近期全基因组测序研究进展一览
【1】Cell:全基因组测序揭示出自闭症新的基因变异doi:10.1016/j.cell.2017.08.047自闭症有遗传的根源,但是大多数病例并不能够通过当前的遗传测试加以解释。如今,在自闭症儿童中发现的基因组模式---细胞内完整的一套遗传指令---揭示这种出这种疾病的一种新的遗传特征。这种特征有助解释那些不存在自闭症其他遗传标记的病例。相关研究结果于2017年9月28日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Genomic Patterns of De Novo Mutation in Simplex Autism”。这些结果提示着扫描患者的整个基因组可能有助人们更好地理解自闭症背后的基因异常。论文通信作者、美国华盛顿大学霍华德-休斯医学研究所研究员Evan Eichler说,如果能够得到重复的话,那么这些发现可能最终有助医生诊断这种疾病。全基因组测序技术是一种正在迅速变得更便宜和可用的技术,提供患者完整的遗传信息。Eich......阅读全文
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?
近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在
肿瘤免疫研究进展一览
本期为大家带来的肿瘤免疫治疗领域的相关研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。 1. 肿瘤免疫疗法或许会导致胸腺异常 根据在内分泌学会年会上发表的一项新的研究,接受免疫检查点抑制剂治疗癌症后会出现更加普遍的甲状腺功能异常症状。 癌症免疫疗法,尤其是免疫检查点抑制剂的治疗手段,已成为治疗某些类型癌
帕金森领域研究进展一览
本期为大家带来的是帕金森领域的相关研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。 1. neurology:眼部疾病常见于帕金森症患者 DOI: https://doi.org/10.1212/WNL.0000000000009214 根据最近发表的一项研究,患有帕金森氏病的人比健康人群更容易出现视力
2015-cifsq-Jorgen-Schlund下一代测序和全基因组测序
分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 cifsq)在京召开。会议由国际食品保护协会(iafp)主办,北京讯息展信息技术有限公司承办。新加坡南洋理工大学教授 Jorgen Schlundt 新加坡南洋理工大学教授Jorgen Sch
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?
近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。 全基因组测序(Whole-genome seque
Genome-Res:全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是一种常见的引发院内感染的致病菌,其也是资源不足医院感染的一大负担,此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时,针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚,近日,来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M
JAMA:全基因组测序用于临床仍存在技术挑
据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预
我国科学家率先完成枣全基因组测序
日前,河北农业大学教授刘孟军团队与深圳华大基因科技服务有限公司合作,在世界上率先完成枣树的高质量全基因组测序,使枣树成为世界鼠李科植物和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。《自然—通讯》10月29日在线发表了该成果。 刘孟军说,其团队自2010年启动枣基因组计划,从枣基因组大小
Science新闻:英国公布大型全基因组测序计划
基因分析技术在快速发展,昨日英国首相宣布了一项大型计划,将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA,而英国这一新项目的不同之处在于,其测序的是全基因组而非基因组个别区域。 英国首相David Cameron在声明中称,英国国民医
《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布
最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。 在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠
脑癌细胞系全基因组测序首次完成
其所揭示的新分子靶标将有助于开发出更具效力和更少毒性的药物 美国加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症研究中心的科学家在1月29日的《公共科学图书馆·遗传学》(PLoS Genetics)专刊上发表论文指出,他们首次完成了脑癌细胞系全基因组测序,这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。
全基因组测序可作为一线诊断工具
近日,一项涉及54个国家1000个家庭的研究表明,全基因组测序对未确诊疾病的诊断率比经典遗传诊断方法还高。科学家们呼吁将全基因组测序作为未确诊疾病的一线诊断工具,以给患者带来更好的医疗护理。相关结果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 sa
Illumina推出Nextera-DNA-Flex全基因组测序制备产品
近日,Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex,它让全血和唾液样本省去了样本制备,也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤,比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程,适合广泛的应用,
全基因组测序解决虎亚种纷争:6亚种体系
研究人员运用群体基因组学方法描绘了迄今为止最完整的虎演化史,解析了其自然选择和生态适应性的遗传基础,确认了现存虎应划分为孟加拉虎、马来虎等6亚种,由此解决了数十年以来关于虎亚种划分的争议,奠定了世界虎保护单元策略制定的科学基础。 虎的物种形成时间大约在2-3百万年前,群体基因组学分析将现代虎的
中国科学家PNAS发布辣椒全基因组测序
辣椒(Capsicum annuum)是一种重要的经济作物,它在满足人们口腹之欲的同时,还是世界上广为使用的药物。辣椒富含维生素和营养,可以用来生产许多药物、天然染色剂和化妆品。 为了更好的理解辣椒属的进化、驯化和特化,四川农业大学玉米研究所、遵义农科院辣椒研究所、华南农业大学园艺学院
世界首个梅花全基因组重测序研究完成
日前,北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心,与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱,“梅花花部性状的遗传结构”(The genetic architecture of
全基因组测序是癌症诊断的强有力工具
一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1 和 BRCA2突变检测)无法显示出有用的
首个中国地区古人全基因组数据被测序
近日,《当代生物学》发表了首次针对中国地区古人类的全基因组研究成果。该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所和德国马普进化人类研究所等团队合作完成,研究分析了距今4万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体基因组,发现东亚早期人群组成十分复杂。 虽然欧洲和西伯利亚地区都有古人类样本基因组被测序
谢晓亮:单细胞全基因组测序曙光初现
谢晓亮 12月21日出版的美国《科学》杂志发表了题为《单细胞全基因组测序探索精子重组规律和遗传缺陷》的论文。同时,该期《科学》杂志也将单细胞全基因测序列为2013年六大值得关注的科学领域之一。 该论文由美国科学院院士、哈佛大学教授谢晓亮课题组与北京大学生物动态光学成像中心(
基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓
8月29日,《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。 全基因组测序就能知道基因是否表达 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的
关于全基因组测序的研究结果分析介绍
① 全基因组测序的研究结果— NCI-H209细胞系基因组中,共检测到22,910个碱基替换、65个插入缺失(Indels)、58个结构变异;在基因组的编码区,除了发现RB1 和TP53基因发生点突变和MLL2基因由于发生了G>T的颠换,从而产生了pre-stop codon外,有94个点突变直
新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展
2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。 通过对从患者收集的
自闭症研究进展一览
本期为大家带来的是自闭症的研究进展汇总,希望读者朋友们能够喜欢。 1. Cell Res:科学家利用猴子模型取得自闭症研究新进展 自闭症是一种常见的神经发育紊乱疾病,主要症状为社交行为首先以及出现重复性的行为。目前全球范围对自闭症研究兴趣越来越高,而且随着大规模外显子测序技术的发展,一些新型
炎症反应相关研究进展一览
1. Sci Sig:炎症机制研究新突破 炎症反应是机体应对损伤或者感染时发生的免疫反应,然而这一过程如果失控之后将导致疾病的发生。最近,来自莫纳什生物医学研发研究所的研究者们发现了炎症反应过程中的关键生物学事件。该发现或许能够促进新的治疗炎症疾病的疗法的开发,例如动脉粥样硬化、中风以及II型
近期外泌体重要研究成果一览!
本文中,小编整理了近期科学家们在外泌体相关研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习! 图片来源:Nature 【1】Nature:一种特殊的“诱饵”外泌体机制或能保护宿主抵御细菌感染 doi:10.1038/s41586-020-2066-6 近日,一篇发表在国际杂志Nature上的研
近期基因测序研究领域新成果!
本文中,小编整理了多篇研究报道,共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Nature 【1】Nature:中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密 doi:10.1038/s41586-019-1500-0 近日,中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测
Nat-Commun:全基因组测序剖析肾癌形成的遗传结构
近日,来自麦基尔大学等处的研究人员通过研究揭示了肾癌发病的遗传结构,或为揭示马兜铃酸暴露和肾癌的发生率之间的关系提供一定的依据,相关研究刊登于国际杂志Nature Communications上。 文章中研究人员主要对一种名为透明细胞癌的肾癌进行研究,透明细胞癌占所有成人细胞癌的2.4%,每年
快速全基因组测序提升儿童罕见病早诊水平
罕见病通常被定义为发病率0.65‰至1‰的疾病,罕见病种类繁多,现已知约有7000多种罕见病。尽管罕见病发病率低,但由于我国人口基数巨大,我国罕见病患者总数预计超过千万人。7月17日,中国罕见病联盟指导、北京病痛挑战基金会主办的“2021第三届罕见病合作交流会”在北京举行,与会专家学者围绕“健
全基因组测序助力临床基因诊断发现更多阳性诊断
随着测序技术的快速发展和成本下降,二代测序在临床遗传病的诊断上已经变得越来越成熟,全外显子测序已成为遗传病诊断一线检测方案,然而仍然有一半以上的疑似病例得不到确诊,高深度全基因组测序(WGS)除了检测常规的点突变和微小插入缺失(Indel)外,可以同时检测结构变异(包括拷贝数变异、倒位、易位)、动态