首个庞贝人基因组测序完成,前年谜题解开

自然科研旗下《科学报告》26日发表的一项考古学研究,首次报道了公元79年维苏威火山喷发后在意大利庞贝去世的一名个体的人类基因组测序结果。在此之前,研究人员只测序过庞贝人和动物残骸的线粒体DNA短片段。 丹麦哥本哈根大学和意大利萨兰托大学的研究人员此次分析了在庞贝“匠人之家”发现的两名个体的残骸,并提取了他们的DNA。根据这些骨骼的形状、构造和长度判断,一组残骸属于一名死亡时年龄35到40岁的男性,另一组残骸属于一名50岁以上的女性。虽然作者能提取两名个体的古DNA并进行测序,但他们只能获得男性残骸的完整基因组,因为女性残骸的序列存在空白。 研究团队比较了这名男性个体的DNA与其他1030名古代及471名现代西方欧亚个体的DNA,发现他的DNA与现代中部意大利人以及罗马帝国时期住在意大利的其他个体的相似性最大。不过,对这名男性的线粒体DNA和Y染色体DNA的分析还发现了在撒丁岛个体中常见的基因群,但在罗马帝国时期住在意大利......阅读全文

首个庞贝人基因组测序完成,前年谜题解开

自然科研旗下《科学报告》26日发表的一项考古学研究,首次报道了公元79年维苏威火山喷发后在意大利庞贝去世的一名个体的人类基因组测序结果。在此之前,研究人员只测序过庞贝人和动物残骸的线粒体DNA短片段。 丹麦哥本哈根大学和意大利萨兰托大学的研究人员此次分析了在庞贝“匠人之家”发现的两名个体的残骸,

基因组测序新公司工作全靠机器人

CG公司的基因组测序工作完全由机器人完成工作人员正在蓝色幽暗的“车间”内操作检测设备   美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在,一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起,那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过,一家名为“整

英国将测序万人基因组用于疾病研究

  近日,在英国伦敦的科学博物馆,维康基金会(Wellcome Trust)宣布了英国10K(UK10K)项目,即英国将在接下来的三年内测定10000个人的基因组序列。英国10K项目的负责人Richard Durbin表示,这项宏伟的计划将得到生物医学慈善会约1000万英镑的支持,10K项目旨在找出

人基因组测序关键设备攻关不能再等了

  “目前国内能做人基因组测序的公司有不少,但是测序的整套设备包括试剂都是从美国购买的。”两会期间,中科院北京基因研究所副所长张德兴委员在接受科技日报记者采访时说,一个人做一次全基因组测序,在美国成本是1000美元,在中国却要1500美元,成本差异就在于关键设备。  2013年,华大基因并购美国基因

Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序

  人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。   该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

人的一生,全基因组测序引发的4个需求

  2014年年初Illumina公司推出的HiSeq X Ten 测序平台,实现了“人类基因组测序成本降低至1000美元”的设想。该测序平台测序成本为当前其他测序平台成本的20%。换句话说,Illunima公司在引领二代测序市场的发展,促使测序成本呈跳水式骤降。  全基因组测序成本随时间变化图(不

张德兴委员:人基因组测序关键设备攻关不能再等了

  “目前国内能做人基因组测序的公司有不少,但是测序的整套设备包括试剂都是从美国购买的。”两会期间,中科院北京基因研究所副所长张德兴委员在接受科技日报记者采访时说,一个人做一次全基因组测序,在美国成本是1000美元,在中国却要1500美元,成本差异就在于关键设备。  2013年,华大基因并购美国基因

亚洲10万人类基因组测序计划发布!

  非盈利联盟GenomeAsia 100K最近宣布了一项计划,测序10万亚洲人的基因组,希望能加速精准医疗在亚洲人群中的应用。该计划除测序外也将利用大数据分析和数据科学及人工智能的研究进展。至少12个南亚国家,7个北亚和东亚国家将参与其中。  第一阶段,该计划将主要为亚洲所有主要种族分布构建参考基

关于全基因组测序的测序指标介绍

  一、全基因组测序的测序指标— 深度  测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

治疗庞贝氏病的基本介绍

  国外已有酶替代治疗药物上市,重组人α-葡萄糖苷酶制剂,Myozyme(alglucosidase alfa)用于主要用于婴儿和儿童患者。Lumizyme 用于8岁及8岁以上晚发型Pompe病患者的治疗。可采用的辅助治疗包括,以肝脏受累为主、空腹低血糖的患者可给予生玉米淀粉治疗,通过控制血糖水平二

简述庞贝氏病的基本症状

  庞贝氏病是累及全身的系统性疾病,临床变异较大,但主要以肌病表现为主。有个别报道中枢神经系统和肾小管受累。  根据起病年龄症状严重程度和进展速度不同可分为不分为三种类型: 婴儿型,症状比较严重,一般在出生1个月或3~4个月后发病。首发症状为进食后发绀,呼吸困难。全身肌肉无力,呈弛缓性瘫痪,且病情进

关于庞贝氏病的基本介绍

  又称为酸性α-葡萄糖苷酶缺乏症或糖原贮积症Ⅱ型(GSDⅡ)。由于溶酶体内缺乏酸性α-葡萄糖苷酶(acidalpha-glucosidase, GAA),使糖原及麦芽糖不能转化为葡萄糖而被利用,以致体内大量糖原在骨骼肌、心肌和平滑肌等组织细胞内聚积而致病。

454用于西红柿基因组测序

  最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发

盘点最新基因组测序成果

  the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者:  种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae)  基因组:~2.86 billion bp  人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年

中国莲基因组测序完成

  继中国科学家成功完成水稻、玉米基因组测序工作后,近日,中国科学院武汉植物园研究人员与国外多家科研机构合作,顺利完成中国莲的基因组测序,构建了首张中国莲全基因组图谱,相关论文在线发表于《基因组生物学》杂志。   “该项目为将来的莲分子育种提供了坚实的基础,也标志着我国相关研究将对生物进

测序解读基因组,真的好吗?

测序解读基因组,真的好吗?   “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire,在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说,“尤其是对自己基因组信息的了解。”  虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年,但

基因组测序的具体过程

讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

简化基因组测序好做吗

简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度,进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。这些技

测序基因组勘探食品污染

   上周,两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂(Blue  Bell Creameries)已确认有少量食品原料已感染李斯特菌,目

基因组测序拯救鸮鹦鹉

  为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。  新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过

白肉灵芝完成基因组测序

 在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet

什么是基因组测序技术

自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种

我国完成小麦A基因组测序

本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和