前广泛采用的 DNA 测序方法有化学法和双脱氧法两种,它们对模板的需要量比较大。利用 PCR 方法可以比较容易地测定位于两个引物之间的序列。利用 PCR 测序有下列几种方法。(1)双链直接测序将 PCR 产物进行电泳回收或利用分子筛等方法除去小分子物质。采用热变性或碱变性的方法使双链 DNA 变成

引物设计和末端标记实验

对 SSCP 解析能力和局限性的系统分析揭示灵敏度和片段长度有显著的相关性。当DNA 长度为 150~200bp 时,突变的检出率最高。本方案应用了高专一性的放射性同位素,并且包含一个纯化步骤用于去除未利用的核苷酸,从而降低了整个反应的放射能量。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,

引物设计和末端标记实验

试剂、试剂盒 激酶缓冲液MgCl2二硫苏糖醇牛血清白蛋白ddH20TE 缓冲液EDTA聚核苷酸激酶引物放射性化合物仪器、耗材 放射性化合物离心机和转子丙烯酸防护板离心管架废弃物容器盖革计数器QuickSpin 柱实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂5X 激酶缓冲液0.25mol/LTris-H

引物设计和末端标记实验

            试剂、试剂盒 激酶缓冲液 MgCl2 二硫苏糖醇 牛血清白蛋白 ddH20 TE 缓冲液 EDTA 聚核苷

用-T7-噬菌体-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验

本方案参照了 Tabor 和 Richardson(1987a,1989b,1990) 的方法,采用单链 DNA 模板进行 DNA 测序(有关单链 M13 噬菌体和质粒 DNA 制备,请参见第 3 章的方案 4、8 和第 12 章的方案 1)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕

用大肠杆菌-DNA-聚合酶-I-Klenow-片段进行双脱氧测序实验

当 Sanger 及其同事建立第一个 DNA 链终止延伸法时,只有一种合适的 DNA 聚合酶可用,即大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段。它具有在模板存在时聚合 dNTP 的活性,但缺乏完整聚合酶 I 的 5'-3'外切酶活性。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,

用-T7-噬菌体-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验

试剂、试剂盒 去离子蒸馏水二硫苏糖醇dNTP 和 ddNTP标记混合液和 ddNTP 延伸 终止混合液甲酰胺上样缓冲液测序酶稀释缓冲液测序酶反应缓冲液含MgCl2测序酶酵母无机焦磷酸酶寡核苷酸引物模板 DNA放射性化合物仪器、耗材 离心机和转头微量离心管或微量滴定板实验步骤 材料缓充液和溶液去离子蒸

DNA测序——双脱氧链末端终止法

实验方法原理DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3'-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3'-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3'-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理,将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体,

双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验

            试剂、试剂盒 乙酸铵 氯仿 异戊醇 DMSO 乙醇 NaOH酚 测序反应缓冲液 琼脂糖凝胶

双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验

双脱氧链终止法变性模板 分子克隆实验指南(第三版)下册 第12章 方案2下面通过碱变性质粒 DNA 的方法应与方案 3 联合使用,因在此过程中采用测序酶催化双脱氧测序反应。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒乙酸铵氯仿异戊醇DMSO

双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验

试剂、试剂盒 乙酸铵氯仿异戊醇DMSO乙醇NaOH酚测序反应缓冲液琼脂糖凝胶寡核苷酸引物闭环双链质粒 DNA仪器、耗材 干冰-乙醇浴65°C 水浴实验步骤 材料缓冲液和溶液试剂、缓冲液、储液的组成参见附录 1, 储液使用前稀释到适当浓度。乙酸铵(5mol/L, 非缓冲,pH~7.4)氯仿:异戊醇(2

T载体克隆的DNA序列分析

实验目的: 了解常规DNA序列分析技术(Sanger双脱氧法)的原理及操作步骤。 实验原理: 在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和Gilbert(1977)发明的化学

用-T7-噬菌体-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应

            试剂、试剂盒 去离子蒸馏水 二硫苏糖醇 dNTP 和 ddNTP 标记混合液和 ddNTP 延伸 终止混合液 甲酰胺上样缓冲液 测序酶稀释缓冲