转录组学分析为分析微环境等肿瘤复杂性问题提供了机会

图片来源:Cell Press 转录组学分析为分析微环境等肿瘤复杂性问题提供了机会。为了全面描述癌细胞及其周围的肿瘤微环境,研究人员分析了超过1万名癌症患者的转录组,结果他们在20种癌症中发现了4种不同的肿瘤微环境亚型。 本期《癌细胞》封面图片展示的这4个亚型,与癌症预后和免疫治疗反应密切相关。一个整合转录组和基因组数据的可视化工具,描述了肿瘤框架、突变负荷、免疫成分、抗肿瘤免疫和免疫抑制逃逸等,有助于生物标志物的发现和治疗方案的个性化。......阅读全文

转录组学分析为分析微环境等肿瘤复杂性问题提供了机会

  图片来源:Cell Press  转录组学分析为分析微环境等肿瘤复杂性问题提供了机会。为了全面描述癌细胞及其周围的肿瘤微环境,研究人员分析了超过1万名癌症患者的转录组,结果他们在20种癌症中发现了4种不同的肿瘤微环境亚型。  本期《癌细胞》封面图片展示的这4个亚型,与癌症预后和免疫治疗反应密切相

高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究

肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种

肿瘤微环境的研究意义

肿瘤与环境,两者既是相互依存,相互促进,又是相互拮抗,相互斗争的。它是现代肿瘤生物学的一个关键和核心的问题。近年来由于肿瘤细胞学和分子生物学的进展,人们对于肿瘤和环境的相互关系有了更加深入的了解。这不仅对于认识肿瘤的发生、发展、转移等有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用。除

肿瘤微环境概念和特点

肿瘤微环境是指肿瘤的发生、生长及转移与肿瘤细胞所处的内外环境有着密切关系,它不仅包括肿瘤所在组织的结构、功能和代谢,而且亦与肿瘤细胞自身的(核和胞质)内在环境有关。肿瘤细胞可以通过自分泌和旁分泌,改变和维持自身生存和发展的条件,促进肿瘤的生长和发展。全身和局部组织亦可通过代谢、分泌、免疫、结构和功能

Nature:靶向肿瘤微环境,用antimiR治疗肿瘤

  近日,著名国际期刊Nature发表了耶鲁大学研究人员的一项最新研究成果,他们建立了一个能够将antimiR靶向输送到酸性肿瘤微环境的药物输送平台,通过抑制miR-155表达,抑制淋巴癌发展。这一研究成果对靶向药物输送系统研究以及通过antimiR治疗癌症具有重要意义。  MicroRNA是是一类

肿瘤微环境稳态重塑可阻抑肿瘤进展

肿瘤的发生、发展、侵袭和转移等生物学行为与其所处环境——肿瘤微环境(TME)密切相关。因此,对TME的稳态重塑和免疫调节机制的深入理解,是实现对恶性肿瘤有效抑制、克服免疫逃逸以及逆转药物耐受的关键。中国工程院院士、国家分子医学转化中心主任、空军军医大学基础医学院细胞生物学教研室陈志南教授和边惠洁、杨

肿瘤微环境对肿瘤血管生成的调控

缺氧实体肿瘤发生发展过程中,高耗氧量、营养缺乏和细胞中代谢物质的积累可能会产生不适合肿瘤细胞生长的缺氧微环境。在常氧条件下,HIF-1α和HIF-2α被PDH和FIH-1羟基化,并通过蛋白酶体介导的降解来降解。在肿瘤的缺氧环境中,FIH-1和PHDs的失活不能羟基化HIF-1/HIF-2α,降低HI

肿瘤微环境稳态重塑可阻抑肿瘤进展

  肿瘤的发生、发展、侵袭和转移等生物学行为与其所处环境——肿瘤微环境(TME)密切相关。因此,对TME的稳态重塑和免疫调节机制的深入理解,是实现对恶性肿瘤有效抑制、克服免疫逃逸以及逆转药物耐受的关键。  中国工程院院士、国家分子医学转化中心主任、空军军医大学基础医学院细胞生物学教研室陈志南教授和边

单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞

T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群,能够对肿瘤抗原产生反应,肩负着清除肿瘤细胞的重任,也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而,随着肿瘤发展,这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态,“战斗力”大幅下降,被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明,不同癌症的肿瘤微环境对

Science:微环境让肿瘤更加难缠

  Science杂志发表的一项最新研究表明,肿瘤抵抗癌症治疗并不一定是出了内部问题。研究人员发现,大脑肿瘤与肿瘤微环境的相互作用,也会使其对药物产生抗性。好在用药物靶标相关信号通路可以解决这个问题。  多形性胶质母细胞瘤(GBM)是一种常见的侵袭性成人脑瘤,现有标准疗法只能稍许延长患者的生命,大多

Nature:肿瘤微环境决定肝癌类型

近日,《Nature》期刊以“Necroptosis microenvironment directs lineage commitment in liver cancer”为题发表了这一最新研究,由德国图宾根大学医院、癌症联合会的Lars Zender教授领导的国际小组发现:肿瘤微环境(包

关于肿瘤微环境的研究意义

  肿瘤与环境,两者既是相互依存,相互促进,又是相互拮抗,相互斗争的。它是现代肿瘤生物学的一个关键和核心的问题。近年来由于肿瘤细胞学和分子生物学的进展,人们对于肿瘤和环境的相互关系有了更加深入的了解。这不仅对于认识肿瘤的发生、发展、转移等有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用

“种子与土壤”——肿瘤与其微环境

  肿瘤并不是一个孤岛,而是由肿瘤细胞、多种基质细胞(如成纤维细胞、免疫和炎性细胞、脂肪细胞、胶质细胞、平滑肌细胞等)以及细胞外基质构成的有机体。一百多年前,Paget即提出肿瘤“种子与土壤”的假说:肿瘤细胞作为“种子”,其发生和转移依赖于周围的微环境“土壤”。肿瘤细胞是核心,其周围的细胞及非细胞组

微环境对肿瘤免疫的影响

迄今为止,宿主肿瘤微环境对肿瘤免疫逃逸的关注不够。1991年,从肿瘤微循环的特征出发,首次提出血液、淋巴和间质液的某些成分在恶性肿瘤组织(称为肿瘤内部环境)中流动可能不是免疫因子和细胞免疫反应的最佳状态,其低氧、低pH和低营养状态不足以为细胞免疫反应提供必要的营养和能量,也不利于免疫细胞与攻击目标之

肿瘤免疫与肿瘤微环境研讨会圆满落幕

经过连日的精心筹备,由Bio-Techne与PerkinElmer主办,广州睿贝医学科技有限公司协办的肿瘤免疫与肿瘤微环境研讨会于2018年9月16日在广州花园酒店圆满结束。肿瘤免疫研究领域的专家、学者顶着超强台风“山竹”的肆虐,齐聚一堂,共同度过这次“干货满满”的分享盛会。在半天的议程中,会议聚焦

Cell:肿瘤微环境中的代谢战争

  肿瘤微环境是指肿瘤周围的细胞和组织,与癌症的发生和发展有着密切的关系。虽然目前的癌症治疗主要以肿瘤为目标,但人们已经逐渐意识到了肿瘤微环境的重要性。  华盛顿大学的科学家们最近在Cell杂志上发表文章指出,肿瘤细胞和T细胞在肿瘤微环境中进行着一场激烈的葡萄糖争夺战。这种代谢竞争会影响T细胞的杀伤

免疫肿瘤微环境的组成及特点

免疫肿瘤微环境被称为肿瘤的“第七大标记性特征”,由固有免疫细胞、适应性免疫细胞、细胞因子、细胞表面分子等组成。这些免疫组分构成了复杂的调控网络,在肿瘤发生、发展中起着举足轻重的作用。本章节将对免疫肿瘤微环境的组成特点及肿瘤免疫微环境的重塑进行介绍。1、免疫细胞免疫肿瘤微环境中包含参与机体免疫反应的所

肿瘤微环境分析指导癌症治疗

  在免疫疗法时代,癌症生物学家依靠新一代工具来了解肿瘤和免疫细胞之间的相互作用是如何影响疾病进程的。  虽然Sean Bendall是一名病理学家,但最近却成了一名图谱制作者,他使用尖端的蛋白质绘图技术来描绘出肿瘤组织的变幻莫测的景观。  这项技术由Bendall在加州斯坦福大学(Stanford

3D转录组图谱阐释造血干细胞和微环境细胞间的调控网络

  血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞,称为造血干细胞,它能够维持机体长久造血和组织稳态1。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段,但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此,造血干细胞的发育,尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而,现在的研究主要集中在特定

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

肿瘤微环境对免疫治疗的影响

免疫治疗是对传统抗癌方法的突破,也是当前癌症治疗的一颗新星。然而,尽管免疫治疗与传统治疗相比具有更好的特异性和持久性,但其治疗效果仍深受肿瘤微环境的理化和细胞因子环境的影响(根据最近的研究,仍认为抑制作用是最重要的因素)。目前的免疫治疗大致可分为两类:抗体治疗和细胞治疗。(1)、抗体治疗。抗体治疗(

胃癌微环境抗肿瘤免疫机制被发现

  复旦大学基础医学院徐洁杰、张伟娟课题组和复旦大学附属中山医院秦净、沈振斌课题组合作研究发现,肿瘤浸润“IL17阳性细胞” 能够激活肿瘤微环境抗肿瘤免疫反应,对促进胃癌患者术后辅助化疗有利。相关研究成果近日在线发表于《肿瘤学年鉴》(《Annals of Oncology》)。  据悉,胃癌患者的术

靶向肿瘤微环境有助于抑制癌症

  人类免疫系统调节并控制了识别微生物感染以及外界异物的入侵。这种天然的免疫反应依赖于重要的新陈代谢和细胞过程,从而达到抵抗感染和其他疾病的目的。然而,免疫系统的相关反应也参与了全身性疾病和癌症的发展。因此,进一步了解免疫系统细胞反应中涉及的基本生化过程至关重要,并且有助于开发针对系统性疾病和癌症的

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。空间转录组测序运用方向(Trends Biotechn

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

  空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。   空间转录组测序运用方向(Trends Bi

GCN2抑制肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫反应

  肿瘤相关巨噬细胞(TAM)和髓样抑制细胞(MDSC)抑制肿瘤微环境中的T细胞功能。  蛋白GCN2(general control nonderepressible 2)是一种环境传感蛋白,可根据营养供应情况控制转录和翻译。虽然GCN2是免疫肿瘤学中的一种潜在的治疗靶点,但是它在塑造肿瘤免疫反应

新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率

近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl

转录组测序原理

而转录组测序即是利用高通量测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq,也就是转录组测序,可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括:正常组织与肿瘤组织;药物治疗前后的表达差异;发育过程中,不同发育阶段,不同组织的表达

连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络

肿瘤基因组中充满了非编码突变,这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez,Trey Ideker,在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona

阻断肿瘤细胞“微环境”抵御白血病恶化

  刊登在国际杂志Cancer Cell上的一篇研究论文中,来自纽约大学医学中心(NYU Langone Medical Center)等处的研究人员通过研究揭示了一项在抵御恶性白血病上的重大研究突破,这或为开发治疗白血病的新型靶向疗法提供一定的帮助,相关研究发表于国际杂志Cancer Cell上。