CellRep:无需参考的甲基化分析新方法

分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在Cell Reports上。 文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同事将简化甲基化测序(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)与一种名为RefFreeDMA的应用程序相结合。这种程序能从RRBS读取中推断出基因组,并发现样品中差异甲基化的区域。 她们开发的这个流程依赖于脊椎动物中DNA甲基化的非随机分布,大多数甲基化都位于CpG位点。在她们这个方法中,DNA先通过限制性内切酶Mspl和/或Taql消化,这两种酶分别切割C^CGG和T^CGA,并且对甲基化不敏感。之后,这些......阅读全文

Cell-Rep:无需参考的甲基化分析新方法

分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在Cell Reports上。    文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer

-Cell-Rep:无需参考的甲基化分析新方法

  分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果发表在Cell Reports上。  文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同

无需参考的甲基化分析新方法

  分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在《Cell Reports》上。  文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer

Cell-Rep:研究发现鉴定恶性乳腺癌的新方法

  袭性乳腺癌经常操纵免疫反应,使之对自己有利。研究人员发现这种操作是在人类身上与在老鼠身上一样的免疫"特征"。波恩大学的科学家和荷兰的同事进行的一项研究证明了这一点。他们的方法使利用患者的肿瘤组织获得疾病预后的指示成为可能,研究结果发表在《Cell Reports》杂志上。图片来源:Cell Re

Cell-Rep:疟疾是这样发生的

  澳大利亚科学家近日研究揭示了疟原虫如何引发机体的炎性反应,相关研究刊登在国际杂志Cell Reports上,文章中研究者揭示了疟原虫如何破坏机体抵御疾病的能力,为后期科学家们通过增强机体关键的免疫力来开发新型疟疾疫苗提供了新的思路。  来自沃尔特与伊丽莎-霍尔研究所(Walter and Eli

Cell-Rep:KRAS可以被“沉默”

  大约三分之一的人类癌症中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突变。其中KRAS突变最为常见,其突变导致人类很多致命癌症的发生,包括胰腺癌和肺癌等。一直以来,科研工作者都致力于找到药物能抑制KRAS本身或KRAS信号通路中的关键分子。但到目前来看,这个问题仍没有得到有效地解决。  最近在Cel

Cell-Rep:脂肪如何变得致命?

  以血糖形式存在的糖,为细胞提供了必要的能量。当它通常的饮食来源——碳水化合物稀缺时,肝脏就在脂肪的帮助下生产它。但是最近约翰霍普金斯大学的一项新研究增加了证据表明,当肝脏的能力受损时,其他组织可以介入葡萄糖的生产,肝脏中的脂肪分解对于保护其免受脂肪的致命袭击,是必不可少的。这些新的结果来自于小鼠

Cell-Rep:开发出一种有效抑制乳腺癌复发的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,来自杜克大学等机构的科学家们通过研究发现,一种治疗恶性乳腺癌的新方法或能关闭对标准激素疗法产生耐受性的癌细胞的生长,相关研究结果是研究人员于今年进行的临床试验所发现的,他们鉴别出了对当前疗法产生耐受性的几乎所有雌激素阳性乳腺癌的薄弱

快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化

  在甲基化分析中,亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单,但要想获得漂亮的结果,却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。   最近,QIAGEN

RNA甲基化位点分析新方法

  继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se

Cell-Rep:脊椎损伤修复新突破

  脊髓损伤会破坏大脑与脊髓之间的通讯,进而破坏大脑对身体某部分的控制。最近一项研究发现,损伤部位下方的特定类型的神经元反馈在早期恢复和维持恢复的运动功能中起着至关重要的作用。这些新的基础研究结果表明继续使用受影响的身体部位对于脊髓损伤患者的康复成功的重要性。  “在脊髓损伤后,破坏的神经通路不再能

Cell-Rep:揭示癌细胞高速分裂的机制

  在恶性肿瘤中,细胞通常增殖迅速且无法控制。德国巴伐利亚州尤利乌斯-马克西米利安-维尔茨堡大学(Julius-Maximilians-Universit?t Würzburg,JMU)生物中心的一个研究小组研究了一种特殊类型的肺癌,他们发现细胞分裂的两个重要调控因子可以在这个过程中相互作用。如果出

Cell-Rep:鉴别出“大头娃娃”致病基因

  索托氏症又称为儿童期巨脑畸形综合征(Sotos syndrome),其主要特点为个体不同程度的智力不足及头围较大,研究表明有90%的索托氏症患者机体中都存在一种名为NSD1的基因突变,近日,一篇发表在国际杂志Cell Reports上的研究论文中,来自日本自然科学家研究院的研究人员通过对小鼠进行

Cell发布革命性DNA甲基化分析技术

  Whitehead研究所的研究人员开发出了一种方法,监测单个细胞中随着时间推移发生的DNA甲基化改变。这一突破性的研究成果发布在顶级科学期刊《细胞》(Cell)杂志上。  DNA甲基化对正确控制基因表达及细胞身份——使得细胞具有相同遗传物质的细胞变为神经细胞、肌肉细胞或皮肤细胞,起至关重要的作用

Cell-Rep:细胞衰老与年龄相关的血块有关

  衰老的细胞在压力下不可逆转地停止分裂,随着时间的推移,越来越多的细胞积累,炎症蛋白的混合物会导致慢性炎症。巴克研究所(Buck Institute)的研究人员在9月24日出版的《细胞报告》(Cell Reports)上发现了44种与衰老相关的特定蛋白质,它们与血液凝固有关,这标志着细胞衰老首次与

Cell-Rep:细胞衰老与年龄相关的血块有关

  衰老的细胞在压力下不可逆转地停止分裂,随着时间的推移,越来越多的细胞积累,炎症蛋白的混合物会导致慢性炎症。巴克研究所(Buck Institute)的研究人员在9月24日出版的《细胞报告》(Cell Reports)上发现了44种与衰老相关的特定蛋白质,它们与血液凝固有关,这标志着细胞衰老首次与

Cell-Rep:神经退行性疾病的早期诊断

  最近,来自Basel大学的研究者们发现了一种促进阿兹海默症等神经退行性疾病发生的关键因子。这类细胞因子是由于细胞内线粒体的压力反应产生的,相关结果发表在最近一期的《Cell Reports》杂志上。  人类细胞的正常功能的形式是需要细胞器的协同工作。在很多情况下,细胞器之间的交流的损伤会导致压力

Cell-Rep:具有抑癌作用的细胞调控分子

  最近,英国曼彻斯特的科学家们探讨了一个蛋白质在调控肿瘤发展过程中的作用,并发现它能够抑制实验室培养的肝癌细胞生长。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》杂志。  为了开发新的抗癌疗法,研究人员需要确定负责控制肿瘤生长的靶分子。有两种这样的分子,是应激活化蛋白激酶(stress-ac

Cell-Rep:多巴胺对大脑前叶层的作用机制

  最近一项研究首次揭示了多巴胺如何改变前额皮质的功能。在这项发表在《Cell Reports》杂志上的研究中,研究人员发现多巴胺对个体细胞几乎没有影响。相反,它会在前额叶皮层的细胞集合中产生持续的活动,持续长达20分钟。  “集合脑细胞活动,就像一起表演的音乐家的合奏,可以产生与个体神经元活动不同

-Cell-Rep:食管中干细胞群被发现

  近日,来自美国匹斯堡大学医学院一组研究人员称,他们已经在食管中发现了干细胞的存在,这也是研究者首次在食管中发现干细胞群,该研究对食管癌以及能引起癌症的Barrett食管炎将有新的认识,相关研究发表在Cell Reports杂志上。  据介绍,食管癌是常见的消化道肿瘤,全世界每年约有30万人死于食

-Cell子刊突破:无需克隆的CRISPR新技术

  来自荷兰Hubrecht研究所和乌特勒支医学中心(UMC Utrecht)、麻省理工学院的研究人员称,他们开发出了一种自身克隆CRISPR/Cas9(scCRISPR)技术,可以绕开基因编辑过程中所有的克隆步骤,在数小时内完成CRISPR/Cas9介导基因突变及位点特异性转基因敲入。他们的研究成

Developmental-Cell:精子的正常发育或无需外源性RNA

  近日,一项发表于Developmental Cell的研究报告中,来自英国巴斯大学的科学家们通过进行一项双盲试验发现,健康的小鼠幼崽或许可以通过从特殊的精子中出生,而这些精子在附睾中迁移的过程并未获得短的RNA链,附睾是精子从睾丸中出来后向前运动的一种导管器官。  该研究结果与2018年的发表的

Cell-Rep:这款药物或能有效抑制癌症的扩散

  近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,来自Harry Perkins医学研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种药物来阻断一些癌症周围的血管形成对疗法耐药的屏障,同时他们还发现,这些药物或能有效抑制癌症的扩散。图片来源:Harry Perkins Institute o

Cell-Rep:发现一种阻止肥胖的代谢开关

  2016年11月6日/生物谷BIOON/--你尝试过所有饮食。不管怎样:你仍然再次恢复你丢失的体重,即便你吃得健康和定期锻炼。这可能是由于大脑中的一种特定的酶:α/β水解酶结构域-6(alpha/beta hydrolase domain-6, ABHD6)。在一项新的研究中,来自加拿大蒙特利尔

Cell-Rep:影响EBV胞内复制过程的关键基因

最近,来自VCU的研究者们鉴定出了两个与EBV(Epstein-Barr virus)复制有关的基因,该病毒的侵染会导致多种不同类型癌症的发生。这项发现有助于病毒相关疾病(包括胃癌以及淋巴瘤等)的新型疗法的开发。EBV是一类最常见的人类病毒,几乎95%的成年人都携带EBV。根据美国健康组织的报告,每

Cell-Rep:NAD-+可以恢复与年龄有关的肌肉退化

  我们随着年龄增长,肌肉变得更弱,人因此变得步履蹒跚。然而,对定义肌肉衰老的生物学过程和生物标记物的研究工作尚未确定其根本原因。  现在,来自EPFL生命科学学院Johan Auwerx实验室的一组科学家从另一个角度审视了这个问题:肌肉衰老与变性肌肉疾病之间的相似性。他们发现了自然衰老过程中沉积在

Cell-Rep:揭发肿瘤细胞转移的“幕后主谋”

  肿瘤细胞转移的恶果是造成癌细胞全身性扩散,侵略全身各处的组织器官。因此,想办法锁定控制这种转移或者是从一开始就阻断它们的信息传递将会是抗癌路上的一个突破性进展。比利时鲁汶天主教大学的研究人员首次成功得利用小鼠研究人类肿瘤模型,研究结果发表在了7月24日的Cell Report期刊上。  鲁汶天主

Cell-Rep:影响EBV胞内复制过程的关键基因

最近,来自VCU的研究者们鉴定出了两个与EBV(Epstein-Barr virus)复制有关的基因,该病毒的侵染会导致多种不同类型癌症的发生。这项发现有助于病毒相关疾病(包括胃癌以及淋巴瘤等)的新型疗法的开发。    EBV是一类最常见的人类病毒,几乎95%的成年人都携带EBV。根据美国健康组织的

Cell-Rep:测序揭示人类肠道菌群的进化

  与狩猎者相比,西方人的肠道微生物种类较少,但这些微生物群为什么会有此差异,一直都是一个谜。2月25日,在《Cell Reports》发表的一项研究中,研究人员描述了中非共和国班图人群体的肠道微生物,这个传统的人类群体,有一些西化的生活方式。这一发现,对于“什么因素可能会引起我们肠道菌群的差异——

Cell-Rep:特殊蛋白或可调节机体软骨的形成

  我们常常认为软骨仅可以帮助确定人体耳朵和鼻子的形状,然而实际上软骨的作用要远大于此,其还可以帮助机体呼吸并且形成健康的骨质,而这两种过程对机体存活至关重要;近日一篇刊登于国际杂志Cell Reoports上的研究论文中,来自东京大学等处的研究人员通过研究阐明了名为Sox9的蛋白质调节软骨产生的分