斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
水生所揭示Smad蛋白介导BMP信号的调控机制
BMP蛋白是一类形态发生素(morphogen)，对胚胎早期发育的背腹轴向决定起着关键作用，其功能丧失将导致腹侧发育的严重缺陷。BMP信号由3类受体型Smad——Smad1、Smad5、Smad8 (Smad9)来介导。然而，这些受体型Smad是如何在胚胎发育早期进行精细调控，在整体水平上调
科学家揭示软骨鱼类感短波基因丢失适应性进化机制
上海海洋大学教授鲍宝龙、李云凯团队，联合南方海洋科学与工程广东省实验室（湛江）研究员赵娜、青岛华大基因研究院张要磊等，发现依赖短波视蛋白的短波光会导致视网膜感光细胞衰老，并探究了鲨鱼等软骨鱼类感短波基因丢失的适应性演化机制，揭示了鲨鱼不能感蓝光和紫光的原因。相关研究8月18日发表于《自然-通讯》
生命科学研究中常见模式生物简介（一）
模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点，在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题，对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有有真菌中的酵母，原核生物中的大肠杆菌，低等无脊椎动物中的线虫，昆虫纲的果蝇，鱼纲的斑马鱼，哺乳纲的
水生所在鱼类诱导型原始生殖细胞理论和技术方面获进展
原始生殖细胞（primordial germ cell，PGC）是精子和卵子在胚胎期的祖先细胞（progenitor cell），是遗传物质代际传递的细胞载体。因此，PGC是开展基因编辑和转基因等遗传操作的理想靶细胞。将遗传操作后的PGC移植入内源PGC剔除的受体胚，利用受体高效产生遗传操作的供
美研制出高效基因组改编方法
中国科技网讯 据物理学家组织网、《自然》网站等媒体9月23日报道，一个由美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所研究人员领导的国际研究小组，开发出一种高效的基因组改编方法，可对斑马鱼基因组进行精确定位的剪切替换，用于各种研究目的。该研究首次实现了对斑马鱼基因组分的自定义
斑马鱼模型首次揭示干扰素λ受体突变导致遗传性耳聋
2月16日（正月初一），国际医学遗传学期刊 Journal of Medical Genetics 在线发表了解放军总医院的科研成果“Mutation of IFNLR1, an interferon lambda receptor 1, is associated with autosomal
研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制
斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解，其中包
斑马鱼模型揭示干扰素λ受体突变导致临床遗传性耳聋
2月16日（正月初一），国际医学遗传学期刊 Journal of Medical Genetics 在线发表了解放军总医院的科研成果“Mutation of IFNLR1, an interferon lambda receptor 1, is associated with autosomal
水生所揭示斑马鱼肠道微生物群落构建及演替规律
生物多样性的形成和维持机制一直以来都是生态学研究的重要内容。针对群落的构建规律，生物多样性的时空格局是研究的重点，其中关注最多的是物种-面积理论，但主要是针对动、植物在典型岛屿的分布规律，而微生物方面的研究相对较少。由于动物消化道最开始是无菌的，之后通过迁入、迁出形成了特定的群落并维持
斑马鱼20羟化二十碳四烯酸（20HETE）酶联说明
实验原理本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中斑马鱼20-羟化二十碳四烯酸(20-HETE)水平。用纯化的斑马鱼20-羟化二十碳四烯酸(20-HETE)抗体包被微孔板，制成固相抗体，往包被单抗的微孔中依次加入20-羟化二十碳四烯酸(20-HETE)，再与HRP标记的20-羟化二十碳四烯酸(20-HETE
日研究人员又发现一个基因与肥胖有关
日本三重大学日前发表公报称，发现一种称为“MXD3”的基因与肥胖有关。研究小组认为，如果开发出遏制这种基因作用的药物，就有望缓解代谢综合征。 研究小组利用小型热带鱼——斑马鱼进行了实验。研究人员给斑马鱼喂食过量的食物，约8周后取出内脏脂肪组织进行研究，结果发现有91个基因的功能变得活跃起来
热带鱼也吸毒－有助寻找新的戒毒疗法
热带斑马鱼并不需要太长时间便会对氢可酮上瘾。在一个星期内，这些小鱼会冒着生命危险，每小时数千次地获取1单位剂量的阿片类药物，这是第一个让鱼自己选择何时服用药物的研究。 美国科研人员发现，这种在生物学研究中常用的斑马鱼会主动“吸毒”，一些与毒瘾有关的行为与人类相似，这将有助研究新的戒毒药物和疗法
水生所等创制出无肌间刺银鲫突变体
无肌间刺鱼突变体种质的创制是近年来鱼类遗传育种学研究的热点。异育银鲫以其肉质细嫩鲜美深受消费者青睐，但其体内具有的80多根细小的肌间刺给食用者带来了不少麻烦。近两年来，中国科学院院士、中科院水生生物研究所研究员桂建芳团队经全基因组解析揭示银鲫为双三倍体，即包含有两套三倍体基因组，由此开拓完善了在
科学家发现新的“分子闹钟”
脊椎动物大脑中的许多化学相互作用，可保持一张自然的睡眠时间表，科学家们最近发现了其中一个参与因子——一种称为神经介肽U（Nmu）的神经化学物质。他们在斑马鱼和人类中分析了这个蛋白质，发现该蛋白可刺激清醒，特别是在早上。这项研究于2016年2月17日发表于《Neuron》杂志。 本文资深作者、加
VFA测定简易方法是怎么做
a.药品和设备仪器：0.1000mol/L的HCl标准溶液、0.1000mol/L的NaOH标准溶液、250ml烧瓶（带磨口）、50ml烧杯、移液管、加热回流装置，PH酸度计等。b.操作步骤（1）安装并校准自动电位滴定计。（2）取已经过滤的水样20ml（其中含有VFA的量不超过3ml）加入50ml烧
细菌抗原分析这个是怎么做
1）表面抗原：细胞壁外的抗原物质 如：K抗原（大肠杆菌） Vi抗原（伤寒杆菌）2）菌体抗原：细胞壁中的抗原物质：O抗原。3）鞭毛抗原：鞭毛中的抗原物质：H抗原。4）菌毛抗原
大肠杆菌基因组基因无痕敲除的优化方法
近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成生物学等领域的重要工具菌株，是生产重组蛋白、氨基酸、有机酸、能源物质和一些重要化工产品的主力微生物之一。为使大肠杆菌获得新的性状和生产能力， 基因敲除及基因敲入是构建新型大肠杆菌的重要手段。 近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成
文献中遇到的实验动物知识：基因敲除小鼠
投稿人：郭晓冲 中国医科大学动物部 写给看文献的你们： 我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识，希望对大家有帮助。为了便于理解，语言偏通俗，可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识，欢迎选修实验动物学。 第一集，关于基因敲除小鼠。 基因敲除小鼠（Knoc
基因敲除小鼠在抗体药物研发平台的应用
“千鼠万抗”计划 (Project Integrum) 是百奥赛图抗体药物研发平台的重要组成部分。目标是利用3-5年时间，在全人抗体小鼠RenMab上，逐一对上千个潜在抗体药物靶点进行基因敲除，并利用这些基因敲除小鼠制备抗体的计划。其主要内容包括： 在RenMab上完成1000多个Ta
文献中遇到的实验动物知识：基因敲除小鼠
投稿人：郭晓冲 中国医科大学动物部 写给看文献的你们： 我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识，希望对大家有帮助。为了便于理解，语言偏通俗，可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识，欢迎选修实验动物学。 第一集，关于基因敲除小鼠。 基因敲除小鼠（Knoc
基因敲除小鼠在抗体药物研发平台的应用
“千鼠万抗”计划 (Project Integrum) 是百奥赛图抗体药物研发平台的重要组成部分。目标是利用3-5年时间，在全人抗体小鼠RenMab上，逐一对上千个潜在抗体药物靶点进行基因敲除，并利用这些基因敲除小鼠制备抗体的计划。其主要内容包括： 在RenMab上完成1000多个Targets的
文献中遇到的实验动物知识：基因敲除小鼠
我在这里想写一些看文献时可能遇到的实验动物知识，希望对大家有帮助。为了便于理解，语言偏通俗，可能不够严谨。如果大家希望深入了解实验动物专业知识，欢迎选修实验动物学。第一集，关于基因敲除小鼠。基因敲除小鼠（Knockout Mice），人们使用复杂的方法使小鼠体内的某一个基因不表达，从而使小鼠呈现这个
Science：为何有些细胞永远不会癌变
许多细胞都包含有癌症相关的基因，但是它们却永远不会变成肿瘤，这到底是为什么呢？近期来自波士顿儿童医院的研究人员利用一种荧光报告基因解析了为何细胞会被激活进入类似干细胞的基因表达模式，这种新型可视化技术为了解癌症的起源提供了新工具。 发表期刊：这一研究成果公布在1月29日的Science杂志上。
Science：为何有些细胞永远不会癌变
许多细胞都包含有癌症相关的基因，但是它们却永远不会变成肿瘤，这到底是为什么呢？近期来自波士顿儿童医院的研究人员利用一种荧光报告基因解析了为何细胞会被激活进入类似干细胞的基因表达模式，这种新型可视化技术为了解癌症的起源提供了新工具。这一研究成果公布在1月29日的Science杂志上。 简介与评论
北京大学期刊文章发表帕金森氏病新成果
来自北京大学、加州大学洛杉矶分校的研究人员在斑马鱼模型中证实，th2 (tyrosine hydroxylase 2 )基因是色氨酸羟化酶的编码基因，在5-羟色胺合成中起至关重要的作用，可作为5-羟色胺能神经元(serotonergic neuron)的一个标记物。这些研究成果发表在6月
中科院重离子辐射生物医学重点实验室建成斑马鱼研究平台
在国家重点基础研究发展计划(973计划)、国家自然科学基金重点项目和中科院“西部之光”人才计划项目，以及斑马鱼资源库北方服务中心的支持和帮助，中科院重离子辐射生物医学重点实验室最近建成斑马鱼研究平台。 作为一种新型模式生物，斑马鱼全基因组序列已完全清楚，与人类基因组有85%同源性，目前已获
自闭症研究进展一览
本期为大家带来的是自闭症的研究进展汇总，希望读者朋友们能够喜欢。 1. Cell Res：科学家利用猴子模型取得自闭症研究新进展 自闭症是一种常见的神经发育紊乱疾病，主要症状为社交行为首先以及出现重复性的行为。目前全球范围对自闭症研究兴趣越来越高，而且随着大规模外显子测序技术的发展，一些新型
中科院、清华Cell子刊发表miRNA研究新成果
来自中科院动物研究所及清华大学的研究人员通过斑马鱼胚胎实验，揭示了一个对咽软骨形成起至关重要作用的小分子MicroRNA-92a及其作用机制。相关论文发表在2月11日的《发育细胞》(Developmental Cell)杂志上。 中科院动物研究所的王强(Qiang Wang)博士和清华
Development：一种能阻止性别反转的关键基因
生物通报道：来自中科院遗传与发育生物学的研究人员发表了题为“Translation repression by maternal RNA binding protein zar1 is essential for early oogenesis in zebrafish”的文章，发现斑马鱼zar
基因敲除的不简单论p53基因的重要性
p53基因位于17号染色体p13，全长16-20kb，含有11个外显子，转录2.8kb的mRNA，编码一种分子量为43.7KDa的P53蛋白质，是一种核内磷酸化蛋白。因蛋白条带出现在Marker所示53KDa处，命名为P53。p53基因是人体一种肿瘤抑制基因（tumor suppressor gen