灵素系统——一种基于基因指纹和深度学习的药效预测系统

2021年6月17日,北京大学国际癌症研究院谢正伟团队在Nature Biotechnology(IF=36.6)在线发表了题目为“Prediction of drug efficacy fromtranscriptional profiles with deep learning”的科研论文(图1),揭示了一种基于基因指纹和深度学习的药效预测系统(DLEPS,中文名灵素系统)。 创新药物研发是一个周期长、耗费大的艰难过程。与发达国家相比,我国在创新药研发方面仍有巨大差距。一方面,人工智能和深度学习在复杂体系方面的成功应用使研发人员认识到其在药物研发领域巨大的应用潜力。另一方面,药物研发的各个环节都积累了大量的数据,包括蛋白质三维结构、小分子有机合成通路、小分子-蛋白靶点结合、药物的药代动力学、药物制剂等方面。基于这些数据开发新的深度学习算法使得药物研发正在加速药物研发的进程。 传统的基于靶点的药物开发采取的是“一个......阅读全文

研究揭示脑部疾病治疗新靶点

  OHSU Vollum研究所的科学家已经发现了一种在神经系统内传递信号的神经细胞线状部分的轴突变性中发挥关键作用的酶。所有神经退行性疾病都发生轴突损失,因此这一发现可以为治疗或预防广泛的脑部疾病开辟新的途径。  研究小组发现Axendead酶或Axed酶在促进轴突自身破坏方面发挥了新的作用。他们

治疗慢性肝脏疾病的新型潜在药物靶点

  近日,一篇发表于Science Translational Medicine的研究报告中,来自昆士兰大学的科学家们通过研究鉴别出了治疗慢性肝脏疾病的可能性药物靶点,文章中,研究人员发现了与慢性肝脏疾病进展相关的特殊基因。  研究者表示,透明质酸(HA,hyaluronan)分子能作为肝脏疾病的标

J.-Immun:研究发现牙龈疾病的新靶点

  在美国有近一半的成年人患有牙龈疾病牙周炎,其中8.5%的人比较严重,可增加心脏病、糖尿病、关节炎和妊娠并发症的风险。  美国宾夕法尼亚大学的研究人员一直以来都在寻找阻止和逆转牙周炎的方法。最近在免疫学权威杂志《Journal of Immunology》发表的一项研究中,他们描述了一个很有前途的

综合组学分析中发现的肾脏疾病靶点

  宾夕法尼亚大学领导的一个团队已经确定了数百个肾脏疾病风险位点,引入了额外的表观遗传、基因表达、单细胞和功能数据,以挖掘遗传关联背后的一些基因、途径和细胞类型。  “我们报告了对人类肾功能的遗传决定因素的全面分析,并显示了表观遗传变化介导表型发展的关键作用,”通讯作者、宾夕法尼亚大学的肾病学家、医

研究发现治疗和预防心血管疾病新靶点

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474850.shtm 心脑血管疾病是人类健康的头号威胁,其根本病因是动脉粥样硬化。血液中低密度脂蛋白胆固醇(LDL-c)水平过高显著加速动脉粥样硬化进展,降低血液中LDL-c含量是预防和治疗心脑血管疾

武汉科研人员发现治疗代谢性疾病新靶点

中新网湖北新闻9月11日电(常宇)华中科技大学同济医学院附属同济医院教授陈勇带领团队研究发现Sortilin在米色脂肪细胞激活过程中的关键作用,以及其对脂肪组织脂肪酸氧化的调控机制,为治疗代谢性疾病提供了新的潜在靶点。相关成果近日在线发表于国际期刊《自然·通讯》。米色脂肪细胞作为一种特殊类型的脂肪细

武汉科研人员发现治疗代谢性疾病新靶点

华中科技大学同济医学院附属同济医院教授陈勇带领团队研究发现Sortilin在米色脂肪细胞激活过程中的关键作用,以及其对脂肪组织脂肪酸氧化的调控机制,为治疗代谢性疾病提供了新的潜在靶点。相关成果近日在线发表于国际期刊《自然·通讯》。米色脂肪细胞作为一种特殊类型的脂肪细胞,大部分分布于皮下白色脂肪组织中

研究发现治疗和预防心血管疾病新靶点

  心脑血管疾病是人类健康的头号威胁,其根本病因是动脉粥样硬化。血液中低密度脂蛋白胆固醇(LDL-c)水平过高显著加速动脉粥样硬化进展,降低血液中LDL-c含量是预防和治疗心脑血管疾病的重要手段。肝脏中低密度脂蛋白受体(LDLR)是清除血液中LDL-c的关键蛋白分子,是多个降脂药物的直接或间接靶点,

丝氨酸为畜禽营养调控和疾病治疗提供新靶点

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503643.shtm丝氨酸在维持代谢稳态和机体健康中发挥了重要作用,在代谢综合征、免疫系统疾病和神经病变的临床治疗中具有重要意义。丝氨酸从头合成途径是体内丝氨酸的主要来源,其合成速率可能受到负反馈调控以及

免疫激活剂靶点界之星——OX40靶点

基因背景OX40,又名Tnfrsf4(Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4),主要在表达于激活的CD4+和CD8+ T细胞表面,和OX40配体结合可以刺激CD8+ T细胞的活化。通过OX40/OX40L信号的共激活效应,T细胞的功能

实体瘤靶点蛋白

近年来,生物药市场保持高速增长的趋势。和小分子药物相比,抗体药物与靶点的结合具有更高的特异性和选择性,在肿瘤、自身免疫病治疗中发挥了巨大的作用,造福肿瘤患者的同时也助推了这个细分市场持续扩容。相比血液肿瘤,实体瘤有着更为复杂的肿瘤免疫微环境及治疗屏障,相应抗体药物和疗法的开发也更有难度,而在开发过程

药物靶点是什么?

1 药物靶点的定义药物靶点通常是指药物在体内与其发挥作用的分子或生物结构。这些靶点可以是细胞内的特定蛋白质、酶、受体、离子通道、细胞表面分子等。药物靶点与药物发挥作用的方式密切相关,在药物研发和治疗中起着至关重要的作用。从另一个角度来理解。它们是药物所针对的特定细胞、组织或病理过程,通过与其相互作用

关键靶点或有望开发治疗引发肿瘤疾病的新型疗法

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Metabolism上的研究报告中,来自辛辛那提大学的科学家们通过研究开发了一种新方法来靶向作用激活特殊蛋白复合体的分子过程,相关研究或有望帮助开发治疗引发肿瘤疾病的新型疗法。图片来源:Colleen Kelley/University of Cincinn

PNAS:研究者发现攻克遗传性肌肉疾病的靶点

  遗传性的肌肉疾病包括肌营养不良症和肌萎缩性侧索硬化症(ALS),很多年来,科学家都在寻找治疗肌肉疾病的疗法,如今来自亚利桑那大学等处的研究者开发了一种新型的疗法来治疗肌肉疾病,相关研究刊登于国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences

Nature-Reviews-Cardiology:心血管疾病乙酰化及治疗靶点

  赖氨酸乙酰化修饰是一种可逆的蛋白翻译后修饰,其通过改变赖氨酸残基上的电荷和蛋白质结构,影响酶的活性、DNA结合力以及蛋白质稳定性。蛋白质的赖氨酸乙酰化是由赖氨酸乙酰基转移酶(KATs)催化,由赖氨酸去乙酰化酶(KDACs)去修饰。研究显示赖氨酸乙酰化修饰与人类心血管疾病的发生、发展关系密切。  

明星靶点IL4Rα:过敏性疾病关键角色

  在过敏性疾病的发病机理中,Th2扮演关键角色,在Th2细胞介导的2型免疫反应中,可见IL-4/13处于中枢位置(见图1),IL-4Rα是IL-4与IL-13受体的共同亚基,也是目前开发最为火热的靶点之一。  IL-4是1980年代发现的一种细胞因子,由于翻译后修饰的不规则模式,特别是糖基化,其分

免疫激活剂靶点界的辉煌之星——OX40靶点

  新的一年,新的气象,在这里小编给大家拜个吉祥年哦!相信各位宝宝们对肿瘤免疫治疗相关的一些药物并不陌生,已有很多药品上市并用于治疗中,开发更多可以用于提高免疫系统对肿瘤识别及杀伤能力的药物一直是免疫学研究的热点之一。那么,今天小编要为大家带来的就是免疫激活剂靶点界的辉煌之星——OX40靶点。  

抗癌新药:瞄准“靶点”突破

   5月初,“中科院2018年第一季度科技成果转移转化亮点工作”结果公布,中科院上海药物研究所研制的一种抗癌药物位列其中。  这就是由该所丁健课题组、杨春皓课题组、蒙凌华课题组与上海海和药物研究开发有限公司(以下简称海和药物)研发的抗肿瘤1类新药CYH33。今年年初,这一具有自主知识产权的新药获得

研究揭示抗衰老靶点

  根据最近发表在《Nature》杂志上的一项研究,两个保守的表观遗传调控因子可能是新型的抗衰老靶标。这项研究由中国科学院神经科学研究所脑科学与智能技术卓越中心蔡时青博士以及中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌博士合作完成。通过使用多种方法和系统,作者确定了保守的衰老负向调节因子,从而为如何实现健康衰老

抗癌新药:瞄准“靶点”突破

  5月初,“中科院2018年第一季度科技成果转移转化亮点工作”结果公布,中科院上海药物研究所研制的一种抗癌药物位列其中。  这就是由该所丁健课题组、杨春皓课题组、蒙凌华课题组与上海海和药物研究开发有限公司(以下简称海和药物)研发的抗肿瘤1类新药CYH33。今年年初,这一具有自主知识产权的新药获得了

找出病变基因当“靶点”

  提起最佳的射击,很多人的答案都是正中靶心。对于癌症病人来说,能够准确地找到病变原因,不仅能够实现真正的对症下药,还能大大减轻病人身体上所受的痛苦。在青岛市中心医院肿瘤综合治疗科,通过检测基因序列,发现病变基因,来揭示病人患上癌症的核心“密码”,尤其是对于癌症晚期病人来说,无疑是黑暗中的“柳暗花明

发现抗抑郁新靶点

  近日,挪威医学科学家利用脑内基因治疗操纵一个新的靶点发现了一种新的治疗抑郁症的方法。  研究人员通过小鼠体内实验发现,降低HCN通道蛋白的含量可以减轻抑郁症状,如果能够在人体内也有相同的效果,那么这项发现提供了一个新的治疗靶点,可以拯救成千上万名对现有疗法治疗不佳的抑郁症患者。  “现有的治疗方

Nature:慢性炎症性疾病新靶点,直指更特异的抗炎药物

  炎症是人体自愈过程不可分割的组成部分,但是,当它变成慢性炎症时就会导致癌症、阿尔兹海默症和心血管疾病等。炎性体(inflammasomes)是遇到各种细胞应激信号时触发炎症反应的蛋白质分子机器。  7月25日,加州大学圣地亚哥分校在《Nature》发表文章指出激活NLRP3炎性体的信号途径与几种

推开GPCR靶点与代谢性疾病研究的敲门砖动物模型

   基因编辑技术最具代表性的就是在人类疾病动物模型制备方面的应用。随着经济发展,代谢性疾病的发病率逐年增高,其中心血管疾病导致的死亡占我国居民全部死因的40%以上,死亡率居于首位[1]。通过构建包括心血管疾病、糖尿病等代谢领域基因编辑小鼠模型,并进行多种深入研究,可以找到相关疾病的潜在治疗靶点,研

科学家发现可用于治疗神经退行性疾病的新靶点

  在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学的研究人员发现利用抗体阻断一种蛋白的活性能够改善衰老小鼠的认知行为。相关研究结果发表在2019年4月11日的Nature期刊上,论文标题为“CD22 blockade restores homeostatic microglial phagocytosis i

合成胆固醇中的“好学生”,或为肝脏疾病治疗带来新靶点

  胆固醇,大家都很熟悉,经常有人将其归类为有害身体健康的“坏东西”,“降低胆固醇”也是时常萦绕在大家耳边的一句话。然而,很多人似乎会忘记,胆固醇也有“好”“坏”之分,“坏”胆固醇,叫做低密度脂蛋白(LDL-C),它经常会对心脏、动脉等造成伤害,而“好”胆固醇,叫做高密度脂蛋白(HDL-C),能够清

NEJM:广谱抗癌新靶点

  来自哈佛干细胞研究所(HSCI)的研究人员在最具侵袭性的肝癌中,鉴别出了一个已知调控胚胎干细胞自我更新的基因,由此开始积极地寻找能够阻断其活性的药物。   这一称作为SALL4的基因,赋予了干细胞持续分化的能力,使得它们不会转变为成熟细胞。通常情况下,细胞只在胚胎发育过程中表达SALL4,而在

改善伤口愈合的新靶点

  MicroRNA是新的治疗剂的有趣靶标结构。它们可以通过合成抗氧化剂阻断。然而,到目前为止,仅在局部使用这些数据是不可能的。歌德大学法兰克福的研究人员现在已经成功地实现了这一点,在光诱导型抗生素的帮助下治疗伤口愈合受损。  MicroRNA是在细胞中键合到靶结构上的小基因片段,以这种方式防止某些

改善伤口愈合的新靶点

  MicroRNA 是新的治疗剂的有趣靶标结构。它们可以通过合成抗氧化剂阻断。然而,到目前为止,仅在局部使用这些数据是不可能的。歌德大学法兰克福的研究人员现在已经成功地实现了这一点,在光诱导型抗生素的帮助下治疗伤口愈合受损。  MicroRNA 是在细胞中键合到靶结构上的小基因片段,以这种方式防止

靶点难寻:新药创制只能亦步亦趋

“靶点就如组成金字塔的一块特定的石头,它就在那儿,但要准确找到,却并不是件容易的事儿。”10月14日, 南京传奇生物科技公司首席科学官范晓虎博士在接受科技日报记者采访时说。从发现PD-1分子到相关药物问世、摘得诺奖,日本免疫学家本庶佑用了26年。找靶点难,这是全球新药研发业界的共识,中国尤为如此。“