RNA抽提成功经验法则大公开!

本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。 Lab 的经验和客户的难题 以华联基因体实验室的长期以来承接客户RNA检体的经验来说,我们经常遇到的问题是(1)RNA的总量不够,(2)RNA有严重的盐类污染,(3)RNA有严重的有机溶剂污染,(4)DNA污染及(5)样品降解严重(图一图二)。前四项问题都还好解决,只需要再次萃取或进行纯化即可解决,但是样品降解就较为棘手,常常因重新准备检体一来一往,耗掉不少心力和时间,最后也拿不到好的结果。 客户经常会问为什么执行芯片实验会如此要求RNA质量呢?而其他的检测方法如实时定量聚合连锁反应(Real-time Quantitative Poly......阅读全文

RNA抽提-成功经验法则大公开!

  本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。   Lab 的经验和

RNA抽提-成功经验法则

本期专文要来跟大家讨论的话题是核糖核酸(RNA)的萃取,看到这里各位心中可能已经起了疑问: RNA 萃取不是很简单吗?只要照着标准步骤操作,加一加试剂就完成了,有必要大费周章特地开篇幅来谈这件事吗?其实越简单的东西遇到困难时就越难解,各位看倌就请耐着性子,听我们娓娓道来。Lab 的经验和客户

RNA-萃取实验前必读-成功经验法则大公开

Lab 的经验和客户的难题以华联基因体实验室的长期以来承接客户 RNA 检体的经验来说,我们经常遇到的问题:(1)RNA 的总量不够;(2)RNA 有严重的盐类污染;(3)RNA 有严重的有机溶剂污染;(4)DNA 污染;(5)样品降解严重。前四项问题都还好解决,只需要再次萃取或进行纯化即可解决,但

RNA抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?   组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降

血与泪的RNA抽提抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降解和组

RNA抽提指南(TRIZOL法)

RNA抽提指南(TRIZOL法)注意事项:* 全程佩戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。* 使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。例如,使用RNA探针的实验室

RNA抽提和标记实验

实验材料从组织培养收获的细胞在组织培养中的细胞冻存的整个组织试剂、试剂盒磷酸盐缓冲液(PBS)TRIzol 试剂乙醇乙酸钠EDTANaOHTris-ClTE 缓冲液固定化的 oligo-dT 引物仪器、耗材组织匀浆器热循环仪荧光扫描仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1a.

RNA抽提和标记实验

实验方法原理 实验材料 从组织培养收获的细胞在组织培养中的细胞冻存的整个组织试剂、试剂盒 磷酸盐缓冲液(PBS)TRIzol 试剂乙醇乙酸钠EDTA NaOHTris-ClTE 缓冲液固定化的 oligo-dT 引物仪器、耗材 组织匀浆器热循环仪荧光扫描仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材

RNA抽提和标记实验

            实验方法原理 实验材料 从组织培养收获的细胞 在组织培养中的细胞 冻存的整个组织

基本方案2-RNA-抽提和标记

试剂、试剂盒TRIzol 试剂PBS氣仿乙醇乙酸钠引物Superscript Ⅱ RNase H反转录酶10 X low-T dNTP 混合物EDTATE 缓冲液仪器、耗材RNeasy Maxi 试剂盒组织匀浆机圆底离心管圆锥底离心管水平离心机薄壁 PCR 管热循环仪荧光扫描仪实验步骤展

哺乳动物组织样品RNA的抽提

哺乳动物组织样品RNA的抽提最基本的要素是防止RNA在抽提过程中降解,以及尽可能得到最高的RNA抽提效率。以下介绍我们实验室认为最符合以上两个要素的抽提方法。一、实验材料:Trizol试剂(Invitrogen公司)研钵,匀浆器,镊子,铝箔都高温灭菌即可;二、具体过程:1、样品在离体后应迅速冷冻在液

微量RNA的抽提RNeasy-MinElute-Spin-Column

·为了更好地裂解,细胞数不能大于5×105,细胞过多会减低产率和纯度。 准备工作: 1.在 24 ml 96-100%乙醇 中加入 6 ml 去RNA酶的水。 2.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ml β-ME (加入β-ME的Buffer RLT可在室温下放置1

RNA抽提注意事项和经验指南1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

样本抽提中RNA降解的解决方法

从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不准确。遇到R

RNA抽提注意事项和经验指南3

RNA 抽提的“三大纪律八项注意” 纪律一:杜绝外源酶的污染。注意一:严格戴好口罩,手套。注意二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。纪律二:阻止内源酶的活性注意四:选择合适的匀浆方法。注意

样本抽提中RNA降解的解决方法

  从临床样本出发进行芯片、测序等高通量生物学研究是最常用的思路,但样本采集过程受制于病理特征、病例数量等因素,耗时费力。无数期盼等来了期待中的临床样本,做个RNA抽提还常常……   降解样本的RNA完整度低,长链RNA变成了短链,在常规的扩增过程中会发生探针检测的目的片段的丢失,导致芯片结果的不

RNA抽提注意事项和经验指南2

3:裂解液的选择 – 影响操作方便程度,内源杂质残留的因素常用的裂解液几乎都能抑制 Rnase 活性,因此,选择裂解液的重点是要结合纯化方法一起考虑。只有一个例外:高内源酶含量的样品建议使用含苯酚的裂解液,以增加灭活内源酶的能力。 4:纯化方法的选择 – 影响内源杂质残留。抽提速度的因素对于干净的样

RNA抽提注意事项和经验指南1

背景介绍实验前方法/试剂的选择问题解答 (外源性污染导致的问题不在本解答考虑中)RNA 抽提的“三大纪律八项注意”Rnase 污染的10大来源RNase 和 DEPC 处理RNA 抽提的10大窍门提高 RNA 得率经典抽提小技巧特殊组织的抽提样品冻融的影响RNA 质量的判断RNAguard:使降解成

RNA抽提注意事项和经验指南4

经典抽提小技巧 1: Phenol 纯化:将等体积的 1:1 Phenol/Chloroform 加入,剧烈混允 1-2 分钟。高速离心 2 分钟。小心取上清 (80-90%)。决不能取到中间层。可以使用等体积的反应液加入 Phenol/Chloroform 中,同样再取出上清。将两次的上清

核酸抽提

mRNA的分离 与rRNA和tRNA不同的是,哺乳动物细胞的绝大部分mRNA在其3'端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纤维素亲和层析法从大量的细胞RNA中分离mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在构建cDNA文库时, 必须经上述纯化步骤制

核酸抽提

最糟糕的心态 - 实验失败了,抱怨试剂不好。实验人员本来是应该拥有修正主义、机会主义、怀疑论等诸多“不完美的”意识,所以一定要用“完美的”自我批评意识来平衡。我为什么没有一双慧眼选择可靠的供应商?我为什么不做预实验检测所购试剂?最糟糕的知识 - RNase A 的作用。RNase A 是内切酶,内切

DNA抽提

DNA抽提(主要内容如下)·   Working with DNA·   DNA Extraction from Bacteria and Other Organisms·   DNA Extraction from Cell and Tissue·   Mitochondria DNA Isola

在抽提RNA时,有色素污染,怎样去除色

用Trizol法沉淀RNA容易有一些杂质的。部分色素是会和RNA一起沉下来。这种情况可以用75%冷的乙醇多洗几遍。对后续qRT-PCR多数情况下没什么影响。另外可以用硅胶柱法纯化RNA,色素残留会少一些。RNase 污染的10大来源1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换

脂肪抽提仪开展脂肪抽提的四个步骤

脂肪抽提仪是 基于索氏抽提法原理研发生产的一款脂肪测定仪器。由于索氏抽提具有方便快捷的特点,因此脂肪抽提仪采用该原理来测定食品中的脂肪含量等,会更有优势,应用 会更加广泛。脂肪抽提仪的工作过程是通过在适当的温度下试剂对样品的浸提,最终实现目标物(如脂肪)的分离。应用脂肪抽提仪开展脂肪抽提,主要可以为

RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)5

室温下充分混匀,离心10000g×2min。取上层液置另一0.5 ml离心管中,加入100μl氯仿,混匀,离心10000g×2min。将上层液转移至另一0.5ml 离心管中,再加入3M NaAc 10μl、预冷无水乙醇250μl,混匀后,-20OC静置30min。4OC离心13500g×10

RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)2

关于平台期和线性期的问题,实际上线性期是指数期,只不过碰巧2的冥和2的倍数是相同的。看上去任何一个时期都可以,实际上是不对的,因为牵涉到酶促动力学的问题,这个我也不懂,有一些专门的文章,好像,涉及到很多化学的东西。我们学医的,也没必要知道那些,但是其中主要是因为模板引物酶原料和buffer之间的关系

RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)1

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温

RNA-抽提中自备有机溶液的配制及保存问题

看了离心机的配平讨论帖,才决定发起该帖的。该帖的问题也比较简单,但人人都会遇到,所以帖之。实验者,5 成用心,3+ 成用脑,2- 成用手是也。假定你抽提 RNA 时使用到的有机试剂 - 氯仿、异丙醇、无水乙醇 - 都是国产的 (这是完全可以使用的)。我的问题是:你采取了什么措施来降低或者杜绝 RNa

RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)4

3. 由于与反义RNA探针杂交的样品RNA仅为该RNA分子的部分片段,因此,部分降解的RNA样品仍可进行分析。4. 步骤较少,耗时短。与Northern杂交相比,省去了转膜和洗膜的过程。5. RNA-RNA杂交体稳定性高,无探针自身复性问题,无须封闭。6. 一个杂交体系中可同时进行多个探针杂交,无竞

RTPCR实验方法大全(抽提RNA,RT,PCR)3

4. 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经 0.22μm滤膜过滤除菌。5. 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。6. 设置RNA操作专用实验室,所有器