青岛农大等团队完成海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个亚种基因组的成功测序，为从分子水平解析海湾扇贝属扇贝及其杂交后代的生长、抗逆性、育性和寿命等重要性状的决定机制及分子育种，打下了基础。 海湾扇贝属是原产于美洲的雌雄同体型扇贝，大部分种类分布在北大西洋沿岸，其中海湾扇贝北部亚种和海湾扇贝南部亚种已由张福绥院士分别于1982年和1991年由美国引进我国，成为我国北方和南方海域主要扇贝养殖品种。紫扇贝是唯一分布于南太平洋沿岸的海湾扇贝属种类，2007年由王春德课题组首次从秘鲁引进我国。 近年来，课题组通过将紫扇贝与海湾扇贝两个亚种分别进行杂交，成功培育出一系列生长优势极其显着的杂交扇贝......阅读全文
青岛农业大学完成紫扇贝基因组测序
近日，青岛农业大学海洋科学与工程学院科研团队日前完成了紫扇贝基因组的测序和分析，这是继虾夷扇贝和栉孔扇贝之后人类完成的第三个扇贝基因组测序。图片来源于网络 青岛农业大学海洋科学与工程学院教授王春德带领的科研团队结合第二代和第三代基因测序方法，对紫扇贝进行了全基因组测序分析，共获得４６３．１９Ｇ
研究揭示海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
青岛农大等完成海湾扇贝两个亚种基因组测序
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
青岛农大等团队完成海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
紫鑫药业与北京基因组所联手进军测序仪市场
10月29日上午，在青岛召开的国际基因组学大会开幕现场，作为大会主办方的吉林紫鑫药业股份有限公司和中国科学院北京基因组研究所，就合作开发第二代高通量测序系统项目正式签订了投资意向协议，标志着此前由中科院自主研发的第二代测序仪项目即将进入市场转化和产业化阶段。 基因测序技术，自人类基因组计划
烟台海岸带所探索贝类寿命的遗传“密码”
近日，中科院烟台海岸带研究所研究员王春德团队利用生物信息学和分子生物学技术开展系统研究，首次揭示了胰岛素/IGF-1信号（IIS）通路核心基因的遗传变异对紫扇贝和海湾扇贝的寿命发挥了重要作用。相关研究成果分别发表于《水产养殖》与《生理学前沿》。 紫扇贝和海湾扇贝同为Argopecten属扇贝，但
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前，中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制，探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等，在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物，进化学家推测这些双侧对称动物可能起
中科院烟台海岸带所贝类寿命研究获进展
FoxO和PTEN参与衰老和寿命调控的IIS通路 课题组供图 抗衰老机制一直是生命科学前沿热点问题，这个问题在人类和陆生模式生物中已进行了较为深入广泛的研究，但是鲜有关于海洋无脊椎动物寿命决定机制的研究报道。 中国科学院烟台海岸带研究所研究员王春德团队利用生物信息学和分子生物学技术开展系统研究，
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成
日前，长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成，并筛查得到与重要性状相关的基因或信号通路，在国际上填补了冠轮动物基因组学研究空白。 这是在国家863计划支持下，由中国海洋大学、中国科学院海洋研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国科学院南海海洋研究所、威海长青海洋科技股份有限公司、大连獐子
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器，于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库，从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道，以节约试剂用量。
认识泛基因组测序
什么是泛基因组？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念（pangenome，pan源自希腊语‘παν’，全部的意思），泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年，Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接，发现了个体独有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
PNAS：甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值，日前西班牙的九个研究中心通力合作，利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组，科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组，文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
紫鑫药业:基因测序仪量产基地已落户北京
紫鑫药业(14.590, -0.11, -0.75%)（002118）周五在全景网互动平台上表示，公司用于批量生产基因测序仪的基地已落户北京，目前已处于筹划批量生产阶段。 紫鑫药业主营业务为加工销售中成药，化学药制剂，药材原料，针织品加工，种养殖业；设计、制作，代理电视
关于全基因组测序的测序指标介绍
一、全基因组测序的测序指标— 深度 测序深度（Sequencing depth）是指测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体，如果采用的是双末端或Ma
杂交扇贝技术引领产业中兴
雄性不育且雌性可育个体的发现为海湾扇贝育种提供了珍贵材料，其可用于构建动物育种中的首个杂交扇贝不育系三系配套育种方法，是动物育种技术的重大突破，不亚于植物界推动杂交水稻育种革命的雄性不育株。 从秘鲁空运回紫扇贝，找到实现雌雄同体扇贝杂交的“诀窍”，发现杂交扇贝雄性不育的材料，利用杂交后代进行种
青岛农大扇贝育种技术获4项美国发明ZL授权
近日，青岛农业大学教授王春德团队申请的“紫扇贝与海湾扇贝三系杂交育种体系及应用”等4项发明ZL获得美国ZL与商标局授权，实现了对紫扇贝与海湾扇贝杂交育种和制种技术的国际保护。 这些发明ZL是王春德团队在开展紫扇贝与海湾扇贝杂交育种和制种过程中形成的。据介绍，为改良海湾扇贝种质，该团队自200
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
扇贝发育演化研究获进展
《自然》（Nature）子刊《自然-生态学与进化》（Nature Ecology & Evolution）日前以Article形式在线发表了中国科学院海洋研究所刘保忠课题组参与完成的研究论文"Scallop genome provides insights into evolution of b
白肉灵芝完成基因组测序
在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日，中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉，这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3：基因，基因组，遗传学》（G3-Genes Genomes Genet
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发
Nature突破：香蕉基因组测序
由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序，并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。 研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部（DOE）与美国国家卫生研究院（NIH），分别在1986年与1987年加入人类基
什么是基因组测序技术
自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来，人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开，分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中，他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法"，人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法"，其实是一种
我国完成小麦A基因组测序
本报讯（记者丁佳）5月10日，《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果，该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究，全面揭示了小麦A基因组的结构和
测序基因组勘探食品污染
上周，两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂（Blue Bell Creameries）已确认有少量食品原料已感染李斯特菌，目
基因组测序的具体过程
讲起来很复杂哈，简单来说，就是边合成边测序，把所要测序的序列通过各种手段来建库，然后加上5‘和3’都加上接头，放在一个小玻璃片一样的芯片上，上面一般是8个lane，把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合（之前的建库时加的接头与之反向互补），然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇，然
Nature完成桉树基因组测序
一个横跨五大洲的科学团队宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成，巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。 巨桉生长速度快，可以用作燃料和木材，是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东