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7招搞定微生物同源性分析

医院感染病原菌同源性分析是确定感染途径和传播途径的重要工具,对于研判医院感染暴发、协助追踪感染来源、感染途径和定植规律,分析源自不同患者、不同部位、不同病区、患者与周围环境分离菌株的相关性,对医院感染的流行病学调查、监测和追踪以及耐药菌的诊治具有重要意义,因此我们应了解医院感染病原菌同源性分析方法。今天,本人为您简单阐述我们经常用到7种同源性分析方法。(一)药敏谱分型细菌耐药最主要机制是水平转移获得耐药基因,耐药表型相同可粗略地认为是同一克隆株,耐药表型不同可粗略地认为不是同一克隆株,临床微生物学实验室可通过分析医院感染病原菌的耐药表型来比较所研究菌株的同源性关系,该方法简单易行,不需特殊仪器设备。(二)血清型分型血清分型依据细菌表面多糖抗原的不同来分类,编码细菌表面多糖抗原合成酶的基因是细菌基因组中高度变化区域,在不同的环境压力下而改变,因而具有高度可变性。可对所研究的菌株进行一系列的凝集反应。本方法需要高度特异的抗血清,往往......阅读全文

口腔微生物与肠道微生物的同源性

  3月30日,由生物谷主办的2018(第四届)肠道微生态与健康国际研讨会隆重召开。在分会场四“肠道微生物与其他疾病”中,来自四川大学华西口腔医学院的李雨庆副教授为我们作了题为“口腔微生物与肠道微生物生物同源性”的精彩报告。  李雨庆副教授是四川省微生物学会的理事兼秘书长、口腔生物学教研室主任、口腔

冠状病毒17问:2019-ncov疫苗有多重要?

什么是冠状病毒?  冠状病毒(Coronavirus)是一种有包膜(或囊膜)的正链线性RNA病毒,也是一种最大的RNA病毒。冠状病毒属于网巢病毒目。我们通常说的冠状病毒是冠状病毒科的两个亚科之一。该亚科包括甲、乙、丙、丁(α,β,γ和δ )四个属。  冠状病毒的包膜是由双层脂质和跨膜蛋白组成。病毒的

中疾控等重磅研究揭示新冠病毒演变

  当地时间3月2日,中国医学科学院北京协和医院、中国疾控中心、加州大学洛杉矶分校、匹兹堡大学、湖南大学五家合作单位的研究人员共同在生物科学预印本网站bioRxiv在线发表了一项针对新冠病毒演化过程中的突变、重组和插入的重磅研究(“Mutations, Recombination and Inser

RiboPrinter® 系统实现乳企污染微生物溯源

2013 年底,国家食品药品监督管理总局发布了一系列新政,对乳品,尤其是婴幼儿配方乳粉产品,全面加强了生产监管、流通监管和进出口监管,这一系列新的举措将在2014 年正式开始实施。 而对乳品企业而言,对环境监测和生产过程的控制比最终产品的检测更为重要,需要通过自动化的溯源技术,污染的来源、

微生物学检验基本技术(六)

二、沉淀反应可溶性抗原(如细菌的培养滤液、含细菌的患者血清、脑脊液及组织浸出液等)与相应抗体相混合,在比例适合和适量电解质的存在等条件下,形成肉眼可见的沉淀物,称沉淀反应。利用沉淀反应进行血清学试验的方法称为沉淀试验。沉淀反应有环状、絮状和琼脂扩散法3种基本类型。1.环状沉淀试验将已知的抗血清加于内

分子生物学技术在微生物检验中的应用

分子生物学技术的迅速发展,拓展了微生物学检验方面的应用空间。该技术具有敏感、特异、安全和快速等特点,在微生物检验中发挥着日益重要的作用。本节简要介绍分子生物学技术在微生物检验中的应用,具体检测方法参见有关专著或试剂盒说明书。一、分子生物学技术在细菌分类中的应用细菌的传统分类法和数值分类法以表型特征相

引物(primers)设计知识介绍

引物(primers)引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。引物的重要性在整个PCR体系中, 引物占有十分重要的地位。PCR的特异性要求引物与靶DNA特异结合,不与其他非目的DNA结合,PCR的灵敏性要

微生物的分类

一、 分类单元及其等级  分类单元(taxon,复数taxa)是指具体的分类群,如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。  和其他生物分类一样,细菌的分类单元也分为七个基本的分

微生物的分类

一、 分类单元及其等级分类单元(taxon,复数taxa)是指具体的分类群,如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。和其他生物分类一样,细菌的分类单元也分为七个基本的分类等级(

微生物检测基础知识之微生物的分类!

 一、 分类单元及其等级分类单元(taxon,复数taxa)是指具体的分类群,如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。 和其他生物分类一样,细菌的分类单元也

中国、美国及WHO新冠病毒核酸检测试剂审评要求简要对比

  自2019年12月新冠肺炎疫情发生到如今全球呈多区域爆发情况下,各国监管机构和IVD企业陆续采取积极措施。为积极应对新冠肺炎疫情,国家药监局于第一时间启动应急审批程序。1月20日,器审中心起草《2019新型冠状病毒核酸检测试剂注册技术审评要点》,并于2月12日在中心官网率先对外发布。  世界卫生

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用   微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用  微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已在世界

中山大学完成3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列测定和分析

  日前,中山大学海洋学院教授何建国及其项目组完成了3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列的测定和分析。在此基础上,他们提出了虹彩病毒的一个新属,并找到该病毒里3个与鱼类免疫信号传导系统相互作用的基因。在鳜鱼(俗称桂花鱼)、石斑鱼、大黄鱼等多种养殖鱼类中频繁流行,对鳜鱼的致死率接近100%,对石斑鱼、美国

何建国小组提出鱼类虹彩病毒新属

  在NSFC-广东联合基金重点项目的资助下,中山大学海洋学院教授何建国项目组完成3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列的测定和分析。在此基础上,他们提出了虹彩病毒的一个新属,并找到该病毒里3个与鱼类免疫信号传导系统相互作用的基因。   在鳜鱼、石斑鱼、大黄鱼等多种海淡水养殖鱼类中频繁流行,对鳜鱼(

小小酵母菌实现PM2.5毒性指标实时在线监测

当PM2.5对酵母菌发生了某些损伤,相对应的绿色荧光蛋白就会表达并发光,这样就好像“实时监测到不同地区每辆车的行驶拥挤状况”,从而可以更好地了解PM2.5的损伤机理。交通要道、供暖锅炉与农田附近大气中的细颗粒物PM2.5浓度相同,但三地PM2.5的毒性也许并不一样,对人体的健康影响也可能大相

PM2.5最新研究进展:用酵母菌对其毒性在线监测

图为180分钟后酵母菌对北京灰霾的响应  当PM2.5对酵母菌发生了某些损伤,相对应的绿色荧光蛋白就会表达并发光,这样就好像“实时监测到不同地区每辆车的行驶拥挤状况”,从而可以更好地了解PM2.5的损伤机理。  交通要道、供暖锅炉与农田附近大气中的细颗粒物PM2.5浓度相同,但三地PM2.5的毒性也

MALDI-TOF MS | 临床微生物鉴定中的一大新利器

  自20世纪80年代起,质谱技术就已经成为科学研究中用于蛋白分析的强大工具。随着技术的不断成熟和广泛使用,其在微生物检验常规诊断中的作用越来越受到关注,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of fl

加州鲈细菌性出血病的检测和防治

加州鲈又名大口黑鲈,隶属于鲈形目、鲈亚目、太阳鱼科、黑鲈属。加州鲈是广温肉食性淡水名贵鱼类,具有个体大、生长快、适应性强、肉味鲜美等优点。该鱼喜栖息于沙质或沙泥质且混浊度低的缓流静水中,是发展池塘养殖的重要经济鱼类之一;同时该鱼较贪食,易上钩,又是发展休闲渔业的好品种。   该实验对此次加州鲈病

与T细胞识别、粘附、活化有关的CD分子(二)

  (一)T细胞受体  T细胞受体(T cell receptor,TCR或Ti)是T淋巴细胞表面识别外来抗原与自身MHc Ⅰ类抗原(或Ⅱ类抗原)复合物的受体,在同种异体移植中TCR也识别单独的非已的MHC抗原。目前已经证实,TCR在细胞表面与CD3密切结合在一起组成TCR/CD3复合

血清丙型肝炎病毒感染指标及序列变异的动态研究(2)

二、血液透析患者HCV E2/NS1区序列变异  扩增的PCR产物经双向引物直接进行序列测定得到长度为388bp的一段序列(HCV e2/NS1区序列,核苷酸位置1110-1497,氨基酸位置371-499),发现6例患者感染的HCV株E2/NS1序列间存在差异(序列未列出),核苷酸同源性范围为82

MALDI-TOF-MS 在病原微生物鉴定中的研究进展

       基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术是近年来发展起来的一种软电离新

邵峰系统介绍细胞焦亡的分子机制

  gasdermins是最近发现的致孔蛋白效应蛋白家族,可引起膜通透性和细胞凋亡,这是一种裂解性促炎性细胞死亡。 gasdermins含有通过柔性接头连接的细胞毒性N末端结构域和C末端阻遏物结构域。 这两个结构域之间的蛋白水解切割释放了对细胞毒性结构域的分子内抑制作用,使其能够插入细胞膜并形成大的

植物组织培养技术知识汇总(二)

三、生根 生根是获得完整植株的一个关键。通过侧芽和不定芽途径产生的芽长成嫩枝后(此时的嫩枝叫试管苗),必须诱导生根才能移植。促使试管苗生根的方法通常有两种。一种是在固体培养基上诱导生根。当试管苗长到2~3厘米高时,将它从基部切下,转移到只含0.2~0.5毫克/升的萘乙酸或吲哚丁酸的固体培养基

植物组织培养苗之污染来源与污染鉴定

一、在组织培养中污染来源 1. 植物  本身具有: (1)植物  病原菌 有些作物的病害已被透彻研究,因此在大量繁殖时,可立即检查出来,但有些则否,造成若有污染时,不知来源为何。 (2)和植物  有关的菌类 有修植物本身便会和一些菌种共生,或是寄生于植物

菌种保藏中的细菌鉴定方法

作为科研生产中最重要的基础性资源—菌毒种,其收集、保藏及相关的研究工作在我国正处于整理、整合以及全方面逐步正规化阶段.2003年7月23日,科技部在北京召开了“国家科技基础条件平台建设”部际联席会和专家顾问组成立大会,正式启动了国家科技基础条件平台建设工作.国家自然科技资源共享平台建设作为其中的一个

菌种保藏中的细菌鉴定方法

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无菌检测仪不使用集菌仪和使用集菌仪的差别

  OOS(outofspecification,超限度、超规格)结果,是指产品质量指标测试中超出已经建立的可接受标准的单个或一系列结果。无菌产品的阳性结果、微生物限度试验超出行动值或超过规格、内毒素试验结果超标准等均为OOS结果《中国药典》2015年版m和新版《药品生产质量管理规范》(GMP)增加

无菌检测仪不使用集菌仪和使用集菌仪的差别

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PCR反应体系与反应条件 高速冷冻离心机

PCR反应体系与反应条件    标准的PCR反应体系:   10×扩增缓冲液      10ul   4种dNTP混合物    各200umol/L   引物           各10~1