随机寡核苷酸诱变的概念

中文名称随机寡核苷酸诱变英文名称random oligonucleotide mutagenesis定 义通过合成一系列突变寡核苷酸引物对基因组某个区域进行聚合酶链反应扩增,获得大量突变的DNA,以研究突变对功能的影响。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)......阅读全文

用放射性标记的寡核苷酸杂交筛选定点诱变重组克隆实验

实验方法原理 试剂、试剂盒 甲酸铵寡核苷酸杂交溶液寡核苷酸预杂交液TE噬菌体T4多核苷酸激酶限制性内切核酸酶琼脂糖凝胶诱变寡核苷酸[γ-32P]ATP2XYT 顶层琼脂和 2xYT 琼脂平皿 仪器、耗材 钝端镊子皮下注射用针头(18 号)和印度墨水孵箱硝酸纤维素膜或尼龙膜真空烤箱68°C 水

用放射性标记的寡核苷酸杂交筛选定点诱变重组克隆实验

            实验方法原理 试剂、试剂盒 甲酸铵 寡核苷酸杂交溶液 寡核苷酸预杂交液 TE 噬菌体T4多核

用放射性标记的寡核苷酸杂交筛选定点诱变重组克隆实验

本方案主要描述了筛选噬菌体 M13 重组克隆,而一种选择方案是筛选含噬菌粒的细菌克隆。最后也介绍了用 PCR 检测突变体的方法。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验方法原理试剂、试剂盒甲酸铵寡核苷酸杂交溶液寡核苷酸预杂交液TE噬菌体T4多核

关于基因诱变的γ射线诱变剂的介绍

  γ-射线属于电离辐射,是电磁波.一般具有很高的能量,能产生电离作用,因而能直接或间接地改变DNA结构.其直接效应是,脱氧核糖的碱基发生氧化,或脱氧核糖的化学键和糖-磷酸相连接的化学键断裂,使得DNA的单链或双链键断裂.其间接效应是电离辐射使水或有机分子产生自由基,这些自由基与细胞中的溶质分子起作

关于基因诱变的激光诱变剂的介绍

  激光在微生物诱变育种方面的研究与开发应用比较晚。激光诱变育种技术研究始于20世纪60年代,经过世界各国40多年的开发应用研究,不仅证明激光和普通光在本质上都是电磁波,它们发光的微观机制都与组成发光物质的原子、分子能量状态和变化密切相关。激光是一种与自然光不同的辐射光,它具有能量高度集中、颜色单一

关于基因诱变的微波诱变剂的介绍

  微波辐射属于一种低能电磁辐射,具有较强生物效应的频率范围在300MHz~300GHz,对生物体具有热效应和非热效应。其热效应是指它能引起生物体局部温度上升,从而引起生理生化反应;非热效应指在微波作用下,生物体会产生非温度关联的各种生理生化反应。在这两种效应的综合作用下,生物体会产生一系列突变效应

定点诱变与盒式诱变的比较介绍

  构建一个位点导向的文库涉及使用含有一个或多个简并密码子的合成DNA片段替代一个基因片段。这可以通过双链盒式诱变或单链寡核苷酸定向诱变来实现。我们相对倾向于寡核苷酸定向诱变,因为不同于盒式诱变,它不需要在目的区域附近有独特的限制性酶切位点,并且构建一个文库只需要一个寡核苷酸片段。因此,这个方法相当

关于诱变的化学诱变剂的介绍

  1、碱基类似物  碱基类似物是与DNA正常碱基结构类似的化合物,能在DNA复制时取代正常碱基掺入并与互补碱基配对。如5-溴尿嘧啶(BU)和2-氨基嘌呤(AP),都能引起AT碱基对转换为GC碱基对。  2、氯化锂  氯化锂诱变,普遍认为是它导致AT-GC碱基对的转换或导致碱基的缺失。  3、叠氮化

酵母菌细胞的诱变实验——甲乙硫醚诱变

实验材料酵母试剂、试剂盒YPD磷酸钠缓冲液甲乙硫醚刀豆氨酸硫代硫酸钠仪器、耗材试管摇床离心机平板实验步骤1.  将过夜培养的待诱变酵母菌株转接于5 ml YPD培养基,于30℃继续培养。检查细胞密度,记录并调整到2×108细胞/ml。2.  转移1 ml 的菌悬液到无菌的离心管中。高速离心5~10

酵母菌细胞的诱变实验——紫外光诱变

实验材料酵母试剂、试剂盒YPD刀豆氨酸仪器、耗材紫外光杀菌灯紫外光放射量测定器实验步骤1.  将过夜培养的酵母菌培养液接种到5 ml YPD培养基中,于30℃培养。离心5~10 s,用1 ml 无菌水重悬沉淀细胞,重复洗涤1次,再用1 ml 无菌水重悬。 2.  检查细胞密度,记录数据后将细胞密度调

关于基因诱变的紫外线诱变剂的介绍

  我们知道,DNA和RNA的嘌呤和嘧啶有很强的紫外光吸收能力,最大的吸收峰在260nm,因此波长260nm的紫外辐射是最有效的诱变剂.对于紫外线的作用已有多种解释,但研究的比较清楚的一个作用是使DNA分子形成嘧啶二聚体,即两个相邻的嘧啶共价连接,二聚体出现会减弱双键间氢键的作用,并引起双链结构扭曲

关于基因诱变的离子束诱变剂的介绍

  离子注入是20世纪80年代初兴起的一项高新技术,主要用于金属材料表面的改性。1986年以来逐渐用于农作物育种,近年来在微生物育种中逐渐引入该技术 [2] 离子注入诱变是利用离子注入设备产生高能离子束(40~60keV)并注入生物体引起遗传物质的永久改变,然后从变异菌株中选育优良菌株的方法。离子束

随机孢子分析

实验步骤展开

随机引物法

此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1

诱变-PCR-实验

试剂、试剂盒 氯仿 异戊醇乙醇矿物油或者一个蜡珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突变 PCR 缓冲液DNA 聚合酶Native Taq 或 AmpliTaq DNA 聚合酶高纯度的脱氧核苷 5'-三磷酸dNTP 混合物模板 DNA引物琼脂糖凝胶用溴化乙锭染色仪器、

诱变-PCR-实验

            试剂、试剂盒 氯仿 异戊醇 乙醇 矿物油或者一个蜡珠 3mol L NaOAc 5 mmol L MnCl2 突变 PCR 缓冲液

诱变-PCR-实验

诱变 PCR 最大的优势是以一种没有偏好的方式引入了各种类型的突变,而不是获得高水平的单一的扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒氯仿 异戊醇乙醇矿物油或者一个蜡珠3mol L NaOAc5 mmol L MnCl2突变 PCR 缓冲液DNA 聚合酶Nati

USE-诱变实验

本方法中,两条寡核苷酸引物杂交到变性重组质粒 DNA 双链的同一条链上。一条引物(诱变引物)携带一个拟引进靶 DNA 序列的突变,第二条引物携带一个能破坏质粒单一限制酶位点的突变。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料带 mutS 表型(

USE-诱变实验

实验材料 带 mutS 表型(例如BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态试剂、试剂盒 退火缓冲液贮存液合成缓冲液噬菌体 T4DNA 连接酶噬菌体 T4DNA 聚合酶或测序酶单一位点的限制性内切核酸酶琼脂糖凝胶诱变引物选择引物质粒 DNA仪器、耗材 70°C

USE-诱变实验

            实验材料 带 mutS 表型(例如 BMH71-18) 的转化用大肠杆菌感受态 带 mut+表型的转化用大肠杆菌感受态 试剂、试剂盒

分子遗传学词汇盒式诱变

中文名称:盒式诱变外文名称:cassette mutagenesis原    料:人工合成有突变功能的寡核苷酸定义:所谓盒式诱变(cassette mutagenesis),就是利用一段人工合成的具有突变序列的寡核苷酸片段,即所谓的寡核苷酸盒(oligonucleotide cassette),取代

关于盒式诱变的基本介绍

  所谓盒式诱变(cassette mutagenesis),就是利用一段人工合成的具有突变序列的寡核苷酸片段,即所谓的寡核苷酸盒(oligonucleotide cassette),取代野生型基因中的相应序列。盒式诱变是一种定点突变技术,将靶基因的一段DNA删掉,并用人工化学合成所具有的突变核苷酸

饱和诱变的定义

对基因的某一小区域内碱基进行所有形式或所有可能存在形式的诱变。

关于基因诱变的室温等离子体诱变剂的介绍

  常压室温等离子体(Atmospheric and Room Temperature Plasma)的简称,(缩写为ARTP)能够在大气压下产生温度在25-40 °C之间的、具有高活性粒子(包括处于激发态的氦原子、氧原子、氮原子、OH自由基等)浓度的等离子体射流。按照热力学平衡状态,等离子体可分为

关于诱变的化学诱变剂抗生素的介绍

  如平阳霉素(PYM),PYM是一种抗生素,属于博莱霉素的一类。目前主要作为抗肿瘤药应用于临床,对多种癌症具有较好的疗效。抗生素具有高度选择性,能抑制细胞的生长,其中的大多数对维持生命有重要意义。作为一种新的诱变剂,平阳霉素能直接作用于DNA,高浓度时可使DNA链断开,低浓度时能抑制连接酶,阻止胸

寡核苷酸的性质

寡核苷酸极易与它们的互补对链接。

随机误差(3)

抽样误差在随机误差中,最重要的是抽样误差。我们从同一总体中随机抽取若干个大小相同的样本,各样本平均数(或平均率)之间会有所不同。这些样本间的差异,同时反映了样本与总体间的差异。它是由于从总体中抽取样本才出现的误差,统计上称为抽样误差(或抽样波动)。例如,抽样误差在医学生物实验中最主要的来源是个体的变

随机误差(2)

特征即使测试系统的灵敏度足够高,在相同的测量条件下,对同一量值进行多次等精度测量时,仍会有各种偶然的,无法预测的不确定因素干扰而产生测量误差,其绝对值和符号均不可预知。虽然单次测量的随机误差没有规律,但多次测量的总体却服从统计规律,通过对测量数据的统计处理,能在理论上估计起对测量结果的影响。随机误差

随机误差(1)

随机误差也称为偶然误差和不定误差,是由于在测定过程中一系列有关因素微小的随机波动而形成的具有相互抵偿性的误差。其产生的原因是分析过程中种种不稳定随机因素的影响,如室温、相对湿度和气压等环境条件的不稳定,分析人员操作的微小差异以及仪器的不稳定等。随机误差的大小和正负都不固定,但多次测量就会发现,绝对值

特征筛选(随机森林)

随机森林能够度量每个特征的重要性,我们可以依据这个重要性指标进而选择最重要的特征。sklearn中已经实现了用随机森林评估特征重要性,在训练好随机森林模型后,直接调用feature_importan ces 属性就能得到每个特征的重要性。一般情况下,数据集的特征成百上千,因此有必要从中选取对结果影响