肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水解后产生的理论肽段的质量。(4) 用试验得到的肽质量与数据库中的肽质量计算值相匹配,计算得分或排序值。这种检索途径有一个明显的限制,就是被鉴定的蛋白质必须已经存在于序列数据库(翻译的核酸序列或蛋白序列数据库)。这一手段非常适用那些基因特性非常清楚的物种,特别是全基因组已知的物种(例如见 TIGR 数据库, http,//www. tigr. org/tdb), 亦用于那些已经建立详尽的蛋白质或 cDNA 序列数据库的物种。肽质量检索鉴定蛋白质方法的依据是实验中获得的蛋白质的多个肽段的质量数据与同蛋白质肽段质......阅读全文
肽质量检索实验
基本方案 其他方案 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被
肽质量检索实验_其他方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中,最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高,结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶(或化学试剂)的专一性。酶越纯,专一性胞高,检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是,即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非
肽质量检索实验_基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水
单一同位素肽段质量和平均同位素肽段质量有什么不同?
单一同位素肽段质量(monoisotopic peptide mass)和平均同位素肽段质量(average peptide mass)有什么不同?组成蛋白质的原子在自然界中存在着不同比例的同位素(见下表)。所以含有这些同位素原子的肽段的质量比不含任何同位素的肽段的质量要大。不含任何同位素的肽段的质
一文了解肽质量指纹图谱原理
肽质量指纹谱分析也称肽指纹图谱,是目前蛋白质组研究中鉴定蛋白较为常用的方法。 由于每种蛋白质的氨基酸序列(一级结构)都不同,蛋白质被酶水解后,产生的肽片段序列也各不相同,其肽混合物质量数亦具特征性,所以称为指纹谱,可用于蛋白质的鉴定,即用实验测得的蛋白质酶解肽段质量数在蛋白质数据库中检索,寻找
肽、多肽、活性肽与大肽如何划分?
分子量段在50~5000之间的才能称为肽。分子量段在5000~10000之间的称为大肽。分子量段在50~2000之间的称为小肽、寡肽、低聚肽,也称为小分子活性多肽。生物学家将肽称为“氨基酸链”,将小分子活性多肽统称为“生物活性肽”。常见的有二肽(Dipeptide),三肽(Tripeptide),甚
肽的应用抗菌活性肽
当昆虫受到外界环境刺激时会产生大量具有抗菌活性的阳离子多肽,2013年已从中筛选出百余种抗菌肽。体内外实验证实,很多抗菌肽不仅有很强的抗菌、杀菌能力,而且还能杀死肿瘤细胞。
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶 试剂、试剂盒碳酸氢铵 碳酸氢铵
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材真空离心机烤箱实验步骤许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编自 Je
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(一)
实验材料 测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒 碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材 真空离心机烤箱实验步骤 许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编
“肽”精彩-“2018美国药典多肽药物质量与标准国际论坛”开幕
2018年4月19日-20日,由美国药典委员会(United States Pharmacopoeia,USP)主办,世易科技协办的“2018美国药典多肽药物质量与标准国际论坛”在浙江省杭州市隆重举行。 大会盛邀全球知名多肽药物研发企业领袖、来自美国食品药品监督管理局(US FDA)和中国食品
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(二)
1. 目标样本沉积 1 ) 经典干燥液滴法( 1 ) 半饱和氰基-4-羟基肉桂酸(约 5 mg/ml) 的配制:将 α-氰基-4-羟基苯甲酸溶解在 300 μl 1 : 1 乙腈/ TFA 溶 液(超声 10 min) 。离心几秒钟得到上清液。取 200 μl 上清液加到微量离心管中,并加入相同
方案13-利用化学印刷法进行肽质量指纹图谱分析实验
实验材料细胞或所研究的蛋白质试剂、试剂盒ACTH 肽段样品变性缓冲液直接蓝-71等电聚焦平衡缓冲液碘乙酰胺基质缓冲液辛基-吡喃葡萄糖修饰的猪胰蛋白酶三丁基膦仪器、耗材离心机化学打印仪导电胶带湿盒固定化pH梯度胶条MALDI 板质谱仪NuPAGE离线扫描仪PVDF 膜实验步骤一、样品的 2DPAGE
外显肽
中文名称外显肽英文名称extein定 义某些蛋白质前体中经自我剪接后保存下来的一些肽段。其重新连接成为成熟的蛋白质,与被切除的内含肽相对应。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),氨基酸、多肽与蛋白质(二级学科)
肽段
· Designing Your Peptide (Genosys)· Handling & Storage of Peptides (Genosys)Two Dimensional Peptide Mapping (Sefton Lab) Synthesizi
内含肽
内含肽intein是位于宿主蛋白质中的一段插入序列,前缀in一取自inventing, 后缀tein一取自protein。与内含肽相对应的另一专用术语是外显肽。内含肽基因不是一个独立的基因, 必须插入于外显肽基因才能复制转录,可从前体蛋白中切除并将两侧外显肽连接起来成为成熟蛋白质。其对应的核苷酸序列
肽,二肽及多肽的区别
肽是氨基酸的链状聚合物。由两个氨基酸构成的肽是二肽,三肽和四肽等依此类推。通常把2-10个氨基酸构成的肽称为寡肽;由更多氨基酸构成的肽称为多肽。
肽的应用细胞因子模拟肽
利用已知细胞因子的受体从肽库内筛选细胞因子模拟肽,2011年成为国内外研究的热点。国外已筛选到了人促红细胞生成素、人促血小板生成素、人生长激素、人神经生长因子及白介素-1等多种生长因子的模拟肽,这些模拟肽的氨基酸序列与其相应的细胞因子的氨基酸序列不同,但具有细胞因子的活性,并且具有相对分子质量小等优
关于杆菌肽及短杆菌肽的介绍
分别由苔藓样杆菌及短芽孢杆菌分离得到,均是由肽链连结的氨基酸组成。两种抗生素对大部分革兰氏阳性细菌有高度抗菌活性。金黄色葡萄球菌、β溶血性链球菌对其很敏感,对 B组链球菌常耐药。杆菌肽对致病性奈瑟尔氏球菌敏感,短杆菌肽则稍弱。对革兰氏阴性杆菌则完全无效。 杆菌肽的作用机理主要是抑制细菌细胞壁的
肽酰位
中文名称肽酰位英文名称peptidyl site;P site定 义核糖体中肽酰tRNA停留的部位。在蛋白质合成过程中,肽酰位上的肽酰tRNA的肽链末端羧基与氨酰位上的氨酰tRNA的氨基反应,形成新的肽键,增加了一个氨基酸的肽酰tRNA再移至肽酰位,如此循环,肽酰位上tRNA的肽链逐个延伸,直至蛋
活性肽种类
免疫活性肽、神经活性肽、其他活性肽等。 其他活性肽包括:胆固醇肽、促进矿物质吸收的肽(CPPS)、酶调节剂(如促胰酶肽)、激素肽如生长激素释放因子(GRFS)、白蛋白胰岛素增效肽、抗菌多肽(如乳酸链球菌素、橡胶素)、抗癌多肽(如肿瘤细胞坏死因子、环已肽)、抗艾滋病肽(如GLQ蛋白)等。
浅谈c肽
一、概述胰岛素是体内唯一能直接降低血糖浓度的激素,与糖尿病两者关系密不可分,它促进肝脏肌肉和脂肪组织摄取利用葡萄糖,人体血糖的稳定有赖于体内胰岛素的作用。研究人员在研究胰岛功能的过程中发现胰岛b细胞分泌胰岛素时,首先合成一种胰岛素前体物质叫做胰岛素原。胰岛素在酶的作用下裂解一个分子的胰岛素原和同样一
杆菌肽试验
(1)原理:A群链球菌对杆菌肽几乎是100%敏感,而其它群链球菌对杆菌肽通常耐药。故此试验可对链球菌进行鉴别。 (2)培养基:血琼脂平板。 (3)方法:用棉拭子将待检菌的肉汤培养物均匀涂布于血琼脂平板上,稍干后贴一张含0.04U的杆菌肽纸片,置35℃ 孵育18~24h,观察结果。 (4)
信号肽
信号肽用作靶向信号,使细胞转运机制能够将蛋白质引导至特定的细胞内或细胞外位置。虽然尚未确定信号肽的共有序列,但仍有许多具有特征性的三方结构:靠近N端的带正电的亲水区域。靠近信号肽中间的10到15个疏水氨基酸的跨度。靠近C末端的弱极性区域,通常偏爱在接近切割位点的位置具有较小侧链的氨基酸。在蛋白质到达
什么是肽?
肽,是一种链状的氨基酸聚合物,两个或以上的氨基酸脱水缩合形成若干个肽键从而组成一个肽。多个肽进行多级折叠就组成一个蛋白质分子。肽是介于氨基酸和蛋白质的中间分子物质。氨基酸的分子最小,蛋白质分子最大。机体内很多活性物质,如激素、酶类等本质上都是肽,由于其具有生物活性,在代谢调节、神经传导等方面起着重要
肽的分类
生物活性肽分布广泛,多来源于动、植物体。按其原料来源可分为:海洋生物活性肽和陆地生物活性肽。01 按照分子量大小分为小肽:又叫小分子肽,是指仅由2~4个氨基酸构成的高活性肽;寡肽:是指2-10个氨基酸组成的肽,分子量一般在1000道尔顿以下;多肽:10-50个氨基酸组成的肽;蛋白质:一般指51以上个
胸腺五肽
性状本品为白色或类白色粉末或疏松块状物本品在水中极易溶,在乙醇中微溶,在乙酸乙酯、乙醚或石油醚中不溶比旋度取本品,精密称定,加水溶解并定量稀释制成每lml中含20mg的溶液,依法测定(通则0621),以无水、无溶剂与无醋酸物计算,比旋度为-14.0°至-22.0°。鉴别(1)取本品1mg,加水1ml
纤维蛋白肽A
纤维蛋白肽A(fibrinopepide-A,FPA): 是在凝血酶作用下,纤维蛋白原α(A)链的精-16和甘-17之间的肽链裂解,释放出由1-16个氨基酸组成的纤维蛋白肽A。是反映体内凝血活性及纤维蛋白最终形成血栓的可靠指标。正常值: 1.2±0.8μg/L。临床意义: 血浆
醋酸奥曲肽
性状本品为白色或类白色冻干粉末或疏松块状物。本品在水和冰醋酸中易溶,在乙醚中不溶比旋度取本品,精密称定,加冰醋酸溶解并定量稀释制成每1ml中约含5mg的溶液,依法测定(通则0621),按无水、无醋酸物计算,比旋度为一66.0°至一76.0°鉴别(1)取本品约1mg,加水1ml溶解,加双缩脲试液(取硫