如何确认RNA的质量

1、RNA胶(凝胶成像)检测。例如:原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。在胶上就有三条明显大小不一的条带。2、凝胶迁移分析。可以用来研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:结合了蛋白的RNA在凝胶中的迁移速率更慢,因而可以区分出结合蛋白与未结合蛋白的RNA条带。3、RNA-seq即转录组测序技术,把mRNA,smallRNA等用高通量测序技术把RNA的序列测出来。反映出RNA的表达水平。扩展资料1、RNA的功能是:(1)具有肽酰转移酶的活性。(2)为tRNA提供结合位点。(3)在蛋白质合成起始时,参与同mRNA选择性的结合,在肽链的延伸中与mRNA结合。16S的rRNA3’端有一段核苷酸序列与mRNA的前导序列是互补的,这可能有助于mRNA与核糖体的结合。2、凝胶成像对DNA或RNA胶进行切胶、拍照、观察、分析的实验室类仪器,凝胶成像系统可以应用于分子量计算、密度扫描、密度定量、PCR定量等生物工程常规研究。......阅读全文

Arabidopsis-RNA-extraction-protocol

1-2 g fresh material, freezer-dried, ground with 0.2g sand (if necessary), and then homogenized with 10ml RNA extraction buffer (see below).Spin at 8,

互补RNA的定义

中文名称互补RNA英文名称complementary RNA定  义能与另一条核酸(DNA或RNA)链互补的RNA分子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是转运RNA?

转运RNA(Transfer RNA),又称传送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称为tRNA,是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定种类的氨基酸。转译的过程中,tRNA可借由自身的反密码子识别mRNA上的密码子,将该密码子对应的氨基酸转运

转运RNA的功能

主要是携带氨基酸进入核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质。即以mRNA为模板,将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序(见蛋白质的生物合成、核糖体)。tRNA与mRNA是通过反密码子与密码子相互作用而发生关系的。在肽链生成过程中,第一个进入核糖体与mRNA起始密码子结合的tRNA叫起始

提取悬浮细胞RNA

提取RNA器械:离心管2支,吸管4个,酒精灯,打火机,记号笔,200ul,1000UL枪,DEPC泡过的枪头EP管,紫外照过的手套。滤纸,DEPC纯水(750ml无水乙醇+150mlDEPC水,剧烈振荡,使劲的摇晃,直至混匀),氯仿,75%酒精,异丙醇,Trizol,预冷的离心机(两种),EP管架(

植物病毒RNA提取

大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。   一、材料   提纯TMV病毒液(10mg/ml)。   二、设备   冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。   三、试剂   TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿

RNA干扰回复实验

RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

RNA电泳操作步骤

试剂: 琼脂糖(Agarose)、甲醛、甲酰胺、MOPS、EDTA、DEPC水。  步骤 一 、5 x MOPS-EDTA Buffer的配制(0.1 M MOPS pH7; 5mM EDTA; 10mM NaAc) 1、称量20.9g的MOPS,置于1L烧杯中。 2. 加700mL DEPC水溶解

反义RNA的来源

细胞中反义RNA的来源有两种途径:第一是反向转录的产物,在多数情况下, 反义RNA是特定靶基因互补链反向转录产物, 即产生mRNA和反义RNA的DNA是同一区段的互补链。第二种来源是不同基因产物,如OMPF基因是大肠杆菌的膜蛋白基因,与透性有关,其反义基因MICFZE则为另一基因。

细胞RNA含量检测

实验步骤             展开

RNA-标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc

分离植物总RNA

实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理;学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA,其中80-85%为rRNA,其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成(如tRNA、核内小分子

ISOLATION-OF-RNA-FROM-BACTEROIDS

3 g nodules (fresh or frozen in liquid N2) were ground to a powder in mortar and pestle with liquid N2. To the powder was added ice cold 0.5 M mannito

RNA编辑主要类型

①简单编辑,单碱基转变的转录后调节;②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格;③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋白颗粒中与前编辑mRNA配对,鉴别作为

核RNA的概念

中文名称核RNA英文名称nuclear RNA定  义细胞核内的RNA。如核内不均一RNA、核小RNA、核仁小RNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

Arabidopsis-RNA-extraction-protocol

1-2 g fresh material, freezer-dried, ground with 0.2g sand (if necessary), and then homogenized with 10ml RNA extraction buffer (see below). Spin

反义RNA技术改良

用反义RNA分子来调节基因表达时,经常会遇到的困难是反应模板的稳定性差。因此,人们正在探索如何改进反义基因的新方法,目前主要有:(1)优化反义RNA的结合。反义RNA链的长度对抑制基因的效果是重要的。双螺旋形成过程中将释放能量,RNA链越长,释放的自由能越多。从这一意义来讲,可以说长RNA作为反义R

什么是RNA作图?

中文名称RNA作图英文名称RNA mapping定  义对RNA分子在基因上的定位分析。将RNA与相应的DNA杂交后,用单链特异性核酸酶(常用的如S1核酸酶)切去不发生杂交的单链部分,用以分析RNA与相应DNA的关系,包括确定RNA的5′和3′端、外显子和内含子在DNA上的相应位置等。应用学科生物化

RNA假结的定义

RNA中的一种常见的三级结构元件。RNA的茎环结构中的环上序列与其他部位(通常是邻近部位)的序列碱基配对,形成类似“打结”形状。

什么是反义RNA?

反义RNA是指与mRNA互补后,能抑制与疾病发生直接相关基因的表达的RNA。它封闭基因表达,具有特异性强、操作简单的特点,可用来治疗由基因突变或过度表达导致的疾病和严重感染性疾病。根据反义RNA的作用机制可将其分为3类:Ⅰ类反义RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分编码区,直接抑制翻译,

RNA印迹(Northern-Blot)

【实验原理】将RNA变性及电泳分离后,转移到固相支持物上,用于与DNA探针杂交以鉴定其中特定 RNA分子的大小与含量。基本原理与Southern印迹相同,但RNA变性方法与DNA不同,不能用碱变性,因为碱会导致RNA的水解。Northern印迹主要用于组织细胞靶基因表达水平的研究以及对同一组织细胞的

植物RNA提取实验

直接研磨法 液氮研磨法             实验方法原理 通过裂解液β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离

微RNA的作用

人类基因组计划结束后,人们发现编码蛋白质的基因只占总基因组的约2%。而占人类基因组95%的非编码序列竟是产生大量非编码RNA的源泉,这些非编码RNA主要充当调控者的角色,在细胞分化凋亡、生物发育、疾病发生等方面均起重要作用。其实,RNA比DNA更为古老,它组成了地球上最早的生命。生命起源初期,没有由

什么是RNA编辑?

RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸。

真菌RNA提取实验

液氮研磨法             实验方法原理 液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚

双RNA测序技术

在发表于《自然》(Nature)杂志上的一篇研究论文中, 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现,采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术,可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制,以及在研究中获得的重要发现

RNA病毒的简介

  RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif -lower mosaic virus),几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80~160nm,为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中,其错误修复机制的酶的活性很低很低,几乎是没有

RNA提取与纯化

实验概要掌握RNA提取的基本技术,了解RNA提取过程中的各种注意事项。实验原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术。 RNA提取和DNA提取有类似的地方,因为它们都是核酸,都具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞,然后用提取液将RNA溶出,反复抽提去除蛋白质,加入乙醇沉淀RNA,将RNA

信使RNA的降解

同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命(稳定性)。在细菌细胞中,单个mRNA可以存活数秒至超过一小时,但平均寿命为1至3分钟,因此,细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高,从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够

RNA干扰的概念

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DNA修