我所提出聚集态蛋白质相互作用组的交联解析新方法
近日，我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组（02T5组）刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队，以及西湖大学张鑫教授团队等合作，通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构，实现分子的三重态化学活性，并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联，获得了聚集态蛋白质的相互作用信息。蛋白质的错误折叠、变性与聚集会引发多种蛋白质构型疾病，如阿尔兹海默症、帕金森症、渐冻人症和淀粉样心肌病等。目前，聚集态蛋白的研究主要停留在发展荧光探针观察其位置形貌并示踪聚集过程，用于疾病的早期发现和临床诊断。然而，用于解析细胞内聚集态的蛋白质组成成分和相互作用信息的分析工具鲜有报道。聚集态蛋白质的组分和互作信息对于揭示上述疾病的发病机制，寻找新的诊疗靶点具有积极的科学和临床意义。 近年来，刘宇团队针对细胞内聚集态蛋白质缺乏完整三维结构信息、难以实现靶向探测这一领域难点，提出靶向聚集态蛋白质内部孔道特征微环境的探针设计思路（......阅读全文
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队，研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通过相
蛋白质相互作用识别和干预机制分析新方法
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队在蛋白质复合物形成和干预机制分析新方法研究方面取得进展，通过溶液状态蛋白质赖氨酸两步稳定同位素标记和定量蛋白质组学分析，实现对蛋白—蛋白识别关键位点区域的精确探测，并可评估小分子对蛋白质复合物的构象识别干预情况。 蛋白质的结构和相互作用决定了其
科学家发展蛋白质组学分析新方法
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮、研究员秦洪强团队开发了表征蛋白质中组氨酸残基反应活性的蛋白质组学分析新方法。该工作筛选并获得了具有组氨酸优异反应效率的α, β-不饱和醛探针，发展了基于烯醛探针的组氨酸标记技术和可逆酰肼化学富集方法，通过蛋白质组定量技术实现了人类蛋白质组中的组氨酸
张玉奎院士：蛋白质组相对定量新方法
第5届亚洲与大洋洲质谱会议暨第33届中国质谱学会学术年会于2014年7月17日上午在北京大学盛大召开。在大会报告中，来自中国科学院大连化学物理研究所的张玉奎院士带了题为《蛋白质组相对定量新方法》的报告。中国科学院大连化学物理研究所 张玉奎院士 蛋白质组相对定量新方
我科学家主导完成全球首个梨基因组解析
由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 11月 13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定坚实的遗
我所开发出蛋白质甲基化分析新技术
近日，我所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心程红研究员团队、中国科学院上海营养与健康研究所王泽峰研究员团队、李国辉研究员团队合作，开发了一种基于代谢标记的蛋白质甲基化分析新技术，实现了蛋白质甲基化组的全景式分析。该方法不需要预先设置甲基
蛋白质与核酸的紫外交联实验
实验方法原理含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷（BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方案中的紫外交联效率是0.1%〜10%，而且在单一复合物中出现1 次以上交联事件的情况十分罕见。实验材料含有所研究结合位点的M13单链载体试剂、试剂盒17 bp 的 M13 通用引物1×和10×
蛋白质与核酸的紫外交联实验
实验方法原理 含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷（BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方案中的紫外交联效率是0.1%〜10%，而且在单一复合物中出现1 次以上交联事件的情况十分罕见。实验材料 含有所研究结合位点的M13单链载体试剂、试剂盒 17 bp 的 M13 通用引物1×和
蛋白质与核酸的紫外交联实验
用溴脱氧尿苷（BrdU)取代的探针进行紫外交联 实验方法原理 含有胸苷卤代物如溴脱氧尿苷（BrdU)的DNA比非取代的DNA对紫外线诱导的 交联更为敏感。本方
蛋白质的醛基交联具体反应机理
醛基和氨基的反应在热力学上说是很容易发生的，因为生成了一个更稳定的亚胺以及水。因为这是一个亲核取代并消除醛基氧的反应，酸和碱均可催化这个过程。所以在实验室进行这类反应的时候常常通过添加一定量的酸或碱，可以加速这个过程，即便是在室温下也能发生，加热的话可以进一步加速这个过程。那么如果不加酸碱，不加温，
蒋华良、王明伟合作发表Nature子刊文章获突破性进展
《自然-通讯》于7月31日在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国南加州大学Raymond C. Stevens、Scripps研究所Patrick Griffin和Bridget Carraghe、荷兰阿姆斯特丹自由大学Chris de Graaf和上海科技大学iHu
关于高分子聚合物的聚集态结构介绍
聚集态结构是指高聚物分子链之间的几何排列和堆砌结构，结构规整或链次价力较强的聚合物容易结晶，例如，高密度聚乙烯、全同聚丙烯和聚酰胺等。结晶聚合物中往往存在一定的无定型区，即使是结晶度很高的聚合物也存在晶体缺陷，熔融温度是结晶聚合物使用的上限温度。结构不规整或链间次价力较弱的聚合物（如聚氯乙烯、聚
中科院新疆理化所提出预测蛋白质相互作用的方法
日前，中科院新疆理化所王延斌在尤著宏研究员指导下，提出一种使用蛋白质序列信息预测蛋白质相互作用的计算方法。相关成果发布于《国际分子科学杂志》。 随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。然而，由于实验技术的限制，很
CASMS分论坛：相互作用组学和结构蛋白质组学前沿
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” （相互作用组学和结构蛋白质组学
哪些因素引起蛋白质交联
蛋白质的变性是蛋白质空间和形态、功能发生的变化，最简单的例子就是，把打碎的鸡蛋里面加入盐的成分，鸡蛋由浑浊状态变成透明状态，这就是蛋白质的变性化学交联和酶交联.蛋白质化学交联剂主要是戊二醛,酶交联剂主要是转谷氨酰胺酶;通过蛋白质交联可改变食品组织结构和功能性质蛋白质是由基因组成的，基因是由每一段的D
我所观测到胶体量子阱的弗洛凯态及其退相干过程
近日，我所化学动力学研究室光电材料动力学研究组 (1121组) 吴凯丰研究员与朱井义副研究员团队在低维材料超快光物理研究中取得新进展。团队在室温下利用飞秒可见光脉冲驱动胶体量子阱，观测到了近红外波段的弗洛凯态光谱特征，并在时域上获得了弗洛凯态通过退相干转变为平衡物质态的动力学演化过程。时变周期性外场
水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
影响蛋白质聚集的因素有哪些？
1. 蛋白结构a) 蛋白质的一级结构及疏水氨基酸的相对数目对蛋白质的聚集速率和聚集体的稳定性有较大的影响。疏水氨基酸会形成聚集倾向区域(aggregation-prone region),在特定位置引入一个新的或不同的疏水氨基酸会显著加快蛋白聚集速率。b) 糖基化对于许多蛋白质的稳定性具有重要意义,
胰高血糖素受体全长构象变化与功能研究获进展
《自然-通讯》于7月31日在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国南加州大学Raymond C. Stevens、Scripps研究所Patrick Griffin和Bridget Carraghe、荷兰阿姆斯特丹自由大学Chris de Graaf和上海科技大学iHu
北京大学Nature子刊发布研究蛋白质相互作用的新技术
北京大学的研究人员报告称，他们开发出了一种遗传编码蛋白质光交联剂，其带有可转移的、质谱可识别的标签。这一研究成果发布在7月27日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 北京大学化学与分子工程学院的陈鹏（Peng R. Chen）研究员与王初（Chu Wang）研究
我所开发基于仿生材料提高农药利用率的新方法
近日，我所生物技术研究部天然产物及糖工程研究组（1805组）尹恒研究员团队在农药高效利用研究领域取得新进展。农药是重要的农业生产资料，传统农药剂型在作物叶片的附着力较弱，由于雨水冲刷等原因导致只有小部分活性成分被目标生物所利用，这是导致农药过度使用的主要原因之一。因此，提高农药利用率已成为世界各国农
科学家开发蛋白质复合物原位解析新技术
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500192.shtm作为生命活动的执行者，蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显
德国应用化学：蛋白质复合物原位解析新技术
作为生命活动的执行者，蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和
力学所等提出制造高密度单原子催化剂新方法
催化是化学工业的核心之一，深刻影响现代社会与科技的发展。近年来，单原子催化引起了学界和业界的关注。在制造高密度单原子催化剂时，单原子易聚集成团簇，导致制造效率和稳定性偏低。因此，如何抑制团簇的形成是制造高密度单原子催化剂的主要挑战之一。近期，中国科学院力学研究所与德国马克斯-普朗克高分子研究所、浙江
新技术实现脂滴聚集体的光催化邻近标记
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员刘宇团队与研究员张丽华、研究员赵群团队，联合西湖大学教授张鑫团队，在脂滴（LDs）聚集复合物组分解析和调控机制研究中取得新进展。合作团队建立了一种基于小分子光催化剂的蛋白质邻近标记技术（LipoID），在活细胞中快速标记捕获脂滴周边的相互作用蛋白，并发现了
JACS|大连化物所：基于nMS表征影响蛋白质结构的分子机制
近日，连化物所生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员、刘哲益副研究员团队与西南交通大学封顺教授团队合作，利用我所自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器，揭示了质子化氨基酸侧链的正电荷在电喷雾离子化过程中影响蛋白质结构的分子机制，为质谱精确表征蛋白质高级结构提供了参考。 非变性
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病（ANKL）起源于NK细胞异常增殖，病情进展迅速，多数患者在极短时间内发生多器官衰竭，部分患者会出现吞噬血细胞的现象，病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗，平均生存时间也仅有几个月。目前，临床上ANKL的治疗面临两大问题：患者对传统化疗方案不敏感，医学界没有统一的治疗标
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病（ANKL）起源于NK细胞异常增殖，病情进展迅速，多数患者在极短时间内发生多器官衰竭，部分患者会出现吞噬血细胞的现象，病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗，平均生存时间也仅有几个月。目前，临床上ANKL的治疗面临两大问题：患者对传统化疗方案不敏感，医学界没有统一的治疗标
昆明植物所解析九倍体木本竹基因组
竹子即竹亚科是禾本科的重要分支，广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲，约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源，木本竹子越来越多被用作木材的替代品，具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现，木本竹子均为异源多倍体，具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进