南京大学PNAS文章：基因转换事件
来自来自南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，英国巴斯大学等处的研究人员指出了减数分裂过程中的一个重要进化进程：拟南芥重组事件中大部分都属于基因转换事件，这将有助于解析拟南芥着丝点附近具有较高的遗传多样性的遗传模式。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者分别是南京大学的田大成教授，陈建群教授，以及巴斯大学的Laurence D. Hurstc，其中田大成教授和陈建群教授研究方向主要为植物分子进化与分子生态学，植物抗病基因的多样性，植物基因组学，分子进化遗传学等。 田大成教授和陈建群教授2008年曾在Nature杂志上发表文章，在真核生物中发现插入/缺失(Indel)两侧的碱基点突变出现的频率，较其他区域要高的多，从而提出了一种新遗传突变机制：Indel诱变假说，从源头上回答了“遗传变异究竟是如何形成的”这一生命科学面临的基本问题。 这一观点挑战了传统的进化论观......阅读全文
拟南芥基因组DNA的提取
实验概要本实验介绍了用CTAB法提取拟南芥基因组DNA。主要试剂CTAB提取液(2%CTAB，50mMEDTA，50mM Tris-HCl，PH 8.0，0.84M NaCI，0.05%巯基乙醇)，氯仿，无水酒精，70%的酒精主要设备1.5 mL离心管，65℃水浴锅，高速离心机，研钵实验材料拟南芥叶
拟南芥基因研究显示：环境对遗传多样性影响巨大
一项针对多种拟南芥的基因研究表明，环境因素对物种遗传多样性和基因组的影响比之前人们预期的更大。相关论文发表在7月20日的《科学》杂志上。 除了实验室中科学家的“最爱”，世界各地还分布着多种野生拟南芥。它们的生长速度、叶子颜色以及发枝方式都是不同的。在最新的研究中，由德国马普发育生物学研究所（Max
南京大学PNAS文章：基因转换事件
来自来自南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室，英国巴斯大学等处的研究人员指出了减数分裂过程中的一个重要进化进程：拟南芥重组事件中大部分都属于基因转换事件，这将有助于解析拟南芥着丝点附近具有较高的遗传多样性的遗传模式。相关成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的
拟南芥转化
实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培
研究揭示模式植物适应高海拔环境机制
青藏高原具有低温、强风和强辐射等极端环境特点，是全球生物多样性的热点地区。模式植物拟南芥在全球广泛分布。西藏地区自然分布的拟南芥为探讨植物如何适应极端环境提供了理想材料。中国科学院植物研究所研究员郭亚龙与徐永超团队，联合北京大学教授顾红雅，聚焦青藏高原海拔约4000米的拟南芥自然群体材料，将其与海拔
拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制
2021年6月16日，清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates
北大生命科学学院发表了拟南芥有性生殖的分子调控机制
北京大学生命科学学院,马萨诸塞大学安姆斯特分校的研究人员发表了题为“Arabidopsis pollen tube integrity and sperm release are regulated by RALF-mediated signaling”的文章，首次找到了拟南芥有性生殖过程中参与
Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
碳离子束辐射对拟南芥基因组诱变效应研究获进展
重离子辐射诱变育种是植物品种改良的重要手段，辐射诱变效应及分子机制的研究是涉及多学科交叉的重要共性课题。目前，对重离子辐射诱变效应的研究集中在表型、染色体畸变、遗传物质多态性及特定基因序列分析等方面，而分子水平的突变特征研究仍相对薄弱，欠缺全基因组水平大视角、多方位及大样本量数据支持。 中国科
拟南芥的转化
实验概要本实验采用花浸泡法利用农杆菌介导将目的基因转入拟南芥。主要试剂YEB液体培养基，LB培养基，0.1 M CaCl2，0.05 M MgSO4，花浸泡缓冲液(0.5XMS，5%蔗糖，0. 03%Silwet L-77 )，Rif，Kan主要设备摇床，离心机，培养钵，温室，托盘，塑料薄膜实验材料
拟南芥的培养
实验概要本实验方法就拟南芥的培养技术进行了简单介绍。主要试剂1. PNS营养液:每升含2.5m1 1M磷酸缓冲液(pH5.5)5ml 1M KN03，2m1 1M MgSO4.7H20，2m1 1M Ca(N03)a.4H20，2.5m1 20mM Fe.EDTA，1 ml MS微量兀素。2. 人
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬，河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布，向全国征集曹姓男性DNA样本，拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子，基因组科学成为热门，这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上，伴随着2
研究揭示拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
花开有时的基因奥秘
植物开花时间各不相同，到底是什么“神奇的力量”在调控开花时间？科学家们一直在探寻这个“奥秘”。 近日，安徽农业大学生命科学学院植物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室教授李培金课题组在《自然—通讯》在线发表最新研究论文，揭示了拟南芥花期自然变异的调控新机制。 开花时间的多样性 开花时间是
Cell：全基因组测序揭示人类遗传多样性
遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构及基因表达调控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
我国专家首绘蝎子基因组图谱－揭开多样性面纱
由武汉大学领衔，与上海生物信息技术研究中心合作，近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序，预测了32016个蛋白质编码基因，在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示，马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
质体基因组多样性演化，提供土壤碳动态新视角
近日，中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象，依托野外长期氮添加控制实验平台，结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来，化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持
中科院植物所植物适应性进化研究取得新进展
中科院植物研究所郭亚龙研究组在研究中首次提供了在全基因组水平上开展植物平衡选择研究的案例。图片来源于网络 适应性是生物在变化多样的环境中生存所需的最基本能力，其中一个核心因素是遗传多样性的高低，丰富的遗传多样性是保证物种在变化多端的生态环境中生存繁衍的根本。中科院植物研究所郭亚龙研究组在研究中
遗传发育所揭示植物萜类物质多样性分子机制
萜类化合物是植物中广泛存在的种类最多的一种次生代谢产物，目前在自然界中共发现了7万余种萜类物质（包括多种植物激素），在植物生长发育、植物与生长环境相互作用、抗病虫等过程中起着重要的作用。但目前人们对植物萜类物质多样性分子机制的认识还十分有限。 中国科学院遗传与发育生物学研究所王国栋研究组在前期
农杆菌介导转化拟南芥
实验概要1. 学习真核生物的转基因技术及农杆菌介导的转化原理。2. 掌握农杆菌介导转化拟南芥 的实验方法，了解拟南芥的生理特点及在基因工程实验中应用实验原理拟南芥（Arabidopsis thaliana）是一种十字花科植物，二年生草本，高7～40厘米，花期3～5月。广泛用于植物遗传学、发育生物学和
后基因组时代生命科学发展的里程碑
——评“首个人造生命”的诞生 日前，国内各大媒体均以《世界首个人造生命在美诞生》为题，报道美国生物学家克雷格·文特尔（J. Craig Venter）在实验室中重塑“丝状支原体丝状亚种”的DNA，并将其植入去除了遗传物质的山羊支原体体内，创造出历史上首个“人造单细胞生物”。这一成果被报道后，引起了
拟南芥培养箱怎么培养拟南芥培呢？这套方法为你解惑
拟南芥作为高等植物的模式生物被全世界的植物生物学实验室广泛研究。拟南芥培养箱可用于基因表达、器官发育、基因突变等研究。然而，怎么培养好这种小植物可能不是那么容易。 拟南芥培养箱培养拟南芥步骤： 1、首先把拟南芥种子放到滤纸上，用70%酒精进行消毒处理，再用无水酒精进行处理（也可
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
Nature：科学家完成云杉超大基因组草图
在超过两亿年的历史中，极具生态重要性的松柏类植物在森林中占据着统治地位。 现在，瑞典斯德哥尔摩大学生命科学实验室(Science for Life Laboratory)和于默奥植物科学中心(Umeå Plant Science Centre)的科学家完成了对挪威云杉(Picea
Science：表观遗传学的“神秘花园”
许多研究者都在探寻各种复杂性状背后的遗传学基础。然而，大家往往忽视了天然表观遗传学变化为表型带来的多样性。表观遗传学突变发生在DNA序列之外，将其与DNA序列突变区分开是一项富有挑战性的工作。 在本期Science杂志上Cortijo等人向人们展示，表观等位基因( epialleles
拟南芥转基因植株的鉴定
实验概要本实验介绍了拟南芥转基因植株的初步鉴定方法，包括：阳性苗的筛选，GUS基因表达分析，组织PCR和RT-PCR分析。主要试剂0.2%的Triton X-100，10%的次氯酸钠，含20 mg/L Hygromycin的MS培养基，X-Gluc，75%乙醇，0.25 N NaOH，0.25