我所提出聚集态蛋白质相互作用组的交联解析新方法
近日，我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组（02T5组）刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队，以及西湖大学张鑫教授团队等合作，通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构，实现分子的三重态化学活性，并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联，获得了聚集态蛋白质的相互作用信息。蛋白质的错误折叠、变性与聚集会引发多种蛋白质构型疾病，如阿尔兹海默症、帕金森症、渐冻人症和淀粉样心肌病等。目前，聚集态蛋白的研究主要停留在发展荧光探针观察其位置形貌并示踪聚集过程，用于疾病的早期发现和临床诊断。然而，用于解析细胞内聚集态的蛋白质组成成分和相互作用信息的分析工具鲜有报道。聚集态蛋白质的组分和互作信息对于揭示上述疾病的发病机制，寻找新的诊疗靶点具有积极的科学和临床意义。 近年来，刘宇团队针对细胞内聚集态蛋白质缺乏完整三维结构信息、难以实现靶向探测这一领域难点，提出靶向聚集态蛋白质内部孔道特征微环境的探针设计思路（......阅读全文
董梦秋：化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼
在蛋白质组学分析方法中，质谱获得的是多肽序列结构的信息；那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息？近几年来，董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作，主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下，很多研究者都把样品一分为二，一份做冷冻电镜，一份做交联质谱。那么交联
蛋白质相互作用组研究获进展
蛋白质相互作用组是指蛋白质之间的基本相互作用，对于大多数物种而言，其在很大程度上都是未知的。因而，研究探索膜蛋白潜在的相互作用组必然是一项极具挑战性的工作。 美国斯坦福大学卡耐基科学研究所Jones等研究人员，使用构建好的分裂泛素化酵母试验系统，从拟南芥中筛选鉴定出超过3000个膜蛋白之间的相
影响蛋白质聚集的因素
1. 蛋白结构a) 蛋白质的一级结构及疏水氨基酸的相对数目对蛋白质的聚集速率和聚集体的稳定性有较大的影响。疏水氨基酸会形成聚集倾向区域(aggregation-prone region),在特定位置引入一个新的或不同的疏水氨基酸会显著加快蛋白聚集速率。b) 糖基化对于许多蛋白质的稳定性具有重要意义,
张丽华：搭建蛋白质组学研究平台
分析测试百科网讯 自然科学研究，原则上应该是理性思辨能力更强的男性占优；而从屠呦呦获得了诺贝尔奖可以推断，女性从事科学研究同样可以做得出色。在分析化学领域，有这样一位女性。她曾荣获2015年“中国青年女科学家奖”；在和男性同台竞争的舞台上，她2014年入选了中组部“万人计划”； 2017年获得了
武汉物数所等建立蛋白质动态研究新方法
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳带领的生物大分子动态学研究团队和北京生命科学研究所董梦秋研究组合作，在《生物化学杂志》（The Journal of Biological Chemistry）发表题为Modeling protein excited-state structures
我所利用大连光源发现首例分子高激发态的漫游反应通道
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202402/t20240207_6987729.html近日，我所分子反应动力学国家重点实验室袁开军研究员、杨学明院士实验团队联合傅碧娜研究员、张东辉院士理论团队，在分子光化学研究领域取得重要进展，利用大连光源发现了二氧化
我所实现三线态锑宾化合物的分离与表征
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202306/t20230612_6776778.html 近日，我所催化基础国家重点实验室生物无机催化研究组（507组）叶生发研究员团队与苏州大学谭庚文教授团队在低配位主族元素化合物的研究中取得新进展，实现了单配位锑宾化
科研人员利用可见光催化破解蛋白质标记选择性瓶颈
近日，中国科学院上海有机化学研究所研究团队等，在生物正交标记技术领域取得进展。研究团队发展出可见光驱动的酮基自由基偶联新策略，在活细胞层面实现了蛋白质的原子级精度标记与交联。该方法通过可见光催化，高效生成稳定的二芳基酮自由基，有效规避了传统紫外激发技术因高能光照导致的选择性差、副反应多、背景干扰
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
我所“重油浆态床加氢解构转化技术”通过科技成果评价
4月16日，我所化石能源与应用催化研究部烷烃转化新催化材料及新过程研究组（DNL0802）田志坚研究员、马怀军研究员团队与克拉玛依市先能科创重油开发有限公司合作开发的“重油浆态床加氢解构转化技术”通过了中国石油和化学工业联合会（以下简称“石化联合会”）组织的科技成果评价。评价会由石化联合会科技与装备
我所提出生物质制备一氧化碳新方法
近日，我所生物能源化学品研究组(DNL0603)王峰研究员团队与大连理工大学王敏特聘研究员团队合作，发展了一种光催化生物质氧化重整制备一氧化碳的新方法，实现了多种生物质多元醇和糖类在常温常压条件下高速率转化到一氧化碳，为生物质资源的利用开拓了新路径。 一氧化碳作为合成气(H2+CO)的主要
武汉物数所蛋白质动态学新技术助力重要蛋白结构解析
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术，协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构，该研究成果发表于《自然》杂志。 该工作揭示了RNA N6腺
武汉物数所蛋白质动态学研究助力重要蛋白结构解析
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术，协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构，该研究成果发表于《自然》杂志。 该工作揭示了RNA N6腺
董梦秋：破译衰老密码
办公桌上、窗台上，摆满了绿植，还有一个精致的小鱼缸，四平方米左右的办公室干净温馨。在见识前几位PI简陋的办公室后，这里的风景让人眼前一亮。“哈哈，肯定是黄牛说的，他老说我这是闺房。”董梦秋的一串爽朗笑声瞬间让我轻松许多。 受“女生不太擅长理科”这种根深蒂固观点的影响，我向来对很牛的女科研人
中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术
近日，中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通
新疆理化所提出预测蛋白质相互作用的计算方法
蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能，帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。
一种基于化学交联质谱分析蛋白质动态学研究新方法
解析蛋白质的动态结构，能够揭示蛋白质行使功能的内在机制。化学交联质谱分析（Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry，CXMS），结合高灵敏质谱分析，是近十年发展起来的结构生物学技术。利用有特定长度的化学交联剂将蛋白质中的特定氨基酸
亚甲基蓝介导光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用
亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构，亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合，插入碱基。浓度较高时，亚甲基蓝带阳离子，可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用
实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构，亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合，插入碱基。浓度较高时，亚甲基蓝带阳离子，可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。
我所开发N糖肽质谱谱图解析新软件
近日，我所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库，利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点，发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法，实现
我所揭示MXenes电子—声子相互作用新机制
近日，我所分子反应动力学国家重点实验室、大连光源科学研究室（二十五室）袁开军研究员团队与北京航空航天大学郭洪波教授、李介博副教授等合作，发现了MXenes中电子能量弛豫新通道，揭示了MXenes电子—声子相互作用新机制。该成果对设计等离激元新材料，实现材料高效光电、光热转化等提供了新思路。 等离激
研究开发出可一步富集和定量分析的新型交联剂
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群团队研制了基于二甲基哌啶基的可一步富集和定量分析的新型交联剂，通过降低样品损失，实现了少量细胞（1×104个）中蛋白质复合物的原位交联质谱（XL-MS）分析。相关成果发表在《德国应用化学》。新型交联剂特征。大连化物所供图细胞内的蛋白质通过构象
新方法能预测蛋白质与环境间的相互作用
众所周知，蛋白质是生命的基石，在所有的生物过程中发挥着关键的作用。因此，了解它们如何与环境相互作用，对于开发有效的治疗方法和设计人工细胞的基础至关重要。图片来源：Laura Persat / 2019 EPFL 近日，由瑞士联邦理工学院（EPFL）生物工程研究所蛋白质设计与免疫工程实验室(LP
学者开发出基于氟磺酸的可富集化学交联剂
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员唐士兵与浙江大学研究员杨兵、北京航空航天大学副教授刘超团队合作，在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持下，开发出一种新型氟磺酸类可富集化学交联的非天然氨基酸并在活细胞中研究蛋白质直接相互作用。相关成果发表于《自然-通讯》。蛋白质-蛋白质相互作用
学者开发出基于氟磺酸的可富集化学交联剂
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员唐士兵与浙江大学研究员杨兵、北京航空航天大学副教授刘超团队合作，在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持下，开发出一种新型氟磺酸类可富集化学交联的非天然氨基酸并在活细胞中研究蛋白质直接相互作用。相关成果发表于《自然-通讯》。 蛋白质-蛋白质
我所揭示金属颗粒诱导分子自旋三线态产生的新机制
近日，我所化学动力学研究室光电材料动力学研究组 (1121组) 吴凯丰研究员与郑州大学陈宗威博士等合作，揭示了一种分子自旋三线态产生的新机制。研究人员利用金属纳米颗粒与有机分子构建无机-有机杂化材料，通过金属-分子界面超快电荷分离，结合金属纳米颗粒中超快的电子自旋翻转，高效率地产生了分子自旋三线态，
上海交大提出求解自然界强相互作用新方法
上海交通大学物理系季向东教授在近期物理研究领域顶级刊物《物理快报》发表文章，题为《欧几里得时空格点上的部分子物理》，介绍了在量子色动力学研究中取得的最新成果，解决了困扰强相互作用物理研究方面的一个重要问题。物理学界认为：“这为用量子色动力学理论研究强相互作用现象打开了一扇大门。” 自然界有
分子光谱年会分会－探索生命分析新技术及新方法
2024年11月30日-12月2日，第 23 届全国分子光谱学学术会议和第五届光谱年会暨黄本立院士百岁华诞学术研讨会在福建省厦门市召开。会议首日下午，在“生命分析新技术及新方法”分会场中，中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、中国科学院大连化学物理研究所张丽华研究员、东华理工大学张兴磊副教授、
Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队，研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通过相