高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育
circFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度保守环状RNA-circFgfr2调控骨骼肌生长发育的新机制。相关研究成果在线发表在《恶病质、肌少症与肌肉杂志》。 骨骼肌是哺乳动物体内最丰富的组织。在畜牧业生产中,骨骼肌的生长发育直接决定畜禽肉的产量和品质,是动物遗传育种领域最重要的研究课题之一。骨骼肌生长发育是一个高度复杂且精准调控的生物学过程,受成千上万的编码基因和表观因子的调节。环状RNA是一类新近发现、具有环形结构的特殊RNA分子。研究表明,环状RNA在许多生命活动中起重要作用,但其对骨骼肌生长发育的作用机制仍不清楚,在动物育种中......阅读全文
高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育
ircFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度保守环状RNA-circFgfr2调控骨骼肌生长发育的新机制。相关研究成果在线发表在《恶病质、肌少症与肌肉
高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育
circFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度
高度保守的环状RNA如何调控骨骼肌生长发育
circFgfr2调控骨骼肌生长发育和再生的分子机制。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队系统绘制了猪骨骼肌生长发育环状RNA图谱,并揭示了物种间高度
非编码RNA调控骨骼肌发育研究取得进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508336.shtm骨骼肌约占成年动物体重的45%~60%,是维持动物运动和代谢功能的重要组织。经济动物骨骼肌纤维的数量和质量直接影响了产肉能力和肉品质,决定了动物的经济价值。动物肌纤维数量在胚胎期基本固
高度保守的两个基因,如何做qPCR
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引 物终浓度为100-40
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)
4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr
云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(一)
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大
调控鸡骨骼肌发育研究获进展
鸡骨骼肌的生长速度直接决定肉鸡产业的发展,随着鸡肉产量的持续提升,鸡肉已成为我国第二大的肉类消费品,但我国地方鸡品种在市场中处于弱势地位,仍需要大力培育具有自主知识产权的高产肉鸡。传统育种方法培育速度缓慢,亟需通过分子标记辅助育种加快育种进程,因此挖掘调控鸡骨骼肌发育的关键调控因子是分子标记辅
环状-RNA-测序案例分析
案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣? 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前
环状RNA研究方法(一)
至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务,涵盖了50+疾病,20+物种,帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段,rip&RNA pull down技术,帮助客户冲刺高分机制文章。
环状RNA研究方法(二)
在此基础上,哪些环状RNA分子发生了差异表达?在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准,一共发现42个环状发生上调,47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章,差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
最新揭秘!植物如何调控生长发育、适应环境变化?
植物如何调控生长发育、适应环境变化?因其被《科学》杂志列入125个人类未知的重大科学问题之中,而备受学界关注并持续开展研究。 中国科学院遗传与发育生物学研究所(遗传发育所)青年研究员王冰团队等通过合作研究,最新发现植物激素独脚金内酯信号感知机制及其在氮素响应中的关键作用,阐明植物如何通过调控独
环状RNA研究深度剖析(一)
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两
环状RNA研究深度剖析(二)
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR:挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验,检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。(AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白) b RNA pull down:对上述circRNA进行RNA pull down实验,拉
环状RNA研究文章汇总(一)
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20
环状RNA研究文章汇总(二)
4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究(影响因子:3.0)胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%,电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的
研究揭示猪骨骼肌发育的关键因子
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所、佛山鲲鹏现代农业研究院研究员唐中林团队在《先进科学》(Advanced Science)上发表研究论文。该研究鉴定了骨骼肌发育的关键RNA结合蛋白RPS27L,并揭示了其通过液液相分离(LLPS)调控骨骼肌生长发育的分子机制。这一发现不仅为畜禽产肉性状的遗传
环状RNA,飞速发展的新前沿
生物学家们几十年前就知道存在一种不寻常的分子,环状RNA(circRNA)。与线性RNA相比,circRNA受到的关注比较少,也比较难于研究。举例来说,circRNA很难与其它RNA区分开,扩增或片段化会破坏RNA环,而且早期RNA测序的分析算法会过滤掉circRNA的标志性序列。因为技术和方法
新型RNA修饰m1A与m7G的物种保守性和动态调控条件
表观转录组学”是通过转录后修饰影响RNA的结构和功能,是近几年来生物学科里最热门的研究领域之一,目前已知的RNA修饰类型超过150种,其中包括m6A、m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化等。近期小编发现在探究RNA修饰领域中,各位m6A研究领域的鼻祖们又有了新的动作。
我国学者在环状RNA调控血管重塑保护研究领域取得新进展
在国家自然科学基金项目(批准号:81670376)等资助下,中国医学科学院阜外医院胡盛寿、宋江平团队在心脏移植急性排斥反应发生机制和免疫耐受诱导方面取得新进展,相关工作以“单细胞转录组学测序揭示HIF1A可抑制心脏移植急性排斥反应(Single-cell transcriptomic identif
环状RNA高分文章怎么发?
文章导读环状RNA作为最新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为癌症新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界第
研究揭示脑皮层细胞类型在鲸与人之间高度保守
从距今约5550万年前的陆地到如今海洋生境的转变对于鲸类而言无疑重塑了大脑,鲸类大脑集早期哺乳动物的保守特征与独有衍生特征于一身。鲸脑内各个细胞类型高效协同工作以维持其独特的认知、运动、听觉及视觉感知等过程。细胞水平的转录组学可以系统地表征脑内细胞的多样性,实现神经科学研究范式由重视细胞解剖向细胞类
青岛能源所在植物miRNA合成调控领域取得进展
在不同的生长发育阶段和受到外界生物、非生物胁迫时,生物体需要精细地调控基因的表达水平。近年来,microRNA (miRNA)在基因精细调控中的作用越来越被重视。miRNA在真核生物中普遍存在,是21-24个核苷酸的非编码小RNA分子, 通过负调控mRNA靶基因的转录后表达水平影响动植物的生长发
SMA1基因调控miRNA合成--改善产量品质和环境适应性
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所李胜军研究组与中科院遗传发育所李云海研究组、内布拉斯加大学于彬实验室合作,利用生物化学、分子生物学和遗传学的手段,鉴定了SMA1调控miRNA合成的重要功能。 该研究首次揭示了SMA1基因调控miRNA合成的新功能,也将为利用生物技术的手段改善农
环状RNA研究的方法及功能作用(一)
环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的研究思路,认识圆圈重塑
环状RNA研究的方法及功能作用(二)
RNA是怎样变成环状的呢?a. 在可变剪切过程中,外显子迁移,剪切形成套索结构,拉近剪切位点,促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对,拉近剪切位点,使其相互攻击,促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能,敲降看看据文献报道,环状RNA可以被小干扰R
Nat-Rev-Genetics-|-环状RNA的合成与功能
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具