长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展

6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队,关于长链非编码RNA(lncRNA)编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides Encoded by Long Noncoding RNAs。 lncRNAs被认为是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的非编码RNAs转录本。然而,研究表明,较多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(small open reading frame,smORFs)可以编码多肽(smORF encoded polypeptides,SEPs),后者可广泛参与肌肉形成、粘膜免疫、RNA脱帽及肿瘤增殖等生物学过程。考虑到lncRNAs转录本及其smORFs的庞大数量,SEPs或代表着一个被忽视且待开发的富含蛋白质活性调节因子的宝库......阅读全文

上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制

  5月5日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin

曹雪涛阐明新型长非编码RNA介导固有免疫的反馈调节机制

  宿主的固有免疫系统通过模式识别受体(pattern recognition receptors,PRRs)感应入侵病原体激活免疫应答从而达到清除病原体的目的。针对于RNA病毒的入侵,RIG-I(retinoic acid-inducible gene-I)受体识别胞质病毒RNA并产生I型干扰素(

研究人员发现长非编码RNA物种差异加工及其功能演变

   从细菌到真核单细胞,从真核单细胞到复杂生命,在物种进化的时间长河里,生命体中每一个可能导致物种演变的功能“单位”都值得科学家探究,比如细胞中广泛地存在功能未知的“暗物质”——长非编码RNA。中科院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所,简称分子细胞卓越中心)陈玲玲研究组的最新研究

研究发现长非编码RNA种属特异性加工决定其功能差异

  北京时间4月6日,国际学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果“Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved fun

Nature解析癌症与非编码RNA

  人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子,但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。

细胞化学词汇非编码小RNA

中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定  义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学

张金伟团队揭示长链非编码RNA-NEAT1成熟和menRNA胞内快速降解的结构机制

  核旁斑组装转录本1 (NEAT1)是一种高度丰富且保守的长链非编码 RNA (lncRNA),从多发性内分泌肿瘤 (MEN) 基因座转录,编码 NEAT1-1(或 MEN-ε,~3.7 kb)和 NEAT1-2(或 MEN-β,~22.7 kb)。NEAT1-2 lncRNA是核旁斑 (para

我国科学家发现长非编码RNA对细胞核仁功能的调控机制

图. SLERT的加工产生以及其与DDX21环、RNA聚合酶Pol I的相互作用机制  在国家自然科学基金重大研究计划项目(项目编号:91440202,91540115)等资助下,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组取得重要研究进展,揭示了长非编码RNA SLERT 在细胞核仁功能和RN

Nature重要发现:独特的非编码RNA

  我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体,每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织,其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调,这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在,来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu

非编码小RNA的结构和功能

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

非编码小RNA的基本信息

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

我国发现一类新型长非编码RNA-基因组“暗物质”不断“正名”

  国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现,一类新型长非编码RNA,或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。  人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列,包括基因

陈玲玲课题组等发表长非编码RNA功能及调控机制综述论文

  近期,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈玲玲课题组等在Nature Review Molecular Cell Biology上,在线发表了题为Gene regulation by long non-coding RNAs and its biological functions的综述文

带你认识RNA军团中“非正规军”——非编码RNA

人类的每一个细胞随时都像在进行着一场无止尽的战争,细胞核是司令部,细胞质是战场。六十年前,弗朗西斯·克里克(Francis Crick)的“中心法则”( DNA转录成RNA,再翻译成蛋白质)现在一直是细胞作战的绝对军规,军事机密(遗传信息)必须从司令DNA先到RNA军团,再到“武器弹药”蛋白质。司令

深入研究非编码RNA的新工具

  最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。  这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang

出人意料的非编码RNA调控

  为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。  基因组测序研究最近显示,增强

长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

  在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?   《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫

Cell封面故事:抗癌向着非编码RNA开炮

  一种常见儿童血癌中对触动及推动肿瘤生长和进展的因子开展大型遗传分析,来自纽约大学Langone医学中心的研究人员报告称,他们鉴别出了一个可能的、治疗这种疾病的新药物靶点。  T细胞急性淋巴母细胞性白血病(T-cell acute lymphoblastic leukemia)是一种最常见且具有侵

单革:非编码RNA的探索者

  日前,国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》刊发了中国科学技术大学单革教授的一篇文章,他的实验室发现了一类新型环状非编码RNA,并揭示了其功能和功能机理,相关成果得到了新华社、中科院官网等媒体关注。  记者了解到,在2012年9月,《自然·通讯》也在线发表了单革的研究成果,那次他发现了曾被认为是

非编码RNA的功能引发国际研究热潮

  由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。   根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的

中国科大发现新型非编码RNA

  最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。  非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起

长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存? 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免

可以促进癌细胞生长的非编码RNA

国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究

非编码RNA为癌症研究提供新思路

  澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明,非编码RNA(核糖核酸)在癌症治疗方面存在巨大潜力,有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。  非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来,全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因,这些基因只占人类基因组的2%。  发表

m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在

生物物理所揭示新的长非编码RNA在神经系统中的作用机制

  10月15日,Nucleic Acid Research杂志在线发表了中科院生物物理研究所刘力研究组和陈润生研究组合作的最新研究成果The novel long non-coding RNA CRGregulates Drosophila locomotor behavior。该研

北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术

   2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存

JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA

  尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。  以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。  发表在Journal of Clin

Nature:像海绵一样的非编码RNA

  一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用,最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制,指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白(repressor proteins)。  小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一类长度为40-400个

Nature里程碑研究:新型非编码反义RNA

  在研究帕金森氏病的过程中,一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能:借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。   为了合成蛋白