一种新的生物工程报告系统——蛋白质亚型报告机

蛋白质是我们细胞过程中的关键角色。他们这一代遵循的原则被称为转录和翻译。首先,DNA将其遗传信息复制到信使RNA(信使RNA),然后由信使RNA决定氨基酸链的序列,氨基酸链最终折叠成蛋白质。然而,现实更为复杂:超过90%的基因不会只产生一个信使RNA,然后产生一个蛋白质,而是一种称为选择性剪接的过程产生了几个mRNA变体,只有其中的一部分在特定的时间被翻译成特定细胞中的特定蛋白质亚型。传统的检测选择性剪接的技术大多是单时间点的测量,工作强度大,不能可靠地监测随着时间的推移哪些蛋白质异构体在细胞中实际翻译。 亥姆霍兹慕尼黑中心和慕尼黑技术大学(TUM)开发了一种新的生物工程报告系统,称为EXSISERS。其背后的想法是,一旦特定的蛋白质异构体被翻译,就会产生一种信号,如光。“这是可能的,通过设计师报告蛋白,可以切断自己的新生氨基酸链-它们是自激发的,”Dong-Jiunn Jeffery Truong说。“与魔术表演中著名的......阅读全文

通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质RNA相互作用...

通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂Azure Biosystems国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。那为

科学家DNA与RNA-量身打造专属蛋白质外壳可提升“基因治疗”

  【Technews科技新报】生病吃药很少吃一次就有效,通常都要“照三餐吃”好几天以上。部分原因在于药物进入体内后并不稳定,很快就被人体代谢排出体外。化学药物如此,用于基因治疗的 DNA 或 RNA 进入体内后,更容易被体内酵素分解,因此如何增加 DNA 或 RNA 进到人体后的稳定性,是发展中的

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作...

补骨脂素介导的光交联反应研究RNA与蛋白质分子间的作用实验实验材料 蛋白酶K试剂、试剂盒 变性胶电泳缓冲液非变性胶电泳缓冲液结合缓冲液水解缓冲液丙烯酰胺储存液RNA 洗脱缓冲液四甲基乙二胺过硫酸铵AMV 反转录酶及反应缓冲液磷酸钠8-羟基补骨脂素13-二碘丙烷碳酸钾丙酮石油醚乙酸乙酯硫酸钠硅胶三氟乙

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互...

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试

纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA

实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织,直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均匀,冰浴 15 分钟

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(3)

SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA

Science聚焦:球形RNA让RNA疗法重获新生

  几十年来,RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过,随着新型RNA(球形核酸SNA)在人体试验中取得成功,这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。  RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上,研究人员

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(2)

1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA (antisenseRNA )的过程中发现的,由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA (senseRNA )和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(1)

Rnai最近由于RNA 干扰(RNA interference,RNA i)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA 干扰是

什么是RNA?RNA的作用是什么?

核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿

什么叫做外源性RNA和内源性RNA

核糖核酸(缩写为RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA

大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展

  中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的

亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用

亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用

            实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。

RNA-Isolation-Protocol

RNA Isolation Protocol(Revised 5-15-2003)Stabilize RNAStart with 15 ml E. coli Culture containing 7.5* 109 cells (OD600= 0.2 Dilute cells or scale up)

RNA-isolation-for-Microarray

Description RNA extraction using TRI REAGENT. This method gives ample amout of RNA.Procedure It is 3 days procedure.Day 1:1. Harvest the cells and cen

DNA-and-RNA-EXTRACTIONS

A protocol / method / schedule /procedure for extraction / isolation of both DNA and RNA from the same material typically plant leaf / leaves(See also

RNA微注射

·         RNA Injection (Hoshi Lab)The oocyte is a useful model for the investigation of the function of usr/localious genes and is a widely used syst

RNA干涉实验

化学合成siRNA分子实验 体外转录合成siRNA分子实验 采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子 采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验             实验方法

RNA-Immunoprecipita...

实验概要Interest in RNA-protein interactions is booming as we begin to appreciate the role of RNA, not just in well-established processes such as tran

RNA加工修饰

中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。

RNA-gel-electrophoresis

MaterialsDEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide solutions should also be

Reverse-Transcription-of-RNA

实验概要The purpose of Reverse transcription of RNA is acquiring cDNA for follow research.实验原理Reverse  Transcription (RT reaction) is a process in which s

前信使RNA

中文名称前信使RNA英文名称pre-messenger RNA;pre-mRNA;precursor mRNA定  义未经剪接加工的基因转录产物。即初级转录物。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA点线杂交

RNA点线杂交(Dot and Slot blotting)·         RNA dot blot and slot blot (Beverly Faulkner-Jones)This methods allows the rapid analysis of numerous small sa

RNA干涉实验

RNA 干涉(RNA1) 是指在真核细胞中引入双链 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子从而导致具有序列同源性的基因产生特异件基内沉默(gene silencing ) 的现象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理当确定了靶基因上的 siRN

RNA-gel-electrophoresis

实验概要RNA gel electrophoresis主要试剂DEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide sol

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

Poly(A)+RNA-Isolation

Eukaryotic messenger RNA (mRNA) can be separated from the other RNA species in a total RNA preparation by affinity chromatography by virtue of the

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo