“六谷”丰登？——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研究所、深圳农业基因组研究所等单位联合，完成首个中国菰染色体水平基因组组装，并通过共线性分析和转录组测序鉴定到中国菰落粒性相关基因。该研究为中国菰落粒性基因编辑提供了候选靶点，有助于加速中国菰落粒性的定向驯化改良。相关研究成果发表于《通讯—生物学》（Communications Biology）。 论文通讯作者、烟草所副研究员闫宁介绍，中国菰具有生物量大、耐深水、灌浆成熟快、籽粒蛋白质含量高和抗稻瘟病等优良性状，由于未......阅读全文
首个庞贝人基因组测序完成，前年谜题解开
自然科研旗下《科学报告》26日发表的一项考古学研究，首次报道了公元79年维苏威火山喷发后在意大利庞贝去世的一名个体的人类基因组测序结果。在此之前，研究人员只测序过庞贝人和动物残骸的线粒体DNA短片段。 丹麦哥本哈根大学和意大利萨兰托大学的研究人员此次分析了在庞贝“匠人之家”发现的两名个体的残骸，
世界首个梅花全基因组重测序研究完成
日前，北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心，与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究，构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱，“梅花花部性状的遗传结构”（The genetic architecture of
我国完成世界首个番茄超泛基因组构建
4月6日，由新疆农科院加工番茄生物育种创新团队牵头，联合中国农业科学院、新疆大学、新疆农业大学等多家单位，在国际学术期刊《自然·遗传》在线发表了题为《超泛基因组研究揭示野生和栽培番茄物种基因组和结构变异多样性》的科研成果。这是新疆农科院首次以第一单位在《自然·遗传》发表论文。 新疆农科院余庆辉
研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了
聚焦基因组组装－至今最大组装竞赛寻找最优基因组指标
2013年7月23日，由华大基因和BioMed Cental联合创办的开放式期刊《GigaScience》发表了当前最大、最系统的基因组组装过程及评价结果。在第二届Assemblathon竞赛中，共有21个团队基于由三种不同的测序技术所得的鸟、鱼和蛇的未组装基因组数据，提交了43个组装结果，
天津环保人六昼夜完成装备组装调试移动医废应急焚烧炉
湖北孝感与天津遥距千里，一场突如其来的新冠肺炎疫情让两座城市的心紧紧贴在了一起…… “天津市生态环境科学研究院支援的移动式医废应急焚烧炉，今天中午1点运到孝感，经过安装调试，今天下午5点一次试烧成功！”2月8日，从手机上接到这条振奋人心的信息后，马建立一直悬着的心终于落了地。此刻，已经连续奋战
中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装
近日，记者从中国科学院海洋研究所获悉，我国科学家正式完成仿刺参基因组测序和组装，这在国际上尚属首次。该研究成果对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义，对我国刺参产业发展将产生重要推动作用。 据了解，该项研究得到了国家科技部973 、863计划，国家基金委，中国科学院和山东省科技厅、青岛市
科学团队研究组装无患子染色体级别高质量基因组
近日，中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队在《经济作物和产品》（Industrial Crops & Products）上发表了研究论文。该研究组装了无患子的染色体级别高质量基因组，分析挖掘了油脂合成候选基因，开发验证了一套特异分子标记，为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价
水平测斜仪的组装简介
首先检查测斜仪的导轮是否转动灵活、扭簧是否有力、密封圈是否完好。将测杆与电缆连接头连接在一起，为防止测斜仪进水影响测值的稳定，连接一定要牢固可靠，最好用扳手将电缆连接头与测杆拧紧。将电缆从电缆绕盘上放下测管的长度，再将读数仪的测量线拧在电缆绕盘的插座上。打开读数仪，将测斜仪在水平面上下转动，检查
华大基因、中科院Nature子刊发表新成果
OpGen公司今日宣布，通过利用ARGUS® Whole Genome Mapping System技术结合新一代测序技术(NGS)，生成了首个家山羊(domestic goat)的高质量参考基因组。这一研究是由深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所领导，相关成果发表在《自然生物技术》
我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱
6月3日，深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会，宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱，这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础，鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅
我科学家主导完成全球首个梨基因组解析
由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 11月 13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定坚实的遗
全球首个青稞基因组图谱绘制完成－揭示其驯化栽培过程
青稞经过藏族人民长达3500—4000年的驯化栽培，已经完全适应了极端的高原气候，成为了藏族人民的主食。全球首个青稞基因组图谱由我国科学家正式绘制成功，1月13日，其研究成果在线发表在PNAS杂志上。研究成果揭示了青稞的高原适应性机制，解读其起源、驯化及栽培选育过程。 科学家对西藏的地方品种青
首个白蚁基因组破译完成－促进社会性昆虫进化研究
白蚁的蚁王具有长久的生殖能力，与蚁后拥有同等的特殊地位，其他社会性昆虫却没有王。因此，白蚁是研究社会性进化重要的昆虫。近日，《自然·通讯》在线发表的文章中，中、美、德等国科学家宣布完成了首个白蚁(内华达古白蚁)基因组测序和分析，在揭示白蚁复杂社会性的分子基础方面获新发现。 白蚁与蚂蚁和蜜蜂一样
青岛农大等团队完成海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
崖州湾国家实验室联合发布首个种业大语言模型“丰登”
4月28日，崖州湾国家实验室精准设计与智造团队与中国农业大学、上海人工智能实验室共同发布首个种业大语言模型“丰登”。该模型集成了先进的人工智能技术与大数据分析，对海量来自不同渠道的育种科研文献、技术书籍及网络资源进行深度解析和索引，在品种选育过程、农艺性状描述、栽培技术推荐和历史推广区域查询等四大应
小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成
近日，生物学预印本服务器（www.biorxiv.org）在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果，该团队采用单分子实时测序（SMRT）和 Hi-C技术，在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”，将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上，在国际上
我国科学家发现黄花蒿首个染色体级别基因组图谱
疟疾至今仍威胁着人类的健康。黄花蒿是全球普遍使用的抗疟疾药物——青蒿素的主要天然资源，保障全球优质廉价的青蒿素原料供应对于全球疟疾防控有重要价值。但黄花蒿基因组杂合度和重复度很高，致使高质量的黄花蒿基因组组装成为该领域难题。 在重大新药创制科技重大专项、国家重点研发计划“中医药现代化研究”重点
一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释
黄连 (Coptis chinensis Franch.) 是毛茛科的一员，代表了一个重要的早期分叉双子叶植物谱系，具有多种药用价值。 2021年6月2日，湖北省食品药品监督检验研究院聂晶，华中农业大学王学奎，中国中医科学院陈士林及湖北中医药大学Liu Yifei（湖北中医药大学为第一单位）共
研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日，中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展，首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组，相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。银鲳隶属
破解了香气之谜－蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布
“一花香十里，更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅，是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景，其香味浓郁而独特，成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花？其独特香味由何而来？蜡梅 华中农大供图 近日，华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组，在《基因组生物学》在线发表
我国科学家发布海带高质量染色体水平参考基因组
近日，中国科学院海洋研究所海藻种质库团队在大型海藻基因组学研究方面取得重要突破，成功构建了海带的高质量染色体水平参考基因组。该成果发表在国际期刊《科学数据》。这是该团队在海洋经济藻类基因组研究领域取得的又一重要成果，为海带的遗传改良和基因组学研究提供了关键资源。海带孤雌生殖孢子体基因组组装 海洋
Nature子刊：“五谷”之一重要作物糜子的高质量基因组组装
糜子是起源于中国的古老作物，相关文献报道糜子在中国已经有超过1万年的栽培历史，是少数最古老的农作物之一。糜子是中国传统“五谷”中的一种。古代文献中出现的黍和稷分别为糥性和非糯性的糜子，在中华农耕文化中具有重要地位。同时，糜子具有较短的生长周期以及极强的非生物胁迫抗性，也是典型C4高光效作物。然而
PNAS最新介绍测序组装染色体技术
你有没有试过在不知道最终图案的情况下玩拼图游戏?这正是一些基因组研究人员在尝试通过新一代DNA测序数据，拼接成染色体时所面临的同样问题。这些染色体能提供基因组组织和结构变异方面的信息，有助于解析进化历史。为了能拼凑出这些染色体来，科学家们可以通过物理或者遗传图谱完成，但是对于许多物种而言，这种指
首个半野生型单倍型甜瓜T2T基因组装成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511997.shtm甜瓜（ Cucumis melo L.）是一种重要的园艺作物，位居十大水果之列。甜瓜分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜两个亚种，多样性丰富。长期的人工选择导致严重的驯化瓶颈，栽培品种的遗传多样
北大汤富酬团队首次在单细胞水平上从头组装人类基因组
基因组组装受益于具有更高准确性和更高连续性的长读长测序技术。然而，大多数人类基因组组装需要来自同质细胞系的大量 DNA，而不会保持细胞异质性，因为细胞异质性会严重影响单倍型组装结果。 2022年7月12日，北京大学汤富酬团队在Nucleic Acids Research （IF=19）在线发表
染色体的运动依赖纺锤体微管的组装和去组装
当细胞从间期进入有丝分裂期，间期细胞微管网络解聚为游离的αβ-微管蛋白二聚体，再重组成纺锤体，介导染色体的运动；分裂末期纺锤体微管解聚，又重组形成细胞质微管网络。 可分为：动粒微管：连接染色体动粒于两极的微管。 极间微管：从两极发出，在纺锤体中部赤道区相互交错的微管。 星体微管：中心体周围
国际首例猪T2T全基因组组装成功
2月8日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员、重庆市畜牧科学院王金勇研究员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授联合发布消息，国际首个猪T2T全基因组组装——民猪完整全基因组构建成功完成，标志着猪基因组研究迈入“完整解析”时代，为我国养殖业