分子细胞中心等研发出系统性鉴定siRNA脱靶位点新方法
12月4日，Molecular Therapy–Nucleic Acids在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）吴立刚研究组，上海市计划生育科学研究所李卫华研究组与扬州大学赵雅研究组合作的研究成果Identifying Cleaved and Noncleaved Targets of Small Interfering RNAs and MicroRNAs in Mammalian Cells by SpyCLIP。该研究运用自主研发的SpyCLIP技术，对野生型和切割活性缺失的miRNA/siRNA效应器蛋白AGO2平行进行SpyCLIP建库测序，在全基因组层面准确、高效地鉴定出siRNA、miRNA的切割活性以及非切割活性作用位点，为降低siRNA药物的潜在脱靶风险，改进siRNA的设计规则提供了强有力的手段。 2018年8月，美国食品药品监督管理局批准了siRNA药物ONPATT......阅读全文
AGO2基因的结构特点及作用
该基因编码Argonaute家族的一个成员，在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的，包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用，在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
AGO2基因编码功能及结构描述
该基因编码Argonaute家族的一个成员，在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的，包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用，在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供，2009年9月]This gene e
AGO2基因突变与药物因子介绍
该基因编码Argonaute家族的一个成员，在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的，包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用，在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供，2009年9月]This gene e
癌症相关的基因突变类型及临床解释－AGO2
该基因编码Argonaute家族的一个成员，在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的，包含一个PAZ结构域和一个PIWI结构域它可能与dicer1相互作用，在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。
贺福初院士、周钢桥研究员发表癌症新成果
来自军事医学科学院放射与辐射医学研究所的研究人员，通过遗传关联研究和功能分析调查了AGO2单核苷酸多态性（SNPs）与鼻咽癌风险之间的关系。这项研究发布在本月的《BMC Cancer》杂志上。 国际著名细胞生物学家、遗传学家贺福初（Fuchu He）院士和军事医学科学院放射与辐射医学研究所的周
上海交大Hepatology文章解析癌转移新机制
来自上海交通大学医学院、上海人类基因组研究中心的研究人员在新研究中证实，Argonaute2通过上调黏着斑激酶(focal adhesion kinase，FAK)的表达，促进了肝癌转移。相关研究论文发表在4月22日国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子11.665)上。
Cell－Rep：KRAS可以被“沉默”
大约三分之一的人类癌症中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突变。其中KRAS突变最为常见，其突变导致人类很多致命癌症的发生，包括胰腺癌和肺癌等。一直以来，科研工作者都致力于找到药物能抑制KRAS本身或KRAS信号通路中的关键分子。但到目前来看，这个问题仍没有得到有效地解决。 最近在Cel
Nature：缺氧环境下EGFR阻止抗癌miRNA成熟的机制
近来，研究人员在Nature杂志上在线公布一项研究成果称：即使被破坏，一种促进癌症生长因子受体在它溶解之前仍能发送信号阻挠具有肿瘤抑制功能的microRNA发展。 德克萨斯大学MD Anderson癌症中心的科学家领导的一个国际研究小组发现在肿瘤氧饥饿条件下，表皮生长因子受体(EGFR
中科院Cell－Res揭示DNA修复新机制
来自中科院北京基因组研究所、清华大学的研究人员证实，Ago2通过同源重组促进了Rad51招募以及DNA双链断裂修复。这一研究发现发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 中科院北京基因组研究所的杨运桂 (Yun-Gui Yang)研究员和清华大学的戚益军(Y
Nature重要论文：抗癌miRNA的抑制因子
近日来自德克萨斯大学MD安德森癌症和肿瘤中心的研究人员发现，癌症促生长因子受体EGFR即便是在被拖入到细胞内快要遭到破坏的情况下，在溶解之前它也能得到激活，转而阻止肿瘤抑制microRNAs (miRNAs)生成。这一重要的研究发现发布在著名期刊《自然》(Nature)杂志上。 肿瘤常
上海生科院发明一种高效安全的新型RNAi载体
10月12日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）吴立刚研究组的最新研究成果：Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed inter
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点，大部分的研究人员在立项之初，通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析，获得了合适的研究对象，但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因：1. 找错了转录本；2. ncRN
分子细胞中心等研发出系统性鉴定siRNA脱靶位点新方法
12月4日，Molecular Therapy–Nucleic Acids在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）吴立刚研究组，上海市计划生育科学研究所李卫华研究组与扬州大学赵雅研究组合作的研究成果Identifying Cleaved and Noncleav
LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法
在真核细胞中，RNA可以“形单影只”，也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白，它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合？将怎样作用于人类的发育、疾病？这都是悬而未解的难题。 6月10日，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...（一）
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复文章导读血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增
LACEseq方法在微量细胞中准确鉴定PTBP1的结合靶标
6月10日凌晨，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超课题组及其合作者在Nature Cell Biology上，在线发表了题为Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq的论文。 人类基因组编码了约1500个R
可在微量细胞中鉴定RBP作用靶点的新技术LACEseq被开发
人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白（RNA-binding protein, RBP），它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。R
－Gene－Dev：研究果蝇提示衰老相关疾病的发病机制
阿尔茨海默氏病和亨廷顿病通常都与老化相关，但她们之间的生物联系一直不甚明了。现在，Rutgers大学研究人员通过学习常见果蝇中小RNA分子，寻求解答上述问题。 Ammar Naqvi博士表示：利用果蝇，我们能够检测特定microRNA模式，当microRNA绑定到特定蛋白质时，会有助于
Cell公布2012最佳论文中国学者占三篇
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN
Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新
Cell公布2012最佳论文中国学者成果入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN
北大学者发表Cell论文：首次发现外源植物蛋白可抗肿瘤
癌症作为一种细胞异常增殖的疾病，是全球主要的公共卫生问题。癌症的诱因非常复杂，是胞内多种调控通路的突变和微环境共同作用的结果，其中微小RNA（miRNA）是近年来被认为与癌症发生息息相关的重要RNA分子。在哺乳动物中，具有2-nt 3' 末端悬垂的成熟miRNA双链可以被Argonaute（
南京大学曾科教授JBC解析microRNA的核转运
南京大学生命科学学院的研究团队对microRNA进行了深入研究，揭示了成熟microRNA转运进入细胞核的具体机制。这项研究于三月四日提前发表在The Journal of Biological Chemistry杂志的网站上。 成熟的microRNA是长约22nt的非编码RNA，它们
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
－Genes－－Devel：科学家揭示老化和神经变性之间的内在关联
阿尔兹海默氏症和亨廷顿氏症等疾病经常和老化相关，但是其两者之间的关系却一直并不清楚，近日，来自美国罗格斯大学的研究人员通过对常见果蝇的小RNA分子进行研究来揭示疾病发生和老化之间的关系，相关研究成果刊登于国际杂志Genes & Development上。 Ammar Naqvi教授
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称，他们设计出了一种替代性的小干扰RNA（small interfering RNA，siRNA）前体，将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
环状RNA研究的方法及功能作用（二）
RNA是怎样变成环状的呢？a. 在可变剪切过程中，外显子迁移，剪切形成套索结构，拉近剪切位点，促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对，拉近剪切位点，使其相互攻击，促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能，敲降看看据文献报道，环状RNA可以被小干扰R
环状RNA研究深度剖析（二）
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR：挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验，检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。（AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白） b RNA pull down：对上述circRNA进行RNA pull down实验，拉
Dicer－Pathway
The degradation of endogenous mRNA in a sequence-specific manner can be induced by dsRNA [RNA interfernce (RNAi)], antisense transcription, or viral i