原始数据管理体系（GSAFamily）研发取得进展
8月14日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）在Genomics，Proteomics & Bioinformatics上，在线发表研究论文The Genome Sequence Archive Family: Toward Explosive Data Growth and Diverse Data Types。GSA数据库体系接受全世界科研工作者的数据提交，汇交和管理各类型的数据，并对所有公开可用数据提供免费开放访问，支撑生命科学研究。 组学原始数据归档库（GSA）是生命组学原始测序数据管理的公益性数据库，旨在推动全球生命组学数据的共享与应用。近年来，随着组学数据的爆炸性增长和数据类型的多样化，以及人类遗传资源数据管理的特殊需求，CNCB-NGDC对GSA数据库进行了更新和扩展，形成了GSA数据库体系，包括GSA、GSA-Human和OMIX。 GSA数......阅读全文
GSA数据库获得国际出版社Springer－Nature认可
8月4日，国际著名出版社Springer Nature在其官网中将北京基因组所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）开发并运行的组学数据归档库，即GSA和GSA-Human，列为其推荐使用的数据存储和共享系统，Springer Nature旗下的3000多个期刊都将认可
原始数据管理体系（GSA－Family）研发取得进展
8月14日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）在Genomics，Proteomics & Bioinformatics上，在线发表研究论文The Genome Sequence Archive Family: Toward Explosi
生物信息中心组学原始数据归档库数据汇交量突破10PB！
9月28日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（CNCB-NGDC）组学原始数据归档库（Genome Sequence Archive，简称GSA）的用户汇交数据量突破10 PB（1 PB=1024 TB）。 为存好、管好、用好我国生命组学大数据，解决国内重要
国家基因组科学数据中心发布2019新型冠状病毒资源库
1月22日，国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织（WHO）、中国疾病预防控制中心（CDC）、美国国家生物技术信息中心（NCBI）、全球流感序列数据库（GISAID）等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时，对不
国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系
近日，国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建设
北京基因组所资源建设取得阶段性进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文，在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BIG
北京开建全球最大重疾数据样本资源库
记者12月5日从北京市科学技术委员会、北京市卫生局联合主办的“2010首都重大疾病防治科技创新高峰论坛”上了解到，北京已在全国率先启动“重大疾病临床数据和样本资源库”建设，预计到2012年，该资源库将成为拥有5万例临床数据、 40万例样本的全球最大的疾病临床数据和样本库。 据悉，患者临
北京基因组所生命与健康大数据研究获进展
与健康大数据研究成果，包括生命组学数据资源建设成果（D14-20）、实时定量PCR内参基因知识库——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化数据库Methbank升级版（D288-295）以及基因组序列变异库——GVM（Genome Variation M
首个DNA损伤修复测序数据资源库被开发
10月13日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心吴薇研究组与广州国家实验室完成的最新合作研究成果（DNA Damage Atlas: an atlas of DNA damage and repair）。该研究整合开发了首个D
缺乏数据使用指导原则，基因组数据共享遇阻
基因组数据共享将生物医学研究推向快车道，但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性，另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来，这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用
基因组数据分析的“金标准”
五月十八日，美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员，在《Nature M
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank－3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Rese
木荷种质资源库确定为国家林草种质资源库
日前，国家林业和草原局发布公告，中国林业科学研究院亚热带林业研究所（以下简称亚林所）支撑建设的浙江省龙泉林科院木荷种质资源库新增为国家级林木种质资源库。这是目前全国唯一的国家木荷种质资源库，意味着亚林所收集保存的木荷育种资源得到了国家认可。这批新增的国家林木种质资源库是国家围绕“绿化、彩化、珍贵化”
种质资源库应用价值
随着气候环境和社会环境的改变，越来越多的农作物、林木种质资源等需要被保护，以避免消失的厄运。虽然我国对种质资源的认识起步较晚，但是由于种质资源的价值非常高，因此种质资源的保护和挖掘利用也得到了足够的重视，不少地区更是建立了专业的种质资源库来进行保存和保护。下面就来简单介绍一下种质资源库的应用价值。种
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
北京基因组所数据资源建设取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式，整体发布我国生命组学数据资源建设情况，标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展，也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 生命与健康大数
为何大家愿意公开自己基因组数据？
2007年，在诺贝尔奖得主James Watson共同发现DNA结构的54年之后，他成为了第一个完成个人基因组测序的人，当时这花费了近100万美元。但随着近年来测序成本的下降，到了测序先驱Craig Venter这里，已经可以在一个小时内，花不到100美元的钱就能得到个人基因组序列了。 这一市
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台，是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
又一灭绝物种全基因组数据解析
日前，吉林大学考古学院蔡大伟教授团队与西北农林科技大学动物科技学院姜雨教授团队在马属动物古DNA研究领域取得重要进展。该研究在国际上首次成功获取已灭绝马属动物奥氏马的高质量全基因组数据，重建了马属动物的演化历史。 马科动物自古以来就与人们的关系密切,对人类社会文明的发展产生了重大影响。中国家马起源
中国开放最新家蚕基因组研究数据
“我们通过网络，以开放的姿态与世界共享家蚕基因组最新研究成果”，中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀26日介绍，包含有最新研究数据的中国家蚕遗传数据库目前已收到来自国内外科研人员的访问25万余次。 向仲怀介绍，中国家蚕遗传数据库由西南大学家蚕基因研究团队和深圳华大基因研究院合
2019新冠病毒资源库发布
1月22日，国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织（WHO）、中国疾病预防控制中心（CDC）、美国国家生物技术信息中心（NCBI）、全球流感序列数据库（GISAID）等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时，对不
我国学者建成全球最大乳酸菌种质库
近日，内蒙古农业大学教授张和平带领团队建成全球最大、种类最全的原创性乳酸菌种质资源库，分离保藏乳酸菌47000余株,相关成果在线发表于《科学通报》（英文版）。 在人类历史中，60%的食物都与乳酸菌发酵有关。乳酸菌是最重要的微生物战略资源之一，被称为乳品工业的“芯片”。 “20世纪90年代前，
整合中国组学资源，在国际舞台奏出“共享乐章”
2018年、2019年连续两年，组学数据库权威杂志《核酸研究》对前一年的全球基因组数据库建设进行总结，鲜见地在美英两个老牌的数据库以外，提到了中国的GSA（组学原始数据归档库）。 “美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Informati
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术，其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境，从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日，中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作，证实界面极化
人肠道菌株资源库建立
肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。微生物所供图 近日，中科院微生物所研究员刘双江团队构建了包含400个不同物种的健康人群肠道微生物菌株资源库（hGMB），相关成果发表于《微生物组》期刊。 越来越多的证据表明，肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。目前，仅有不足半数的肠道微生物物种，
种质资源库的设计原则
设计总原则: 安全性、可靠性、前瞻性和布局合理实用,符合环保要求,在保证安全性的前提下考虑先进性(Ellis et al., 1990; 陈叔平1995)。由于种质资源库的设计专业性非常强,因此,在工程设计过程中,必须始终贯彻上述设计思想与原则。1、 安全性植物种质资源是在不同生态条件下经过自然界长
15000年前“农民”全基因组数据出炉
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项遗传学报告中，德国科学家公布了生活在15000年前的安纳托利亚“农民”的首个全基因组数据。该研究结果有助于认识欧亚大陆的农业起源。图片来源于网络 农业在公元前10000年至9000年左右起源于亚洲西南部的新月沃土（Fertile Crescent），随后传
加拿大个人基因组计划公布首批数据
加拿大个人基因组计划（PGP-Canada）于2012年启动，欲建立一个在线的加拿大人基因组数据库，供全世界的研究人员使用。近日，该计划公布了首批测序数据。根据《加拿大环球邮报》（the Globe and Mail）的报道，研究人员发现了许多意想不到的结果。 这个计划测序了首批56名参与者的
基因组新数据或改写人类进化史
新的人类进化模型表明，人类起源于非洲大陆的多个祖先种群。5月17日发表在《自然》杂志上的一项新研究对主流理论提出了挑战，认为智人是从非洲多个不同的种群进化而来的，在经历了长期的基因混合后，最早可检测到的分裂发生在12万至13.5万年前。 在检测非洲当前种群的遗传物质，并将其与那里早期智人种群的现有