cDNA末端快速扩增法的方法介绍
中文名称cDNA末端快速扩增法英文名称rapid amplification of cDNA end;RACE定 义从低丰度转录物中快速扩增cDNA片段,以获得具5'和3'端的全长cDNA的一种方法。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)......阅读全文
cDNA末端快速扩增法的方法介绍
中文名称cDNA末端快速扩增法英文名称rapid amplification of cDNA end;RACE定 义从低丰度转录物中快速扩增cDNA片段,以获得具5'和3'端的全长cDNA的一种方法。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
cDNA末端快速扩增技术的定义
定义:cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends, RACE)是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3’末端的有效方法。
cDNA末端快速扩增技术的定义
⑴.5’ RACE-PCR:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核营酸序列通 用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准第一链cDNA。然后用一个基因特异引物GSP2 (gene specific primer,GSP)作为上游引物
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂
cDNA-3末端的快速扩增(3’RACE)
实验方法原理 在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDNA 合成过程中还是在分子克隆中怎样缺失和在哪个环节中缺失的尚
cDNA-3末端的快速扩增(3’RACE)
在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDNA 合成过程中还是在分子克隆中怎样缺失和在哪个环节中缺失的尚不清楚。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理在用 o
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条
cDNA-5’末端的快速扩增(5’RACE)
实验方法原理 在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。实验材料 反转录酶末端脱氧核
cDNA-3末端的快速扩增(3’RACE)
实验方法原理 在用 oligo (dT) 引物构建的 cDNA 文库中,偶而发生部分 cDNA 克隆缺失了与靶 mRNA 3' 末端互补的序列。这部分序列到底是在 cDNA 合成过程中还是在分子克隆中怎样缺失和在哪个环节中缺失的尚不清楚。第一链 cDNA 的随机断裂,在合成第二链 c
仅扩增全长cDNA末端的高级RACE方法
为了获得全长的cDNA 5’及3’末端序列,许多研究人员使用了称之为cDNA末端快速扩增,或RACE的方法。传统的RACE方法得到的PCR产物含有全长及断裂的cDNA产物。GeneRacer™试剂盒确保您只得到含有全长cDNA末端的完整序列,是您得到更高效的结果并节省您的时间GeneRacer™
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓冲液 RNA 酶 HRNasinSuperScriptII 逆转录酶dNTP 溶液DTTTECoCl2dATP 溶液脱氧核苷酸末端转移酶加尾缓冲液 HerculesHot-Start 聚合酶HerculesHot
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
试剂、试剂盒 GSP-RT 引物 poly(A)+RNA 或总 RNA 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptI
用经典-RACE-扩增-cDNA-的5’末端实验
这一实验方案分为 3 个阶段。 第 1 阶段:反转录产生 cDNA 模板 ;第 2 阶段:在第一链 cDNA 产物末端加 poly(A) 尾 ;第 3 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒GSP-RT 引物poly(A)+RNA 或总 RNA反转录缓
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 仪器、耗材 特殊设备
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端
这一实验方案分为 6 个阶段。第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化; 第 2 阶段:完整 RNA 去帽; 第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备; 第 4 阶段:RNA 寡核苷酸与细胞 RNA 的连接; 第 5 阶段:反转录; 第 6 阶段:扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(一)
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸仪器、耗材 特殊设备实验步骤 第 1 阶段:降解 RNA 的去磷酸化一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙酸钠,3mol/L,pH5.2乙醇二硫苏糖醇(DTT)(0.1mol/L)苯酚/氯仿(1:1,体积比)2. 酶和酶缓冲液磷酸酶缓冲液,10X
用新-RACE-法扩増-cDNA-的-5末端(二)
第 3 阶段:RNA 寡核苷酸的制备选择离 T7 或 T3RNA 聚合酶作用位点下游约 lOObp 处可以线性化的质粒 [见图 25-3(b)]。因为来自多克隆位点回文序列的引物用于 PCR 效果不好,因此比较理想的是用在多克隆位点克隆进某个插入片段的质粒。一个已经验证过的质粒是 pBS-S
功能基因-cDNA-3’末端的克隆
一.原理 (1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。 (2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。 (
功能基因cDNA-5’末端的克隆
一.原理⑴ 5’-RACE法① 以目的mRNA 为模板,使用5’末端P 标记的RT 引物进行反转录反应,合成1ststrand cDNA。② 使用RNase H 分解 Hybrid DNA-RNA中的RNA链。③ 使用T4 RNA Ligase 使单链cDNA进行环化或形成首尾连接物。④ 进行PCR
cDNA-扩增和影印实验
实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒 LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材 离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具
cDNA-扩增和影印实验
实验材料保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 将密
cDNA-扩增和影印实验
实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列 试剂、试剂盒
功能基因cDNA3#39;末端的克隆
一.原理(1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。(2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。(3)
cDNA文库组标准流程八:pBlueScript-cDNA库扩增
1.试剂及配方:2 x LB (1升): 20g 氯化钠 20g 蛋白提取物 10g 酵母提取物 加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)175ml 2 x LB液体2
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒 dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材 水浴或加热仪热循环仪实验步骤 试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒 dNTP 溶液 二硫苏糖醇 TE 反转录缓冲液 RNA 酶 H RNasin SuperScriptⅡ逆转录酶
用经典-RACE-扩増-3末端-cDNA-实验
试剂、试剂盒dNTP 溶液二硫苏糖醇TE反转录缓冲液RNA 酶 HRNasinSuperScriptⅡ逆转录酶poly(A)+RNA 或总 RNAQT 引物Hercules Hot-Start 聚合酶仪器、耗材水浴或加热仪热循环仪实验步骤试剂可以从多数大供应商那里买到该过程所需要的材料与合适的 5X
RACE技术扩增构建全长cDNA文库
实验概要利用RACE(利用PCR技术快速扩增全长mRNA)技术构建全长cDNA文库是传统C库构建技术的改进。本实验即是利用寡核苷酸帽法,进行全长C库的构建,从而掌握RACE技术的原理与基本操作方法。实验原理其原理是利用真核mRNA的3’poly(A)和5’帽子结构作为标签,用通用引物识别并配对标签序
RTPCR扩增目的基因cDNA
实验概要学习从细胞或组织的RNA中用逆转录PCR扩增目的基因的技术及操作。实验原理普通PCR方法可以以DNA为模板扩增基因,但真核生物的基因组中通常分为可转为mRNA的外显子和不转录的成mRNA的内含子,所以从染色体DNA用PCR方法扩增出的基因是内含子和外显子相间排列的DNA分子,不能用于基因工程
RACE的原理、应用和优缺点(一)
一、RACE 的简介 目前,全长基因的获得是生物工程及分子生物学研究的一个重点。尽管已经有多种方法可以获得基因的全长序列,但在很多生物研究中,由于所研究的目的基因丰度较低,从而使得由低丰度mRNA通过转录获得全长cDNA很困难。近年来发展成熟的cDNA末端快速扩增(RACE)技术为从低丰度转录快速