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CellRep:无需参考的甲基化分析新方法

分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在Cell Reports上。 文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同事将简化甲基化测序(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)与一种名为RefFreeDMA的应用程序相结合。这种程序能从RRBS读取中推断出基因组,并发现样品中差异甲基化的区域。 她们开发的这个流程依赖于脊椎动物中DNA甲基化的非随机分布,大多数甲基化都位于CpG位点。在她们这个方法中,DNA先通过限制性内切酶Mspl和/或Taql消化,这两种酶分别切割C^CGG和T^CGA,并且对甲基化不敏感。之后,这些......阅读全文

Cell Rep:无需参考的甲基化分析新方法

  分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果发表在Cell Reports上。  文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer。她及其同

Cell Rep:无需参考的甲基化分析新方法

分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在Cell Reports上。    文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer

无需参考的甲基化分析新方法

  分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在《Cell Reports》上。  文章的第一作者是奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Johanna Klughammer

Cell Rep:研究发现鉴定恶性乳腺癌的新方法

  袭性乳腺癌经常操纵免疫反应,使之对自己有利。研究人员发现这种操作是在人类身上与在老鼠身上一样的免疫"特征"。波恩大学的科学家和荷兰的同事进行的一项研究证明了这一点。他们的方法使利用患者的肿瘤组织获得疾病预后的指示成为可能,研究结果发表在《Cell Reports》杂志上。 图片来源:Ce

Cell Rep:疟疾是这样发生的

  澳大利亚科学家近日研究揭示了疟原虫如何引发机体的炎性反应,相关研究刊登在国际杂志Cell Reports上,文章中研究者揭示了疟原虫如何破坏机体抵御疾病的能力,为后期科学家们通过增强机体关键的免疫力来开发新型疟疾疫苗提供了新的思路。  来自沃尔特与伊丽莎-霍尔研究所(Walter and Eli

Cell Rep:开发出一种有效抑制乳腺癌复发的新方法

  近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,来自杜克大学等机构的科学家们通过研究发现,一种治疗恶性乳腺癌的新方法或能关闭对标准激素疗法产生耐受性的癌细胞的生长,相关研究结果是研究人员于今年进行的临床试验所发现的,他们鉴别出了对当前疗法产生耐受性的几乎所有雌激素阳性乳腺癌的薄弱

快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化

  在甲基化分析中,亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单,但要想获得漂亮的结果,却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。   最近,QIAGEN

Cell Rep:脂肪如何变得致命?

  以血糖形式存在的糖,为细胞提供了必要的能量。当它通常的饮食来源——碳水化合物稀缺时,肝脏就在脂肪的帮助下生产它。但是最近约翰霍普金斯大学的一项新研究增加了证据表明,当肝脏的能力受损时,其他组织可以介入葡萄糖的生产,肝脏中的脂肪分解对于保护其免受脂肪的致命袭击,是必不可少的。这些新的结果来自于小鼠

Cell Rep:KRAS可以被“沉默”

  大约三分之一的人类癌症中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突变。其中KRAS突变最为常见,其突变导致人类很多致命癌症的发生,包括胰腺癌和肺癌等。一直以来,科研工作者都致力于找到药物能抑制KRAS本身或KRAS信号通路中的关键分子。但到目前来看,这个问题仍没有得到有效地解决。  最近在Cel

RNA甲基化位点分析新方法

  继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se