纯化测序反应产物实验

试剂、试剂盒 甲酰胺核酸寡核苷酸仪器、耗材 ABI PRISM 3100Genetic Analyzer微量离心管DTR Gel Filtration Cartridges (Edge Biosystems)或相应的真空浓缩仪实验步骤 一、材料1.缓冲液和溶液样品上样液所用的样品上样液取决于所用的设备。对于ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer,推荐使用高度脱离子的甲酰胺(如ABI的Hi-Di-甲酰胺)。2.核酸和寡核苷酸在方案3中二、方法、步骤5得到的测序反应产物3.特殊设备ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer,微量离心管,DTR Gel Filtration Cartridges(Edge Biosystems)或相应的真空浓缩仪二、方法1.从包装袋中取出所需数目的组装好的圆筒,仔细检査,确保圆筒中板模没有干,如果管中已经没有多余的液体或是板模已干,加入200ul去离子水,使......阅读全文

PCR扩增产物鉴定与纯化

实验原理琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DNA制

PCR扩增产物鉴定与纯化

  实验原理  琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)  本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DN

直接从PCR产物回收纯化DNA

1)直接加90-100μl纯化缓冲液于1.5ml离心管,再加入30~300μl PCR反应物,Vortex混合;2)加入1ml树脂轻轻Vortex 3次,每次间隔1分钟;3)将取出拉杆的注射器筒(3ml)装在纯化柱上,加入上述DNA与树脂混合液,然后装上拉杆,慢慢将混合液推进纯化柱内;4)卸下注射器

PCR扩增产物鉴定与纯化

  实验原理  琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)  本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DN

制备克隆用PCR产物的纯化

PCR 产物经酚:氯仿抽提、乙醇沉淀及其他一些常用方法纯化后,DNA 样品内还往往残留了一些具有酶活性的 Taq DNA 酶与另外一些热稳定 DNA 聚合酶(Cioweetal. 1991; Bamesl992)。这些残余的 DNA 聚合酶连同一些残余的 dNTP 的持续存在,常常妨碍有待进一步克隆

PCR扩增产物鉴定与纯化

实验概要通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物,并对获得的产物进行割胶纯化回收,为接下来的DNA重组和转化实验提供外源DNA片段。实验原理琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验) 本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purifi

制备克隆用PCR产物的纯化

实验方法原理 PCR 产物经酚:氯仿抽提、乙醇沉淀及其他一些常用方法纯化后,DNA 样品内还往往残留了一些具有酶活性的 Taq DNA 酶与另外一些热稳定 DNA 聚合酶(Cioweetal. 1991; Bamesl992)。这些残余的 DNA 聚合酶连同一些残余的 dNTP 的持续存

制备克隆用PCR产物的纯化

            实验方法原理 PCR 产物经酚:氯仿抽提、乙醇沉淀及其他一些常用方法纯化后,DNA 样品内还往往残留了一些具有酶活性的 Taq DNA 酶与另外一些热稳定 DNA 聚合酶(Cioweetal. 1991; Bamesl992)。这些残余的

影响DNA测序技术测序产物银染的因素

  1. 水的质量对于染色的成功极其重要。超纯水(NANOpureR 或Milli-QR 的水)或双蒸水可获得较好的效果, 如果水中有杂质, 则低分子量条带可能无法出现。  2. 碳酸钠也非常重要。使用新鲜的,美国化学学会级碳酸钠较好,如Fisher和Kodak ACS试剂级碳酸钠(Fisher C

PCR产物是否需要用凝胶纯化?

如凝胶分析扩增产物只有一条带,不需要用凝胶纯化。如可见其他杂带,可能是积累了大量引物的二聚体。少量的引物二聚体的摩尔数也很高,这会产生高比例的带有引物二聚体的克隆,而非目的插入片段。为此需在克隆前做凝胶纯化。

常规的-PCR-产物纯化的基本过程

常规的 PCR 产物纯化的基本过程如下:首先使用琼脂糖凝胶电泳分离除去反应体系中靶序列的非特异性扩增片段,然后使用蛋白酶 K 灭活耐热的 DNA 聚合酶,此后使用常规的苯酚/氯仿抽提法除去剩余的 dNTP,离心、乙醇洗脱后干燥,最后使用高效液相色谱或者凝胶电泳分离反应体系中剩余的引物和引物二聚体。通

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600n

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L I

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L

DNA测序PCR测序反应

  1. 取0.2 ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待测的质粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 双链DNA - 1 μl  待测DNA的正向引物 1 μl -  M13(

DNA测序前为什么纯化

第一代测序技术第一代DNA测序技术用的是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)开创的链终止法或者是1976-1977年由马克西姆(Maxam)和吉尔伯特(Gilbert)发明的化学法(链降解). 并在1977年,由桑格老人家测定了第一个基因组序列——噬菌体phiX-174,全长只

反应时间对产物形成的影响实验

实验方法原理 酶反应的时间进程曲线的起始部分在某一段时间范围内呈直线,其斜率代表酶反应的初速度。随着反应时间的延长,曲线斜率不断减小,说明反应速度逐渐降低,这可能是因为底物浓度降低和产物浓度增高而使逆反应加强等原因所致,因此测定准确的酶活力,必须在进程曲线的初速度时间范围内进行,测定这一曲线和初速度

反应时间对产物形成的影响实验

二硝基水杨酸法             实验方法原理 酶反应的时间进程曲线的起始部分在某一段时间范围内呈直线,其斜率代表酶反应的初速度。随着反应时间的延长,曲线斜率不断减小,说明反应

PCR产物的直接纯化原理、材料与方法

一.原理PCR产物一般都含有过量的引物、Taq DNA酶及dNTP,这些成分的存在将直接影响到后续的酶切、双脱氧PCR测序反应等过程,因此有必要除去。目前核酸纯化的方法有很多,商用化试剂盒的出现使得DNA的纯化过程变得更加简便快捷。本实验中,Buffer PCR-A促使大于100bp的DNA片断选择

PCR产物的直接纯化原理、材料与方法

一.原理PCR产物一般都含有过量的引物、Taq DNA酶及dNTP,这些成分的存在将直接影响到后续的酶切、双脱氧PCR测序反应等过程,因此有必要除去。目前核酸纯化的方法有很多,商用化试剂盒的出现使得DNA的纯化过程变得更加简便快捷。本实验中,Buffer PCR-A促使大于100bp的DNA

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -  

PCR-产物定量实验

            试剂、试剂盒 DNA 标准 TE PCR 产物 仪器、耗材 荧光计 金属箔纸

PCR-产物定量实验

试剂、试剂盒 DNA 标准TEPCR 产物仪器、耗材 荧光计金属箔纸微量离心管实验步骤 方法 A: 荧光测定法荧光测定法可以在纳克级范围精确定量。荧光计和 DNA 定量试剂盒许多公司都有出售。确定荧光计是否安装了适合于特定染料的激发和发射的部件至关重要。该方法在设计上适用于配有带蓝色 LED

PCR-产物定量实验

测序之前对模板精确定量至关重要。根据 DNA 用量的多少,有几种不同的方法可供选择。下面介绍另外两种方法:荧光测定法和比较溴化物染色法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒DNA 标准TEPCR 产物仪器、耗材荧光计金属箔纸微量离心管实验步骤方法 A: 荧光测定

天然产物中多糖的分离、纯化与鉴定(2)

二、粗多糖的纯化粗多糖溶液加入Sevag试剂(氯仿:正丁醇=3:1混合摇匀)后,置恒温振荡器中震荡过夜,使蛋白质充分沉淀,离心(3000r/min)分离,去除蛋白质。然后浓缩,透析,加入4倍体积的乙醇沉淀多糖,将沉淀冻干。取样品0.1g溶于10ml 0.01mol/L Tris-HCL, PH=7.

天然产物中多糖的分离、纯化与鉴定(1)

第一部分多糖的提取、纯化目的要求了解多糖提取和纯化的一般方法。实验原理多糖类物质是除蛋白质和核酸之外的又一类重要的生物大分子。早在60年代,人们就发现多糖复杂的生物活性和功能。它可以调节免疫功能,促进蛋白质和核酸的生物合成,调节细胞的生长,提高生物体的免疫力,具有抗肿瘤、抗疡和抗爱滋病 (AIDS)

双脱氧法DNA测序实验——α标记核苷酸进行热循环测序反应

实验材料DNA试剂、试剂盒DNA测序缓冲液dATPDNA聚合酶仪器、耗材热心换反应装置离心机实验步骤1.  对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。2.  分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。 3.  对于单链模板:在0.5 ml 微量

免疫纯化实验

实验方法原理 制备免疫亲和柱要求抗体首先共价结合到介质上。另一方法是将抗体结合到蛋白 A 或 G 小珠上,再用交联剂固相化。后一方法由于蛋白 A 或 G 结合在杭体的 Fe 区, 所以结合抗原的部位获得充分暴露,从易于接近。免疫亲和柱制备完成后,抗原溶液即可以上样,接着洗去污染物,然后洗脱抗

纯化DNA实验

实验材料 细胞试剂、试剂盒 TBS抽提缓冲液仪器、耗材 离心管实验步骤 1. 根据样品类型,从下列方法中选一个作为步骤 1 进行操作。(1) 细胞样品① 单层培养的细胞以用冰预冷的 TBS 将单层细胞洗涤 2 次,用刮棒把细胞刮入约 0.5 ml 的 TBS 中,将细胞悬液转移到冰浴的离心管中,

凝胶纯化实验

试剂、试剂盒蒸馏水乙醇甲酰胺胶的缓冲液亚甲基蓝十二烷基硫酸钠储存液TAE 缓冲液Tris 乙酸盐乙酸纳EDTA蓝色葡聚糖TEN 缓冲液40mer聚丙烯酰胺胶仪器、耗材解剖刀UV 灯过滤 UV 的安全破璃实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水乙醇,95%甲酰胺 (使用安珀莱特单床离子交换树脂