非同一般的非编码smallRNA,参与缺氧下的血管生成
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interacting RNAs(piRNAs),small nucleolar RNAs(snoRNAs)和transfer RNAs(tRNAs)。 由于血液供应不足引起的缺血损伤会引起缺血组织的生能行使。其中,缺血性中风会引起成人脑缺血而致残或致死。已有研究表明,缺血性中风会伴随血管生成,在缺血诱导几个小时后,血管生成因子的表达会急速提高。这对于缺血后的神经管修复与中风恢复至关重要。因此,在缺血下诱导的血管生成机制研究显得非常重要。 研究表明,miRNAs在血管内皮细胞和肿瘤细胞中高表达,是血管生成的重要调控因子。另外,PiRNAs也......阅读全文
非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(二)
接下来,Northern blot实验也验证了其中上调的tRNAVal(CAC)和tRNAGly(GCC)来源片段。此外,qPCR分析也表明,这些small RNAs在缺血后24hr,48hr和72hr时都显著提高。为了进一步探究胁迫诱导的tRNAs剪切过程,研究人员在缺血条件下对不同时间
非编码small-RNA参与缺氧下的血管生成(一)
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interac
非同一般的非编码small-RNA,参与缺氧下的血管生成
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点,其中,long non-coding RNA(lncRNA),microRNA,circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实,在small non-coding RNAs世界,除了我们熟知的microRNA之外,还包括piwi-interacti
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
简述非编码RNA的成熟
多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN
Small-interfering-RNA(siRNA)的概念
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
Nature重要发现:独特的非编码RNA
我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体,每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织,其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调,这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在,来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu
非编码小RNA的结构和功能
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
非编码小RNA的基本信息
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
RNA干扰相关知识Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
Cell惊人发现:谁说非编码RNA不编码?
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时,发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA,它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞
Nature解析癌症与非编码RNA
人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子,但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。
细胞化学词汇非编码小RNA
中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定 义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学
长非编码RNA与肺癌转移
我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白,不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了,近年来人们又发现了一类长非编码RNA,这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。 长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细
非编码RNA的功能引发国际研究热潮
由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。 根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的
如何揭开长非编码RNA的神秘面纱
长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本,但并不编码任何蛋白质。尽管如此,长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究
深入研究非编码RNA的新工具
最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。 这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang
可以促进癌细胞生长的非编码RNA
国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示,增强
单革:非编码RNA的探索者
日前,国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》刊发了中国科学技术大学单革教授的一篇文章,他的实验室发现了一类新型环状非编码RNA,并揭示了其功能和功能机理,相关成果得到了新华社、中科院官网等媒体关注。 记者了解到,在2012年9月,《自然·通讯》也在线发表了单革的研究成果,那次他发现了曾被认为是
血管生成的生成过程
生长因子血管内皮生长因子(VEGF),为单一基因编码的同源二聚体糖蛋白,能直接刺激血管内皮细胞移动、增殖及分裂,并增加微血管通透性。它是针对内皮细胞特异性最高,促血管生长作用最强的有丝分裂原。VEGF与内皮细胞上的两种受体KDR和Flt-1高亲和力结合后,直接刺激血管内皮细胞增殖,并诱导其迁移和形成
Nature:像海绵一样的非编码RNA
一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用,最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制,指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白(repressor proteins)。 小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一类长度为40-400个
Science子刊专题:癌症中的非编码RNA
非编码RNA(尤其是microRNA)是众多细胞过程的关键调控子,与发育和癌症进程密切相关。本期Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”,介绍了这类分子的生理和病理学功能。 发现哺乳动物基因组中的非编码RNA,不仅揭示了一类新的生物学调
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控
出人意料的新才能:非编码RNA
在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过
非编码RNA的调控作用研究计划项目指南
基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2016年度项目指南 非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和
JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA
尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。 以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。 发表在Journal of Clin
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA),但是至今为止,人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明,两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作