Cell子刊颠覆经典教条,癌症表观遗传有新说

由澳大利亚Garvan医学研究所Susan Clark教授领导的一个研究小组在新研究中揭示:前列腺癌中基因组的大片区域(约达到2%)受到了表观遗传调控激活。这一成果发表在12月13日的《癌细胞》(Cancer cell)杂志上。 激活区域包含许多前列腺癌特异基因,例如前列腺癌最常见的标志物PSA(前列腺特异抗原)和PCA3等。直到现在,人们都并不清楚这些基因是通过表观遗传调控。 Clark教授实验室在以往的研究中证实,相似地前列腺癌基因组的大片区域也被表观遗传调控沉默,表明癌症的表观遗传组(epigenome)有结构性重排。 表观遗传学(Epigenetics)是着眼于研究不涉及DNA序列改变,通过影响细胞核内基因组的结构调控基因表达的生物化学改变的一门遗传学科。通过某些分子的附着或脱离准确打开或关闭DNA结构,使得基因在结构打开时表达,结构关闭时沉默。 在表观遗传激活方面,新研究表明,一种称......阅读全文

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

进行全基因组甲基化检测需要多少钱

建库是5000块钱一个库,测序就是1500每G,看您要测多少G的数据量,信息分析大概要5000块钱左右吧。。。

揭示Y染色体上LncRNA-TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移

  前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln

中国学者Cell等2篇论文:癌症表观标志

  9月底,Cell及其子刊Cell Reports两篇文章指出 5-hmC(5-羟甲基胞嘧啶)和DNA羟化酶TET1对于黑色素瘤,乳腺癌和前列腺癌的发生发展,预后和治疗中的重要意义。   首篇文章由布莱根妇女医院(BWH),复旦大学等处完成,文章通讯作者之一是复旦生物医学研究院表观遗传学中心

北京基因组所等首次实现前列腺癌的无创性体液检测

  前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一,目前前列腺癌的传统诊断方法是检测血清中特异性抗原(PSA)浓度,对PSA偏高的患者进行穿刺活检最终确诊。然而,该方法的主要缺陷是PSA的特异性较差(PSA 4-10ng/ml时,特异性只有25%-40%),其它如前列腺炎、前列腺增生等前列腺疾病也能引起PSA

揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法

  5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

GenomeDx-Bioscience-开发前列腺癌基因组检测试剂盒

  随着医疗水平的提高,人们已经认识到检测方法的更新对疾病治疗的重要意义。因此,许多专注于新型检测手段开发的生物医药公司也越来越受到产业的追捧。最近,GenomeDx Biosciences就宣布公司将募集超过2500万美元的经费用于推广期最新前列腺癌基因组检测方法Decipher Biopsy的推

Cell-Res:CRISPR/Cas9瞬时表达基因组编辑体系

  基因组编辑技术是最新发展起来的植物基因功能研究及定向育种的重要手段。在植物中实现基因组编辑的常规方法是将序列特异性核酸酶(如CRISPR/Cas9)的编码DNA转化植物细胞,稳定表达进而实现对目的基因的定点编辑。这种情况下,CRISPR载体整合在植物染色体中,需通过后代分离获得不含CRISPR/

管住嘴-迈开腿——将前列腺癌拦截于门外

   前列腺癌是指发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤,目前病因尚未完全明晰。随着人们生活方式的改变、人口老龄化的进展,前列腺癌已经成为男性健康的重大威胁。有研究指出高脂饮食(HFD)与前列腺癌的发生发展具有一定的关系,但具体缘由仍未有定论。  近日,美国哈佛医学院的研究人员为这一推论递上了实锤。他们指出H

吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象

2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化

北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

抑癌基因调控前列腺癌机理获阐明

  日前,肿瘤领域期刊《临床肿瘤研究》在线发表了上海交大基础医学院王建华课题组的最新研究成果,该研究从表观遗传学修饰新角度,阐明了抑癌基因在调控前列腺癌的发展、转移中的作用机制,有助于为前列腺癌的早期诊断和治疗提供新的思路,同时也为构建新的前列腺癌小鼠模型奠定理论基础。   

PNAS:利用基因组编辑家蚕大量表达蜘蛛丝

  蜘蛛丝是自然界中机械性能最好的天然蛋白纤维,其强度甚至高于用于制作防弹衣的凯夫拉纤维,在工业、医疗和国防上都有着广泛的应用前景。但是如何大量获取蜘蛛丝纤维是一直以来难以解决的问题。  来自中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所谭安江研究组题为“Mass spider silk pro

新晋院士孙颖浩Cell子刊等连发4项癌症新成果

  第二军医大学校长孙颖浩(Yinghao Sun)教授是我国首屈一指的前列腺疾病专家,在中国乃至世界的泌尿外科界都享有盛誉。其长期致力于前列腺癌、泌尿系结石和微创泌尿外科技术的研究,并取得卓越的成就。根据最新的消息,孙颖浩教授当选成为了2015年中国工程院院士。  近期,孙颖浩院士课题组在癌症研究

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展

  2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)

中国科学家首次发现线虫基因组存在DNA甲基化现象

中国科学家最新研究成果首次证实在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶并证实了DNA甲基化的存在,改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。同时也使以DNA甲基化序列做靶标进行抗寄生虫药物研发成为可能,为抗旋毛形线虫病的药物开发提供了全新思路。 吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院合作完成的

Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现

  北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨

干细胞标和分化信号通路相关的基因介绍​EZH2基因

EZH2基因编码的是一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,参与DNA甲基化从而抑制其他基因转录,EZH2也可甲基化组蛋白H3第27位赖氨酸。EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默,是PRC2复合物的组分之一。EZH2的突变或者过表达与多种类型癌症相关,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。

与-干细胞标和分化信号通路相关因子介绍EZH2

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与肾癌相关的EZH2基因编码功能描述

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与结直肠癌相关的EZH2基因编码功能描述

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与白血病相关的EZH2基因编码功能描述

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具有遗传风险的基因介绍EZH2基因

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与组蛋白修饰相关因子介绍EZH2

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与黑色素瘤相关的EZH2基因编码功能描述

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遗传风险基因信号通路相关因子EZH2

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与组蛋白修饰相关因子介绍EZH2

EZH2基因编码的是一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,参与DNA甲基化从而抑制其他基因转录,EZH2也可甲基化组蛋白H3第27位赖氨酸。EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默,是PRC2复合物的组分之一。EZH2的突变或者过表达与多种类型癌症相关,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。