Science|乘风破浪!AI深耕蛋白复合体预测

蛋白质常常形成复合物进行运作,以协同完成生物机体的各项巩固走。虽然其中一些相互作用得到了很好的深入研究,但许多蛋白复合体工作机制仍然成谜。直到最近,构建相互作用组的一个主要障碍是许多蛋白质结构的不确定性,这是科学家半个世纪以来一直试图解决的问题。2020 年和 2021 年,一家名为 DeepMind 的公司和 Baker 博士的实验室分别独立发布了名为 AlphaFold(bioart报道:Nature 亮点丨精确预测蛋白结构可以依赖Google吗?DeepMind团队开发新型深度学习算法精确预测蛋白结构)和 RoseTTAFold的两项 AI 技术,它们使用不同的策略根据产生蛋白质的基因序列准确预测蛋白质结构。 来自德克萨斯州西南医学中心的Qian Cong博士和华盛顿大学David Baker博士领导了一个国际团队,他们使用人工智能 (AI) 和共进化来预测生物体内会直接相互作用的真核生物蛋白质,并且构建了这些蛋白复......阅读全文

Science-|-乘风破浪!AI深耕蛋白复合体预测

  蛋白质常常形成复合物进行运作,以协同完成生物机体的各项巩固走。虽然其中一些相互作用得到了很好的深入研究,但许多蛋白复合体工作机制仍然成谜。直到最近,构建相互作用组的一个主要障碍是许多蛋白质结构的不确定性,这是科学家半个世纪以来一直试图解决的问题。2020 年和 2021 年,一家名为 DeepM

Nature、Science齐发:两款新型AI精准预测蛋白结构

  去年,DeepMind公司开发的AlphaFold2人工智能系统,基于氨基酸序列,精确预测了蛋白质的3D结构。它的准确性与使用冷冻电子显微镜(CryoEM)、核磁共振或 X 射线晶体学等实验技术解析的3D结构相媲美。这一突破被誉为“变革生命科学和生物医学”的突破。  今日,DeepMind公司在

Science:谷歌AI新模型预测天气快又准

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512459.shtm编译 | 辛雨 图片来源:Carlos Munoz Yague 人工智能(AI)公司Google DeepMind开发的机器学习模型GraphCast,在“3至

预测蛋白质序列的新AI模型问世

使用CARBonAra进行序列预测(示意图)。图片来源:瑞士洛桑联邦理工学院科技日报北京8月8日电 (记者张佳欣)瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内

预测蛋白质序列的新AI模型问世

瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个

预测蛋白质序列的新AI模型问世

瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个

预测蛋白质序列的新AI模型问世

  瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。使用CARBonAra进行序列预测(示意图

Meta公司AI预测6亿蛋白质结构

ESM宏基因组图谱数据库包含6.17亿个蛋白质的结构预测。图片来源:ESM宏基因组图谱 谷歌旗下人工智能(AI)公司Deep Mind今年公布了2.2亿个蛋白质的预测结构,几乎涵盖了DNA数据库中已知生物的所有蛋白质。现在,另一个科技巨头正在填补蛋白质宇宙中的暗物质。 Meta公司(前

从预测进化-AI能“构想”新蛋白质结构

  半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种升级的阿尔法折叠系统,该系统由深度思维(

施一公等登Science封面:AI与冷冻电镜揭示「原子级」NPC结构

6月10日,《Science》杂志以封面专题形式发表了 5 篇论文,其中 3 篇论文共同揭开了人类核孔复合体的近原子分辨率冷冻电镜结构,另外两项研究通过非洲爪蟾呈现了脊椎动物核孔复合体的单颗粒冷冻电镜图像。这篇封面文章将多项研究成果拼接在一起,形成的人类 NPC 图像接近原子级。这一研究成果建立在多

DeepMind-AI模型预测天气又快又好

近日一项发表于《自然》的研究报道了谷歌DeepMind开发的首个天气预测人工智能(AI)模型——GenCast。该模型比目前运行中的最佳中期预报系统——欧洲中期天气预报中心的集合预报(ENS)更精准。GenCast在8分钟内就能完成15天的预测,而目前的预测程序需要几个小时。据介绍,包括ENS在内的

预测材料结构与特性可以预测,AI帮大忙

美国加州大学圣地亚哥分校工程学院的纳米工程师开发了一种人工智能(AI)算法,可几乎即时地预测任何材料(无论是现有材料还是新材料)的结构和动态特性。此项研究成果28日发表在《自然·计算科学》杂志上。 该算法被称为M3GNet,用于开发Matterverse.ai数据库,该数据库包含超过3100万种

Science:可预测的免疫应答

  Walter和Eliza Hall研究所的研究人员利用数学模型来预测免疫系统对于感染和疾病的反应强度,第一次明确了如何来控制免疫反应的大小。  这些发表在《科学》(Science)杂志上的研究发现,对于我们理解如何操控有害或有益的免疫反应来改善健康具有重要的意义。  研究小组利用数学和计算机模拟

Science:粪便预测宝宝未来疾病

  研究者们指出,通过分析纸尿布我们就能够得出宝宝是否会得哮喘的结论。这一说法背后的原因是宝宝排出的粪便中含有的微生物种类能够准确预测疾病的发生。这一研究结果不仅可以帮助宝宝尽快进行疾病的预测,还能够尽早地通过改善饮食来预防哮喘的发生。  来自约翰霍普金斯公共健康学院的的哮喘专家Marsha Wil

专家解读AI-for-Science专项工作

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497164.shtm “AI for Science有可能推动我们在下一轮科技革命中走在前沿。”谈及近期科技部、自然科学基金委联合启动人工智能驱动的科学研究(AI for Science)专项部署工作

90后斯坦福博士登Science封面!AI算法准确预测RNA三维结构

  半个世纪以来,确定RNA三维结构一直困惑着科学家,也成为生物学的重大挑战之一。而现在,90后斯坦福大学博士和团队通过新型AI算法——ARES准确预测出RNA三维结构,堪比AlphaFold,是生物界「海啸级」存在!我们对大部分RNA的结构几乎一无所知  半个世纪以来,确定生物分子的三维结构一直困

AI再添一成就--AlphaFold蛋白结构预测击败人类

  讲到人工智能(AI),可能在大多数人脑海里首先想到的是谷歌的AlphaGo。2017年围棋人机大战仿佛就在昨天,世界排名第一的天才围棋少年柯洁败北绝望痛哭“我赢不了”。人工智能让人类真真切切的感受到了自己的强大。  而在生命科学领域,AlphaGo的“孪生兄弟”AlphaFold也让世界为之颤抖

AI预测调查将改变整个行业

大模型能相当准确地"猜"出社会实验的结果,但它真的理解人类行为吗?一项发表于《自然》的研究给出了令人惊讶的答案,也附带一句严肃的警告:能预测,不等于能理解。 问题提出 是什么让人改变想法或行为?社会科学家花大量时间思考这个问题,而受控实验是最有力的回答方式之一。但在真人身上检验想法,既费时又费钱

Science:利用宏基因组数据预测之前未知的蛋白结构

  根据一项新的研究,从多种环境中收集的DNA序列数据有助研究人员构建出600多种蛋白家族的三维结构模型,而在此之前,它们的结构是未知的。这些宏基因组数据能够让人们在多种物种之间进行蛋白序列比较,从而允许利用统计学力量预测这些之前不可能预测的蛋白结构。相关研究结果发表在2017年1月20日那期Sci

Science:血液测试可预测孕妇早产

  在全世界,每年1500万婴儿早产。在此之前,医生们还没有一种可靠的方法来预测怀孕是否会过早结束,并且一直在努力准确预测所有怀孕类型的分娩日期,特别是在资源匮乏的情况下。图片来自Tom Mallinson/Wikipedia。  在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学、宾夕法尼亚大学、阿拉巴马大学和

Science:AI成功设计自然界中尚不存在的蛋白

7月21日,来自华盛顿大学等机构的科学家们在Science杂志上发布了一款新的人工智能(AI)软件,该软件能够为自然界中尚不存在的蛋白质绘制结构。更令人振奋的是,科学家们已经利用这一软件创造出潜在用于工业反应、癌症治疗、甚至用于预防呼吸道合胞病毒(RSV)感染的候选疫苗的原始化合物。计算生物学家Ju

AI时代新战绩:气象预测又快又准

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512353.shtm谷歌人工智能(AI)公司DeepMind开发出一种机器学习模型GraphCast,该模型在“3至10天的中期气象预测领域”展现出超越传统气象预测模型和其他AI方法的准确率和效率。相关

AI睡眠风险预测将改变整个行业

一项发表于《自然·通讯》(Nature Communications)的新研究显示,一种新型人工智能模型可利用常规睡眠检查中收集的信息,识别患者的长期健康风险。该模型由克利夫兰诊所与IBM的"发现加速器"(为期10年的联合研究伙伴)促成,团队含睡眠医师、AI研究员、数据科学家与神经科学家,从睡眠数

为何量子AI预测混沌系统引发关注?

伦敦大学学院(UCL)的研究团队近日发表了一项突破性研究:将量子计算与人工智能相结合,在预测复杂物理系统方面取得了显著进展。这种混合方法的准确率比传统AI模型高出约20%,且所需内存减少了数百倍,为气候科学、医学血流模拟和风力发电等领域带来了全新可能。 这项研究发表在《科学进展》(Scienc

AI新模型快速预测材料光学性质

未来的中央处理器(艺术图)。图片来源:美国趣味工程网站科技日报讯 (记者刘霞)据美国趣味工程网站近日报道,日本东北大学和美国麻省理工学院科学家,成功开发出一款新人工智能(AI)模型GNNOpt。该模型能以与量子模拟相同的精度预测材料的光学性质,但速度能快100万倍。研究团队表示,这一重要进展有望加速

AI脑龄预测取得重大进展

一种在睡眠期间检查脑活动的机器学习新方法,或有助于识别痴呆风险升高的人群。研究由加州大学旧金山分校(UCSF)与波士顿贝斯以色列女执事医疗中心科学家领衔,通过分析睡眠中脑电图(EEG)收集的电信号来估算一个人的“脑龄”,并发现当大脑显得比实际年龄更老时,痴呆风险上升。 估计脑龄每比实际年龄高出 1

AI预测疫苗反应将改变整个行业

AI预测疫苗反应将改变整个行业 疫苗为无数人挡住了重症,但不同的人接种后获得的免疫保护却差异显著。美国亚利桑那州立大学(ASU)领衔的一项新研究,为解释这种差异背后的原因提供了关键线索。研究规模可观:团队分析了来自逾4000人的血液样本,测量了其中能够识别185种抗原的抗体。这些免疫靶标既包括常见

预测蛋白质结构只是开始-AI或为生命科学领域带来巨变

  蛋白质结构预测是生物学的重要“圣杯”,也是人工智能落子生命科学领域最炙手可热的研究之一。  近日,我国自研深度学习蛋白质折叠预测平台TRFold传来好消息,其基于2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛(CASP14)蛋白质测试集的成绩仅次于“阿尔法折叠的迭代版”(AlphaFold2),排名全

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  蛋白质结构预测是生物学的重要“圣杯”,也是人工智能落子生命科学领域最炙手可热的研究之一。  近日,我国自研深度学习蛋白质折叠预测平台TRFold传来好消息,其基于2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛(CASP14)蛋白质测试集的成绩仅次于“阿尔法折叠的迭代版”(AlphaFold2),排名全

蛋白复合体直接酶消化法

Direct Enzymatic Digestion of Protein ComplexesSherry Niessen, Ian McLeod and John R. Yates IIIDepartment of Cell Biology, The Scripps Research Instit