怎么鉴别引物二聚体和产物

这个不好说:一般引物二聚体小于150BP.条带模糊、条带宽、跑的比较快在溴酚蓝前面.你可以跑胶过程总观察一下。如果不是可能为非特异性扩增。您片段要是比较短建议您克隆后测序效果比较好.......阅读全文

PCR基因扩增2

(4)引物的熔点温度(Tm值)要适当。Tm值与引物的碱基组成和长度有关;PCR引物的GC/AT应与要扩增的模板DNA相当或略高些。一般熔点温度以大于55℃为宜。(5)引物的3,末端必须与模板严格互补,而5,末端的要求可灵活些。(6)目前在引物选择中已广泛应用计算机软件,从EMBL或Genebank中

PCR技术

 PCR常见问题总汇 PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模

PCR仪关于引物的问题及解决办法?

  1. 应该选择哪种纯化方法?  取决于实验目的和引物的长度  2. 为什么我订购了50nmol,但是收到却只有40nmol?  50nmol是起始量  3. 怎样制备100μM的储液?  体积(μl)=质检报告上的nmol数目×10  4. 怎样设计引物?  *一般长度20-30bp;  *至少

PCR引物设计的11条黄金法则

 PCR引物设计的11条黄金法则1.引物zui好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。 2.引物长度一般在15~30碱基

PCR引物设计,如何进行编辑

PCR引物设计的11条黄金法则1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引

PCR引物设计的11条黄金法则

PCR引物设计的11条黄金法则 1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。 2.引物长度一般在15~30碱基之

PCR引物设计的11条黄金法则

实验概要设计PCR引物。实验步骤1. 引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。 2. 引物长度一般在15~30碱

探针引物和探针有什么区别

如果你做的事荧光定量PCR,其引物和一般引物在构成上是没有什么区别的,只是要更加注意引物二聚体、PCR产物大小等问题。染料法不需要其他东西,探针法还需要taqman探针,这个探针的设计是比较有讲究的,并且上面有荧光集团和猝灭基团。具体设计,一般使用相关软件进行。

核酸扩增引物设计的要求

  1、避免重复碱基,尤其是G。  2、引物退火温度Tm控制在58~60℃。  3、G+C为30%~80%。  4、3'端最后5个碱基内不能有多于2个的G或C。  5、正向引物与探针离得越近越好,但不能重叠。  6、扩增产物长度不能太大,一般在80~250 bp,80~150bp最为合适。 

荧光探针的化学性质

  荧光定量PCR所使用的荧光化学制剂可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切

扩增曲线异常,请问原因

具体要看你做什么实验,模板和扩增的基因实怎样的。1、扩增曲线:一般来说如果你做双ΔCT法那么你的扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。比如同一种CDN

pcr引物设计的基本原则有哪些

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到3’

PCR无扩增产物的原因及处理办法

原因:    1、模板:含有抑制物,含量低    2、Buffer对样品不合适    3、引物设计不当或者发生降解    4、反应条件:退火温度太高,延伸时间太短对策:    1、纯化模板或者使用试剂盒提取模板DNA或加大模板的用量    2、更换Buffer或调整浓度    3、重新设计引物(避免

溶解曲线双峰可以用吗

如果不是很明显的话,是可以用的,但是很明显,就要重新设计实验一般的主峰前面出峰的话,是引物二聚体,而如果主峰后面出峰的话,一般的是非特异性的大片段的扩增。如果主峰相对强于次峰,可以通过改变引物浓度,退火温度和镁离子浓度来解决,但如果次峰强于主峰,就是说杂带的特异性高于目的条带,一般的只能换引物了。扩

qPCR常见问题及其分析解决方法

  常见问题  1. 无Ct值出现  检测荧光信号的步骤有误: 一般SG法采用72℃延伸时采集,Taqman法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。  引物或探针降解: 可通过PAGE电泳检测其完整性。  模板量不足: 对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起。  模板降解: 避免样品制备中杂

基因扩增PCR的扩增与克隆方法介绍

  ①引物的序列应位于基因组DNA的高度保守区,且与非扩增区无同源序列。这样可以减少引物与基因组的非特异性结合,提高反应的特异性  ②引物长度:15-40bp为宜。引物过短或过长均可使反应的特异性下降。  ③引物的碱基尽可能随机发布,避免出现数个嘌呤或嘧啶的连续排列,G+C碱基的含量在40%-75%

详述D二聚体临床应用价值

 D-二聚体     D-二聚体是纤维蛋白单体经活化因子XIII交联后,再经纤溶酶水解所产生的一种特异性降解产物,是一个特异性的纤溶过程标记物。D-二聚体来源于纤溶酶溶解的交联纤维蛋白凝块。英文缩写D-Dimer     D-二聚体的临床价值已经得到普遍的认同,它以其高度的敏感性,在深静脉血栓和肺栓

D二聚体,你了解它多少-?

    D-二聚体增高提示了与体内各种原因引起的血栓性疾病相关。同时也说明了纤溶活性的增强;     临床上常见于弥慢性血管内凝血(DIC)、深静脉血栓(DVT)、肺栓塞(PE)、急性心肌梗塞、脑梗塞、恶性肿瘤、卵巢癌、肺癌、败血症、肝病、妊高征孕妇、先兆子痫、烧伤、外科手术、创伤和脓毒血症等均可使

血浆D二聚体测定的简介

  血浆D-二聚体测定是对人体血浆中的血浆D-二聚体进行含量测定,被检血浆中加入标记D-二聚体单抗的胶乳颗粒悬液,根据被检血浆的稀释度可计算出血浆D-二聚体的含量。

D--二聚体检测及临床意义

D-二聚体是纤维蛋白单体经活化因子XIII交联后,再经纤溶酶水解所产生的一种特异性降解产物,是一个特异性的纤溶过程标记物。D-二聚体主要反映纤维蛋白溶解功能。     D-二聚体增高提示了与体内各种原因引起的血栓性疾病相关。同时也说明了纤溶活性的增强;     临床上常见于弥慢性血管内凝血(

D二聚体临床应用价值详述

  D-二聚体     D-二聚体是纤维蛋白单体经活化因子XIII交联后,再经纤溶酶水解所产生的一种特异性降解产物,是一个特异性的纤溶过程标记物。D-二聚体来源于纤溶酶溶解的交联纤维蛋白凝块。英文缩写D-Dimer     D-二聚体的临床价值已经得到普遍的认同,它以其高度的敏感性,在深静脉血栓和肺

D--二聚体检验的那些事儿(二)

    应用价值    自从1971年Wilson⑸等首先应用纤维蛋白降解产物用于诊断肺动脉栓塞(Pulmonary artery embolization PE)。D-二聚体的检测在诊断肺动脉栓塞方面发挥了巨大的作用,随着研究的开展和深入,临床工作者对D-二聚体在肺动脉栓塞中的意义认识日益

跑胶时二聚体为什么很亮

在我印象里我们实验室PCR没出现过这种情况,也没有人专门研究这种情况,文章估计就更没有了=.=我提一点我自己的看法吧.你们做过没做过对照试验?如果没有的话建议做两个对照试验:一是PCR体系里加模板和酶,不加引物;二是PCR体系里加引物和酶,不加模板.这两个和正常实验组一起P一起跑胶,然后对照着看一下

D--二聚体检测及临床意义

  D-二聚体是纤维蛋白单体经活化因子XIII交联后,再经纤溶酶水解所产生的一种特异性降解产物,是一个特异性的纤溶过程标记物。D-二聚体主要反映纤维蛋白溶解功能。     D-二聚体增高提示了与体内各种原因引起的血栓性疾病相关。同时也说明了纤溶活性的增强;     临床上常见于弥慢性血管内凝血(DI

你可知道DD二聚体?

D-D二聚体主要反映纤维蛋白溶解功能。D-D二聚体增高提示了与体内各种原因引起的血栓性疾病相关,同时也说明了纤溶活性的增强。临床上常见于弥慢性血管内凝血(DIC)、深静脉血栓(DVT)、肺栓塞(PE)、急性心肌梗塞、脑梗塞、恶性肿瘤、卵巢癌、肺癌、败血症、肝病、妊高征孕妇、先兆子痫、烧伤、外科手术、

D二聚体,你了解它多少-?

D-二聚体增高提示了与体内各种原因引起的血栓性疾病相关。同时也说明了纤溶活性的增强;     临床上常见于弥慢性血管内凝血(DIC)、深静脉血栓(DVT)、肺栓塞(PE)、急性心肌梗塞、脑梗塞、恶性肿瘤、卵巢癌、肺癌、败血症、肝病、妊高征孕妇、先兆子痫、烧伤、外科手术、创伤和脓毒血症等均可使

D--二聚体检验的那些事儿(一)

血浆D-二聚体(DD)是特异性交联纤维蛋白降解产物,正常人血中含量很低,遇血栓形成的疾病可导致DD 升高,近年来血浆DD 检测作为PE 诊断的过筛试验已得到业界认同,相关文献报道D-二聚体对急性肺血栓栓塞的阴性预测价值接近100%,也就是D-二聚体不高可以排除急性肺血栓。由于有检查方便与非创

寡聚体和二聚体的区别

低聚物又称寡聚物,旧称齐聚物。低聚反应产物。分子量在1500以下和分子长度不超过5纳米的聚合物。分子量和分子长度在上述范围以上的是高聚物。低聚物的性质与高聚物不同,能溶解、蒸馏、形成晶形或无定形物质。 低聚物的物理化学性能随分子量不同而变化,是一个不完全聚合的聚合物。如未交联固化前的环氧树脂、不饱和

核酸扩增引物设计的原则

  引物设计的必要条件是与引物互补的靶DNA序列必须是已知的,两引物之间的序列未必清楚,这两段已知序列一般为15~20个碱基,可以用DNA合成仪合成与其对应互补的两条引物。除此之外,引物设计一般遵循的原则包括: 一、引物长度根据统计学计算,长约17个碱基的寡核苷酸序列在人的基因组中可能出现的几率为1

pcr反应体系包括哪几个组分

PCR反应体系由寡核苷酸(引物)、4 种dNTP、Taq DNA聚合酶、靶序列DNA和PCR反应缓冲液体系组成。设计PCR引物时的一般原则:(1)引物长度一般15~ 30碱基,过短则特异性低; 过长则会引起引物间的退火而影响有效扩增。(2) 避免内部二级结构,避免序列内有较长的回文结构,使引物自身不