对核小体进行高分辨率模拟，揭开其复杂堆积
日本京都大学(Kyoto University)细胞材料综合科学研究所(iCeMS)的科学家开发了一种技术，可以对人类基因组的一个基本单元——核小体——进行高分辨率模拟。他们的研究结果发表在Nature Protocols杂志上，应该有助于加深对核小体折叠变化如何影响基因内部工作的理解。 核小体是细胞核内DNA包装的基本结构单位。它们是由缠绕在少量组蛋白周围的DNA构成的。核小体在细胞核内四处移动，折叠和展开，改变它们的方向，靠近或远离。这些运动影响了DNA中各种分子的可及性，决定了基因何时以及如何开启和关闭。 领导这项研究的iCeMS系统生物学家Yuichi Taniguchi解释说:“3D基因组结构为细胞中的基因表达过程提供了物理分子基础。” 为了更好地可视化这种结构，Taniguchi和他的同事开发了Hi-CO，即核小体取向的高通量染色体构象捕获。它建立在现有的Hi-C技术的基础上，显著提高了分辨率，以便模拟......阅读全文
复旦大学Science最新发文：揭示+1核小体调控转录起始机制
作为基因表达调控的核心，转录起始过程发生在基因启动子区，通过染色质重塑复合物剔除核小体暴露出启动子, 允许转录起始复合物（preinitiation complex，PIC）的组装，在中介体（Mediator）的帮助下组装成PIC-Mediator转录起始超级复合物。我院徐彦辉团队在2020和2
生物物理所揭示开放核小体导致染色质松散的分子机制
常规核小体的结构包括一个由四种组蛋白H2A、H2B、H3、H4组装而成的蛋白核心，一条在组蛋白核心上缠绕1.6圈、长度为147 bp的双链DNA。核小体具有稳定的结构，对DNA组成和组蛋白修饰的改变均不敏感。组蛋白变体可改变核小体和染色质结构调控基因转录，在迄今测定的所有单核小体结构中，组蛋白H
近球小体
近球小体（juxtaglomerular apparatus）由颗粒细胞、系膜（间质）细胞和致密斑三者组成。颗粒细胞是位于入球小动脉的中膜内的肌上皮样细胞，内含分泌颗粒，分泌颗粒内含肾素。系膜细胞是指入球小动脉和出球小动脉之间的一群细胞，具有吞噬功能。致密斑位于远曲小管的起始部分，此处的上皮细胞变
假Auer小体
Auer小体有真假之分，这里所说真假是指形态相同而性质不同者。 Auer小体是细胞形态学判断髓系还是淋系急性白血病的重要特征，然而，有文献报道慢性淋巴细胞白血病／小淋巴细胞淋巴瘤（图1 、2 ）、B细胞急性淋巴性白血病、滤泡淋巴瘤、幼淋巴细胞白血病、边缘区淋巴瘤以及文献早有记载
中国科学家首次阐明了H2A.Z核小体的优先识别机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506108.shtm8月2日，中国科学院生物物理研究所周政课题组联合本所李国红、朱平课题组等在国际学术期刊《分子细胞》（Molecular Cell）发表论文，报道了人源SUV420H1结合H2A.Z核小
Nature：解析人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构
清华大学生命科学学院/结构生物学高精尖创新中心/清华-北大生命科学联合中心陈柱成教授研究团队在《自然》杂志在线发表题为“人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构”（Structure of human PBAF chromatin remodeling complex bound to a
Cell－|－染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性
染色质结构通过促进或抑制该结构的转录可以控制基因组的功能和细胞身份认定。这些染色质结构中存在特定的组蛋白翻译后修饰（posttranslational modifications，PTMs），它们与特定转录状态相关，并可促进抑制性染色体结构的形成，影响基因的表达【1】。 为了在细胞分裂时依然保
科研人员创造出含有定点共翻译修饰核小体的酵母菌
随着蛋白质谱技术的发展，许多组蛋白赖氨酸残基的酰化修饰被鉴定出来，其中巴豆酰化修饰是一类在酵母、哺乳动物等真核生物中保守存在的组蛋白酰化修饰。自2011年被发现以来，巴豆酰化修饰俨然成为了领域内的研究热点。这是因为该修饰是一种重要的表观遗传机制调节基因转录的翻译后修饰。尽管巴豆酰化和乙酰化基团的
染色质着丝粒区核小体组装的结构机理研究获新成果
人源HJURP与CENP-A以及组蛋白H4复合体的晶体结构 5月1日，中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组在Genes & Development杂志上发表了题目为Structure of a CENP-A-histone H4 heterodimer in
真核生物基因组的结构特点有哪些
1、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存在细胞核中。除了配子外，体细胞中的基因基因组是二倍体，即有两个同源的基因组。2、真核细胞基因的转录产物为单顺反式。结构基因被转录并翻译成mRNA分子和多肽链。3、有重复，重复次数可以超过一百万次。4、在基因组中，非编码区多于编码区。5、大多数基因含
关于真核基因组的基本信息介绍
真核基因组：由真核基因编码的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒编码的基因组。 真核生物的基因组一般比较庞大，例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成，按1000个碱基编码一种蛋白质计，理论上可有300万个基因。但实际上，人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有
细胞质雄性不育与核基因组
对胞质遗传物质的研究无疑加深了人们对 CMS 现象分子机制的认识，但是 CMS 是一种核质互作的结果，因此核基因组在 CMS 发生过程的作用是不容忽视的。研究表明在核基因组中可能存在育性恢复(restorer of fertility，Rf)基因。在 Rf 基因存在下，与 CMS 相关的线粒体等胞质
关于原核基因组的基本内容介绍
原核基因组：原核生物和真核生物基因组由DNA组成。古细菌有一个环状染色体组成的DNA基因组 [2]。大多数细菌也有一个环状染色体，然而，一些细菌物种含有线性染色体 [3]或多个染色体。大多数原核生物基因组中不含有重复DNA [4]。一些共生细菌基因组种含有高比例的假基因，例如Serratia s
关于真核基因组的中度重复顺序简介
真核基因组的中度重复顺序简介：中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万（＜105）次的重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序，但慢于高度重复顺序。少数在基因组中成串排列在一个区域，大多数与单拷贝基因间隔排列。依据重复顺序的长度，中度重复顺序可分为两种类型。 短分散片段：（short inte
关于真核基因组的主要特点介绍
1、真核基因组— 真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体,diploid），即有两份同源的基因组。 2、真核基因组— 真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链。 3、
关于真核基因组的基本信息介绍
真核基因组由一条或多条线性DNA染色体组成。组成真核生物基因组的染色体的数量差异很大，杰克跳线蚂蚁和无性线虫的基因组每个只有一对染色体 [6]，而蕨类物种有720对染色体 [7]。人类细胞具有22对常染色体和1对性染色体。 除了细胞核中的染色体外，真核生物的细胞器如叶绿体和线粒体都有自己的DN
厉害了！cfDNA又添新用途，或将成为新型衰老生物标志物
在我们年轻的时候，DNA会规矩的待在细胞核中，但随着年龄的增长，DNA开始不再那么听话。在血液中，细胞因应激或降解释放的cfDNA仍保留了部分的组装状态，可为生物标志物研究提供信息。 近年来，表观遗传学成为研究热点。由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位——核小体也是表观基因组的重要组成。在
两位华人教授最新Cell介绍新技术－胚胎干细胞中的核小体
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性，因此也是科学家们关注的研究领域之一。 近日，来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法，为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一
NatureCell两大顶级杂志获表观遗传研究突破
来自美国宾州大学与西北大学的两个研究组，近期分别在Nature和Cell这两大顶级期刊上发表文章，分别取得了表观遗传学核小体研究方面的突破性进展，这两项的关键点都来自其重要的研究新技术――宾州大学的研究人员发展了超高分辨率ChIP-exo技术，而西北大学的研究人员则研发了一种基于改造后组蛋白的化
凋亡小体的概述
程序性死亡细胞的核DNA在核小体连接处断裂成核小体片段，并向核膜下或中央异染色质区聚集形成浓缩的染色质块。随着染色质不断聚集，核纤层断裂消失，核膜在核孔处断裂，形成核碎片。同时在程序性死亡过程中，由于不断脱水，细胞质不断浓缩，但仍有选择透过性。细胞体积减小。凋亡细胞经核碎裂形成的染色质块(核碎片
φ（Phi）小体染色检查
（一） 原理 粒细胞系列的白血病细胞中形成的φ（Phi）小体与3，3，—二氨基联苯胺（DAB）及（或）过氧化氢基质液作用，以及硝酸酮处理的氢过氧化酶染色，能催化DAB氧化生成蓝色沉淀，定位于胞质中。 （二） 操作步骤 1 试剂配制 (1) 1.25%戊二醛固定液：0.1mol/L磷酸盐缓冲液（PH
φ（Phi）小体染色检查
（一） 原理粒细胞系列的白血病细胞中形成的φ（Phi）小体与3，3，—二氨基联苯胺（DAB）及（或）过氧化氢基质液作用，以及硝酸酮处理的氢过氧化酶染色，能催化DAB氧化生成蓝色沉淀，定位于胞质中。（二） 操作步骤1 试剂配制(1) 1.25%戊二醛固定液：0.1mol/L磷酸盐缓冲液（PH7.3）9
科学家将血浆核小体表观遗传标记用于结直肠癌诊断
结直肠癌是全球常见癌症，患者死亡率高，肿瘤转移是患者死亡的主要原因，早期筛查和诊断对于改善患者预后至关重要。常规的检查方法如肠镜和组织活检是侵入性的，过程痛苦且存在风险。因此，需要发展更有利于临床开展的结直肠癌检测方法。 近期，以色列魏兹曼科学研究所和希伯来大学研究团队在《Nature Bio
感染变形虫病毒也能将它们的DNA组装成类似核小体的结构
对于一些巨病毒（giant virus）来说，一种DNA包装技巧可能对它们的感染性至关重要。称为Marseilleviridae的变形虫感染病毒（Amoeba-infecting virus）将它们的DNA缠绕在它们自己编码 的组蛋白上，就像线轴上松散地包裹着的线。在一项新的研究中，美国霍华德-
两位华人教授最新Cell介绍新技术－胚胎干细胞中的核小体
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性，因此也是科学家们关注的研究领域之一。近日，来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法，为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一个宝贵的
BRCA1BARD1复合物特异识别泛素化核小体促进同源重组修复
DNA双链断裂（DNA double-strand breaks，DSBs）是真核细胞中最严重的DNA损伤类型之一，单个裸露的DSB即可诱发细胞凋亡。DSB主要通过非同源末端连接（NHEJ，non-homologous end-joining）和同源重组（HR，homologous recomb
三篇Nature－Methods：定位基因组的调控序列
科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性，对基因组的调控序列进行定位和解读。 近来越来越多的证据显示，许多遗传学差异并非直接影响基因，而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章，介绍了在基因组中定位调控序列的新技术，阐述了进行数
真核基因组的组装，有纳米孔就够了
生物通报道 农业生物技术公司KeyGene近日只利用纳米孔测序仪MinION生成的序列，组装了立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）的基因组。立枯丝核菌是一种农业害虫，感染一些重要的经济作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv网站的预印本上，KeyGene的Martin de
关于真核基因组的高度重复序列的介绍
1、真核基因组的高度重复序列— 简介 高度重复序列在基因组中重复频率高，可达10^3以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列 这种重复顺序复性速度极快，即
真核基因组的单拷贝顺序的内容介绍
一、真核基因组的单拷贝顺序的简介 单拷贝顺序在单倍体基因组中只出现一次或数次，因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%，如人基因组中，大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息，编码各种不同功能的蛋白质。目前尚不清楚单拷贝基因的确切数字，但是是有其在单拷贝