荧光定量PCR实验指南1

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备; 二、技术关键: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对; 从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/网点的genbank中下载所需要的序列。下载的方式有两种:一为打开某个序列后,直接点击“save”,保存格式为“.txt”文件。保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。然后,再打开DNAstar软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“import”,打开后点击“save”,保存为 “.seq”文件。另一种直接用DNAstar软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“openentrezsequence”,导入后保存为“.seq”......阅读全文

实时荧光定量PCR原理和实验(二)

  归一后的荧光信号再扣除本底,就得到DRn:DRn = Rn,样本- Rn,空白。DRn是最后构建PCR实时扩增曲线的纵坐标。   无论绝对定量还是相对定量,在得到实验结果后,还要考虑数据之间的可比性问题。在实验操作中,取样都是以体积或重量为单位的,但是同样体积或重量的样本所来源的细胞数目并不一样

如何做好荧光定量PCR实验?(四)

3.7 模板浓度起始模板的量对于获得高产量很重要。对大多数PCR扩增和荧光PCR扩增,104到106个起始目的分子就足以观测到好的荧光曲线(或在溴化乙锭染色胶上观察到)。所需的最佳模板量取决于基因组的大小(下表)。举例说,100ng到1μg的人类基因组DNA,相当于3×104到3×105个分子,足以

如何做好荧光定量PCR实验?(三)

3.3 引物、探针的纯度和稳定性定制引物的标准纯度对于大多数PCR应用是足够的。部分应用需要纯化,以除去在合成过程中的任何非全长序列。这些截断序列的产生是因为DNA合成化学的效率不是100%。这是个循环过程,在每个碱基加入时使用重复化学反应,使DNA从3'到5'合成。在任何一个循环都

实时荧光定量PCR原理和实验(一)

无论是对遗传病(如地中海贫血和血友病)、传染病(如肝炎和艾滋病)或肿瘤进行基因诊断,还是研究药物对基因表达水平的影响,或者监控药物和疗法的治疗效果,定量PCR技术都可以发挥很大作用。定量PCR技术的最新进展是实时荧光定量。该技术借助于荧光信号来检测PCR产物,一方面提高了灵敏度,另一方面还可以做到P

荧光定量PCR实验中的内参基因

通常它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。内参基因通常是持家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的内参基因包括GAPDH、β-actin(BETA-acti

荧光定量PCR技术

荧光定量pcr(也称taqmanpcr,以下简称fq-pcr)是美国pe(perkinelmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规pcr基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与变通pcr相比,fq-pcr具有许多优点。

实时荧光定量PCR

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析。无论定性还是定量分析,分析的都是PCR终产物。但是在许多

荧光定量pcr原理

荧光定量pcr原理如下:荧光定量PCR(Real-time PCR),是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团,通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针两

关于荧光定量PCR

  实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。  Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号

荧光定量PCR要点

一、荧光定量PCR原理荧光定量PCR(Real-time PCR),是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团,通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针两端

荧光定量pcr原理

荧光定量pcr原理如下:荧光定量PCR(Real-time PCR),是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团,通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针两

荧光定量pcr原理

荧光定量pcr原理如下:荧光定量PCR(Real-time PCR),是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团,通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针两

实时荧光定量PCR

Real Time PCR实时荧光定量PCR   其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料(如: SYBR GREEN I )或特异性的荧光探针(如: Taqman 探针),实时检测荧光量的变化,获得不同样品达到一定的荧光信号(阈值)时所需的循环次数: CT 值( Cycle

实时荧光定量PCR

  实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品Ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。因此,实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的:  1)Ct值的重现性PCR循环在到达Ct值所在的循环数时,

实时荧光定量-PCR

实时荧光定量 PCR 是一种可以实时检测核酸扩增的技术,在 PCR 反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化对 PCR 过程进行实时监控,以此实现对初始模板的定量分析。常用标记方法主要有两种,一是非特异性荧光标记:SYBR Green I;二是特异性荧光标记:Taqman 探针法。    实时荧光

实时荧光定量-PCR

Thomas D. SchmittgenDepartment of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy,Washington State University, Pullman, WA 99164.      对于从 90 年代初就开始接触定

实时荧光定量-PCR

    实时荧光定量 PCR ,简称 RT-QPCR, 属于 Q-PCR 的一种,目前该技术已得到广泛应用,如:扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、 SNP 分析等。荧光定量 PCR 常用的方法是 DNA 结合染料 SYBR GreenⅠ的非特异性方法。    SYBR Green I 是一种结

实时荧光定量PCR(realtime-PCR)

实验材料 细胞样品试剂、试剂盒 RNA提取试剂盒荧光定量PCR MixTRIZOLdNTP氯仿逆转录酶MMLV异丙醇Taq酶DEPC水ddH2OTEMgCl2琼脂糖溴化乙锭MOPS甲醛乙酸钠EDTAEB溴酚兰仪器、耗材 离心管离心机风光光度计电泳槽凝胶板Realtime PCR仪实验步骤 一、 样品

实时荧光定量PCR(realtime-PCR)

实验步骤一、 样品RNA的抽提 1.  取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。2.  两相分离 每1 ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12 000 rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的

实时荧光定量PCR(realtime-PCR)

            实验方法原理 实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 实验材料

实时荧光定量PCR(Realtime-PCR,QPCR,荧光定量)分类以...

实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)分类以及实验步骤介绍实时荧光定量PCR(Real-time PCR,QPCR,荧光定量)技术(Real-time quantitative PCR),是指在(QPCR,荧光定量)反应体系中加入荧光基因,利用荧光信号积累实时监测整个(

荧光定量PCR实验中的反转录对照

可以使用提取好的RNA内参基因,RNA假病毒混合基质,灭活RNA病毒混合基质来监控反转录到扩增的流程。无反转录对照(no-RT control)含有除反转录酶以外的所有成分。

荧光定量PCR实验中的核酸提取对照

可以使用内参基因,假病毒混合基质,灭活病毒混合基质来监控提取到扩增的流程。

实时荧光定量PCR(RealTimePCR)实验流程

   一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)   不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-TimePCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。   在总rna的提取过程中,注意避免m

如何进行兽医检测荧光定量PCR实验?

实时荧光定量PCR技术(real-time fluorescent quantitative PCR,后文简称qPCR)作为目前核酸检测和定量中最主要的分子生物学工具之一,以其特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、自动化程度高、速度快等多个优点在疾病快速检测、食品安全检测、靶向用药基因检测等多种应

荧光定量PCR实验中人工内标的概念

添加一种不会干扰靶序列扩增的人工合成的内标。现在国外的诊断试剂盒大部分都会将内标直接添加在反应液中与模板一起扩增,但是这样的内标不能监控采样,运输和核酸提取的过程。还有另一种形式的内标,使用人工合成的假病毒,在核酸提取前在每一份样品中加入等量的内标,这样就可以监控样品的提取到扩增的过程。但是由于是人

荧光定量PCR实验中的空白对照

无模板空白对照NTC是指不含有模板(阳性模板或者阴性模板)的对照。目前的试剂盒的NC一般都是水或阴性缓冲液,所以NC等同于NTC。其实两者有不同的作用。仪器空白对照NTC是含有引物探针和反应液主要监控引物探针,反应体系有没有被污染。这里的仪器空白对照我通常使用的是空反应管来监控仪器有无非特异性的荧光

定量PCR实验

实验材料 限制性内切核酸酶反转录酶热稳定 DNA 聚合酶dCTP靶核酸试剂、试剂盒 扩增缓冲液dNTP 贮存液胎盘 RNase 抑制剂仪器、耗材 琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶屏蔽型枪头离心管正向排液式移液器PCR 仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液与溶液10X 扩增缓冲液4 种 dNTP 贮存液(20

荧光定量PCR技术简介

国内最先进的荧光定量PCR检测系统,是国际上最新研制的一种核酸定量技术,该技术在PCR反应系统中引入了荧光标记探针,具有高灵敏性、高特异性、和高精确性的特点。目前已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、免疫分析、基因表达、突变和多态性研究等多个领域。荧光定量PCR(简称FQ-PCR)由美国PE公司199

荧光定量PCR技术原理

  将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增