数字PCR在二代测序辅助建库的应用

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可大大降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。......阅读全文

数字PCR在糖尿病治疗中的应用

    数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点,通过定量检测非甲基化DNA的水平,对I型糖尿病β细胞死亡进行定量,从而监控病情发展。

数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用

摘要:Vogelstein和Kinzler(美国国家科学院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一种在微量细胞群中(如原发性肿瘤组织)鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平,它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个

二代测序在肿瘤治疗研究项目中的应用及数据

GenomeWeb芝加哥讯 – 本周美国临床肿瘤学会年度会议中展示的研究项目包括了来自于部分研究项目的大量数据,这些研究项目均使用了二代测序技术来指导对肿瘤患者的治疗方法。 研究结果表明,正如之前科学界已报道的那样,NGS panel及更广泛的测序方法可以在很多情况下的少部分(有时是多数)患者中鉴别

FastAmp基因扩增仪在Y染色样本建库的应用

自2020年2月6日召开联防联控发布会之后,各个村庄、路口、学校、单位设置了体温检测,体温正常与否是目前比较简单易得的有效判断依据,一旦体温确认超过37.3℃,马上就有会安排到隔离区,并且你有可能会被要求隔离14天。由此看见,温度对当前疫情的重要性,随时牵动了一个小区或者一个片区几万人的神经。温度对

NGS测序中DNA质量对建库结果的影响

NGS测序中的常规类文库主要针对全基因组测序,广泛应用于各类物种的重测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、质粒&线粒体&叶绿体测序、宏基因组测序、小片段测序等领域。NGS测序涉及提取、建库、上机多个环节,每一步都会影响最终的数据质量。很多老师在收到质检报告后,

第二代数字PCR——管内芯片式数字PCR仪特点及优势简介

管子里面有芯片?!第二代数字PCR?! 如果你熟悉数字PCR,你肯定知道微滴式、芯片式。在精准医疗风靡全球的时代主题下,我们对于检测精准度、灵敏度也越来越高。PCR作为分子生物学一个重要工具、主要手段,被赋予的使命也越来越多;研究者们对这个工具的要求也越来越高。数字PCR的问世,正是为了解决这些要求

PCR测序技术的应用

PCR测序是对生物遗传信息的最终判定。随着各种基因组计划的开展,PCR测序工作在不断加强和完善,特别是全自动DNA测序仪的开发,为提前完成人类基因组计划奠定了基础。此外,在临床遗传病、传染性疾病和癌症的基因诊断、农业畜牧业的动植物育种、法医鉴定等领域上有广泛的应用前景。过去由于全自动DNA测序的仪器

数字PCR在传染性疾病的检测的应用

 数字PCR技术因起高精密度、耐受能力强、高灵敏度等优点,逐渐被用于病毒载量分析的相关研究。如HIV抗逆转录病毒治疗过程中病毒残留量的监控;HBV耐药突变的检测;HCV的分子分型;抗甲氧西林金黄色葡萄球菌的院内感染监控;环境微生物不同功能基因之间的连锁分析等等。

领航基因获首张完全自主知识产权液滴数字PCR仪注册证

  2019年1月7日,浙江省药品监督管理局正式批准领航基因科技(杭州)有限公司的生物芯片阅读仪iScanner 5(浙械注准20192220007)上市。该产品是领航基因继2018年6月获批国内首款拥有完全独立自主知识产权的固态芯片式数字PCR仪iScanner24之后,推出的全新五色荧光液滴数字

数字PCR技术在DNA定量精准等领域的应用

数字PCR先进的数字PCR技术实现了样品中的单分子核酸扩增,从而使的DNA定量的精准度提高到了全新水平。Philip与Stilla Technologies的首席执行官兼联合创始人Rémi Dangla进行了交流,讨论了数字PCR技术领域的进展和挑战。Stilla Technologies公司总部位

数字PCR在临床和预后融合基因检测的应用

众所周知,融合基因检测对临床诊断及预后指导都具有十分重要的意义。那么究竟什么是融合基因呢?融合基因的发现始于上个世纪60年代,它是指染色体断裂后又重新拼接。如果恰巧拼接时发生了错误,使两个不同基因互相融合,大多数情况下,它会造成某些序列或功能异常的蛋白表达,亦或者是某些基因表达失调,从而促进肿瘤的发

数字PCR在拷贝数变异(CNV)研究的应用

微滴化的样品处理及检测,这种摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的绝对拷贝数,为拷贝数变异的研究提供了绝对的检测精度。是其他诸如二代测序、芯片杂交等平台无法达到的。采用数字PCR能够有效对二代测序(NGS)和微阵列比较基因组杂交(aCGH)等实验结果进行验证,并具有检测周期短、成本低、样本通量高等

数字PCR应用及前景

 剖析|你想要知道的数字PCR应用及前景 一. PCR的发展历史 PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。 随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real

数字PCR应用及前景

一. PCR的发展历史 PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。 随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR) 应运

数字PCR技术的应用举例

EGFR突变的肺癌治疗过程中 的液体活检检测是一个非常具有挑战性的工作 ,但这个基因在亚洲人群的高突变频率使非常多的肺癌患者在接受对应靶向药中受益(约30%)。数字PCR可以以肺癌患者的血浆中游离肿瘤DNA(CTDNA)为样品,检测EGFR敏感性和药物抗性相关的突变。      运用数字PCR为精准

一代测序、二代测序及三代测序的应用对比

  一、初现庐山真面目  一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆)  历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用

一代测序、二代测序及三代测序的应用对比

  一、初现庐山真面目  一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆)  历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用

数字PCR在-癌症标志物稀有突变检测的应用

 在一份给定的样本中,相比于野生型DNA,癌症相关的突变序列比例较低,经常无法检测。而凭借其超高灵敏度,dPCR系统可以很容易地定量分析低至0.001%-0.0001%的突变频率。之前用任何方法都无法实现准确稳定检测的样本,现在可以使用dPCR轻松进行定量分析。例如,已实现肺癌相关的表皮生长因子受体

数字PCR在转基因食品或成分检测中的应用

 目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法,这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。ddPCR绝对定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作,从而确保安全和品质。

数字PCR技术在DNA甲基化检测中的应用

DNA甲基化是目前研究最多的表观遗传修饰之一,发生于CpG二核苷酸序列C5位置的胞嘧啶上,多发生于CpG岛上,研究发现,DNA甲基化参与调节多种细胞过程,包括胚胎发育,转录,X染色体失活,基因组印迹、染色体稳定性等。许多研究发现,DNA甲基化在一系列的疾病(如癌症等)起到十分重要的作用。在癌症患者中

第二代DNA测序技术的应用展望

第二代测序技术--以Illumina/Solexa Genome Analyzer 为例1.概述DNA测序(DNA sequencing)作为一种重要的实验技术,在生物学研究中有着广泛的应用。早在DNA双螺旋结构(Watson and Crick,1953)被发现后不久就有人报道过DNA测序技术,但

CSCO:肿瘤二代测序技术应用重在规范

  “二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治最关键的问题,是规范测序公司的标准和操作方法,只有规范的技术才能保证后续的精准发现和精准治疗。”前不久,中国临床肿瘤学会(CSCO)理事长吴一龙教授在《二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识》(以下简称《共识》)发布会上表示,《共识》旨在为二代测序(NGS)

CSCO:肿瘤二代测序技术应用重在规范

  “二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治最关键的问题,是规范测序公司的标准和操作方法,只有规范的技术才能保证后续的精准发现和精准治疗。”前不久,中国临床肿瘤学会(CSCO)理事长吴一龙教授在《二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识》(以下简称《共识》)发布会上表示,《共识》旨在为二代

二代测序技术

人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表达什么听

二代测序原理

第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Seque

数字PCR技术的应用领域

从上世纪90年代以来qPCR技术的爆发式发展使得现代核酸检测技术具有全新的面貌,而进入二十一世纪之后,速度更快、通量更高。成本更低的DNA测序技术正在迅速发展,也是目前竞争最为激烈的研究领域之一,即使在这种情况下,dPCR技术仍然以其高度的灵敏性和特异性在诸多科学领域争取到属于自己的一席之地。即使在

神通广大的数字PCR,到底有多厉害?

   什么是数字PCR?  提起PCR,在生物及其相关行业内可谓无人不知无人不晓,半个世纪以来分子诊断的高速发展离不开分子生物学技术特别是PCR技术日新月异的进步。1983年由美国Mullis首先提出设想,1985年发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,标志着PCR技术的真正诞生。1999 年,美

微滴芯片数字PCR技术在检测新冠病毒的应用

国家卫健委发布了《新型冠状病毒肺炎防控方案(第五版)》,其中在实验室检测技术指南中明确提出,核酸检测结果阴性不能排除新型冠状病毒感染。3月4日,国家卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》 中提到了以下两点:对疑似病例要尽可能采取包括快速抗原检测和多重PCR核酸检测等方法对呼吸道病

数字PCR在CRISPRCas9基因编辑结果验证的应用

 CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。

数字PCR在癌症早筛和微小残留病灶检测的应用

最近几十年的大量研究表明,在许多血液系统恶性肿瘤中,微小残留病灶(MRD)与临床结果及预后显著相关。癌症中MRD是指癌症治疗达到完全缓解后,用常规的形态学检测方法不能检测到明显的癌病灶,而此时体内仍存在的少量癌细胞。微小残留病灶是肿瘤复发的直接原因。目前应用最广泛最精确的MRD检测手段是通过取患者的