上药所揭示KRAS突变肿瘤的分子分型和精准治疗新策略
8月9日，中国科学院上海药物研究所研究员谭敏佳和研究员黄敏团队合作，在Molecular Cell上在线发表了题为A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination therapies的研究论文。该研究揭示出KRAS突变肿瘤的分子分型和精准治疗新策略。 KRAS是人类恶性肿瘤中突变率最高的致癌基因之一，是肺癌、结直肠癌、胰腺癌等高死亡率肿瘤的重要癌驱动基因。KRAS突变肿瘤的治疗在肿瘤研究领域备受关注，然而，由于KRAS蛋白自身的难靶向性和下游信号通路的复杂代偿及反馈调节效应，针对KRAS突变肿瘤的精准治疗面临较大挑战。KRAS突变通过持续激活细胞内的大量磷酸化信号转导通路，促进肿瘤发生发展。在KRAS突变的基因背景下，全景描绘肿瘤的蛋白质组和磷酸化修饰信号通路，有望带来KRAS突变肿瘤的分子分型的......阅读全文
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
背景去除背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。> 如果背景不均匀，请使用 Rolling Ball。 类似指定半径的圆盘在泳道轮廓下“滚动”，对信号求平均，从而产生平滑小的变化。 半径越大，滚动越平滑。> 如果轮廓的末端与轮廓的其余部分没有
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法；磷酸化蛋白质被纯化，如果可能蛋白质要均一；磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物，其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列，定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法， 2D-PP 作图、 HPLC 或 l
磷酸化的和非磷酸化的抗体有什么不同
通常来说，磷酸化抗体芯片上检测某一个磷酸化位点会设置一对抗体，即：磷酸化的和非磷酸化的抗体。说到区别，可能从制备讲起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位点的保守性，对某一个磷酸化位点周边20个氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定带有磷酸基团，非磷酸化多肽就掉了这个磷酸基团。然后就是
中国科学家发现肾上腺皮质肿瘤致病基因
由上海瑞金医院、深圳华大基因等单位组成的科研团队，通过对57例肾上腺皮质肿瘤患者的肿瘤样本进行基因测序，发现了肾上腺瘤致病基因，为肾上腺皮质肿瘤及库欣综合征的诊断、治疗提供了新思路。研究成果于近日在《科学》杂志网站上在线发表。 库欣综合征主要是由于肾上腺皮质肿瘤引发的皮质醇过量分泌导致，包
Cancer－cell：制药巨头研发新分子全面狙击RAF突变肿瘤
一组来自美国的研究小组发现，在某些情况下，使用放疗方法治疗皮肤癌可能导致弊大于利。他们的论文发表在《Nature Immunology》杂志上，研究小组描述了一种以前未知的机制，在放射治疗时有助于免疫抑制。巴黎大学的Guido Kroemer 和 Laurence Zitvogel 在该杂志中对
研究揭示肾上腺库欣综合征的致病基因和机制
今天，记者从上海交大医学院获悉，该院附属瑞金医院内分泌科和上海市内分泌肿瘤重点实验室的科研团队，发现了一种基因热点突变与肾上腺皮质腺瘤发生密切相关，并且发现了两种基因突变与其他亚型的关联，为肾上腺皮质肿瘤及库欣综合征的诊断、治疗提供了新思路。相关研究成果4月3日在《科学》杂志在线发表。 肾
Dev－Cell丨同济王平组揭示肿瘤干细胞调控新机制
肿瘤干细胞是导致肿瘤产生耐药性、潜伏及转移的关键因素，因此靶向肿瘤干细胞是治疗癌症的有效策略。转录因子NANOG（源于 Tir Nan Og 凯尔特语，意即永恒青春之地【1,2】）对维持肿瘤细胞的干性至关重要，可作为多种癌症恶性程度和预后不良的标志。因此，阐明NANOG的表达调控机制有助于找到靶
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
2019年5月2日，Cell杂志报道了美国休斯敦贝勒医学院研究人员利用基因、转录、蛋白及翻译后修饰等多组学技术，对结肠癌/癌旁组织进行了系统、全面的分析，整合多组学结果为后续癌症治疗方案提供了新思路，同时也为生物标志物筛选、药物靶点、分子分型等研究工作奠定理论基础。实验背景结肠癌是世界上死亡率排名第
大连化物所首次揭示Rheb基因突变所驱动的分子机制
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术转化医学科学中心研究员刘扬带领的疾病基因组学研究团队在肿瘤转化医学领域取得新进展。该团队首次揭示了Rheb基因突变所驱动的肾癌和宫颈癌发生、发展的分子机制，并提供了可潜在用于治疗Rheb突变型肿瘤的新临床策略和方法。相关成果发表在Oncogene 杂志上
大化所在肿瘤转化医学领域取得新进展
近日，我所生物技术转化医学科学中心刘扬研究员带领的研究团队（疾病基因组学研究组，1832组）在肿瘤转化医学领域取得新进展。该团队首次揭示了Rheb基因突变所驱动的肾癌和宫颈癌发生、发展的分子机制，并提供了可潜在用于治疗Rheb突变型肿瘤的新临床策略和方法。相关成果发表在Nature子刊Oncog
大连化物所在肿瘤转化医学领域取得新进展
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术转化医学科学中心研究员刘扬带领的疾病基因组学研究团队在肿瘤转化医学领域取得新进展。该团队首次揭示了Rheb基因突变所驱动的肾癌和宫颈癌发生、发展的分子机制，并提供了可潜在用于治疗Rheb突变型肿瘤的新临床策略和方法。相关成果发表在Oncogene 杂志上
Nature：精准医疗需更精！转移癌突变多于原发肿瘤
8月2日在线发表在Nature上的一项新研究发现，平均来说转移癌的遗传突变比早期肿瘤要多。 这意味着：要使精准医疗成为癌症治疗中的一个现实，你需要一种实时、全面的方法，将转移性肿瘤和序列置于比大多数商业测试更详细的水平上。 美国密歇根大学综合癌症研究中心的研究人员对500例转移癌患者的DNA
新药安卓健为Kras突变恶性肿瘤推荐治疗方案
Kras突变的恶性肿瘤尚无公开的针对性治疗方案。作为Ras/Raf/MEK/ERK细胞信号传导通路上游基因，Ras(包括Kras、Nras、Hras)基因抑制剂的成功开发极大程度上促进了对Kras突变恶性肿瘤的治疗研究。 研究表明，所有真核细胞中均存在Ras/Raf/MEK/ERK这一细胞
或将改变肿瘤治疗临床路径的血液EGFR突变检测技术？
一、血液EGFR检测：临床肿瘤治疗新选择 在非小细胞肺癌（NSCLC）里，EGFR基因的突变频率非常高，尤其是亚裔非吸烟的女性患者，其突变比例可高达60-70%。NSCLC临床治疗实践中，明确EGFR基因状态对指导后续靶向用药治疗至关重要。 目前，EGFR基因突变NSCLC的临床治疗主要通过
嵌合RNA外泌体疫苗治疗突变非依赖肿瘤获揭示
在国家自然科学基金的资助下，暨南大学教授张灏团队联合荷兰格罗宁根大学和汕头大学等单位以嵌合RNA作为肿瘤新生抗原，研制出嵌合RNA外泌体疫苗，并开展了食管癌免疫治疗的实验研究。相关研究日前发表于Journal Extracellular Vesicles（JEV）。熊枭和柯秀荣博士为该论文第一作者。
揭示VAV1基因突变导致小鼠患上T细胞肿瘤
生命是成长和变化的精致编曲，通过相互制衡来微调复杂的内在和外在的相互作用。白细胞是有机体抵御疾病和入侵的免疫防御系统中不可或缺的一部分；不幸的是，这些机制可能会出错，导致功能失调的细胞数量不受控制地增加，从而形成肿瘤。如今，在一项新的研究中，来自日本筑波大学的研究人员在实验小鼠中揭示了一种名为VAV
Nature：精准医疗需更精！转移癌突变多于原发肿瘤
8月2日在线发表在Nature上的一项新研究发现，平均来说转移癌的遗传突变比早期肿瘤要多。 这意味着：要使精准医疗成为癌症治疗中的一个现实，你需要一种实时、全面的方法，将转移性肿瘤和序列置于比大多数商业测试更详细的水平上。 美国密歇根大学综合癌症研究中心的研究人员对500例转移癌患者的DNA
干细胞突变如何悄然出现－成为令人惧怕的恶性肿瘤
杜克大学癌症研究所的研究人员发现了干细胞突变如何悄然出现，并扩散到整个结肠区域，直到最终占主导地位并成为恶性肿瘤的过程。 他们通过在小鼠中使用创新性的建模系统，使干细胞发光，标记结肠癌的突变。然后在动物体内观察到在结肠癌中发现的突变，阐明了一种正在进行的“死亡竞赛”，其中一种或另一种突变优于其
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
《自然·代谢》：复旦大学附属肿瘤医院团队发现BCAT1突变促进肿瘤生长转移
要说癌细胞啥都抢，不过分吧。像亮氨酸、缬氨酸和异亮氨酸这样的支链氨基酸（BCAA）也在癌细胞的抢夺范围之列。此外，癌细胞还可以通过改变氨基酸的代谢来给自己生长和转移提供能量。 既往研究显示，BCAA代谢异常，如负责BCAA分解代谢的关键转氨酶1（BCAT1）表达增加可出现在多种癌症（胶质瘤、胃
Science：磷酸化，进化的另一条路径
EMBL-EBI和华盛顿大学的研究人员发现，蛋白质修饰变化为进化提供了显著的生物多样性。相关论文发表在十月十三日的Science杂志上，有助于更好的理解物种对环境的适应。 遗传多样性研究过去往往针对的是基因表达。而这项研究表明，蛋白磷酸化也对遗传多样性做出了重要的贡献。蛋白磷酸化属于翻译后修饰
蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路
原文： Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities 原文链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/
JCB：FAK帮助肿瘤细胞越狱
癌细胞都是越狱的高手，现在加州大学Moores癌症中心的科学家们揭示了它们的秘诀。研究显示，一种促进肿瘤生长的关键蛋白，可以帮助癌细胞突破组织的囚禁。文章发表在Journal of Cell Biology杂志上。 肿瘤细胞形成之后会受到周围组织的限制，只有进入血液或者淋巴管，才能转移
蛋白质磷酸化
Tyrosine Kinase Assay Using Synthetic Peptides (T. Miller)Small synthetic peptide substrates are especially well suited for applications such as assay
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤：胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质（见 24. 3.1 )；固相金属螯合亲和层析（IMAC) 富集磷酸肽（见 24. 3. 2 )；用串联质谱对磷酸
自磷酸化的定义
当配体-受体结合时，受体胞外结构域构象变化导致相邻的单跨膜受体二聚化，以利于受体间的交互磷酸化,即自磷酸化。同时可以提供磷酸集团，和作为蛋白质激酶磷酸化的底物
什么是去磷酸化？
去磷酸化:是磷酸基团的除去，对许多生物起着"开/关"作用。防止质粒载体的自身连接，最常用于质粒进行单酶切连接时。去磷酸化是由于DNA连接酶催化DNA连接时需要有磷酸基团的存在，载体在经酶切后会在切点端保留一个磷酸基团。载体去磷酸化后因自身5'端无磷酸基团，因而不可以和自身3'端连接。
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤：胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质（见 24. 3.1 )；固相金属螯合亲和层析（IMAC) 富集磷酸肽（见 24. 3. 2 )；用串
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶 试剂、试剂盒二硫苏糖醇 碘代乙酰
磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型
实验方法原理 实验材料 蛋白样品 实验步骤 了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型