GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库
2021年6月14日，JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。该研究开发的GenOrigin数据库可系统追溯565个物种，9,102,113个基因起源，并根据包含时间刻度的物种树推断基因年龄。 DOI:10.1016/j.jgg.2021.03.018 基因起源的时间（即基因年龄）与其功能密切相关。例如，抑癌基因TP53等癌症相关基因的起源时间与生物多细胞性出现的时间相对应。目前注释同源基因的数据库大多没有提供推断基因年龄的功能，即使有此功能，也仅针对少数核心物种。此外，由于不同研究之间所用注释和方法存在差异，各数据集的基因年龄推断之间也难以比较。 GenOrigin数据库建立流程......阅读全文
蛋白质纯化
蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛，是一项重要的操作技术。 一个典型的真核细胞可以包含数以千计的不同蛋白质，一些含量十分丰富，一些仅含有几个拷贝。为了研究某一个蛋白质，必须首先将该蛋白质从其他蛋白质和非蛋白质分子中纯化出来。
蛋白质测序
一、概念当前，所谓蛋白质测序，主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San
蛋白质定量
Quantitative Determination of Peptides by Sulfhydryl (-SH) Groups New (Contributed by David Van Horn, Dept. of Chemistry, UC Berkeley Greg Bulaj, Dept
蛋白质测序
一、概念当前，所谓蛋白质测序，主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San
蛋白质测序
Edman降解法 实验方法原理 主要有质谱法，利用蛋白质测序仪进行测序以及利用蛋白质对应DNA或mRNA进行间接测序。传统的蛋白质测序实验一般包括以下步骤：1
蛋白质纯化
蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛，是一项重要的操作技术。 一个典型的真核细胞可以包含数以千计的不同蛋白质，一些含量十分丰富，一些仅含有几个拷贝。为了研究某一个蛋白质，必须首先将该蛋白质从其他蛋白质和非蛋白质分子中纯化出来。用于分离蛋白质的最重要特性有大小、电荷、疏水性和对其他分子的
蛋白质染色
二维凝胶电泳(2-DE)是广为蛋白质组学科学家们应用的经典技术之一，蛋白混合物在两个维度上被分离。第一步是常规的等电聚焦，此过程中蛋白质根据其等电点被分离。接着，第二维使用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)，将蛋白质按分子量进一步分离。上述两步操作在互相垂直的两个方向上，使分离的蛋白
蛋白质电泳
蛋白质电泳（主要内容如下）One-Dimensional SDS-PAGETwo-Demensional SDS-PAGEProtein Electrophoresis in Agarose Gel Gel StainingRecipesOne-Dimensional SDS-PAGE·
蛋白质纯化
是当代生物产业当中的核心技术。该技术难度、成本均高；例如一个生物药品的成本75%都花在下游蛋白质分离纯化当中。常用技术有：１、沉淀，２、电泳：蛋白质在高于或低于其等电点的溶液中是带电的，在电场中能向电场的正极或负极移动。根据支撑物不同，有薄膜电泳、凝胶电泳等。３、透析：利用透析袋把大分子蛋白质与小分
蛋白质亚基
在结构生物学，一个蛋白质亚基是一个单一的蛋白质分子，其组装（或“ coassembles ”）与其他蛋白质分子以形成蛋白复合物。一些天然存在的蛋白质具有相对较少的亚基，因此被描述为寡聚体，例如血红蛋白或DNA聚合酶。其他的可能由非常多的亚基组成，因此被描述为多聚体，例蛋白质亚基如微管和其他细胞骨架蛋
蛋白质测序
一、概念当前，所谓蛋白质测序，主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San
蛋白质测定仪测奶制品蛋白质
随着人们生活水平的提高,鲜奶已成为人们普遍食用的营养佳品。鲜奶中蛋白质、脂肪、糖类含量丰富,且易被人体消化吸收;鲜奶中钙、铁等矿物质含量也很丰富,是人们补钙的天然优良食品。在日本就有一杯奶改善一个民族之说。蛋白质是鲜奶的重要组成成分,也是评价鲜奶质量的重要营养学指标之一。 目前，市售部分大
球状蛋白质和纤维状蛋白质区别
以长轴和短轴之比为标准，球状蛋白质小于10，纤维状蛋白质大于10 [2] 。纤维状蛋白多为结构蛋白，是组织结构不可缺少的蛋白质，由长的氨基酸肽链连接成为纤维状或蜷曲成盘状结构，成为各种组织的支柱，如皮肤、肌腱、软骨及骨组织中的胶原蛋白；球状蛋白的形状近似于球形或椭圆形。许多具有生理活性的蛋白质，
完全蛋白质和半完全蛋白质等简介
完全蛋白质 所含必需氨基酸种类齐全，数量充足，相互之问比例也适当，不但能够维持成人的健康，也能够促进人体的生长发育，如乳中的酪蛋白、蛋类中的卵白蛋白、大豆球蛋白、小麦中的麦符蛋白等。 半完全蛋白质 所含各种必需氨基酸种类齐全，但各种氨基酸含量多少不匀，互相之间比例不合适。在膳食中作为唯一
蛋白质的结构及蛋白质的功能（一）
蛋白质为生物高分子物质之一，具有三维空间结构，因而执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功能之间的关系非常密切。在研究中，一般将蛋白质分子的结构分为一级结构与空间结构两类。 一、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
ATP储存液的配制依赖环核苷酸的蛋白质激酶蛋白质激酶C酪蛋白激酶酪氨酸激酶凝胶蛋白质激酶分析试剂、试剂盒ATP储存液 实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多
球状蛋白质和纤维状蛋白质区别
以长轴和短轴之比为标准，球状蛋白质小于10，纤维状蛋白质大于10。纤维状蛋白多为结构蛋白，是组织结构不可缺少的蛋白质，由长的氨基酸肽链连接成为纤维状或蜷曲成盘状结构，成为各种组织的支柱，如皮肤、肌腱、软骨及骨组织中的胶原蛋白；球状蛋白的形状近似于球形或椭圆形。许多具有生理活性的蛋白质，如酶、转运蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合，然后将DNA从被修饰的碱基处切割，电泳分离，结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰，不能切断，可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
关于蛋白质工程融合蛋白质的介绍
脑啡肽(Enk)N端5肽线形结构是与δ型受体结合的基本功能区域，干扰素（IFN）是一种广谱抗病毒抗肿瘤的细胞因子。黎孟枫等人化学合成了EnkN端5肽编码区，通过一连接3肽编码区与人α1型IFN基因连接，在大肠杆菌中表达了这一融合蛋白。以体外人结肠腺癌细胞和多形胶质瘤细胞为模型，采用3H－胸腺嘧啶
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念：一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
蛋白质的结构及蛋白质的功能（二）
(二)蛋白质空间橡象与功能活性的关系 蛋白质多种多样的功能与各种蛋白质特定的空间构象密切相关，蛋白质的空间构象是其功能活性的基础，构象发生变化，其功能活性也随之改变。蛋白质变性时，由于其空间构象被破坏，故引起功能活性丧失，变性蛋白质在复性后，构象复原，活性即能恢复。 在生物体内，当某种物质
蛋白质印迹法的测定蛋白质含量
1、制作标准曲线（1 ）从－20℃取出1mg/ml BSA，室温融化后，备用。（2） 取18个1.5ml离心管，3个一组，分别标记为0μg，2.5μg，5.0μg，10.0μg，20.0μg，40.0μg。（3 ）按下表在各管中加入各种试剂。0μg2.5μg5.0μg10.0μg20.0μg40.0
蛋白质测定仪用于羊奶蛋白质测定
研究表明，羊奶是最接近母乳的奶，分子结构与母乳最相似，含有大量的乳清蛋白，婴儿对羊奶的消化率可达94%以上。因此在现代的很多奶制品生产企业，羊奶的生产频率很高，而在这些企业的品控中心，一般都配备有蛋白质测定仪这样的检测仪器，用于测定羊奶中的蛋白质含量，从而保障产品的质量。
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
试剂、试剂盒 ATP储存液实验步骤 一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多数激酶需要 ATP 镁盐作为高效底物。有时可以用锰代替镁。1. 20 mmol/L MgCl2 或 MgSO42. 20 mmol/L Na2-ATP以 1:1 的比例混合这两种溶液，测 pH 值。慢慢将
蛋白质根据蛋白质分子的外形进行分类
1．球状蛋白质分子形状接近球形，水溶性较好，种类很多，可行使多种多样的生物学功能。2．纤维状蛋白质分子外形呈棒状或纤维状，大多数不溶于水，是生物体重要的结构成分，或对生物体起保护作用。3．膜蛋白质一般折叠成近球形，插入生物膜，也有一些通过非共价键或共价键结合在生物膜的表面。生物膜的多数功能是通过膜蛋
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
ATP储存液的配制 依赖环核苷酸的蛋白质激酶 蛋白质激酶C 酪蛋白激酶 酪氨酸激酶 凝胶蛋白质激酶分析
蛋白质分离实验_分离已知pI－的蛋白质
实验材料含10 mg蛋白质／ml 的溶于水的样品试剂、试剂盒缓冲液（pH>pI）仪器、耗材50 μm 内径的未包被的融合硅毛细管柱CE 仪器实验步骤1. 用 pH 高于蛋白质的pI的 5 mmol/L 缓冲液 1/10 （V/F） 稀释蛋白质样品，使蛋白质（终浓度 = 1.0 mg/ml） 产生电荷
蛋白质定量/蛋白质含量的测定(LOWRY法)
实验概要运用LOWRY法测定蛋白质的含量。实验原理Lowry法是双缩脲法和福林酚法的结合与发展，其原理是：蛋白质溶液用碱性铜溶液处理，形成铜-蛋白质的络合盐，再加入酚试剂后，除使肽链中酪氨酸、色氨酸和半胱氨酸等显色外，还使双缩脲法中肽键、碱性铜的显色效果更强烈。因此，Lowry法的显色效果比单独使用
“十二五”基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
十二五基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常