科学家揭示肝内胆管癌多组学分子特征全景图谱
近日,复旦大学(附属中山医院)肝癌研究所樊嘉院士团队与中科院上海药物所研究员周虎、中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员高大明等团队合作,全面解析了肝内胆管癌的分子特征全景,为肝内胆管癌的临床诊治提供了新思路和新策略。相关研究已在线发表于《癌细胞》。 肝内胆管癌恶性程度高,早期诊断难,手术切除率低,易转移并累及周边脏器,同时缺乏有效的靶向和免疫治疗,预后极差,术后5年生存率仅20%~30%。因此,急需深入阐明肝内胆管癌的发病机制,绘制更精确的基因及分子图谱,为鉴定新的诊治靶点并实现个体化治疗提供理论依据。 研究人员用262例在中山医院肝外科手术中切除的样本,综合基因组、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组和微生物组等多组学、多维度数据,首次系统性绘制了肝内胆管癌的多维分子图谱,为肝内胆管癌的发生发展机制、精准分子分型、预后判断和个性化治疗策略提供了新思路。 在该研究中,研究人员建立了以蛋白质组为核心肝内胆管癌患者的分子分型:......阅读全文
科学家揭示肝内胆管癌多组学分子特征全景图谱
近日,复旦大学(附属中山医院)肝癌研究所樊嘉院士团队与中科院上海药物所研究员周虎、中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员高大明等团队合作,全面解析了肝内胆管癌的分子特征全景,为肝内胆管癌的临床诊治提供了新思路和新策略。相关研究已在线发表于《癌细胞》。 肝内胆管癌恶性程度高,早期诊断难,手术切除率
Cancer-Cell:樊嘉/周虎绘制肝内胆管癌多组学分子特征全景
肝内胆管癌(iCCA)是第二常见的原发性肝恶性肿瘤,当前手术切除率低,同时缺乏有效的靶向/免疫治疗方案。肝内胆管癌具有高度异质性的基因组突变和肿瘤微环境,可能介导其高侵袭性和不良预后。因此,迫切需要对iCCA进行“鸟瞰式”研究,绘制其精确的分子图谱,为系统理解肝内胆管癌异质性及实现个体化治疗提供
中国科学家揭示肝癌分子特征全景和个性化诊治新策略
复旦大学(中山医院)肝癌研究所樊嘉院士等团队借助大规模的蛋白质基因组平台,以高质量的蛋白质组学技术为基础,充分结合基因组和转录组学研究,首次实现了对乙肝相关肝癌的多组学、多层次、多维度的系统性分析,为更深入地探索肝癌发生发展机制及指导肝癌的个体化精准诊疗带来了新希望。相关研究成果10月3日在线发
“沉默肿瘤”首张全景分子图谱绘成
7日,记者从复旦大学附属肿瘤医院获悉,该院院长虞先濬教授联合北京大学肿瘤医院、中国科学院上海药物研究所、上海长海医院等单位的研究团队,历时5年成功绘制全球首张无功能性胰腺神经内分泌瘤多组学全景图谱,并根据图谱突破性提出这种“沉默肿瘤”的分子分型框架、预后模型和靶向—免疫治疗新策略,为临床精准诊疗
中国科学家绘制全球最“毒”乳腺癌多组学图谱
3月8日,国际妇女节。 当天凌晨,国际肿瘤学顶尖期刊《癌细胞》发表了中国科学家完成的一项重要研究成果。 由复旦大学附属肿瘤医院大外科主任兼乳腺外科主任、复旦大学肿瘤研究所所长邵志敏教授领衔的,包括复旦大学附属肿瘤医院精准肿瘤中心执行主任、上海科学院国家人类基因组南方研究中心黄薇研究员团队、复
研究揭示甲状腺乳头状癌复发相关多组学分子特征
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员朴海龙等与复旦大学附属肿瘤医院上海癌症中心嵇庆海教授、史荣亮教授团队合作,整合利用蛋白质基因组学和代谢组学技术,运用生物信息学及机器学习方法,从基因突变、转录表达、代谢物水平、蛋白质及磷酸化蛋白质表达情况多个尺度,对具有不同复发风险的甲状腺乳头状癌样本进行深入
科学家揭示不同肿瘤类型的免疫特征图谱
肿瘤由于其组织来源、驱动突变和周围组织特性的不同而表现出显著的异质性。不同的肿瘤之间可能会享有共同的免疫原型,事实上,在特定肿瘤类型中已经鉴定到不同的免疫细胞亚群和免疫治疗响应性之间强大的原型关系。然而,如何从不同的肿瘤中去找到主要的免疫原型仍不清晰。 近日,发表在《Cell》上的一项题为“D
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
复旦邵志敏等发《自然.遗传》:乳腺癌多组学全景图谱-实现分型精准诊疗
中新网上海10月8日电 (记者 陈静)在乳腺癌患者中,临床上近七成初诊患者和超过半数的复发转移患者罹患的是腔面型乳腺癌。记者8日获悉,中国的学者们历时5年攻关,率先绘制“腔面型乳腺癌多组学全景图谱”,并提出“复旦腔面四分型”基础上的精准治疗策略。这将改变以往腔面型乳腺癌治疗“一把尺子衡量一群人”的治
我所揭示甲状腺乳头状癌复发相关多组学分子特征
近日,我所本草物质科学研究室(2800组群)朴海龙研究员等与复旦大学附属肿瘤医院上海癌症中心嵇庆海教授、史荣亮教授团队合作,整合利用蛋白质基因组学和代谢组学技术,运用生物信息学及机器学习方法,从基因突变、转录表达、代谢物水平、蛋白质及磷酸化蛋白质表达情况多个尺度,对具有不同复发风险的甲状腺乳头状癌样
Nature-genetics揭示胆管癌的分子秘密
由来自新加坡国立癌症中心、杜克-新加坡国立大学医学研究生院等机构的科学家们组成的一个研究小组,在对胆管癌分子基础的了解上取得了重大的突破性进展。研究人员采用先进的DNA测序技术绘制出了胆管癌中遭受破坏的人类基因完整目录。该研究小组的研究发现有可能促成胆管癌新疗法,并阐明癌症研究中的一些最古老的问
复旦大学樊嘉、孙云帆等团队揭秘转移性肝癌:多组学研究揭示关键分子特征
一支来自中国的团队采用多组学方法,分析了随时间变化的转移性肝细胞癌(HCC)肿瘤内部和跨越肿瘤的分子特征,发现了早期转移性扩散的多样性肿瘤克隆。复旦大学肝癌研究所的肝脏外科研究员孙云帆在一封电子邮件中解释说:“传统上将HCC转移视为疾病的终点。然而,我们的数据显示原发性HCC和转移瘤之间存在高度的遗
时空组学技术助力生物学和医学发展
一直以来,科学家们努力解读由30亿碱基对组成的生命“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破,人们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到身体每个细胞的全景特征,为理解基因组“天书”以及生物学和医学研究带来新机遇。 8月22日,《细胞》刊发了华大生命科学研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组
时空组学技术助力生物学和医学发展
一直以来,科学家们努力解读由30亿碱基对组成的生命“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破,人们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到身体每个细胞的全景特征,为理解基因组“天书”以及生物学和医学研究带来新机遇。8月22日,《细胞》刊发了华大生命科学研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组学技术如
多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘
苦荞 董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子
Cell:中国团队发布首个肺腺癌分子全景图谱助力精准医学
肺癌是发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。非小细胞肺癌约占所有肺癌的80%,其中肺腺癌(Lung Adenocarcinoma, LUAD)是非小细胞肺癌中最普遍的分型,大约占所有恶性肺肿瘤的一半。已有研究发现,LUAD中最常见的体细胞突变是TP53、KRAS、KEAP1
肝星状细胞的生物学特征
正常情况下肝星状细胞处于静止状态。当肝脏受到炎症或机械刺激等损伤时,肝星状细胞被激活,其表型由静止型转变 为激活型。肝星状细胞位于肝窦周Disse 腔内,约占肝脏所有细胞的13%。在规HE染色的肝组织切片中,不能显示星状细胞,但可用免疫组织化学将其定位,并可将其分离进行体外细胞培养。正常情况下肝
Cell重磅!揭秘肝癌多维蛋白组学最新成果
2019年10月3日,国际顶尖期刊《cell》(SCI影响因子 36.216)在线发表了复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队、中科院药物所周虎研究员团队、中科院生化与细胞所高大明研究员团队、美国“登月计划”临床蛋白质组肿瘤分析协作组(Clinical Proteomic Tumor Analysis
杭州华大与南科大新突破:3D“生命剧本”解码果蝇发育全程
动物发育是基因与细胞在时空维度上精密协作的复杂过程。以果蝇为例,其发育的过程,大体需要经过卵、幼虫、蛹和成虫4个阶段。如果说这个成长过程,是一场精密编排的“生命舞台剧”,那么每个细胞何时何地“登场”、如何变成特定的细胞类型,便都是由基因“剧本”调控的。但一直以来,科学家很难完全读懂发育时空动态背后的
科学家开发出新型空间多组学技术
5月25日,中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组在《自然-方法》(Nature methods)上,发表了题为Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou
Cell:科学家绘制出神经元细胞表面所有蛋白全景图谱
近日,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中,来自霍华德-休斯医学研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法来重点研究特殊细胞表面覆盖的蛋白质,相关研究结果或能帮助阐明机体发育过程中脑细胞如何形成精细化的网络。这就好比是撒了一张小网,如今研究者就能利用这种新技术将果蝇大脑中神经元表面的所有
科学家合作构建再生生物学多组学数据库
随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再
Cancer-Biol-Med:清华团队运用多组学+AI,揭秘胃癌演进,开启个性化治疗新时代
胃癌,作为全球第五大常见癌症,仍是对抗病魔前线的重大挑战,夺走了无数生命。炎症引发的肿瘤生长是胃癌演进的关键步骤,深入了解这一过程背后的生物机制,对于揭开胃癌之谜至关重要。 近日,一篇发表在国际杂志Cancer Biology & Medicine上题为“Deciphering gastric
分子遗传学词汇基因内抑制
中文名称:基因内抑制英文名称:intragenic suppression定 义:同一基因内部在不同部位的第二次突变而使其恢复野生型表型。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇基因内重组
中文名称:基因内重组英文名称:intragenic recombination定 义:同一顺反子内不同突变位点间的重组。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
高清肝脏时空图谱出炉!揭示肝再生机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521203.shtm在过度熬夜、吸烟喝酒、高糖高盐饮食等不良习惯日渐常态化的现代生活中,肝脏疾病也呈现出日益严峻的态势。作为人体的“化工厂”,肝脏除了解毒功能外,还具备代谢、合成、消化、免疫等多种功能。肝
全球肝内胆管癌死亡率升高-肝外胆管癌死亡率趋于平稳
肝内胆管癌(ICC)和肝外胆管癌(ECC)由于其诊断和鉴别相对困难,目前所能得到明确的研究结果较少。在过去的几十年里,这两种肿瘤的死亡率趋势不尽一致。 近期意大利米兰大学生物医学与临床科学系的Paola Bertuccio教授联合多位意大利及美国学者对全球32个国家1995-2016年登记的I
我科学家首次详尽揭示肝癌免疫图谱
对研发抗癌新药意义重大 近日,我国科学家对取自多个肝癌患者的5000余个T细胞逐个进行了基因测序,从而勾勒出每个细胞的基因表达图谱,这是世界上首次对癌症患者体内的T细胞在单细胞层面上进行如此大规模的详尽分析,为未来发现肝癌及其他癌症的免疫疗法奠定了基础。 这项由北京大学生命科学学院BIOPI
中国科学院自动化研究所揭示人类小脑功能层级背后的时空分子谱
人类小脑体积仅为大脑总体积的10%,却包含整个神经系统超过50%的神经元。小脑不仅协调运动,而且影响着人类的思考和情感。在探索小脑功能多样性的过程中,特别是剖析小脑如何参与和影响认知功能和情绪处理,研究发现了一个关键的轴线——感觉运动-联络(SA)轴。这一轴线有助于解释小脑功能层级的复杂性。然而
Nature-Cancer:研究揭示高危前列腺癌代谢干预机制及诊断标志物
近日,中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组、中科中山药物创新研究院徐骏宇课题组,联合中国科学院营养与健康研究所秦骏课题组、上海交通大学附属仁济医院薛蔚和董柏君团队、上海交通大学生命科学技术学院李婧课题组,在《自然-癌症》(Nature Cancer)上发表了题为Integrative prote