浙理工大：芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息
掌叶半夏（Pinellia pedatisecta）是中医中最重要的中草药之一，可治肿毒，具有止呕，化痰，消肿，止痛等功能。MicroRNAs（miRNAs）是内源性非编码小RNA，在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息，并且对其相关生物学功能的研究仍然不足。近日，浙江理工大学的徐涛教授领衔的团队对掌叶半夏的miRNAs进行了深入研究，研究成果发表在9月刊的PLoS One上。 为了检测掌叶半夏中的miRNA并分析其与半夏miRNA的表达差异，研究人员根据miRNAs的保守性，从miRBase数据库上搜集了43个植物物种的成熟体miRNAs序列，采用定制化miRNA芯片对掌叶半夏的miRNAs进行检测（定制化miRNA芯片服务由联川生物完成）。从掌叶半夏和半夏中检出共有的属于22个miRNA家族的101个miRNAs，其中有21个miRNAs在两个品种间存在表......阅读全文
浙理工大：芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息
掌叶半夏（Pinellia pedatisecta）是中医中最重要的中草药之一，可治肿毒，具有止呕，化痰，消肿，止痛等功能。MicroRNAs（miRNAs）是内源性非编码小RNA，在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息，并且对其相关生物
芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息
掌叶半夏（Pinellia pedatisecta）是中医中最重要的中草药之一，可治肿毒，具有止呕，化痰，消肿，止痛等功能。MicroRNAs（miRNAs）是内源性非编码小RNA，在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息，并且对其相关生物学功
浙理工：测序揭示鲨鱼肝脏再生相关miRNAs
大量的证据表明，microRNAs（miRNAs）丰富地存在于肝脏中，并对肝脏的发育，再生及疾病的发生发挥着重要作用。为了更好地促进肝脏疾病与海洋生物的研究，近日，浙江理工大学的吕正兵教授，领衔其团队，对条纹斑竹鲨肝脏的miRNA进行了深入研究，研究成果发表在7月刊的BioMed Researc
测序揭示鲨鱼肝脏再生相关miRNAs
大量的证据表明，microRNAs（miRNAs）丰富地存在于肝脏中，并对肝脏的发育，再生及疾病的发生发挥着重要作用。为了更好地促进肝脏疾病与海洋生物的研究，近日，浙江理工大学的吕正兵教授，领衔其团队，对条纹斑竹鲨肝脏的miRNA进行了深入研究，研究成果发表在7月刊的BioMed Research
转录、降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定
木材的形成是一个复杂的发展过程，主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制，调节植物生长发育过程中靶基因的表达。 这项研究中，中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术，研究不同剥皮时间后，毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取
四川农大：揭示miRNA调控玉米穗发育机制
microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA，在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用，包括代谢，激素反应，转座子的表观遗传控制，胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中，胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而，关于miRNA参
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
BMC－Plant－Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢率明
华南农大：miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA
华南植物园：荔枝果实衰老受miRNA调控
荔枝色泽鲜艳，营养丰富，具有较高的商业价值。然而，在采收后1-2天内荔枝就会变质，主要体现为果皮褐色。调控荔枝果实衰老的因素很复杂。MicroRNAs作为负调控因子参与了几乎所有的生理过程。在最新的一项研究中，中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室从miRNA水平探究了荔枝果实衰
miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA）参与
中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
中国农大：玉米miRNA参与应答氮缺乏
虽然最近研究表明，miRNA能调节植物对于营养缺乏的适应性应答，但对于miRNA在氮缺乏适应性应答的功能仍需进一步探索。为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制，中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统
中海大：测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢
芯片与测序（一）
在高通量检测这个领域里，基因芯片和二代测序这对相爱相杀的cp，原本均是了解基因组结构和功能的绝佳高手，如今为了一争高下，又是闹的不开交。这不，基因芯片仗着自己老大哥的身份，手持一个二维的DNA探针阵列所形成的三维地图，以数以万计的探针做方向标，能按图索骥的找到基因组的特定位置，且结合完整成熟的指控分
芯片与测序（二）
另外，欲寻找疾病诊断标记物的小伙伴可要记住了，无论是mRNA或者lncRNA，HTA平台有更多的基因可作为biomarker。 可变剪切分析是识别基因不同转录本特异性表达的有效手段。其中，RNA-seq可鉴定到23,934个差异exons，HTA鉴定到26,999个差异exons(3698个共
粗蛋白测定仪对不同叶型半夏的研究
分布于中国长江流域以及东北、华北等地区的半夏是一种南星科草本植物，它又被称作守田和地文等。干燥块茎为常用中药,用干湿痰,逆止呕吐,外用可治疗急性乳腺炎、急性或慢性化脓性中耳炎。蛋白质的含量存在于半夏中主要用于血液凝集素具有许多生物活性,除了抑制癌细胞的生长,防病毒等等,蛋白质含量的高低是
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
DNA芯片技术和RNA测序有啥不同？
日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界：日本政府秘密建立名为“白金数据”的数据库。该库搜集了全国人民的DNA数据，通过对犯罪分子留在现场的毛发、体液等证物进行比对，警方可以高效、快速、准确锁定真凶。借助“白金数据”的帮助，一个检举率100%、冤案率0%的理想法制社会构建完
SNP检测技术（测序、taqman探针和snp芯片）
snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点，如hla区域，但成本较高，工作量大，不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠，国外文章也大量应用，不过对于国内成本偏高，同类还有snpshot技术，abi和贝克曼
miRNAs有助开启小儿脑肿瘤新疗法
脑肿瘤是小儿时期最常见的肿瘤，是导致儿童疾病相关死亡的首要原因。以往许多研究都集中在涉及小儿脑肿瘤复杂的生物过程，但很少有人揭示microRNAs（miRNAs）在小儿肿瘤发生中可能扮演的角色。 本研究中，来自上海生命科学院和上海交通大学的研究人员，使用miRNAs芯片技术筛
江苏农科院：miRNA调控茄科抗盐胁迫
茄科包括许多重要的蔬菜作物，它们经常遭受盐胁迫。microRNA（miRNA）已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而，几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析，研究成果发表在近期的Int
miRNAs检测技术
MicroRNAs （miRNAs）是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA，具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体（RISC），识别并与靶向mRNA互补配对，从而降解或者阻止mRNA翻译。miRNAs负责调控多种生理过程，包括细胞周期（发育、
直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征
此前，南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文，称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日，发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征，揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的
Nature子刊：新测序技术揭示细菌多样性
斯坦福大学的研究人员首次将一种新测序技术用于人类肠道微生物组，揭示了惊人的细菌多样性。这项研究发表在十二月十四日的Nature Biotechnology杂志上。 “这些细菌在遗传学上比我们想象的更加多样化，”文章资深作者Michael Snyder教授说。人类个体之间只有千分之一的基因组序列
测序首次鉴定鲨鱼肝脏microRNA组
条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum)，是主要栖息于沿海礁砂混合且海藻繁生的海床中的一种鱼类，卵生，对其生活习性我们还不甚了解，可能以底栖无嵴椎动物及小鱼为食。条纹斑竹鲨具有一定的经济价值，可在水族馆中展示，食用可治疗佝偻病、外痔、 水火烫伤、夜盲症等。microR
半夏的临床应用
1．半夏泻心汤（《伤寒论》）主治寒热互结之痞证。半夏12g，黄芩、干姜、人参各9g，黄连3g，大枣12枚，甘草9g。上七味，以水一斗，煮取六升，去渣，再煮，取三升，温服一升，日三服。方中以辛温之半夏为君，散结除痞，又善降逆止呕。 2．半夏厚朴汤（《金匮要略》）主治梅核气。半夏12g，厚朴9g，
miRNAs有助开启小儿脑肿瘤新疗法
脑肿瘤是小儿时期最常见的肿瘤，是导致儿童疾病相关死亡的首要原因。以往许多研究都集中在涉及小儿脑肿瘤复杂的生物过程，但很少有人揭示microRNAs（miRNAs）在小儿肿瘤发生中可能扮演的角色。本研究中，来自上海生命科学院和上海交通大学的研究人员，使用miRNAs芯片技术筛选了小儿脑胶质瘤和配对的正