新方法可实现多环境数据的全基因组关联分析
全基因组关联分析是在自然群体中将标记基因型与复杂性状表型关联以挖掘复杂性状基因的方法，在动物、植物、林木和人类遗传中广泛应用。近日，华中农业大学植物科学技术学院教授章元明团队在植物学领域期刊额《分子植物》（Molecular Plant）上发表了研究论文，报道了全基因组关联分析方法学研究的突破性进展。 该研究显著减少了混合模型中方差组分的数目，统一构建了关联分析主效位点、环境互作和位点间互作检测以全面剖析数量性状遗传构成的新框架，实现了从单环境数据关联分析到多环境数据联合分析的转变，为复杂性状基因发掘提供了新方法。 在QTN检测中，虽然关联群体标记通常有AA、Aa和aa三种基因型，应该估计加性与显性两种效应，但是目前几乎所有方法只估计等位基因替代效应，导致效应估计混杂和多基因背景控制不全面。在QTN×环境互作（QEI）和QTN×QTN互作（QQI）检测中，除上述问题外，还存在可供利用的方法十分有限的问题，导致了作物关联分......阅读全文
环境监测数据造假起底：企业伪造数据花样多
“前不久，我们通过在线监测，发现一家企业的排放数据超出正常范围，系统也自动报警。但到企业调查时，他们死不承认。最后通过调阅现场监控视频，只用了几帧图片，就证明有人做了手脚。到了这个程度，这家企业的负责人不得不承认篡改了数据。”去年12月29日，河南省环境在线监控中心执法人员赵娜对《第一财经日报》
－环境影响基因表达
日复一日、年复一年，我们的基因不断地和我们所生活的环境、邻居、家人，以及我们自己的心态“对话”。这些社会性互动的结果会进入我们细胞的控制室，改变基因的强弱表达，从而影响我们的习性、行为、生理、心理与健康。美国知名科学作家戴维·多布斯日前撰写了《基因的社会生活——改变你的分子组成》一文，介绍了科学
英国利用大规模全基因组测序数据－研发出新型血液病panel
英国研究人员利用5000份全基因组测序数据，其中超过一半来自患有血液病或者免疫疾病的患者，研发出检测遗传性出血性疾病、血栓性疾病和血小板疾病的靶向NGS panel，其验证研究结果发表在《Blood》杂志上，该研究表明大规模测序项目可以转化到临床应用中。 该panel分析由血栓基因组学联盟（T
全基因组扩增技术介绍
研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。QIAGEN的全基因组扩增技术通过以包括单细胞在内的小量样本或珍贵样本扩增获得基因组DNA，解决此类难题。REPLI-g Kit能够准确地复制原始DNA样本，不会造成偏差，扩增后的DNA可以直接应用于广泛的遗传学分析。什么是全基因组扩增(w
虎尾海马全基因组破译
中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同，海马呈现高度特殊的形态，例如头部前方具有管状长嘴，无腹鳍和尾鳍，尾端卷曲，全身覆盖硬骨骼，没有鳞片
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部（DOE）与美国国家卫生研究院（NIH），分别在1986年与1987年加入人类基
全基因能合成多长的片段？
全基因合成理论上没有长度限制。但是由于克隆技术，载体容量等因素存在，一般全基因合成长度不超过10kb。
全基因合成的步骤是什么？
全基因合成包括：设计合成引物；PCR拼接序列；克隆到载体；测序验证。
深圳今年拟水环境监测全覆盖
近日，市人居环境委召开专题会议。会议要求，以环境质量为核心，全面做好“十三五”工作谋划和今年各项重点工作。在水治理方面，在今年要实现水环境监测全覆盖，建立水质通报和异常反馈处理机制，完善水质考评机制，积极发挥专业部门作用；在大气治理方面，深入实施大气环境质量提升行动计划，重点是控制柴油车污染；在
陕西构建全覆盖环境监测网络
为加快推动“政府主导、部门协同、社会参与、公众监督”的生态环境监测网络建设，让市民更便捷地获取环境信息，日前陕西省正式出台《陕西省生态环境监测网络建设工作方案》（以下简称《方案》）。《方案》提出，到2020年，陕西省要实现环境质量、重点污染源、生态状况监测点位全覆盖。 建设空气、水、土壤、声、
环境信息中心：依托生态环境大数据创新环境管理
信息化不再是看不见摸不着的抽象概念，而是与我们的工作生活密接相关。 移动支付让我们出门时不再考虑带多少现金、几张卡，而是带上手机，走遍天下都不怕。 电子办公让我们工作时不再考虑一天能跑几个地方，出门需要携带几份文件，而是足不出户就可以实现文件的自动流转。 在日前举办的全国环境信息中心主任工
环境监测部门如何提高环境监测数据的质量？
前不久，中共中央办公厅、国务院办公厅印发了《关于深化环境监测改革提高环境监测数据质量的意见》(以下简称《意见》)，并发出通知，要求各地区各部门结合实际认真贯彻落实。那么《意见》有何亮点?环境监测部门如何提高环境监测数据的质量?中国环境监测总站相关专家为你解读。 中国环境监测总站员工爬上大烟囱检
数据应用环境项目“数据资源中心建设”子项目通过验收
12月30日，中科院计算机网络信息中心在北京召开了中科院“十一五”信息化专项“数据应用环境建设与服务”项目的“数据资源中心建设”子项目验收会议。来自北京航空航天大学、清华大学、中国地震局、中科院相关院所等单位的7名专家组成专家组。 网络中心科学数据中心主任、中科院数据应用环境建设与服务项目
全基因组测序揭示肝癌相关基因突变
由亚洲癌症研究组织(ACRG)、深圳华大基因研究院等多家单位合作完成的与肝细胞癌相关的基因突变研究成果于2013年6月20日在《基因组研究》(Genome Research)杂志上发表。这是继2012年3月份在《自然-遗传学》上发表的乙肝病毒整合机制研究之后，该研究团队在肝癌研究中所取得的又
全基因测序和一般基因检测的区别
全基因测序和一般基因检测的区别：基因检测的作用就在于此：它可以先判定某人的CYP2C9是否发生了突变，并判定他属于哪种代谢类型，然后再根据代谢类型决定药物剂量。如果是强代谢型，那就适当提高剂量；如果是弱代谢型，那就降低剂量并注意药物在血液中的含量。这样就既保证了药物达到治疗效果，也不会出现ADR。一
基因是否表达：cfDNA全基因组测序可揭晓
《Nature Genetics》杂志上的研究表明，血循环游离DNA（cfDNA）可提供线索来预测基因的表达。 全基因组测序就能知道基因是否表达 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中，把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译，最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的
清除环境监测数据造假之“霾”
最高人民法院、最高人民检察院26日联合发布《关于办理环境污染刑事案件适用法律若干问题的解释》，其中颇受外界关注的是，《解释》将重点排污单位篡改、伪造自动监测数据，干扰自动监测设施，排放化学需氧量、氨氮、二氧化硫、氮氧化物等污染物的，作为严重污染环境的情形；违反国家规定，强令、指使、授意他人实施修
环境数据为何与公众感受有“温差”
公众对2015年雾霾印象深的主要原因是，雾霾集中出现在11月至12月，且持续时间长、范围广、污染程度重 充分认识大气污染治理的长期性、复杂性、艰巨性，既要积极作为，又不能操之过急，需要全社会的共识与共同行动 1月以来，各地纷纷晒出去年蓝天“成绩单”：两次启动雾霾红色预警而备受关注的北京，其空
天津监测数据：最新环境监测情况
从天津环保部门获悉，9月7日8时至14时，事发地警戒区外环境空气5个固定点，警戒区周边500—1000米区域内4个流动采样点，共采集样品14个。监测结果显示，氰化氢、硫化氢、氨等污染物均未检出。 9月6日，环保部门继续对爆炸事故周边3公里内的地表水、地下水和周边可能受影响区域的海水开
让乡镇环境监测数据“发好声”
据本报19日报道，绍兴市今年在所有乡镇实现水、大气环境监测全覆盖，并对监测到的环境质量进行排名，届时各地环境状况一目了然。此举有利于全面掌握各地的环境质量，了解污染源所在。 监测站点要建好、用好，更要让数据“常发声”、“发好声”，切实增强乡镇的属地责任意识，真正打通环境管理的“关键一米”。
环境监测数据造假坑害了谁
排水口“吐”着脏水，烟囱冒着黑烟，在线监测设备却显示达标排放。检测软件“动手脚”、空气样本作弊、人为设定污染上线……2015年2658起监测数据造假案例被环保部门“揪出”，17个省（区）市对发现的问题立案78起。日前，环保部通报15起污染源自动监控设施及数据弄虚作假典型案例。 我们每个人都希望
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
企业如何建设生态环境大数据？
伴随着互联网技术迅猛发展，环境信息化企业近年来也进入了高速发展期。而大数据时代的到来，更让环境信息化企业成为创新环境管理一支不可或缺的力量。 在生态环境大数据建设的当下，环境信息化企业能贡献哪些力量？ 为此，专访了业内专家——中科宇图资源环境科学研究院院长刘锐。 环境信息化企业面临哪些利好
从源头堵住环境监测数据造假
西安环保数据造假案有了结果。因用棉纱封堵空气质量监测仪，西安7名基层环保工作者被判破坏计算机信息系统罪，并承担法律责任。环保部表示，这是该部联合公安部历时15个月重点督办的环境质量监测数据造假被追究刑责的第一案，必将对地方政府和环保系统起到强烈震慑和有效警示作用。 环境监测数据是环境治理的“晴
构建质量管理体系确保数据“真准全”
中办和国办日前联合印发的《关于深化环境监测改革 提高环境监测数据质量的意见》（以下简称《意见》），是继环境监测监察垂直管理改革和环境质量监测事权上收之后，落实《生态环境监测网络建设方案》的又一重大举措。 数据质量是环境监测工作的底线和生命线，确保监测数据“真、准、全”，是环境监测的首要职责，也
“液冷数据中心全链条产业创新基地”走访记
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511892.shtm当下，IT基础设施领域正在掀起一股“液冷”之风。相比传统的“风冷”，液冷技术散热效率高、精确制冷效果好、有利处理器性能提升、低噪音等优点，正成为数据中心等建设的首选。然而，无论是数据
城市环境所等构建水环境动态数据挖掘框架
水环境动态性是环境科学和生态学在水域生态系统的主要交叉研究主题之一。根据水域生态系统边界特征，水环境动态性关联机制包括外部和内部两方面，一是从环境科学角度看水环境动态性受到系统外部因素的驱动，例如流域内气候水文和人类活动叠加作用下水体环境变化；二是从生态学角度看水环境动态性与系统内部水生生物之间
广西环境监察移动执法系统实现全覆盖
记者近日跟随广西壮族自治区环境监察总队和百色市环境监察支队执法人员来到某铝电企业暗查。前不久，广西壮族自治区环保厅对这一企业的超总量排污行为实施按日连续处罚并责令其改正环境违法行为。本次暗查目的是对企业的改正情况进行复查。 记者看到执法人员手持移动执法终端，经过对现场核实并拍照后，带着移动执法
多国实施全基因组分析计划
由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因，该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。 英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。 美国加州一对龙凤胎出生后，他们的父母非常忧虑：两个婴儿不仅发育缓慢，而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示，男婴或存在大脑性麻痹；然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不
全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果，全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导，对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征，但无法通过之前的筛查检测来解