7招搞定微生物同源性分析
医院感染病原菌同源性分析是确定感染途径和传播途径的重要工具,对于研判医院感染暴发、协助追踪感染来源、感染途径和定植规律,分析源自不同患者、不同部位、不同病区、患者与周围环境分离菌株的相关性,对医院感染的流行病学调查、监测和追踪以及耐药菌的诊治具有重要意义,因此我们应了解医院感染病原菌同源性分析方法。今天,本人为您简单阐述我们经常用到7种同源性分析方法。(一)药敏谱分型细菌耐药最主要机制是水平转移获得耐药基因,耐药表型相同可粗略地认为是同一克隆株,耐药表型不同可粗略地认为不是同一克隆株,临床微生物学实验室可通过分析医院感染病原菌的耐药表型来比较所研究菌株的同源性关系,该方法简单易行,不需特殊仪器设备。(二)血清型分型血清分型依据细菌表面多糖抗原的不同来分类,编码细菌表面多糖抗原合成酶的基因是细菌基因组中高度变化区域,在不同的环境压力下而改变,因而具有高度可变性。可对所研究的菌株进行一系列的凝集反应。本方法需要高度特异的抗血清,往往......阅读全文
口腔微生物与肠道微生物的同源性
3月30日,由生物谷主办的2018(第四届)肠道微生态与健康国际研讨会隆重召开。在分会场四“肠道微生物与其他疾病”中,来自四川大学华西口腔医学院的李雨庆副教授为我们作了题为“口腔微生物与肠道微生物生物同源性”的精彩报告。 李雨庆副教授是四川省微生物学会的理事兼秘书长、口腔生物学教研室主任、口腔
7招搞定微生物同源性分析
医院感染病原菌同源性分析是确定感染途径和传播途径的重要工具,对于研判医院感染暴发、协助追踪感染来源、感染途径和定植规律,分析源自不同患者、不同部位、不同病区、患者与周围环境分离菌株的相关性,对医院感染的流行病学调查、监测和追踪以及耐药菌的诊治具有重要意义,因此我们应了解医院感染病原菌同源性分析方法。
同源性的特征
同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源,最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说,如果两个物种中有两个性状(状态)满足以下两个条件中的任意一个,就可以称这两个性状为一对同源性状:(1)它们与这些物种的祖先类群中所发现的某个性状相同;(2)它们是具有祖先—后裔关系的不同性状。 由于进化上或个体发育上的
进化同源性的概念
进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。在进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性,但其功能不一定相同。
进化同源性的特性
同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源,最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说,如果两个物种中有两个性状(状态)满足以下两个条件中的任意一个,就可以称这两个性状为一对同源性状:(1)它们与这些物种的祖先类群中所发现的某个性状相同;(2)它们是具有祖先—后裔关系的不同性状。由于进化上或个体发育上的共
DNA同源性的概念
中文名称DNA同源性英文名称DNA homology定 义不同的DNA分子由于进化上的原因,其核苷酸序列具有相同来源而具有的某些共性,表现在相应的位点具有相同的或相似的核苷酸残基。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇DNA同源性
中文名称:DNA同源性英文名称:DNA homology定 义:不同的DNA分子由于进化上的原因,其核苷酸序列具有相同来源而具有的某些共性,表现在相应的位点具有相同的或相似的核苷酸残基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
同源性的概念和特点
进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。在进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性,但其功能不一定相同。
分子生态学词汇同源性状
中文名称:同源性状外文名称:homologous character定 义:如果不同生物的同一个性状遗传自同一个共同祖先,那么就是同源性状;或者说这些性状有共同的遗传祖先。分 类:两个或多个类元的性状,也见于它们的共同祖先的是同源性状。或者两项性状,或者一项性状的线性系列,一
αs2酪蛋白的序列同源性的介绍
αs2-酪蛋白比αs1-酪蛋白呈现出更多的不同的类群,并且在大量的哺乳动物中得到鉴定,这些种类包括反刍动物的αs2-酪蛋白、大鼠的γ-酪蛋白、小鼠的γ-酪蛋白、荷兰猪的酪蛋白A和兔的αs2a-酪蛋白和αs2b-酪蛋白。小鼠和兔含有两种不寻常的αs2-样酪蛋白基因,正如在αs1-酪蛋白中的信号序列
利用蛋白质同源性鉴定突变功能残基的概述
利用蛋白质同源性鉴定突变功能残基:将感兴趣的目的蛋白质序列与同源蛋白质进行序列比较,可以发现一些高度保守的残基,这些残基与同源蛋白的共同功能以及维持结构有关,因此通常将它们作为突变及功能进化的候选残基。每个残基所起作用的信息能够通过与不同种同源蛋白的序列比较或一类具有相应活性的蛋白质的序列比较而
QuEChERS法测定药食同源性食品中16种真菌毒素
建立了加速溶剂萃取-QuEChERS-超高效液相色谱-串联质谱测定药食同源性食品中16种真菌毒素的方法。样品经过加速溶剂萃取后用QuEChERS方法净化,液相色谱分离,在正、负离子同时扫描和多反应离子监测模式下检测,黄曲霉毒素B1和伏马毒素B1采用内标法定量,其余毒素采用基质外标法定量。在较宽的
铜绿假单胞菌耐药表型分析及MALDITOF-MS在其同源性分析
目的:初步分析我院某科铜绿假单胞菌耐药表型及评价采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time of Flight Mass Spectrometry ,MALDI-TOF MS)的VITEK MS质谱仪(
蛋白的的原核表达及其对同源性感染的免疫保护性研究
实验概要用鸡艾美尔球虫的SO7基因与重组质粒pMG36t 结合,再把pMG36t-SO7导入到 E. coli χ13 体内,选择阳性的E. coli χ13( pMG36t-SO7 )即: E. coli χ2,然后用它去免疫,分析免疫效果。实验原理通过原核表达系统大肠杆菌来表达柔嫩艾美耳球虫的一
丘成桐等构建超网:解析任何社会、自然现象内在规律
日前,北京雁栖湖应用数学研究院院长丘成桐教授、邬荣领研究员、吴杰研究员等在《美国国家科学院院刊》(PNAS)合作发表了题为《Hypernetwork modeling and topology of high-order interactions for complex systems》(复杂系统高
我国科学家揭示肠道真菌菌群对人体健康影响
近日,中山大学附属第六医院左涛研究员团队在《柳叶刀·微生物》上发表综述,揭示肠道菌群对人体健康和肠道稳态的重要作用。 肠道真菌菌群是人类肠道微生物组中一个微小但非常关键的组成部分,参与调节宿主免疫同源性、病理生理过程以及共存于肠道的细菌微生物组的组装。过去十年里,越来越多的研究对健康和多种
微生物
现代定义:微生物是一切肉眼看不见或看不清的微小生物,个体微小,结构简单,通常要用光学显微镜和电子显微镜才能看清楚的生物,统称为微生物。微生物包括细菌、病毒、霉菌、酵母菌等。(但有些微生物是肉眼可以看见的,像属于真菌的蘑菇、灵芝等。)
微生物与微生物学
微生物(Microorganism)是广泛存在于自然界中的一群肉眼看不见,必须借助光学显微镜或电子显微镜放大数百倍、数千倍甚至数万倍才能观察到的微小生物的总称。它们具有体形微小、结构简单、繁殖迅速、容易变异及适应环境能力强等优点。 微生物种类繁多,至少有十万种以上。按其结构、化学组成及生活习性
分子生物学技术在微生物检验中的应用
分子生物学技术的迅速发展,拓展了微生物学检验方面的应用空间。该技术具有敏感、特异、安全和快速等特点,在微生物检验中发挥着日益重要的作用。本节简要介绍分子生物学技术在微生物检验中的应用,具体检测方法参见有关专著或试剂盒说明书。一、分子生物学技术在细菌分类中的应用细菌的传统分类法和数值分类法以表型特征相
全自动微生物脂肪酸分析仪
全自动微生物脂肪酸分析仪是一种用于基础医学、临床医学、预防医学与公共卫生学领域的分析仪器,于2009年10月14日启用。 技术指标 软件含有300多种脂肪酸的信息,可以进行以磷脂脂肪酸分析(PLFA)为技术手段的微生物种群多态性研究,通过短链脂肪酸(C9-C20)的气相色谱图谱快速准确分析研
微生物分类表或分类的详细步骤和方法
微生物分类的目的:把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归类,排成系统,以便于人们对微生物进行鉴定和交流。微生物的主要分类单位:界、门、纲、目、科、属、种、变种、亚种(小种)、型、菌株(品系)种是最基本的分类单位种:亲缘关系较近的微生物有机体的集合,它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分
水质微生物
一、水质微生物及指示菌 在各种水体,特别是污染水体中存在有大量的有机物质,适于各种微生物的生长,因此水体是仅次于土壤的第二种微生物天然培养基。水体中的微生物主要来源于土壤,以及人类的动物的排泄物及污染。水体中微生物的数量和种类受各种环境条件的制约。 一般认为,水中微生物以革兰氏阴性杆菌占有较大优
微生物保存
微生物保存 基本原理是在挑选优良纯培养物并使其处于休眠状态基础上,人为地创造一个有利于休眠的环境,使其长期保存后仍能保持菌种原有的优良特性。基本措施是低温、真空、干燥。 保藏方法: 1、定期移植法 亦称传代培养保藏法,指将菌种接种于适宜的斜面培养基上,最适条件下培养,完成培养于4-6℃进
水质微生物
一、水质微生物及指示菌 在各种水体,特别是污染水体中存在有大量的有机物质,适于各种微生物的生长,因此水体是仅次于土壤的第二种微生物天然培养基。水体中的微生物主要来源于土壤,以及人类的动物的排泄物及污染。水体中微生物的数量和种类受各种环境条件的制约。 一般认为,水中微生物以革兰氏阴性杆菌占有较大优
微生物复壮
对已衰退的菌种(群体)进行纯种分离和选择性培养,使其中未衰退的个体获得大量繁殖,重新成为纯种群体的措施。狭义的复壮是一消极措施,一般指对已衰退的菌种进行复壮;广义的复壮是一积极的措施,即在菌种的生产性状未衰退前就不断进行纯种分离和生产性状测定,以在群体中获得生产性状更好的自发突变株
微生物培养
微生物:培养 1、根据培养时是否需要氧气,可分为好氧培养和厌氧培养两大类。 好氧培养:也称“好气培养”。就是说这种微生物在培养时,需要有氧气加入,否则就不能生长良好。在实验室中,斜面培养是通过棉花塞从外界获得无菌的空气。三角烧瓶液体培养多数是通过摇床振荡,使外界的空气源源不断地进入瓶中。
微生物的分类依据
1. 形态特征 (1)个体形态 镜检细胞形状、大小、排列,革兰氏染色反应,运动性,鞭毛位置、数目,芽孢有无、形状和部位,荚膜,细胞内含物;放线菌和真菌的菌丝结构,孢子丝、孢子囊或孢子穗的形状和结构,孢子的形状、大小、颜色及表面特征等。 (2)培养特征 1)在固体培养基平板上的菌落(
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。 W
微生物实验室检测常见的微生物
在产品微生物检测过程中,实验员们会接触到许多不同的微生物种类,小编就来总结下检测实验中常检出的微生物。 大肠菌群 大肠菌群,它不代表某一个或某一属细菌,而指的是具有某些特性的一组与粪便污染有关的细菌。 大肠菌群都是直接或间接地来自人和温血动物的粪便。一般食品中大肠菌群超标,表示食品受动温
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar