超多重PCR技术及其在临床病原微生物检测的应用(二)
1.3 靶向-NGS(tNGS)技术的应用超多重PCR兼具PCR对于特定微量DNA模板的特异性扩增性能以及多个片段同步扩增的能力,配合NGS测序,会拥有比普通宏基因组,全外显子组测序更为灵敏的特定基因检出率,此外前期建库流程更加简便易行并具有相当大的成本优势。目前tNGS技术的应用范围至少包括遗传疾病检测、癌症检测、人类身份鉴定和传染病检测等几个方面。图2. 超多重PCR-NGS技术应用范围(来源:Thermo Fisher官网)1.3.1 遗传疾病研究及相关检测在辅助生殖领域,胚胎植入前基因筛查(PGS)可以帮助提高怀孕成功率。这一检查需要在胚胎发育的第2天或第5天检查是否发生基因组异倍体性,由于此阶段可用于检测的胚胎细胞细胞数量极少,用超多重PCR的方式进行全基因组规模的扩增会大大增加检测的敏感性和特异性。将tNGS用于新生儿进行相关检查、遗传病及携带者筛查的最大优势在于一次检出通量大于传统检测方法,同时相比于外显子组测序具......阅读全文
超多重PCR技术及其在临床病原微生物检测的应用(二)
1.3 靶向-NGS(tNGS)技术的应用超多重PCR兼具PCR对于特定微量DNA模板的特异性扩增性能以及多个片段同步扩增的能力,配合NGS测序,会拥有比普通宏基因组,全外显子组测序更为灵敏的特定基因检出率,此外前期建库流程更加简便易行并具有相当大的成本优势。目前tNGS技术的应用范围至少包括遗传疾
超多重PCR技术及其在临床病原微生物检测的应用(三)
2.2.2 基于分子的病原体检测技术2.2.2.1蛋白检测目前针对病原体蛋白的直接检测使用质谱技术,基于已建立的微生物胞膜蛋白质、脂多糖、核酸等的数据库对微生物进行精准鉴定和分析。质谱方法针对培养后浓度较高、品种较为单一的待测样品,通过获得其蛋白质图谱,再与已知微生物构建的数据库的参考图谱进行比对,
超多重PCR技术及其在临床病原微生物检测的应用(一)
一超多重PCR技术简介1.1 PCR及多重PCR技术1.1.1 PCR技术聚合酶链式反应(PCR)是一种在体外是用已知寡核苷酸引物引导未知片段中微量待测基因片段进行扩增的技术。PCR反应体系主要包括待扩增样品模版、特异性引物、DNA聚合酶(polymerase)、扩增底物dNTPs以及含有Mg2+的
PCR技术及其在临床诊断应用中的进展
一、病原体的定性及定量检测,PCR及其相关技术适用于病毒,细菌、寄生虫等所有病原体的检测,以下就SDA首批的四种病原体基因诊断项目加以说明。1. PCR技术在结核菌检测中的应用及意义结核菌基因诊断的意义主要表现在:a. 区分TB与其它分枝杆菌;b. 检测TB耐药基因;c . 提高TB的阳性检出率。2
PCR快速检测技术及其在食品中的应用
[摘 要] 微生物食品安全是当前消费者与食品工业共同关注的话题,食品中致病菌的快速、准确、简便检测,对于食品安全质量控制以及食品链中致病性细菌的溯源追踪具有重要作用。在选用微生物的快速检测方法时,应该考虑到方法的预期目标的精确性、检测时间、经济性、可接受性、操作简便性、技术服务等因素。介绍了P
荧光定量PCR技术及其应用(二)
3 应用由于FQ-PCR具有高灵敏性,高特异性和高精确性的特点,目前,该项技术已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、免疫分析、基因表达、突变及其多态性的研究等多个领域。3.1 病原体测定由于PCR技术的问世,使得病原体检测能够快速而方便的进行。但由于其高灵敏性,实验操作很容易受到污染而出现假阳性。只要
荧光定量PCR仪技术及其在医学中的应用(二)
3 在医学中的应用3.1 病原体测定PCR技术的问世使病原体检测能够快速、方便地进行。由于PCR技术假阳性率太高,只要有微量病原体存在就可得到阳性结果,这并不能作为诊断依据, 只有当一定数量的病原体存在时才有临床意义。因此,对模板准确定量显得特别重要,应用荧光技术PCR仪就能够快速、准确地得到结果。
多重分子检测技术特点及其在病原体诊断中的应用
近年来分子检测在病原学诊断上的发展非常迅速,特别是对病毒和非典型病原体的检出效率和准确性大幅提升,成为临床和实验室共同关注的热点。此次新冠疫情后,无论临床还是实验室都意识到分子检测在病原学诊断中具有不可或缺的地位。感染性疾病是大家关注的公共卫生问题。在2016年世界卫生组织公布的数据,全球5690万
多重数字PCR技术介绍(二)
3.探针成本太高,没关系我们用染料法也可以做多重数字PCR来源:Anal Chem.2013 Dec 3;85(23):11619-27通过改变扩增产物的长度,或者调整引物的量,或者改变反应的Tm值等条件,可以轻松尝试多重数字PCR反应。4.染料法也可以检测点突变来源:Anal Chem.2014
PCR在临床检验中的应用(二)
呼吸系统感染性疾病主要的有肺结核、非典型性肺炎等。结核杆菌感染曾给人类健康带来很大威胁,一度是较严重的致死性疾病之一。解放以后由于对结核病的预防的重视,特别是特效抗痨药物的出现,使结核病流行基本被控制。近来结核病有抬头的趋势,基原因可能有两方面,其一是耐药株的不断出现,其二是对结核预防
多重PCR技术在多种病原体检测应用中具有三大特点:
①高效性:同一PCR反应管中可同时检测多个病原体基②系统性:对引起相同或类似症状疾病的不同病原微生物或具有相同感染途径的多种病原体等进行检测或鉴别。例如引起呼吸道疾病的病原体;通过血液传播的感染性病原体;导致脑炎脑膜炎症候群相关病原体等,都可使用多重PCR技术进行组合检测与鉴别。③经济性:相较于多个
荧光定量PCR仪技术及其在医学中的应用
刘向国 谢国明 (重庆医科大 重庆市 400016)摘 要 荧光定量PCR仪技术是一种新的核酸定量技术,该技木在PCR仪反应系统中引人了荧光标记探针,具有可实时监测,高灵敏性,高特异性和高精确性的特点,极大地克服了原有PCR仪技术的不足,扩大了PCR仪的应用范围。关键词 定量pcr;荧光;基因Flu
多重PCR技术原理
多重PCR技术具备单个反应体系检测多种靶标的能力,但是如果需要鉴别反应体系中的不同靶标基因,则需要针对不同的靶标,设计特异性的探针并标记荧光基团,不同的靶标标记不同的荧光基团。为了避免荧光基团之间的相互干扰,应合理选择不同光谱范围的荧光基团。荧光基团应与使用的荧光定量PCR仪器具有适配性,每个荧光通
多重PCR核酸检测
2020年3月11日,世卫组织总干事谭德赛在日内瓦召开的新闻发布会上宣布,新冠肺炎(COVID-19)疫情已经构成全球性大流行(pandemic)。截止到目前,中国的疫情在国内联防联控机制下已基本得到控制,而国外的情况却不容乐观。新冠肺炎疫情爆发于呼吸道疾病高发的季节,有各类呼吸道病原体单一感染或合
多重PCR在遗传病诊断方面的应用抗性基因检测
抗生素的广泛使用导致具有耐药性微生物的增多,比如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( methi-cillin resistant Staphylococcus aureus,MRSA)、万古霉素抗性肠球菌( vancomycin resistant enterococcl)和多重耐药结核分枝杆菌( mu
数字PCR在病毒临床检测中的应用
概述2015年刚成历史,2016年已在眼前。就这样,年复一年间沧海成桑田。生命科学领域,新方法层出不穷,老方法不断升级,好不热闹。也如孔子的感叹:逝者如斯夫,不舍昼夜。就拿PCR技术来说,荧光定量PCR作为一种进行基因表达分析的技术,截至目前最大的应用市场是病原微生物的核酸体外诊断。展望未来,作为q
荧光定量PCR仪技术及其在医学中的应用(一)
1 概述 荧光定量多聚酶链式反应是一种新的核酸定量技术。该技术将荧光能量传递技术(fluorescence resonance energy transfer,FRET)应用于常规多聚酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR仪中,从而进行定量检测。FRE
PCR技术在突变基因检测中的应用
基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其是PCR技术的出
质谱技术及其在临床检验中的应用
引言质谱(mass spectrometry,MS)技术是一种重要的检测分析技术,通过将待测样本转换成高速运动的离子,根据不同的离子拥有不同的质荷比(m/z)进行分离和检测目标离子或片段,然后依据保留时间和其丰度值进行定性和定量[ 1]。近年来,质谱技术发展迅速,通过改进离子源和分离器相
临床检验技术发展及其在耐药基因检测中的应用进展
刘晓燕 (公安县人民医院检验科,湖北公安434300)王 红 (湖北中医药大学医学检验与技术学院,湖北武汉430065)[关键词] 临床检验技术;耐药基因;分子生物学技术一份准确全面的医学检验报告是医生做出准确诊断与制定正确治疗方案必不可少的依据。因此,临床医学检验是一门极其重要的医学学科。笔者对临
多重PCR在遗传病诊断方面的应用DMD和BMD的检测
Duchenne型肌营养不良症( Duchenne muscular dystrophy,DMI)是一种很常见的人类遗传病,为X性染色体隐性遗传性肌肉变性疾病,50%的病例由基因缺失引起,大约每3500个男婴就有一个发病,1/3的病例由新的突变所致,肌营养不良基因长200kb,至少有70个外显子,被
多重PCR法检测STEC
产志贺毒素大肠杆菌(STEC)具有很强的致病性,全球范围内由其引发的食物中毒和其他公共卫生事件呈逐年升高之势,严重威胁人类的健康。开发快速可靠的检测手段对其引发的食源性疾病的监测、控制和预防意义重大。本文结合对STEC分子生物学特征的研究,着重介绍了多重PCR检测技术在检测食品中STEC方面的
荧光定量PCR技术及其应用(一)
荧光定量PCR(也称TaqMan PCR,以下简称FQ-PCR)是美国PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与变通PCR相比,FQ-PCR具有许多优点。本文拟就该技术的特点、原理和方法以及应用作一简
荧光定量PCR技术及其应用(一)
荧光定量PCR(也称TaqMan PCR,以下简称FQ-PCR)是美国PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与变通PCR相比,FQ-PCR具有许多优点。本文拟就该技术的特点、原理和方法以及应用作一简
超滤技术及其在体外循环中的应用(二)
4 超滤法在体外循环中的作用 4.1 超滤对体内水量和HCT的影响 Naik[1.3]研究发现MUF在排水方面要明显优于CUF,一般可以将Hct提高到40%.Hennein等[4]学者对38例先心病患者分组进行研究,对比观察CUF,对照组和使用V-VMUF 3组病例的排除体内水分的能力,
多重PCR技术的应用一个反应中检测多个病原体
本次新冠疫情防控工作中,多次强调了呼吸道病原体鉴别检测的重要性。近期,圣湘生物利用多重PCR技术开发的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、甲型流感病毒、乙型流感病毒多重核酸检测试剂盒(荧光PCR法)已获得欧盟认证机构颁发的CE认证证书。另外,还有六项呼吸道病原体核酸检测试剂盒以及七项呼吸
实时荧光PCR检测技术及其优势
众所周知,PCR(聚合酶链反应)技术自从1985年问世以来,经过十几年的发展,已成为实验室的常规技术。它是现代分子生物学研究中不可缺少的手段,是一种极为敏感的放大系统。相比于传统的临床诊断方法,核酸诊断是分子水平上的诊断技术,可以弥补传统临床诊断方法的某些缺陷,比如,核酸诊断能直接揭示病原体的存在,
多重PCR在遗传病诊断方面的应用用于遗传病的检测
用于其它遗传病的检测 Pici等人对囊性纤维化( cystic fibrosis,CF)基因突变进行了筛选研究,用4对外显子引物进行多重PCR扩增,然后用限制性内切酶消化PCR产物,再进行垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳,检查15例发现有3例发生了基因突变。Pior等设计了8对引物同时检测DMD/BMD
上转发光技术在食品病原微生物检测中的应用
近年来,由食源性致病微生物引发的疫情不断发生,食品安全已成为世界各国共同面临和关注的问题,由病原微生物引起的食源性疾病是影响食品安全最主要的因素之一。快速而准确地检测出被称为“头号杀手”的食品致病菌,是确保食品安全的首要任务,因此建立一种快速、准确、便捷的检测技术,对于从源头制止食源性致病菌污染,预
多重数字PCR技术介绍
什么是数字PCR?数字PCR是一种新的绝对定量PCR,通过对PCR反应物进行有限稀释,随后在不同的反应腔室里进行PCR扩增,最后根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例得出靶分子的起始拷贝数或浓度的技术。什么是多重PCR?多重PCR又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上两对以上